CuGenDBv2

Gene ID	Sed0023255
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	60S ribosomal protein L12
Genome location	LG02:44329809..44330619
RNA-Seq Expression	Sed0023255
Synteny	Sed0023255
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_002281255.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L12 [Vitis vinifera]

7.4e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIA+IMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

1.9e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

5.6e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

2.5e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

XP_038900338.1 60S ribosomal protein L12-3 [Benincasa hispida]

4.3e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIA+IMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A438H6L2 60S ribosomal protein L12

3.6e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIA+IMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

A0A6J1F4X7 60S ribosomal protein L12-1-like

9.4e-84

98.19

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

A0A6J1GE12 60S ribosomal protein L12-3

2.7e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

9.4e-84

98.19

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

A0A6J1KW77 60S ribosomal protein L12-3

2.7e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

1.0e-79

91.57

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        H+G+ISLDDVIEIA+IM+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

6.1e-64

72.29

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDP++V  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKLT+QNRQA VSVVPSA+ALVIK+LKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI +G++EIPQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

1.8e-79

89.16

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

5.1e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA+IMRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI  GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

3.9e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.3e-80

89.16

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

2.8e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

3.7e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA+IMRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI  GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCGCCGAAGTTCGACCCGAGTCAAGTGGTGGACGTGTTCGTCCGCGTCACCGGCGGCGAGGTCGGAGCCGCAAGTTCTCTGGCTCCGAAGATCGGTCCGCTCGGTCT
TTCCCCGAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAAGAGACCGCCAAGGAATGGAAAGGCCTTAGGGTTACGGTTAAGCTCACCGTCCAGAATCGCCAGGCGAAGGTCTCCG
TCGTTCCCTCGGCGGCGGCGTTGGTGATCAAGTCGTTGAAGGAGCCGGAGCGTGACCGGAAGAAGACGAAGAACATCAAGCACAATGGCAACATTTCTCTTGACGATGTG
ATCGAGATCGCTAGGATTATGCGGCCGAGATCCATGGCTAAGGATCTGTCTGGCTCTGTTAAGGAGATTCTTGGAACCTGCGTTTCTGTGGGCTGTACTGTGGATGGGAA
GGACCCTAAGGATCTTCAACAGGAGATTGCTGATGGCGACGTCGAAATTCCCCAAGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTTATGCTCTGTTAGGTCAAATCTCTGTGTGGAATCTCTCGCCGCCGAACCATGCCGCCGAAGTTCGACCCGAGTCAAGTGGTGGACGTGTTCGTCCGCGTCACCGGCG
GCGAGGTCGGAGCCGCAAGTTCTCTGGCTCCGAAGATCGGTCCGCTCGGTCTTTCCCCGAAGAAGATCGGAGAAGACATCGCGAAAGAGACCGCCAAGGAATGGAAAGGC
CTTAGGGTTACGGTTAAGCTCACCGTCCAGAATCGCCAGGCGAAGGTCTCCGTCGTTCCCTCGGCGGCGGCGTTGGTGATCAAGTCGTTGAAGGAGCCGGAGCGTGACCG
GAAGAAGACGAAGAACATCAAGCACAATGGCAACATTTCTCTTGACGATGTGATCGAGATCGCTAGGATTATGCGGCCGAGATCCATGGCTAAGGATCTGTCTGGCTCTG
TTAAGGAGATTCTTGGAACCTGCGTTTCTGTGGGCTGTACTGTGGATGGGAAGGACCCTAAGGATCTTCAACAGGAGATTGCTGATGGCGACGTCGAAATTCCCCAAGAT
TGAGGGTAAATGTTTCTTTGGTCGCTTGTTTAGATTGAGAGATATTGAATTTACTGCTTTTTTGTTTCATCAGTTTTGCTATTTAACGTAGTTTTTAGGGTGGTTTTTCT
TTTCTCTTGTTTATCTATCTGCGTTTTTTTTTGTTGGGTAACTGAGATTGAATTGGATTATTGCAATGAATATCAAATGTTTATTTATGTTCTTTATTTGGTGCAAGGAT
TGCTTTGACTTGATATGAATAGAATTATTATCTTTATTTAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIKHNGNISLDDV
IEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEIADGDVEIPQD

Sed0023255 (gene) of Chayote v1 genome