; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0022114 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0022114
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionHMG-Y-related protein A
Genome locationLG11:30218034..30219184
RNA-Seq ExpressionSed0022114
SyntenySed0022114
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0016584 - nucleosome positioning (biological process)
GO:0030261 - chromosome condensation (biological process)
GO:0045910 - negative regulation of DNA recombination (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0003690 - double-stranded DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
GO:0031492 - nucleosomal DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000116 - High mobility group protein HMGA
IPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR017956 - AT hook, DNA-binding motif
IPR031059 - High mobility group protein HMGA, plant
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150116.1 HMG-Y-related protein A [Cucumis sativus]1.9e-7682.01Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MATDDQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM AID+LNDKNG SKSAITKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLF+KNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK KDP APISQPKK     SGRPRGRPPKYPKP  T+AP PVAG   PRGRGRPPK+KPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

XP_008466945.1 PREDICTED: HMG-Y-related protein A [Cucumis melo]1.5e-7682.54Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MATDDQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM AID+LNDKNG SKSAITKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK KDP APISQPKK     SGRPRGRPPKYPKP  T+AP PVAG   PRGRGRPPK+KPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

XP_022953026.1 HMG-Y-related protein B-like [Cucurbita moschata]1.3e-7580.42Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MAT DQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM+AIDALNDKNG SKS +TKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK++DP APISQPKK PS  SGRPRGRPPKYPKP  T+ PV    +  PRGRGRPPKIKPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

XP_023545599.1 HMG-Y-related protein B-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.1e-7579.89Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MAT DQ NN    PPPAPSLPHYPEMIM+AIDALNDKNG SKS +TKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK++DP APISQPKK PS  SGRPRGRPPKYPKP  T+ PV    +  PRGRGRPPKIKPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

XP_038906720.1 HMG-Y-related protein A-like [Benincasa hispida]2.3e-7781.48Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MATDDQLNN    PPPAPSLPHYPEMIMTAI++LNDKNG SKSAITKQIESTYGDLPPAF+ LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK KDP APISQPKK   P SGRPRGRPPKYPKP  T+APV    +G PRGRGRPPK+KPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KPG4 H15 domain-containing protein9.4e-7782.01Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MATDDQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM AID+LNDKNG SKSAITKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLF+KNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK KDP APISQPKK     SGRPRGRPPKYPKP  T+AP PVAG   PRGRGRPPK+KPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

A0A1S3CSD8 HMG-Y-related protein A7.2e-7782.54Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MATDDQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM AID+LNDKNG SKSAITKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK KDP APISQPKK     SGRPRGRPPKYPKP  T+AP PVAG   PRGRGRPPK+KPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

A0A5D3E3W3 HMG-Y-related protein A7.2e-7782.54Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MATDDQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM AID+LNDKNG SKSAITKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK KDP APISQPKK     SGRPRGRPPKYPKP  T+AP PVAG   PRGRGRPPK+KPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKK--IPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

A0A6J1GLV6 HMG-Y-related protein B-like6.1e-7680.42Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MAT DQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM+AIDALNDKNG SKS +TKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK++DP APISQPKK PS  SGRPRGRPPKYPKP  T+ PV    +  PRGRGRPPKIKPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

A0A6J1JSA2 HMG-Y-related protein B-like6.1e-7680.42Show/hide
Query:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP
        MAT DQLNN    PPPAPSLPHYPEMIM+AIDALNDKNG SKS +TKQIESTYGDLPPAFT LL HHL+VMKQTGQLLFVKNN+MKPDPNAPPKRGRGRP
Subjt:  MATDDQLNN----PPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRP

Query:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC
        PKPK PLP G V SPPRPRGRPPK++DP APISQPKK PS  SGRPRGRPPKYPKP  T+ PV    +  PRGRGRPPKIKPA   VGC
Subjt:  PKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPS--SGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q00423 HMG-Y-related protein A7.5e-4759.56Show/hide
Query:  MATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPK
        MAT +++N P    SLP YPEMI+  ++ALN+ NG++KSAI+K IE+TYG+LP A   +LG HL  MK +G+L F +NN+MK DPNAPPKRGRGRPPKPK
Subjt:  MATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPK

Query:  TPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQP--KKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSV
        TPLP G V SPPRPRGRPP  KDP AP   P  K  P SGRPRGRP K P+    AAP  V+     R RGRPPK+KP    V
Subjt:  TPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQP--KKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSV

Q10370 HMG-Y-related protein B (Fragment)2.4e-3759.35Show/hide
Query:  ALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPI
        ALN+ +G++KSAI+K IE+TYG+LP     +LG HL  MK++G+L F +NN+MK DPNAPPKRGRGRPPKPK PLP G V SPPRPRGRPP  KDP AP 
Subjt:  ALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVASPPRPRGRPPKAKDPLAPI

Query:  SQP--KKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSV
          P  K  P++GRPRGRP K  +  + A P P A S   R RGRPPK+KP    V
Subjt:  SQP--KKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSV

Q43386 HMG-Y-related protein A1.7e-4656.85Show/hide
Query:  ATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKT
        +  D  ++  P+ SLP YP+MIM AI++LNDKNG +K+ I K IEST   LPP+   LL +HL  MK+TGQL+ VKNN+MKPDP+APPKRGRGRPPK KT
Subjt:  ATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKT

Query:  PLPAGAVAS-----------PPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPK--PETTAAPVPVA-GSGVPRGRGRPPKIKPAAVS-VGC
           + A A+           PPR RGRPPK KDP  P  Q K I  SGRPRGRPPK P+   ET AAP P A  +G  RGRGRPPK+KP  V+ VGC
Subjt:  PLPAGAVAS-----------PPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPK--PETTAAPVPVA-GSGVPRGRGRPPKIKPAAVS-VGC

Q9FYS5 HMG-Y-related protein A2.3e-3551.03Show/hide
Query:  MATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPD-PNAPPKRGRGRPPKP
        MATD+      P+P +P YPEMI+ AI+ L+DK+G++KSAI+K IE  YG LPPA  +LL  HL  MK++G+L+F+KNN+ +   P+APPKRGRGRPPK 
Subjt:  MATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPD-PNAPPKRGRGRPPKP

Query:  KTP-LPAGAVASPP---RPRGRPPKAKDPL-APISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPK------PETTAAPVPVAGSGVP--RGRGRPPKIKPAAVS
        + P  PA A  SP    R RGRPPKAK PL A + Q        +PRGRPPK  K      P  + AP P      P  RGRGRPPK++PA  S
Subjt:  KTP-LPAGAVASPP---RPRGRPPKAKDPL-APISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPK------PETTAAPVPVAGSGVP--RGRGRPPKIKPAAVS

Q9M5W4 Histone H11.7e-0633.74Show/hide
Query:  SLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVASPPRP
        S P + EMI  AI  L ++ G+S+ AI K +E  +  LP  F  LL  HL+ +  +G+L+ VKN+F  P   A P     +  KP  P P  A       
Subjt:  SLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVASPPRP

Query:  RGRPPKAKDPLAPISQ------PKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAA-PVPVAGSGVPRGRGR
         G  PKAK  +A  ++       KKIP++ +P+ +     KP+T AA P  VA +      G+
Subjt:  RGRPPKAKDPLAPISQ------PKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAA-PVPVAGSGVPRGRGR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein2.8e-0430.64Show/hide
Query:  SLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVASPPRP
        S P Y EMI  AI  L ++ G+S+ AI K IE    +LPP F  LL  +L+ +  +G+L+ VK +F  P  +A       +   PK      A A     
Subjt:  SLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVASPPRP

Query:  RGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGV---------PRGRGRPPKIKPAA
             KAK  +A  S+ KK   + +P+    K    +  A PVP A +           P+ + RP K    A
Subjt:  RGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGV---------PRGRGRPPKIKPAA

AT1G14900.1 high mobility group A1.2e-4756.85Show/hide
Query:  ATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKT
        +  D  ++  P+ SLP YP+MIM AI++LNDKNG +K+ I K IEST   LPP+   LL +HL  MK+TGQL+ VKNN+MKPDP+APPKRGRGRPPK KT
Subjt:  ATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKT

Query:  PLPAGAVAS-----------PPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPK--PETTAAPVPVA-GSGVPRGRGRPPKIKPAAVS-VGC
           + A A+           PPR RGRPPK KDP  P  Q K I  SGRPRGRPPK P+   ET AAP P A  +G  RGRGRPPK+KP  V+ VGC
Subjt:  PLPAGAVAS-----------PPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPK--PETTAAPVPVA-GSGVPRGRGRPPKIKPAAVS-VGC

AT1G48620.1 high mobility group A56.5e-1436.06Show/hide
Query:  QLNNPPPAPSLPH--YPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNF-MKPDPNAPPKRGRG---RPPK-
        Q +  PP PS+ H  Y +MI TAI ALN+ +G+SK AI++ IE  Y  +P A  ALL HHL+ +K +G L+ VK ++ +   P  PP         PP+ 
Subjt:  QLNNPPPAPSLPH--YPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNF-MKPDPNAPPKRGRG---RPPK-

Query:  -----PKTPLPAGAVASP-----PRPRGRPPKAK------DPLA-----------PISQPKKIPSSGRPRGRPPKYP-KPETTAAPVPVAGSGVPRGRGR
                PLP   +AS       R RGRPPKAK       PL            P+S+P++I      + +PP+ P +P+      P    G PR  G 
Subjt:  -----PKTPLPAGAVASP-----PRPRGRPPKAK------DPLA-----------PISQPKKIPSSGRPRGRPPKYP-KPETTAAPVPVAGSGVPRGRGR

Query:  PPKIKPAA
         P +KPAA
Subjt:  PPKIKPAA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.2e-0428.74Show/hide
Query:  SLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNF--------MKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAG
        S P Y EMI  AI  L ++ G+S+ AI K IE  +  LPP F  LL  +L+ +  + +L+ VK +F          P P AP K+      KPK  +   
Subjt:  SLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNF--------MKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAG

Query:  AVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPK
        A  +P + +      K P A +    K+ +  + +    K       A     A +  P+ + RP K
Subjt:  AVASPPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPK

AT3G18035.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein3.0e-1134.03Show/hide
Query:  PAPSLPH--YPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPP----------------KRGR
        P  S+PH  Y EMI  AI ALN+ +G+SK AI++ IE  Y  L  A  ALL HHL+ +K +G L  VK ++     + PP                 R  
Subjt:  PAPSLPH--YPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPP----------------KRGR

Query:  GRPPKPKTPLPAGAVASP-PRPRGRPPKAK-----DPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAA
                P+ +G+ + P  R RGRPPK K      PL  +    ++ ++G+P     +   P     P PV  S   RG GRP K   AA
Subjt:  GRPPKPKTPLPAGAVASP-PRPRGRPPKAK-----DPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCGACGACCAACTCAACAACCCACCTCCGGCGCCCTCTCTCCCTCACTACCCAGAGATGATTATGACGGCGATCGACGCACTAAACGACAAGAACGGGGCGAG
CAAATCGGCGATTACGAAGCAAATCGAGTCCACATACGGCGATCTGCCGCCAGCCTTCACCGCCCTCCTCGGCCACCACTTGGAAGTCATGAAACAAACAGGCCAACTCC
TCTTCGTCAAGAACAACTTCATGAAACCCGATCCAAACGCCCCCCCTAAGCGCGGCCGTGGCCGCCCGCCCAAACCCAAAACCCCTCTCCCGGCCGGCGCCGTCGCGTCG
CCGCCGCGCCCGCGAGGTCGCCCCCCCAAAGCCAAAGATCCACTCGCCCCCATTTCTCAACCCAAGAAAATCCCCTCAAGTGGACGCCCACGTGGCCGCCCTCCGAAATA
CCCTAAACCGGAGACGACGGCGGCGCCGGTTCCCGTCGCCGGTTCCGGTGTGCCACGTGGAAGAGGCCGGCCGCCCAAGATTAAACCGGCCGCCGTTTCTGTTGGGTGCT
GA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTCTTCTTCCCACCAAACCAACAGTGCTTCTCTCTCTCTAAAATCCCACCGCCGCCGCCGTCTCCGCCGCCGCCATGGCCACCGACGACCAACTCAACAACCCACCTCCG
GCGCCCTCTCTCCCTCACTACCCAGAGATGATTATGACGGCGATCGACGCACTAAACGACAAGAACGGGGCGAGCAAATCGGCGATTACGAAGCAAATCGAGTCCACATA
CGGCGATCTGCCGCCAGCCTTCACCGCCCTCCTCGGCCACCACTTGGAAGTCATGAAACAAACAGGCCAACTCCTCTTCGTCAAGAACAACTTCATGAAACCCGATCCAA
ACGCCCCCCCTAAGCGCGGCCGTGGCCGCCCGCCCAAACCCAAAACCCCTCTCCCGGCCGGCGCCGTCGCGTCGCCGCCGCGCCCGCGAGGTCGCCCCCCCAAAGCCAAA
GATCCACTCGCCCCCATTTCTCAACCCAAGAAAATCCCCTCAAGTGGACGCCCACGTGGCCGCCCTCCGAAATACCCTAAACCGGAGACGACGGCGGCGCCGGTTCCCGT
CGCCGGTTCCGGTGTGCCACGTGGAAGAGGCCGGCCGCCCAAGATTAAACCGGCCGCCGTTTCTGTTGGGTGCTGAAAAACAGAGTGCGATGAGAGACAAAGGGATTAGG
TTTGTGTTTAGCTGTGGAAGAGCTCTTCCGTGAATGGCTCTGTTTGTAGTTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTAATTTTGGAAAAAAAAATTAATTTCACTTTTTTATTTTT
TTTCTTTTTCTTATGTGTATTACGTGGCGGGTTCTGTTTGGCTGTAATTCTGGGTGGGGGTTAGAAGACTGTAATTGCATGTAAGTTATTTTACCGGCGGGTTTTTCACT
TTTCTCTCTTTGAAATTCGGTAAAAAAATTGAAATTAGTTTAATTTAATTATTAATGTGGTCACTTTATCTTTTGACGTGGAATTTGATAACTAATTGAGGTAATTAAAA
GTCGTCTTTATCAATCAAATGTTGGTTAGGGATTTTTGTTAGGGGAATATAGAATCGTATTTTATTTTTCATTTTATTCCGTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATDDQLNNPPPAPSLPHYPEMIMTAIDALNDKNGASKSAITKQIESTYGDLPPAFTALLGHHLEVMKQTGQLLFVKNNFMKPDPNAPPKRGRGRPPKPKTPLPAGAVAS
PPRPRGRPPKAKDPLAPISQPKKIPSSGRPRGRPPKYPKPETTAAPVPVAGSGVPRGRGRPPKIKPAAVSVGC