; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0022735 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0022735
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationLG03:504358..505881
RNA-Seq ExpressionSed0022735
SyntenySed0022735
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008458887.1 PREDICTED: CASP-like protein 4D1 [Cucumis melo]3.4e-4572.37Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKM TKIAS VLRVLTFV L +SIIVL T++ K  G  E HF++VNSY+YAMATII+GGAFNLLQIALALYRLVTKTD +ILF+FYGDKVLSY LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
        AAAALG  +DLKA+   +  S +DQGN AAALLLL+F CSA++SVLSSLA+S
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS

XP_022992769.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita maxima]9.3e-4370.51Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKMGTKIAS VLRVLTFV L ISIIVL T T K  G  +  F++VNSY++AMATII+GGAFNLLQIALALYRL+TKTD  +LF+F+GDKVLSY LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST
        AAAALG  IDLKA+   +  S +DQGN AAALLLL+F CSAVVSVLSS A+S   T
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST

XP_023551429.1 CASP-like protein 4D1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-4269.87Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M  KMGTKIAS VLRVLTFV L ISIIVL T T K  G  +  F++VNSY++AMATII+GGAFNLLQIALALYRL+TKTD  +LF+F+GDKVLSY LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST
        AAAALG  IDLKA+   +  S +DQGN AAALLLL+F CSAVVSVLSS A+S   T
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST

XP_031741109.1 CASP-like protein 4D1 isoform X1 [Cucumis sativus]2.6e-4571.05Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKMGTKIAS VLRVL F  L ISIIVL T++ K  G +E HF++VNSY++AMATII+GGAFNLLQIAL+LYRL+TKTD +ILF+FYGDK+LSY+LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
        AAAALG  IDLKA+ S  ++S +DQGN AAALLLL+F CSA++SVLSSLA+S
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS

XP_038877615.1 CASP-like protein 4D1 [Benincasa hispida]1.3e-4774.19Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKMG+KIAS+VLRV+TFV L ISIIVLAT++ K  G A+ HF++VNSY+YA+ TII+GGAFNLLQIALALYRLVTKTD N+LF+FYGDKVLSY+LLSG
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNS
        AAAALG GIDLKA+   V AS +D GN  AALLLL+FFCSAVVSVLSSLA+S  +
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C911 CASP-like protein1.7e-4572.37Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKM TKIAS VLRVLTFV L +SIIVL T++ K  G  E HF++VNSY+YAMATII+GGAFNLLQIALALYRLVTKTD +ILF+FYGDKVLSY LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
        AAAALG  +DLKA+   +  S +DQGN AAALLLL+F CSA++SVLSSLA+S
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS

A0A6J1BZ60 CASP-like protein1.0e-3965.54Show/hide
Query:  MGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAAAA
        MG+KIAS+VLRV+TFV LFISIIVLAT++         HF++VNSY++AMATII+GGAFNLLQIAL+LY +++K+  N+LF FYGDKVLSY+LLSGAAA 
Subjt:  MGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAAAA

Query:  LGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
        LGGGIDL A+  G+  S + +GN AAALLL++F CSA +S+LSSLA+S
Subjt:  LGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS

A0A6J1C1A4 CASP-like protein5.2e-3150.94Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKV----PGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYL
        MAA  G++IAS++LR+LTFVL+FIS++++AT++  V       A+  F DV SY+Y  A  ++G A +LLQIAL LY +VTK+D    F+ + DK+L+YL
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKV----PGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYL

Query:  LLSGAAAALGGGIDLKAH----KSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI
        LLSGA+A LG GIDL+++       +F S +D+G+ +AA+LLL+F CSAVVS+LSSLA+
Subjt:  LLSGAAAALGGGIDLKAH----KSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI

A0A6J1FMS6 CASP-like protein1.7e-4269.23Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKMGTKIAS VLRVLTFV L ISIIVL T T K  G  +  F++VNSY++AMATII+GGAFNLLQIALALYRL+TK+D  +LF+F+GDKVLSY LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST
        AAAALG  IDLKA+   +  S +DQGN AAALLLL+F CSA+VSVLSS A+S   T
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST

A0A6J1JYE7 CASP-like protein4.5e-4370.51Show/hide
Query:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG
        M AKMGTKIAS VLRVLTFV L ISIIVL T T K  G  +  F++VNSY++AMATII+GGAFNLLQIALALYRL+TKTD  +LF+F+GDKVLSY LL+G
Subjt:  MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSG

Query:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST
        AAAALG  IDLKA+   +  S +DQGN AAALLLL+F CSAVVSVLSS A+S   T
Subjt:  AAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1XGB4 CASP-like protein PIMP12.7e-1639.73Show/hide
Query:  SIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTH---KVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKT----DENILFNFYGDKVLSYLLLSGAAA
        S+++R+LT + L IS IV+AT+      V G  +  F D  +Y+Y +AT+I+G A+ LLQIA ++  L T      +  +LF+FYGDK +SY L++GAAA
Subjt:  SIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTH---KVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKT----DENILFNFYGDKVLSYLLLSGAAA

Query:  ALGGGIDLK-AHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSS
        + G   DLK    S  ++   +  N AA+L L+ FF +   S+ SS
Subjt:  ALGGGIDLK-AHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSS

B9NBE5 CASP-like protein 4D15.7e-1939.38Show/hide
Query:  AAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVP-GYAE--GHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRL------VTKTDENILFNFYGDKV
        A  M +++ ++ LRVLTF  L +S++++ T+T  +  G  E      D  SY+Y +A I  G  + +LQIAL L  +       T  D N++F+FYGDKV
Subjt:  AAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVP-GYAE--GHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRL------VTKTDENILFNFYGDKV

Query:  LSYLLLSGAAAALGGGIDLKAHKSGVFA-SLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI
        +SY+L +GAAAA G   +LK   +G+     +++G  +A+LLLL F C+A++SV SS A+
Subjt:  LSYLLLSGAAAALGGGIDLKAHKSGVFA-SLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI

B9SXY8 CASP-like protein 4D14.2e-2240.13Show/hide
Query:  MGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVP---GYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT-----KTDENILFNFYGDKVLSYL
        + +++A+++LR+LTF+ L  S+++L T+T  +       + HF DV +Y+Y +ATI++G A+ +LQIA  LY + T       D N+ F+F+GDKV+SY+
Subjt:  MGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVP---GYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT-----KTDENILFNFYGDKVLSYL

Query:  LLSGAAAALGGGIDLKA--HKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI
        L++GAAA      D+K     SG F +  ++G  +A+LLL+ F C+AV+SV SS A+
Subjt:  LLSGAAAALGGGIDLKA--HKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI

C6T1Z6 CASP-like protein 4D12.2e-1838.85Show/hide
Query:  AAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLA--TSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT-----KTDENILFNFYGDKVLS
        ++  G++   ++LRVLTFV L I++I++A    T    G  E  F D+ +Y+Y ++TII+G A+NLLQ+AL+++ +V+       D   LF+F+GDK++S
Subjt:  AAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLA--TSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT-----KTDENILFNFYGDKVLS

Query:  YLLLSGAAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI
        YLL+SG+AA  G G+ ++  +     S  D+ N +A+LLL++F  +AV S  +S A+
Subjt:  YLLLSGAAAALGGGIDLKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAI

D7LD59 CASP-like protein 4D26.5e-1535.44Show/hide
Query:  KIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEG---HFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT--KTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAA
        K++ ++LRVLT V L I++I+L+T++  +         HF DV +Y+Y ++  ++G  + ++Q+   +    T  K   N   +FYGDK++SYL+ +G+A
Subjt:  KIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEG---HFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT--KTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAA

Query:  AALGGGIDLKAHKSGVFA--------SLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
        A  G   DLK     + A          + +G  +A+LLL SF C AV+SV SSLAI+
Subjt:  AALGGGIDLKAHKSGVFA--------SLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39518.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.5e-1433.54Show/hide
Query:  KIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEG---HFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT--KTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAA
        K+  ++LRVLT V L I++I+L+T++  +         HF DV +Y+Y ++  ++G  + ++Q+   +    T  K   N   +FYGDK++SYL+ +G+A
Subjt:  KIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEG---HFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVT--KTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAA

Query:  AALGGGIDLKAHKSGVFA--------SLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
        A  G   DLK     + A          + +G  +A+LLL +F C AV+SV SS A++
Subjt:  AALGGGIDLKAHKSGVFA--------SLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS

AT2G39530.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)2.4e-1233.12Show/hide
Query:  IVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEG---HFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENIL--FNFYGDKVLSYLLLSGAAAALG
        ++LRVLT   L I++++++T+T  +   +      F DV +Y+Y ++  ++G  + ++Q+ L + +  T     +   F+FYGDKV+SYLL +G+AA  G
Subjt:  IVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEG---HFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENIL--FNFYGDKVLSYLLLSGAAAALG

Query:  GGIDLK--------AHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS
           DLK           +      + +G  +A+LLL +F   AV+SV SSLA+S
Subjt:  GGIDLK--------AHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAIS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCAAAAATGGGAACAAAAATTGCTTCTATTGTGCTTAGAGTTCTCACTTTTGTTTTACTCTTCATTTCTATTATAGTTCTTGCAACCAGTACTCATAAAGTTCC
AGGATATGCAGAAGGTCATTTCTATGATGTCAATTCCTACAAGTATGCCATGGCAACCATCATCCTTGGAGGTGCATTTAACCTCTTGCAAATTGCCTTGGCACTTTATC
GTCTTGTGACCAAAACCGACGAGAATATTTTATTCAACTTCTATGGTGATAAGGTATTGTCGTACTTGCTGCTGTCGGGAGCTGCGGCGGCGCTCGGTGGTGGAATAGAC
TTGAAGGCGCACAAGTCGGGCGTGTTTGCATCGTTGTACGACCAGGGCAACGGTGCTGCGGCTCTTCTTCTTCTATCATTTTTCTGCAGTGCTGTCGTCTCTGTGCTTTC
CTCTTTGGCCATTTCTACTAATTCTACAATACCTAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTACCCAAAATGGCAGCAAAAATGGGAACAAAAATTGCTTCTATTGTGCTTAGAGTTCTCACTTTTGTTTTACTCTTCATTTCTATTATAGTTCTTGCAACCAGTACT
CATAAAGTTCCAGGATATGCAGAAGGTCATTTCTATGATGTCAATTCCTACAAGTATGCCATGGCAACCATCATCCTTGGAGGTGCATTTAACCTCTTGCAAATTGCCTT
GGCACTTTATCGTCTTGTGACCAAAACCGACGAGAATATTTTATTCAACTTCTATGGTGATAAGGTATTGTCGTACTTGCTGCTGTCGGGAGCTGCGGCGGCGCTCGGTG
GTGGAATAGACTTGAAGGCGCACAAGTCGGGCGTGTTTGCATCGTTGTACGACCAGGGCAACGGTGCTGCGGCTCTTCTTCTTCTATCATTTTTCTGCAGTGCTGTCGTC
TCTGTGCTTTCCTCTTTGGCCATTTCTACTAATTCTACAATACCTAAGTAGTTTTTTTTTTAATCTTGAAAATCCATACGACAATCTTTCTTCTTATTCTGTTTTATTAA
ATTATTTGGTTGTGGTGTGATAATCGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKMGTKIASIVLRVLTFVLLFISIIVLATSTHKVPGYAEGHFYDVNSYKYAMATIILGGAFNLLQIALALYRLVTKTDENILFNFYGDKVLSYLLLSGAAAALGGGID
LKAHKSGVFASLYDQGNGAAALLLLSFFCSAVVSVLSSLAISTNSTIPK