; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0023102 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0023102
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationLG03:1296996..1297792
RNA-Seq ExpressionSed0023102
SyntenySed0023102
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]7.1e-4696.88Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]1.1e-4393.75Show/hide
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XP_022993699.1 mini zinc finger protein 2 [Cucurbita maxima]4.3e-4392.71Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]5.1e-4494.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor2.1e-4395.65Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 23.4e-4696.88Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 23.4e-4696.88Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like5.5e-4493.75Show/hide
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A0A6J1K0U7 mini zinc finger protein 22.1e-4392.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 11.5e-2271.43Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GG+AVDGCREFMASG EGT AAL CAACGCHR+FHRR+V      CDCSS  S+ T
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 32.1e-2461.7Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +    ALTCAACGCHRNFHRR+V TE+VC+ S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 11.5e-2271.43Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 12.5e-2557.73Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          + +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT  AL CAACGCHRNFHR++V TE+VC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 23.1e-3679.38Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger1.5e-2561.7Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.8e-2657.73Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 22.2e-3779.38Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 281.5e-1765.45Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 228.7e-1869.23Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT  AL CAACGCHRNFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGCCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCTTCAAGAGACACTGTGGCTTCATCCTTCACAGTAAGAAGTGTTAGATATGGAGAGTGCCAAAAGAATCA
TGCCGCCGGGGTCGGAGGGTACGCTGTCGATGGGTGTCGGGAATTCATGGCGAGCGGGGACGAAGGGACGACGGCTGCACTCACCTGCGCCGCCTGCGGTTGCCATCGAA
ACTTCCATAGAAGACAAGTTGGAACTGAGATTGTCTGTGATTGTTCTTCATCTCCCTCAAATGAAACTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACACAACCCTTCAAATTTGTGATCTATTATTCATTTTTCTTCAACCCCATTGCCAAAAATTGAAGCTTTTCTTTGTGTAAAACAAGACCTAGCTAATTACAACAAAAAG
GAAGAAACTTTTTTTTTCTTTTGGAGCTCAAAGAAAAAAAATGAGGAAGCGCCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCTTCAAGAGACACTGTGGCTTCATCCTTCA
CAGTAAGAAGTGTTAGATATGGAGAGTGCCAAAAGAATCATGCCGCCGGGGTCGGAGGGTACGCTGTCGATGGGTGTCGGGAATTCATGGCGAGCGGGGACGAAGGGACG
ACGGCTGCACTCACCTGCGCCGCCTGCGGTTGCCATCGAAACTTCCATAGAAGACAAGTTGGAACTGAGATTGTCTGTGATTGTTCTTCATCTCCCTCAAATGAAACTTG
AAGATTACTCAGACTATAACTTCAAATTCTTGTAAGGGTTTTTTTTTGGGTGCTGAATAAGCAAATTTTCTGCTTGAGAGTTGAGATTCTGCTTGTTGTGTTGCTTGATT
TTTTTTTTTTTTTTTGGGTGTTGGGTGAGCTTGGATTTGAACTGCAATTATGTGTATTGAACTATCTTTGCATTACTGGTTCTTGATGAAAAGGGCAAGAACAAGAGAGT
GGAGTGTTTTATTTTTATTTTTATCTTAAAATTTCATCTGAGGATTACAATTTATGTAAAATTTGTTCATGATCATATCCCTTTTGAATTATCTGTATGGGAGTGTATCA
ATCTTTTGGAGATTGGAAGTAATAGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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