; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0023287 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0023287
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:35226612..35229688
RNA-Seq ExpressionSed0023287
SyntenySed0023287
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64061.1 hypothetical protein Csa_013259 [Cucumis sativus]1.9e-5988.1Show/hide
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XP_023520186.1 uncharacterized protein LOC111783486 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-5987.3Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVM5 Uncharacterized protein9.4e-6088.1Show/hide
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A0A1S3BR63 uncharacterized protein LOC1034926246.1e-5987.3Show/hide
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A0A5D3BI32 Uncharacterized protein6.1e-5987.3Show/hide
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A0A6J1E7N6 uncharacterized protein LOC1114313902.1e-5987.3Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G08060.1 unknown protein1.1e-4466.13Show/hide
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        A+SSL Q L+RYIKKPW+ITGPCA PEY  AVP A EYR+ CPATI E+AI+P+S+PETV++I Y+ RDQRRNRPPIRR +L K +V Q+M + K FD +
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        DFP+VYLT T+EED++T GGGY+K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCAAAGCTTCATCCTCTCTGTTCCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAGCCATGGGAGATCACCGGCCCTTGTGCTGATCCAGAGTACAAATTGGCCGTTCCGAG
CGCCTTAGAGTACAGGATCGTCTGCCCGGCCACCATCAAGGAGAAGGCCATTATCCCCAACTCCAATCCCGAAACCGTCTTCGACATCAAGTATTACAGCCGCGACCAGC
GCCGCAATCGCCCCCCGATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCTGACGTCGAGCAGATCATGAAGGACACCAAATTCGACCCCGCCGATTTCCCCAGAGTTTACCTCACT
GCCACCATCGAGGAGGATATGAATACCCATGGAGGAGGTTATCAGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAATCTCCTTTTAAAATGCGCGATTTGAAAGAAAAAACCTTTAAATAAAAAAGTTTTGGAGATGTAATTTCATCATTAAACATTTTTTTTTTTGGTCTGGGAAGATTT
CTGGTTGGTCCGATCCGCCATCGTCACTGAATCGCCATGGTCAAAGCTTCATCCTCTCTGTTCCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAGCCATGGGAGATCACCGGCCC
TTGTGCTGATCCAGAGTACAAATTGGCCGTTCCGAGCGCCTTAGAGTACAGGATCGTCTGCCCGGCCACCATCAAGGAGAAGGCCATTATCCCCAACTCCAATCCCGAAA
CCGTCTTCGACATCAAGTATTACAGCCGCGACCAGCGCCGCAATCGCCCCCCGATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCTGACGTCGAGCAGATCATGAAGGACACCAAA
TTCGACCCCGCCGATTTCCCCAGAGTTTACCTCACTGCCACCATCGAGGAGGATATGAATACCCATGGAGGAGGTTATCAGAAGTGAGGTTCATTGTGCTCTGGGAAATG
CTCTCTCCAGCTTGTATTTGCCTCTCTTTCAATGTTAACCTGAGAGTGGATTATTCAGGTTTTGTTTGTATGCCTAGCCTATACAGTAATACAAGACATGGGATTTGGCA
TCAATAAAGTATATCTCCTCAAACTTCTATTCAATTTTTTTGTTTCTTCTGTAATGTTATGTGCTTTGTACTGCAACCATTTGCCACACTGTTGCATGAGAAAACACTTC
CATTGCTCTTGAAGTTTTGGACTACTTGCTTGCATATCATTATTGTCATTATTGTCATATCCTGAGCTTTCTGCTATGTGTCTTTGACTGCAACAAAACAAAGCTGTTAG
TCCCATGGGCATATCAATAAATAACTGGAAATTTCCTTGTCTTTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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