| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0041416.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.3e-128 | 89.72 | Show/hide |
Query: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLGYPL
Subjt: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
Query: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
QVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHLTLN
Subjt: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
Query: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
SEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| KAG7035864.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 6.9e-128 | 89.41 | Show/hide |
Query: LCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGY
L S+ADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPG+G MYN SPY YVGQPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDVAEFFHGLDIVDI+FVHKNGKFTGEG+CVLGY
Subjt: LCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGY
Query: PLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLT
PLQVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKD AEHTG+LR+RGLPYSA KDDILDFFK F LSEDVIHLT
Subjt: PLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLT
Query: LNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
LNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SS ++L++AIARGR
Subjt: LNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| TYJ96136.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.3e-128 | 89.72 | Show/hide |
Query: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLGYPL
Subjt: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
Query: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
QVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHLTLN
Subjt: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
Query: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
SEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| XP_004142112.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F [Cucumis sativus] | 2.4e-128 | 89.06 | Show/hide |
Query: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Y SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLG
Subjt: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Query: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
YPLQVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHL
Subjt: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
Query: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
TLNSEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| XP_022958677.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F-like [Cucurbita moschata] | 6.9e-128 | 89.06 | Show/hide |
Query: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Y S+ADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPG+G MYN SPY YVGQPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDVAEFFHGLDIVDI+FVHKNGKFTGEG+CVLG
Subjt: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Query: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
YPLQVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKD AEHTG+LR+RGLPYSA KDDILDFFK F LSEDVIHL
Subjt: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
Query: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SS ++L++AIARGR
Subjt: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L205 RRM domain-containing protein | 1.1e-128 | 89.06 | Show/hide |
Query: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Y SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLG
Subjt: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Query: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
YPLQVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHL
Subjt: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
Query: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
TLNSEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| A0A1S3BMM3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F | 1.1e-128 | 89.06 | Show/hide |
Query: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Y SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLG
Subjt: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Query: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
YPLQVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHL
Subjt: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
Query: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
TLNSEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| A0A5A7TH86 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H isoform X1 | 2.5e-128 | 89.72 | Show/hide |
Query: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLGYPL
Subjt: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
Query: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
QVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHLTLN
Subjt: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
Query: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
SEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| A0A5D3BB71 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H isoform X1 | 2.5e-128 | 89.72 | Show/hide |
Query: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
SYADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPGSG MYNTSPY YV QPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDV EFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEG+CVLGYPL
Subjt: SYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPL
Query: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
QVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR+APRSKLNDEVKD+AEHTGVLR+RGLPYSA KDDILDFFK F+LSED IHLTLN
Subjt: QVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLN
Query: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
SEGRPSGEAFVEF+NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SSH++L++AI+RGR
Subjt: SEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| A0A6J1H2H4 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F-like | 3.3e-128 | 89.06 | Show/hide |
Query: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Y S+ADGG+GREM AKRQRIV +GSSYYGTSPG+G MYN SPY YVGQPPPFPVVR+RGLPFDC+ETDVAEFFHGLDIVDI+FVHKNGKFTGEG+CVLG
Subjt: YLCSYADGGNGREMSAKRQRIV-EGSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Query: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
YPLQVDFALQRNRQ MGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKD AEHTG+LR+RGLPYSA KDDILDFFK F LSEDVIHL
Subjt: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHL
Query: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELF SS ++L++AIARGR
Subjt: TLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P52597 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F | 2.5e-24 | 32.16 | Show/hide |
Query: VVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVD----ILFVH-KNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR
VV++RGLP+ C DV F I D + F++ + G+ +GE + LG V AL+++R+ MG RY+E+F+S+R E + +
Subjt: VVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVD----ILFVH-KNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR
Query: TAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDL
+ P S ++ + G +R+RGLP+ +K++I+ FF + + I L ++ EG+ +GEAFV+FA+++ ++ A+ K + +G RYIE+F SS +++
Subjt: TAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDL
|
|
| Q60HC3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F | 2.5e-24 | 32.16 | Show/hide |
Query: VVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVD----ILFVH-KNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR
VV++RGLP+ C DV F I D + F++ + G+ +GE + LG V AL+++R+ MG RY+E+F+S+R E + +
Subjt: VVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVD----ILFVH-KNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR
Query: TAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDL
+ P S ++ + G +R+RGLP+ +K++I+ FF + + I L ++ EG+ +GEAFV+FA+++ ++ A+ K + +G RYIE+F SS +++
Subjt: TAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDL
|
|
| Q8C5Q4 G-rich sequence factor 1 | 7.3e-24 | 34.8 | Show/hide |
Query: VVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFV--HKNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR---
VVR+RGLP+ C E D+ +FF GL+IVDI FV ++ + TGE Y P + AL ++R+++G RY+EIF S R E V + SP
Subjt: VVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFV--HKNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGGSPRR---
Query: TAP-----RSKLNDEVK---------------------DNAEHTGVL------RMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFA
T P ++N++++ A G L MRGLP+ A+ DI++FF L I + +S G+ +GEA V F
Subjt: TAP-----RSKLNDEVK---------------------DNAEHTGVL------RMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFA
Query: NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSS
+D+ AAM KDR + RYIELF++S
Subjt: NEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSS
|
|
| Q8SQ27 RNA-binding protein 12 | 1.3e-23 | 34.34 | Show/hide |
Query: VRVRGLPFDCIETDVAEFFHGL--DIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGG------SP
V V G+PF +E DV +FFHGL D V +L H G+ G G P AL+RNR M +RYVE+ + +++ A + F G P
Subjt: VRVRGLPFDCIETDVAEFFHGL--DIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGG------SP
Query: RRTAPRSKLNDEVKDNAEHTG-----VLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIEL
+T PRSK K + + + ++GLP+ A ++DFFK + ED I++ G+ +GE FVEF NE D KAA+ + + +G+R+I++
Subjt: RRTAPRSKLNDEVKDNAEHTG-----VLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIEL
|
|
| Q9NTZ6 RNA-binding protein 12 | 1.3e-23 | 34.34 | Show/hide |
Query: VRVRGLPFDCIETDVAEFFHGL--DIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGG------SP
V V G+PF +E DV +FFHGL D V +L H G+ G G P AL+RNR M +RYVE+ + +++ A + F G P
Subjt: VRVRGLPFDCIETDVAEFFHGL--DIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDARGG------SP
Query: RRTAPRSKLNDEVKDNAEHTG-----VLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIEL
+T PRSK K + + + ++GLP+ A ++DFFK + ED I++ G+ +GE FVEF NE D KAA+ + + +G+R+I++
Subjt: RRTAPRSKLNDEVKDNAEHTG-----VLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIEL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G45100.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.7e-04 | 34.57 | Show/hide |
Query: DNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIH--LTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIEL
+ A T L + L S DI++FFKD +V+H L +NS+G+ +G FVEFA+ +++ A+ K+ L + I L
Subjt: DNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIH--LTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIEL
|
|
| AT3G20890.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.4e-94 | 59.17 | Show/hide |
Query: YADGGNGREMSAKRQRIVE---GSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVG--QPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Y DG +GREM KRQR+++ +YG P SG MYN PYG+V PPPFP VR+RGLPFDC E DV EFFHGLD+VD+LFVH+N K TGE +CVLG
Subjt: YADGGNGREMSAKRQRIVE---GSSYYGTSPGSGLMYNTSPYGYVG--QPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLG
Query: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDAR---------------------------------GGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHT
YPLQVDFALQ+NRQ MGRRYVE+FRS +QEYYKA+ANEV ++R G SPRR R++ +D+ K++ EHT
Subjt: YPLQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANEVFDAR---------------------------------GGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHT
Query: GVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
G+LR+RGLP+SA K+DILDFFKDF LSED +H+T+N EGRP+GEAFVEF N +DS+AAM KDR TLGSRYIELF SS ++LE+A++RGR
Subjt: GVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| AT4G19610.1 nucleotide binding;nucleic acid binding;RNA binding | 5.1e-04 | 27.96 | Show/hide |
Query: VKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPS-GEAFVEFANEQDSKAAMSK-DRMTLGSRYIELFVSSHDDLED
V D+ TG L +R LPY+A+++++++ F F +V HL L+ E + S G A++ + + + AM + D + R + + + H + D
Subjt: VKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTLNSEGRPS-GEAFVEFANEQDSKAAMSK-DRMTLGSRYIELFVSSHDDLED
|
|
| AT5G66010.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.0e-58 | 45.28 | Show/hide |
Query: GGNGREMSAKRQRIVEGSSY--YGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPLQVD
G G E+ +KRQR+++ + Y GT P S P+GY G FPVVR+RGLPF+C + D+ EFF GL+IVD+L V KNGKF+GE + V P+QV+
Subjt: GGNGREMSAKRQRIVEGSSY--YGTSPGSGLMYNTSPYGYVGQPPPFPVVRVRGLPFDCIETDVAEFFHGLDIVDILFVHKNGKFTGEGYCVLGYPLQVD
Query: FALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANE----VFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTL
ALQR+R MGRRYVE+FR ++Q+YY AVA E ++ R P R+K E K+ E+T VL+MRGLPYS +K I++FF + + + + +
Subjt: FALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANE----VFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVIHLTL
Query: NSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
+G+ +GEAFVEF ++++ AM+KD+M++GSRY+ELF ++ ++ A AR R
Subjt: NSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
| AT5G66010.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.4e-32 | 43.04 | Show/hide |
Query: LQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANE----VFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVI
+QV+ ALQR+R MGRRYVE+FR ++Q+YY AVA E ++ R P R+K E K+ E+T VL+MRGLPYS +K I++FF + + + +
Subjt: LQVDFALQRNRQKMGRRYVEIFRSNRQEYYKAVANE----VFDARGGSPRRTAPRSKLNDEVKDNAEHTGVLRMRGLPYSASKDDILDFFKDFSLSEDVI
Query: HLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
+ +G+ +GEAFVEF ++++ AM+KD+M++GSRY+ELF ++ ++ A AR R
Subjt: HLTLNSEGRPSGEAFVEFANEQDSKAAMSKDRMTLGSRYIELFVSSHDDLEDAIARGR
|
|
