CuGenDBv2

Gene ID	Sed0022623
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	LG10:37622290..37638823
RNA-Seq Expression	Sed0022623
Synteny	Sed0022623
Gene Ontology terms	GO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process) GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0005643 - nuclear pore (cellular component) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6575234.1 Nuclear pore complex protein NUP62, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.0e-181

64.41

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        MSGFSFGSSSSQ++SS+SPFSS TT FSFGSTSAFSFGSSP SL  SSSSNP+S                             SSPFSFSL A+S+ +++
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         SS +S  +ASS +GGLSS                                    + +S APL  SA         +F +     SS APL GS+ S+  
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        SP                            S F GA+ SA +S+PS              PLF T                     SS+LFGSNP  +SS
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Query:  S-ATSNLFASSSSS----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAAS
        S +TSNLF SSSSS    PFQ+SFSS+SSQNLSSSSPFA+SSSGFSFS TSLSK TS+T +SSSSS  S+S++ SSFSFG PASSASQSSFGFSI+NAA 
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Query:  STGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSS
        STGGS AP  T  AAKP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A T+  QPSFS+PAFSLSSS AATTLS AASS P T SS   SS TGFGVT TA+SSS
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Query:  AVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQER
        A+ S+S PTK+LT ASSS AP SFGF          TTTSG NASSQ+QTSS  VVASSSSGT ST+++TV+ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQER
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Query:  TGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERE
        TGKFRKQANAIAEWD+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERE
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Query:  LEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        LEQMTE IKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD E LLGQK WMS
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XP_022959228.1 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata]

1.4e-182

65.45

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        MSGFSFGSSSSQ++SS+SPFSS TT FSFGSTSAFSFGSSP SL  SSSSNP+S                             SSPFSFSL A+S+ +++
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Query:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR
         SS +S  +ASS +GGLSS                                    + +S APL  SA         +F +     SS APL GS+ S+  
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Query:  SP--------------SSFLGASTSASSSSPS--------------PLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASSSSS
        SP              S F GA+ SA +S+PS              PLF T                     SS+LFGSNP  +SSS +TSNLF SSSSS
Subjt:  SP--------------SSFLGASTSASSSSPS--------------PLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASSSSS

Query:  ----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAA
            PFQ+SFSS+SSQNLSSSSPFA+SSSGFSFS TSLSK TS+T +SSSSS  S+S++ SSFSFG PASSASQSSFGFSI+NAA STGGS AP  T  A
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Query:  AKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTV
        AKP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A T+  QPSFS+PAFSLSSS AATTLS AASS P T SS   SS TGFGVT TA+SSSA+ S+S PTK+LT 
Subjt:  AKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTV

Query:  ASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEW
        ASSS AP SFGF          TTTSG NASSQ+QTSS  V+ASSSSGT ST+++TV+ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEW
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Query:  DKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQT
        D+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE IKSIIQT
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Query:  LNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        LNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD E LLGQK WMS
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XP_023006514.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima]

1.1e-176

63.37

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSL--SSSSNPAS-----------------------------SSPFSFSLSASSSSSAA
        MSGFSFGSSSSQS+SS+SPFSS TT FSFGSTSAFSFGSSP SL  SSSSNP+S                             SSPFSFSL A+S+ +++
Subjt:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSL--SSSSNPAS-----------------------------SSPFSFSLSASSSSSAA

Query:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR
          S ++  +ASS +GGLSS                                    + +S APL  SA         +F +     SS APL GS+ S+  
Subjt:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR

Query:  SP---------------SSFLGASTSASSSSP---------------------------SPLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSS
        SP                SF  AS+S SSSSP                           +PLF T                     SS+LFGSN   +SS
Subjt:  SP---------------SSFLGASTSASSSSP---------------------------SPLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSS

Query:  S------ATSNLFASSSSS----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSI
        S      +TSNLF SSSSS    PFQ+SFSS+SSQNLSSSSPFA+SSSGFSFS TSLSK TS+T +SSSSS  S+S++ SSFSFG PASSASQSSFGF+I
Subjt:  S------ATSNLFASSSSS----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSI

Query:  TNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGT
        +NAAS  G S AP  T  AAKP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A T+  QPSFS+PAFSLSSS AATTLS AASSAP   SS   SS TGFG+T T
Subjt:  TNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGT

Query:  ASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
        A+SSSA+ S+S PTK+LT ASSS AP SFGF          TTTSG NASSQ+QTSS  VVASSSSGT ST+++TV+ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
Subjt:  ASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA

Query:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE
        ELQERTGKFRKQANAIAEWD+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE
Subjt:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE

Query:  YIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        YIERELEQMTE IKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD E LLGQK WMS
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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

6.5e-172

69.53

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSQSASS-----TSPFSSTTTAFSFGSTSAFS------FGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSL------SASSSSSAASSSFASQTSASSFA
        +S F FG SSS   SS      +P S ++   SFG+ SA        FGS+P S SS      ++P S S       SA SS S+   SF +  SA S  
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Query:  ----GGLSSTPSSTAPLLASATFASPVLPA----------SSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSS-ATSNLF
            G  SS+ SS++P   +A  A    P+          +S+APL G+S+ TA   SS  GAS +AS S        SS+LFGS+P  +SSS +TSNLF
Subjt:  ----GGLSSTPSSTAPLLASATFASPVLPA----------SSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSS-ATSNLF

Query:  ASSSS----SPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAP
         SSSS    SPFQ+SFSS+SSQNLSSSSPFA+SSSGFSFS TSLSK TS+T +SSSSS  S+S++ SSFSFG PASSASQSSFGFSI+NAA STGGS AP
Subjt:  ASSSS----SPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAP

Query:  SATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFP
          T  AAKP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A T+  QPSFS+PAFSLSSS AATTLS AASSAP T SS   SS TGFGVT TA+SSSA+ S+S P
Subjt:  SATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFP

Query:  TKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA
        TK+LT ASSS AP SFGF          TTTSG NASSQ+QTSS  VVASSSSGT ST+++TV+ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA
Subjt:  TKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQA

Query:  NAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENI
        NAIAEWD+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE I
Subjt:  NAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENI

Query:  KSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        KSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD E LLGQK WMS
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XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]

1.3e-177

68.19

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSS--PFSLSSSS----------------NPAS---------------SSPFSFSL-------
        MSG   GSSSSQ +SS+SPFSS +T FSFGSTSAFSFGSS  P SLSSSS                NPAS               SSPFSFSL       
Subjt:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSS--PFSLSSSS----------------NPAS---------------SSPFSFSL-------

Query:  -----------SASSSSSAASSSFASQTSASSFA----GGLSSTPSSTAPLLASATFASPVLPA---------SSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSA
                   SASSS S+ + SF   +S+ S      G L S+ SS+APL  +   A    P+         +S+APL G++S++  SP S L  ++ A
Subjt:  -----------SASSSSSAASSSFASQTSASSFA----GGLSSTPSSTAPLLASATFASPVLPA---------SSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSA

Query:  SSSSPSPLFATS-------SALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASSSS----SPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFA----SSSSGFSFST-SLSKATSLTPSSSS
        +S S S LF TS       SALFGS+P   SSS +TSNLFASSSS    SPFQ+SFSS+SSQNL+SSS FA    SSSSGFSFST SLSK TS+T +SSS
Subjt:  SSSSPSPLFATS-------SALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASSSS----SPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFA----SSSSGFSFST-SLSKATSLTPSSSS

Query:  SS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAA
        SS  ++S++ SSFSFG PASSASQSSFGFSI+NAA STGGS APS T  A KP+SLS S+SVAPLFSTVTTT+ STP AN+  TQPSFSVPAFS SSS+A
Subjt:  SS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAA

Query:  ATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP---------TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTA
        ATTLS AASS P  +SS   SS TGFGVT  ASSSSA+ S+S PTKT T ASSS AP SFGFP         TTTSGF+ASSQ+QTSS  VVASSSSGT 
Subjt:  ATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP---------TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTA

Query:  STITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVE
        ST+ +TV++TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWD+RI+QNRDILLRLEIEVAKVVE+QAELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE
Subjt:  STITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVE

Query:  KDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLA
        +DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE IKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLA
Subjt:  KDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLA

Query:  ATQGPAADHELLLGQKLWMS
        AT+GPAAD E LLGQK WMS
Subjt:  ATQGPAADHELLLGQKLWMS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

6.5e-170

70.81

Show/hide

Query:  SGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSS-------FASQTSASSFAGGLSSTPSSTA
        + F FG+SSS SA+S++P     ++    S S F  GSSP + S  + P+S S  + S  A SSS+  SS+        A  +SA S  GG SS  +S+A
Subjt:  SGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSS-------FASQTSASSFAGGLSSTPSSTA

Query:  PLLASATFASPVLPASSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASS-SSSPFQSSFSSTSSQNLSSSS
        PL  +A  A     ASS + L G+S+  + S +S  G S  +S S+ S LF +S   FG++   TSSS +TSNLFASS SSSPFQSS SS+SSQNL+SSS
Subjt:  PLLASATFASPVLPASSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASS-SSSPFQSSFSSTSSQNLSSSS

Query:  PFASSSSGFSFSTS-LSKATSLTPSSSSSSSSSSTL-----SSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTV
        PFA+S SGFSF TS LSK TS+T   SSSSSSS TL     SSFSFG PASS+SQSSFGFSI NAA STGGS APS T  A KP+SLS S SVAPLFSTV
Subjt:  PFASSSSGFSFSTS-LSKATSLTPSSSSSSSSSSTL-----SSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTV

Query:  TTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP------
        TTT+ASTP A++  TQPSFSVPAFS SSS+AATTLS AASSAP  ASS   SS TGFGVT +ASSSSA+ S+S PTKT T ASSS AP SFGFP      
Subjt:  TTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP------

Query:  ---TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVA
           TTTSGF+ASSQ+QTSSA VVASSSSGT ST+++TV++TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWD+RI+QNRDILLRLEIEVA
Subjt:  ---TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVA

Query:  KVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD
        KVVETQAELE+KLELIETHQQEVDKAL SVE DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE IKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD
Subjt:  KVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLD

Query:  AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAAD E LLGQK WMS
Subjt:  AVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

A0A6J1CMQ9 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2

1.1e-169

69.2

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSQSASST--SPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSSFASQTSASSFAGGL------------
        MSGF FGSSSSQS+SS+  SPFSS ++ F+FGSTS FSFGSSPF  +SSSNP  S  F    SA SS   AS +F +  SA S +G L            
Subjt:  MSGFSFGSSSSQSASST--SPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSSFASQTSASSFAGGL------------

Query:  ---SSTPS-STAPLLASATF----ASPVLPASSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATS-------SALF---------GSNPLPTSSS
            + PS S+A    S++F    A+P   AS+ +   G+SS+   +P S L  +++A+S S SPLF T+       SALF         GSNP  TSS 
Subjt:  ---SSTPS-STAPLLASATF----ASPVLPASSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATS-------SALF---------GSNPLPTSSS

Query:  ATSNLFASS----SSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPF-ASSSSGFSF-STSLSKA-TSLTPSSSSS--SSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAAS
          S LFASS    S+SPFQ+SFSS+SSQNLSSSSPF ASSSSGFSF +TS SKA TS+T SSSSS  +S+S++  SFSFG PASSASQSSFGFS +NAA 
Subjt:  ATSNLFASS----SSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPF-ASSSSGFSF-STSLSKA-TSLTPSSSSS--SSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAAS

Query:  STGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSS
        ST  S AP  T  A KP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A++  TQ SFSVPAFSLSSS AATT+STAASS P  ASS   SS TGFGVT TASSSS
Subjt:  STGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSS

Query:  AVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP---------TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVA-ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE
        A+ S+S PTKTLT +SSS AP SFGFP         TTTSGF+A SQ+QTSS  VVASSSSGT S +++ V+  TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE
Subjt:  AVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP---------TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVA-ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE

Query:  RTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER
        RTGKFRKQANAI +WD+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKAL SVE+DAE IYKDERGLLLD+EAASTRDAMYEQAEYIER
Subjt:  RTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER

Query:  ELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        ELEQMTE IKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AATQGPAAD E LLGQK WMS
Subjt:  ELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP62

2.7e-163

70.89

Show/hide

Query:  FSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSSF-------ASQTSASSFAGGLSSTPSSTAPLL-ASATFASP--VLPASSTA---PLIGSSSSTARSPSS
        F  + ++  +S S F  + S SS+SSA SSSF       ++  SA S  GG+SS  SS+ PL  +SA  A+P   LP +S A    L G++SS+  + S+
Subjt:  FSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSSF-------ASQTSASSFAGGLSSTPSSTAPLL-ASATFASP--VLPASSTA---PLIGSSSSTARSPSS

Query:  FLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSSAT-SNLFASSSSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPF-ASSSSGFSF-STSLSKAT-SLTPSSSSS--SS
          GA  S +S             FGSN   TSSS   ++  +S+S+S FQ+SFSS+SSQ+LSSSSPF ASSSSGFSF +TSLSK T S+T SSSSS  +S
Subjt:  FLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSSAT-SNLFASSSSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPF-ASSSSGFSF-STSLSKAT-SLTPSSSSS--SS

Query:  SSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLS
        +S++ SSFSFG PASSASQSSFGFS +NAA ST  S AP  T  A KP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTPVA++  TQPSFSVPAFSLSSS AATT+S
Subjt:  SSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLS

Query:  TAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP---------TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITS
        TAASS P  ASS   SS TGFGVT TASSSS + S+S PTKTLT ASSS  P SFGFP         TT+SGF+A SQ+QTSS  VVASSSSGT ST+++
Subjt:  TAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFP---------TTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITS

Query:  TVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAER
         V+ TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWD+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKAL SVE+DAER
Subjt:  TVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAER

Query:  IYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGP
        IYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE IKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AATQGP
Subjt:  IYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGP

Query:  AADHELLLGQKLWMS
        AAD E LLGQK WMS
Subjt:  AADHELLLGQKLWMS

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

6.7e-183

65.45

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSL--SSSSNPAS-----------------------------SSPFSFSLSASSSSSAA
        MSGFSFGSSSSQ++SS+SPFSS TT FSFGSTSAFSFGSSP SL  SSSSNP+S                             SSPFSFSL A+S+ +++
Subjt:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSL--SSSSNPAS-----------------------------SSPFSFSLSASSSSSAA

Query:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR
         SS +S  +ASS +GGLSS                                    + +S APL  SA         +F +     SS APL GS+ S+  
Subjt:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR

Query:  SP--------------SSFLGASTSASSSSPS--------------PLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASSSSS
        SP              S F GA+ SA +S+PS              PLF T                     SS+LFGSNP  +SSS +TSNLF SSSSS
Subjt:  SP--------------SSFLGASTSASSSSPS--------------PLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSSS-ATSNLFASSSSS

Query:  ----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAA
            PFQ+SFSS+SSQNLSSSSPFA+SSSGFSFS TSLSK TS+T +SSSSS  S+S++ SSFSFG PASSASQSSFGFSI+NAA STGGS AP  T  A
Subjt:  ----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAA

Query:  AKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTV
        AKP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A T+  QPSFS+PAFSLSSS AATTLS AASS P T SS   SS TGFGVT TA+SSSA+ S+S PTK+LT 
Subjt:  AKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTV

Query:  ASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEW
        ASSS AP SFGF          TTTSG NASSQ+QTSS  V+ASSSSGT ST+++TV+ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEW
Subjt:  ASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEW

Query:  DKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQT
        D+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE IKSIIQT
Subjt:  DKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQT

Query:  LNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        LNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD E LLGQK WMS
Subjt:  LNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

5.5e-177

63.37

Show/hide

Query:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSL--SSSSNPAS-----------------------------SSPFSFSLSASSSSSAA
        MSGFSFGSSSSQS+SS+SPFSS TT FSFGSTSAFSFGSSP SL  SSSSNP+S                             SSPFSFSL A+S+ +++
Subjt:  MSGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSL--SSSSNPAS-----------------------------SSPFSFSLSASSSSSAA

Query:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR
          S ++  +ASS +GGLSS                                    + +S APL  SA         +F +     SS APL GS+ S+  
Subjt:  SSSFASQTSASSFAGGLSS------------------------------------TPSSTAPLLASA---------TFASPVLPASSTAPLIGSSSSTAR

Query:  SP---------------SSFLGASTSASSSSP---------------------------SPLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSS
        SP                SF  AS+S SSSSP                           +PLF T                     SS+LFGSN   +SS
Subjt:  SP---------------SSFLGASTSASSSSP---------------------------SPLFAT---------------------SSALFGSNPLPTSS

Query:  S------ATSNLFASSSSS----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSI
        S      +TSNLF SSSSS    PFQ+SFSS+SSQNLSSSSPFA+SSSGFSFS TSLSK TS+T +SSSSS  S+S++ SSFSFG PASSASQSSFGF+I
Subjt:  S------ATSNLFASSSSS----PFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFS-TSLSKATSLTPSSSSSS--SSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSI

Query:  TNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGT
        +NAAS  G S AP  T  AAKP+SLSFSTSVAPLFSTVTTT+ASTP A T+  QPSFS+PAFSLSSS AATTLS AASSAP   SS   SS TGFG+T T
Subjt:  TNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGT

Query:  ASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
        A+SSSA+ S+S PTK+LT ASSS AP SFGF          TTTSG NASSQ+QTSS  VVASSSSGT ST+++TV+ATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA
Subjt:  ASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGF---------PTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNA

Query:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE
        ELQERTGKFRKQANAIAEWD+RILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL+SVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE
Subjt:  ELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE

Query:  YIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        YIERELEQMTE IKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAAD E LLGQK WMS
Subjt:  YIERELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

G0SBQ3 Nucleoporin NSP1

3.4e-06

28.37

Show/hide

Query:  FSFGSSSSQSASS----------TSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSS--------FASQTSASSFAGG
        FSFG++S   + S          TS F +T++    G+ +   FG S  S S  S   ++S  S +L  ++S+SAA SS        F S+T+ +S AG 
Subjt:  FSFGSSSSQSASS----------TSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSS--------FASQTSASSFAGG

Query:  LSSTPSSTA---PLLASATFASPVLPASSTAPLIGSSSSTARS---PSSFLGASTSASSSSPS-PLFATSSALFGSNPLPTSSSATSNLFASSS------
         S+TP++TA    L  S T  +      ++  L G SS+ ++S    ++     TS S ++P+ PLF +  +   +   PT ++ T+ LF + S      
Subjt:  LSSTPSSTA---PLLASATFASPVLPASSTAPLIGSSSSTARS---PSSFLGASTSASSSSPS-PLFATSSALFGSNPLPTSSSATSNLFASSS------

Query:  -SSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFSTSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPS
         S+P     +S ++Q  SS+  F +  +  S +T+ S A   TP++S+ +S++ TL  F      SSA  +S   S   A++     P   ATA  + P 
Subjt:  -SSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFSTSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPS

Query:  SLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSS
        S S +T+   LFST   TTA+   +    T          L  +  ATT + AASS P   S+          + G+  +S+   +   PT T   AS+S
Subjt:  SLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSS

Query:  PAPTSFGFPTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLR
           T+   P  TSG +A++ T T+       + + TA    STV    +LP  +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + EWD+ +++N + + +
Subjt:  PAPTSFGFPTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLR

Query:  LEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLN-----ANQ
        L     +      E+ER+L  +E+ Q+E+   L+  E++ + +Y  + G    ++AA     R+  Y+ AE +  +L++M +++  +I+ +N      ++
Subjt:  LEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTENIKSIIQTLN-----ANQ

Query:  GGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATQG
        G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Subjt:  GGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATQG

Q75JC9 Uncharacterized protein DDB_G0271670

6.8e-07

41.31

Show/hide

Query:  SGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSSFASQTSASSFAGGLSSTPSSTAPLLASAT
        S  S  SSSS S+SS+S  SS++++ S  S+S+ S  SS  S SSSS+ +SSS  S S S+SSSSS++SSS +S +S+SS +   SS+ SS++   +S++
Subjt:  SGFSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFSFSLSASSSSSAASSSFASQTSASSFAGGLSSTPSSTAPLLASAT

Query:  FASPVLPASSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSSATSNLFASSSSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGF
         +S    +SS++    SSSS++ S SS   +S+S+SSSS S   ++SS+   S+   +SSS++S+  +SSSSS   SS SS+SS + SSSS  +SSSS  
Subjt:  FASPVLPASSTAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSSATSNLFASSSSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGF

Query:  SFSTSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPT
        S S+S S ++S + SSSSSSSSSS+ SS S    +SS+S SS   S ++++SS+  S + S++++++  SS S S+S +   S+ +++++S+  ++++ +
Subjt:  SFSTSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPT

Query:  QPSFS
          S S
Subjt:  QPSFS

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

3.2e-97

51.68

Show/hide

Query:  FSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFS--FSLSASSSSSAASSSF-----------------------ASQTS
        F FG+++S SA + S F S+TT     + S+ + GSSPF   +SS  ++++P S  F   ASS+++ +SS F                       ++  S
Subjt:  FSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFS--FSLSASSSSSAASSSF-----------------------ASQTS

Query:  ASSFAGGLSSTPSSTAPLL---ASATFASPVLPASSTAPLIGSSSS----TARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFAT-SSALFGSNPLPTSSSATSNLFAS
         SS  G  SS  +ST+PL    +SAT A+P    +S+AP  GSSSS    T  SPS     ++SAS SSPS   AT SS  FGS+   +S+ +T +LFAS
Subjt:  ASSFAGGLSSTPSSTAPLL---ASATFASPVLPASSTAPLIGSSSS----TARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFAT-SSALFGSNPLPTSSSATSNLFAS

Query:  SSS-------SPF-QSSFSSTSSQNLS--SSSPFASSSSGFSF--STSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGS
        SSS       SPF  S+F+S+S+ N S  S+SPF S+S+GFSF  ST+ S  +S TPS+   ++SSS  SSFSFG  A+S      GF++     STG S
Subjt:  SSS-------SPF-QSSFSSTSSQNLS--SSSPFASSSSGFSF--STSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGS

Query:  PAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQ----PSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSA
         AP+++ + A  S            +T TTT++STP A + P       + + P+F ++SSA  TT           ASS+   S TGFG+   ASS+ A
Subjt:  PAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQ----PSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSA

Query:  VASVSFPT-----KTLTVASSSPAPT-----SFGFPTTTS-GFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE
          S +  T     KT T ASSS   T     SF  P++TS    A+S   T+   +V  SSSGT ST  + VA +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQE
Subjt:  VASVSFPT-----KTLTVASSSPAPT-----SFGFPTTTS-GFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE

Query:  RTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER
        RTG+FRKQANAIAEWDKRILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LER+LELIETHQQEVDKAL+S+E++AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ER
Subjt:  RTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER

Query:  ELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        ELE MTE I+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A QG   D E L+  K WMS
Subjt:  ELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

2.3e-98

51.68

Show/hide

Query:  FSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFS--FSLSASSSSSAASSSF-----------------------ASQTS
        F FG+++S SA + S F S+TT     + S+ + GSSPF   +SS  ++++P S  F   ASS+++ +SS F                       ++  S
Subjt:  FSFGSSSSQSASSTSPFSSTTTAFSFGSTSAFSFGSSPFSLSSSSNPASSSPFS--FSLSASSSSSAASSSF-----------------------ASQTS

Query:  ASSFAGGLSSTPSSTAPLL---ASATFASPVLPASSTAPLIGSSSS----TARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFAT-SSALFGSNPLPTSSSATSNLFAS
         SS  G  SS  +ST+PL    +SAT A+P    +S+AP  GSSSS    T  SPS     ++SAS SSPS   AT SS  FGS+   +S+ +T +LFAS
Subjt:  ASSFAGGLSSTPSSTAPLL---ASATFASPVLPASSTAPLIGSSSS----TARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFAT-SSALFGSNPLPTSSSATSNLFAS

Query:  SSS-------SPF-QSSFSSTSSQNLS--SSSPFASSSSGFSF--STSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGS
        SSS       SPF  S+F+S+S+ N S  S+SPF S+S+GFSF  ST+ S  +S TPS+   ++SSS  SSFSFG  A+S      GF++     STG S
Subjt:  SSS-------SPF-QSSFSSTSSQNLS--SSSPFASSSSGFSF--STSLSKATSLTPSSSSSSSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGS

Query:  PAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQ----PSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSA
         AP+++ + A  S            +T TTT++STP A + P       + + P+F ++SSA  TT           ASS+   S TGFG+   ASS+ A
Subjt:  PAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQ----PSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPLTASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSA

Query:  VASVSFPT-----KTLTVASSSPAPT-----SFGFPTTTS-GFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE
          S +  T     KT T ASSS   T     SF  P++TS    A+S   T+   +V  SSSGT ST  + VA +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQE
Subjt:  VASVSFPT-----KTLTVASSSPAPT-----SFGFPTTTS-GFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQE

Query:  RTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER
        RTG+FRKQANAIAEWDKRILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LER+LELIETHQQEVDKAL+S+E++AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ER
Subjt:  RTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIER

Query:  ELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS
        ELE MTE I+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A QG   D E L+  K WMS
Subjt:  ELEQMTENIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

Sequences

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CDS sequence

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ATGTCTGGGTTCTCATTTGGATCTTCGTCCTCCCAATCGGCTTCTTCTACTTCGCCATTTTCGTCCACAACCACTGCTTTCTCTTTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTT
TGGATCTTCCCCTTTCTCCCTCTCTTCCTCCTCCAACCCCGCCTCTTCCTCTCCCTTCTCCTTTTCCCTCTCCGCCTCTTCTTCATCCTCTGCAGCTTCCTCTTCTTTCG
CCTCTCAGACTTCGGCCTCCTCGTTCGCCGGAGGCCTCTCTTCTACCCCTTCTTCCACTGCCCCATTGCTTGCTTCTGCAACTTTCGCCTCCCCTGTTCTTCCGGCTTCT
TCTACTGCACCATTGATTGGCTCGTCTTCTTCCACTGCAAGATCGCCCTCATCCTTTCTCGGCGCTTCTACATCTGCTTCCAGTTCTAGCCCCTCCCCACTGTTCGCCAC
ATCTTCAGCTCTCTTCGGCTCTAATCCCTTGCCTACTTCTTCTTCCGCCACTTCTAACTTGTTTGCGTCATCTTCTTCATCTCCTTTCCAGAGCTCTTTCTCTTCGACTT
CTTCCCAGAATTTGAGTTCCTCTTCGCCATTTGCCTCGTCTTCTTCTGGGTTTTCCTTTTCGACTTCTTTGTCCAAAGCTACTAGTCTTACCCCTTCATCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCATCATCTACTTTGTCGAGCTTCTCATTTGGACCTCCTGCTTCGTCTGCTTCTCAATCTTCTTTTGGCTTTAGTATTACCAATGCGGCATCATCCACGGGGGG
TTCTCCTGCTCCGTCTGCGACCGCTGCAGCTGCAAAGCCTTCTTCTCTGTCGTTTTCTACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACTGTTACGACCACCACTGCTTCTACTC
CAGTTGCTAACACCAACCCAACCCAACCATCCTTCTCGGTACCCGCTTTTAGTTTGAGCTCTTCCGCTGCTGCGACTACCTTGTCGACAGCAGCATCTTCCGCTCCCTTG
ACTGCTTCCTCGAGCGTCCAGAGTTCCCTTACAGGTTTTGGTGTCACAGGCACGGCTTCATCGTCGAGTGCTGTTGCTTCCGTATCGTTTCCAACCAAAACGTTGACTGT
TGCTTCATCATCGCCAGCCCCCACCTCTTTCGGTTTCCCTACCACGACGTCTGGTTTTAATGCTTCAAGTCAGACTCAGACTTCATCAGCTCCTGTTGTAGCAAGTAGTA
GTAGCGGTACAGCTTCAACTATTACCTCTACAGTGGCTGCCACACCTAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATCAAGGAATGGAATGCAGAG
CTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGACAAGAGGATTTTGCAAAATCGTGATATCCTCCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGC
CAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGCTGGAGAGGAAATTGGAGCTGATTGAAACTCACCAGCAAGAGGTTGATAAGGCTTTGGAAAGCGTTGAAAAAGATGCCGAGCGCA
TTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGATGAAGCAGCCTCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATACATAGAGCGGGAGCTGGAGCAGATGACAGAA
AATATTAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGCTGGATGCAGTTGTTCGAATTTTAAACAACCAATT
AAGTTCATTAATGTGGATTGACGAAAAGGCTGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAAAAGCTTGCTGCTACCCAAGGTCCAGCAGCAGATCATGAATTATTGCTGGGTCAGA
AGTTATGGATGTCTTAA

mRNA sequence

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TCCATCCCTTCCGGTGACCGGCGCAACCACGACGTGAGTAACGGCTGAGTTCTGTGGAAGAGGAGAGGGCGGCATTCGAGGTAGTTAGCCAAATTAAACCTAACTTCCGG
CAGAGATCGACGTTGAATCGAGATGTCTGGGTTCTCATTTGGATCTTCGTCCTCCCAATCGGCTTCTTCTACTTCGCCATTTTCGTCCACAACCACTGCTTTCTCTTTCG
GATCCACCTCCGCCTTCTCCTTTGGATCTTCCCCTTTCTCCCTCTCTTCCTCCTCCAACCCCGCCTCTTCCTCTCCCTTCTCCTTTTCCCTCTCCGCCTCTTCTTCATCC
TCTGCAGCTTCCTCTTCTTTCGCCTCTCAGACTTCGGCCTCCTCGTTCGCCGGAGGCCTCTCTTCTACCCCTTCTTCCACTGCCCCATTGCTTGCTTCTGCAACTTTCGC
CTCCCCTGTTCTTCCGGCTTCTTCTACTGCACCATTGATTGGCTCGTCTTCTTCCACTGCAAGATCGCCCTCATCCTTTCTCGGCGCTTCTACATCTGCTTCCAGTTCTA
GCCCCTCCCCACTGTTCGCCACATCTTCAGCTCTCTTCGGCTCTAATCCCTTGCCTACTTCTTCTTCCGCCACTTCTAACTTGTTTGCGTCATCTTCTTCATCTCCTTTC
CAGAGCTCTTTCTCTTCGACTTCTTCCCAGAATTTGAGTTCCTCTTCGCCATTTGCCTCGTCTTCTTCTGGGTTTTCCTTTTCGACTTCTTTGTCCAAAGCTACTAGTCT
TACCCCTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATCATCTACTTTGTCGAGCTTCTCATTTGGACCTCCTGCTTCGTCTGCTTCTCAATCTTCTTTTGGCTTTAGTATTACCA
ATGCGGCATCATCCACGGGGGGTTCTCCTGCTCCGTCTGCGACCGCTGCAGCTGCAAAGCCTTCTTCTCTGTCGTTTTCTACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACTGTT
ACGACCACCACTGCTTCTACTCCAGTTGCTAACACCAACCCAACCCAACCATCCTTCTCGGTACCCGCTTTTAGTTTGAGCTCTTCCGCTGCTGCGACTACCTTGTCGAC
AGCAGCATCTTCCGCTCCCTTGACTGCTTCCTCGAGCGTCCAGAGTTCCCTTACAGGTTTTGGTGTCACAGGCACGGCTTCATCGTCGAGTGCTGTTGCTTCCGTATCGT
TTCCAACCAAAACGTTGACTGTTGCTTCATCATCGCCAGCCCCCACCTCTTTCGGTTTCCCTACCACGACGTCTGGTTTTAATGCTTCAAGTCAGACTCAGACTTCATCA
GCTCCTGTTGTAGCAAGTAGTAGTAGCGGTACAGCTTCAACTATTACCTCTACAGTGGCTGCCACACCTAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGAT
CATCAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACTGGAAAGTTTCGGAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGACAAGAGGATTTTGCAAAATCGTGATATCCTCC
TTAGACTTGAGATTGAAGTTGCCAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGCTGGAGAGGAAATTGGAGCTGATTGAAACTCACCAGCAAGAGGTTGATAAGGCTTTGGAAAGC
GTTGAAAAAGATGCCGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGATGATGAAGCAGCCTCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATACATAGAGCG
GGAGCTGGAGCAGATGACAGAAAATATTAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGAGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGCTGGATGCAGTTG
TTCGAATTTTAAACAACCAATTAAGTTCATTAATGTGGATTGACGAAAAGGCTGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAAAAGCTTGCTGCTACCCAAGGTCCAGCAGCAGAT
CATGAATTATTGCTGGGTCAGAAGTTATGGATGTCTTAATCTGTAAGCTGCTGCTTTTTTATTTGATTGTTGTGAAGATTCTTTGATTTTGAGTGTACACCACAGGCTAC
ATACACAACTCTGGTATTACTTTGTTTTTAGACCTAATAGATTCATGTTTAAATTTACTGCCTTCTAGATGAAACATAGATACTTAAATCTGTAGTTCCCACAGGCTGTT
TGAACTAAAATAGAAAAAACCTATTAGCATGCTATATTTGTTCCCACAGGGTTCCTTATTTGTTTTTGTTGAAGCATATTACTATAAATGATGCAACATTGGAATTA

Protein sequence

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STAPLIGSSSSTARSPSSFLGASTSASSSSPSPLFATSSALFGSNPLPTSSSATSNLFASSSSSPFQSSFSSTSSQNLSSSSPFASSSSGFSFSTSLSKATSLTPSSSSS
SSSSSTLSSFSFGPPASSASQSSFGFSITNAASSTGGSPAPSATAAAAKPSSLSFSTSVAPLFSTVTTTTASTPVANTNPTQPSFSVPAFSLSSSAAATTLSTAASSAPL
TASSSVQSSLTGFGVTGTASSSSAVASVSFPTKTLTVASSSPAPTSFGFPTTTSGFNASSQTQTSSAPVVASSSSGTASTITSTVAATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAE
LQERTGKFRKQANAIAEWDKRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALESVEKDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTE
NIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATQGPAADHELLLGQKLWMS

Sed0022623 (gene) of Chayote v1 genome