| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004134179.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis sativus] | 7.6e-108 | 87.9 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG SYRR SP RSPRRR+ SYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSIS SRSPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSP+PK+N RSPRE DNARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_022137875.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Momordica charantia] | 7.6e-108 | 89.11 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDR+ SRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLRTPFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG SYRR SP RSPRRR+ SYSRSPSPAR SRNRGARD+Y SPARSRSISRSRSP
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSPSPKEN RSPRE D RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_022955785.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita moschata] | 1.3e-107 | 87.9 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M ++RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG S RR SP RSPRRR+HSYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSISRS SPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSP+PKEN RSPR D ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 1.3e-107 | 88.31 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG S RR SP RSPRRR+HSYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSISRS SPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSP+PKEN RSPR D ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida] | 1.5e-108 | 88.71 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKR+DDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG SYRR SP RSPRRR+ SYSRSPSPAR SR+RGAR++Y SPARSRSISRSRSPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSP+PKEN RSPRE DNARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 8.2e-108 | 87.5 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG SYRR SP RSPRRR+ SYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSIS SRSPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
++DYSRSP+PK+N RSPRE DNARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.6e-106 | 87.35 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG SYRR SP RSPRRR+ SYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSIS SRSPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSY
++DYSRSP+PK+N RSPRE DNARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSY
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.7e-108 | 89.11 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDR+ SRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLRTPFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG SYRR SP RSPRRR+ SYSRSPSPAR SRNRGARD+Y SPARSRSISRSRSP
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSPSPKEN RSPRE D RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 6.3e-108 | 87.9 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M ++RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG S RR SP RSPRRR+HSYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSISRS SPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSP+PKEN RSPR D ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 6.3e-108 | 88.31 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R+RSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+R SRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDAR EDLR PFERFGP+KDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS SSG S RR SP RSPRRR+HSYSRSPSPAR SR+RGARD+Y SPARSRSISRS SPR
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRG
Query: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
+RDYSRSP+PKEN RSPR D ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: KRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 6.1e-60 | 63.56 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R R S RD S PSGLL+RNLPLDAR DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSG--SSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGAR-DDYYSP-ARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SG Y+R S RSPRRR+ S+SRS SP R SR+ R DD YSP RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSG--SSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGAR-DDYYSP-ARSRSISRSR
Query: SPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
PR +R+Y N RSPRE + + RS R +SRS S S SR
Subjt: SPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.6e-20 | 41.26 | Show/hide |
Query: SGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRVTSH
+ L V NL + LR FE++G + DVY+P++ YT E RGF FV+F DA +A ++ V+ GRE+R+ A +R+ P R
Subjt: SGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRVTSH
Query: SSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSR
G Y R S RSPRRR S SRS S +R SR+R +R S +RSR+ SRSRS R RS S + R +RSRSRSP VS+ S SR
Subjt: SSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSR
Query: SRSYSP
SRS SP
Subjt: SRSYSP
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 2.4e-32 | 44.79 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
YSP RR RGR PR + G RR + LLVRN+PLD R E+LR PFERFGP++DVY+P++YY+G+PRGF FV+F A DA EA++
Subjt: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
Query: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHS-----SGSSYRRH--------SPGRSPRR------RHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRS
+N GREI +V A E+RK P+EMRV + + SGS R H S RSPRR R+ S S SP+P R G RG D+ YS RS S
Subjt: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHS-----SGSSYRRH--------SPGRSPRR------RHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRS
Query: ISRSRSPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRS--YSPR
+ D R+ +N + A R R RAVSRSPSGSRSRS SPR
Subjt: ISRSRSPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRS--YSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 1.9e-37 | 48.79 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P SPPR GR+ PR R GSR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGP+KD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRGK---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR T G S R RSP R YSRSP P R G R+R Y SP R SRS SP+ +
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRGK---
Query: --RDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSP
R YSRSP + +S SRSPR RS S ++RSY+P
Subjt: --RDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSP
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 2.5e-37 | 48.08 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGP+KD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPR-----GK
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR G R R R++S SRSP P R SR+R DYYSP R RS SPR G+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPR-----GK
Query: RDYSRSPSP-------------KENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
R YSRSP+ K S SP RS SRSPR SRSPS R+RS SPR
Subjt: RDYSRSPSP-------------KENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.8e-38 | 48.08 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGP+KD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPR-----GK
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR G R R R++S SRSP P R SR+R DYYSP R RS SPR G+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPR-----GK
Query: RDYSRSPSP-------------KENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
R YSRSP+ K S SP RS SRSPR SRSPS R+RS SPR
Subjt: RDYSRSPSP-------------KENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 8.2e-36 | 46.31 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGP+KD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPR-----GK
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR G R R R++S SRSP P R SR+R DYYSP R RS SPR G+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPR-----GK
Query: RDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSP-RAVSRSPSGSRSRS
R YSRSP+ +D +R RS +P R SRS S ++ +
Subjt: RDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSP-RAVSRSPSGSRSRS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 7.5e-37 | 46.32 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGP+KD+YLP++YYTG +PRGFG
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
Query: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISR
FV+F DAA+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR GS +R R R++S SRSP P R SR+R DYYSP R R
Subjt: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISR
Query: SRSPR-----GKRDYSRSPSP-------------KENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
S SPR G+R YSRSP+ K S SP RS SRSPR SRSPS R+RS SPR
Subjt: SRSPR-----GKRDYSRSPSP-------------KENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.4e-38 | 48.79 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P SPPR GR+ PR R GSR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGP+KD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRGK---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR T G S R RSP R YSRSP P R G R+R Y SP R SRS SP+ +
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSGSSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGARDDYYSPARSRSISRSRSPRGK---
Query: --RDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSP
R YSRSP + +S SRSPR RS S ++RSY+P
Subjt: --RDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 4.3e-61 | 63.56 | Show/hide |
Query: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M R RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R R S RD S PSGLL+RNLPLDAR DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MPRHRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRGSRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARTEDLRTPFERFGPIKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSG--SSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGAR-DDYYSP-ARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SG Y+R S RSPRRR+ S+SRS SP R SR+ R DD YSP RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSHSSG--SSYRRHSPGRSPRRRHHSYSRSPSPARLGSRNRGAR-DDYYSP-ARSRSISRSR
Query: SPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
PR +R+Y N RSPRE + + RS R +SRS S S SR
Subjt: SPRGKRDYSRSPSPKENSRSPREADNARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
|
|
