; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0021983 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0021983
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionRas-related protein
Genome locationLG14:19912893..19916418
RNA-Seq ExpressionSed0021983
SyntenySed0021983
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF3441062.1 hypothetical protein FNV43_RR19348 [Rhamnella rubrinervis]4.2e-10494.2Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        +KWIEEVRTERG+DVIIVLVGNKTDLVDKRQVSI+EGDAKSR+SGVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+ EDMVDVNLKP VNSSQTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_004143465.1 ras-related protein RABH1e [Cucumis sativus]3.2e-10495.65Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSSQ+EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022950086.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita moschata]1.1e-10496.14Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSSQTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022962792.1 ras-related protein RABH1e-like [Cucurbita moschata]4.2e-10495.65Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_023003400.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita maxima]1.5e-10496.14Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGR9 Uncharacterized protein1.6e-10495.65Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSSQ+EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A1S3B1I2 ras-related protein RABH1e1.6e-10495.65Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSSQ+EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1GDU2 ras-related protein RABH1e5.4e-10596.14Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSSQTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1IN20 ras-related protein RABH1e-like2.1e-10495.65Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1KRN2 ras-related protein RABH1e7.1e-10596.14Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSI+EGDAKSR+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTR EDMVDVNLKP VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b8.3e-9585.1Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++R SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPP-VNSSQTE
        TKWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLVDKRQVSI+E +AK+R+  VMFIETSA+AGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+ EDMVDVNLK    N+S  +
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPP-VNSSQTE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A1.8e-8172.91Show/hide
Query:  SPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNTTKWI
        +PL K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAVVVYD++N  SF  TTKWI
Subjt:  SPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNTTKWI

Query:  EEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQQGGG
        ++VRTERGSDVII+LVGNKTDL DKRQVSI+EG+ K+++  VMFIETSA+AG+N+K LFR++AAALPGME+      EDM+D+ L+ P     +E   GG
Subjt:  EEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQQGGG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e4.6e-10189.86Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSI+EGD K+RD GV+FIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+ EDMVDVNLK   NS+Q EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d1.1e-9987.44Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR+SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGD+K R+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T++EDMVDVNLKP  NSSQ +Q
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c5.8e-8879.44Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNR +FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRHEDMVDVNLKPPVNSSQT
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLV+KRQVSI EG+ K ++ GVMFIETSA+  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSSQ 
Subjt:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRHEDMVDVNLKPPVNSSQT

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D8.0e-10187.44Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR+SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EGD+K R+ GVMFIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T++EDMVDVNLKP  NSSQ +Q
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein5.9e-9685.1Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++R SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPP-VNSSQTE
        TKWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLVDKRQVSI+E +AK+R+  VMFIETSA+AGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+ EDMVDVNLK    N+S  +
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPP-VNSSQTE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C4.1e-8979.44Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNR +FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRHEDMVDVNLKPPVNSSQT
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLV+KRQVSI EG+ K ++ GVMFIETSA+  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSSQ 
Subjt:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRHEDMVDVNLKPPVNSSQT

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E3.2e-10289.86Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSI+EGD K+RD GV+FIETSA+AGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+ EDMVDVNLK   NS+Q EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A1.1e-7874.37Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNTTKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++ SF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNTTKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQ-TEQQGGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV+KRQVSI+EG+ K+R+ G +F+ETSA+AGFNIKPLF KI +AL G E +S T+ ED+VDVNLKP + SSQ   QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQ-TEQQGGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGACCAATCCGTCGGCAAAACCAGCATCATCACCCGCTTCATGTACGACAAGTTCGACACCAC
CTATCAGGCTACCATTGGAATCGACTTTTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGGTTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGGAGTC
TCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCCTCTGTTGCAGTAGTAGTCTATGACGTATCAAATAGAATATCATTCTTGAATACTACCAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACAGAA
AGGGGCAGTGATGTGATCATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGATAAAAGGCAAGTTTCAATAGATGAAGGTGATGCCAAATCTCGTGATTCTGGAGTCAT
GTTTATAGAAACCAGTGCCAGAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTGTTTCGGAAGATAGCTGCAGCGCTGCCGGGGATGGAAACTCTTTCTTCTACAAGACACGAGGACA
TGGTAGACGTAAACTTGAAACCTCCAGTGAATTCATCCCAGACGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTCGTCATCGTTGGCGGTTTCTTCTCCGCACCCGGAGAGAAACAACGAACTTCCAGAAACCCCAATTCCATATCATTTACACCCCACGATCCTGCCTTTCTTTCTCTAA
TAATTTCTTTCAATTTACTTTTTCCTTTCATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGACCAATCCGTCGGCAAAACCAGCATCATCACC
CGCTTCATGTACGACAAGTTCGACACCACCTATCAGGCTACCATTGGAATCGACTTTTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGGTTGCAGCTTTGGGA
TACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGGAGTCTCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCCTCTGTTGCAGTAGTAGTCTATGACGTATCAAATAGAATATCATTCTTGAATACTA
CCAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACAGAAAGGGGCAGTGATGTGATCATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGATAAAAGGCAAGTTTCAATAGATGAAGGT
GATGCCAAATCTCGTGATTCTGGAGTCATGTTTATAGAAACCAGTGCCAGAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTGTTTCGGAAGATAGCTGCAGCGCTGCCGGGGATGGA
AACTCTTTCTTCTACAAGACACGAGGACATGGTAGACGTAAACTTGAAACCTCCAGTGAATTCATCCCAGACGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGCTAGAAGAAGA
TATGTAAGTTCATGAATACATATGAAAAATGCTTCAGAAATGGAATAGTAAAAGCAATCATTCACCGTTCAACAAATATTGACATTCATAATTTTCTAACCATATGATAT
TTGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRISFLNTTKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVDKRQVSIDEGDAKSRDSGVMFIETSARAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRHEDMVDVNLKPPVNSSQTEQQGGGCAC