; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0023350 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0023350
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionHybrid signal transduction histidine kinase M-like protein
Genome locationLG13:24090385..24093175
RNA-Seq ExpressionSed0023350
SyntenySed0023350
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7037686.1 hypothetical protein SDJN02_01316, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-10481.89Show/hide
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XP_022941285.1 uncharacterized protein LOC111446629 [Cucurbita moschata]3.7e-10582.26Show/hide
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XP_022982399.1 uncharacterized protein LOC111481236 [Cucurbita maxima]1.4e-10481.89Show/hide
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XP_023524341.1 uncharacterized protein LOC111788264 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.2e-10581.51Show/hide
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XP_038896868.1 uncharacterized protein LOC120085087 [Benincasa hispida]1.2e-10079.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BU42 vitellogenin-21.9e-9979.1Show/hide
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        MS+ L RVR++D K SGFSPEDLGYGSVFQRL +  VDR V         DESNT    S+SSSSSIGRNSD+     SD ED G +DEVQSSYKGPLD+
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         SEDSNSSSYSSSPPPRPP HPQSR SN N  S+VPPQ+ FSTWRSYSLADLQECAT ANKANLTN N
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A0A5A7VFR8 Vitellogenin-21.9e-9979.1Show/hide
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        MS+ L RVR++D K SGFSPEDLGYGSVFQRL +  VDR V         DESNT    S+SSSSSIGRNSD+     SD ED G +DEVQSSYKGPLD+
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        M+SLEEVLPVRKGISKFY+GKSKSFTSL DASSV+SMKEIAKPENAYSKKRRNLMA+NL+WEKN+SFPLKNNGGGISKRPISSSKSSLA AVAMSSSESN
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         SEDSNSSSYSSSPPPRPP HPQSR SN N  S+VPPQ+ FSTWRSYSLADLQECAT ANKANLTN N
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A0A6J1FCW4 uncharacterized protein LOC1114429641.9e-9978.95Show/hide
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        MS+ L RVRR+D+  SGFSPEDLGYGS+F+RL++  VDR V       +ESNT    S+SSSSSIGRNSD+S RSS D ED G +DEVQSSYKGPLD+M+
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        EDSN SSYSSSPPPRPP HPQS+ASN NLAS+VPPQRNFSTWRSYSLADLQECAT+ANKANLTN N
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A0A6J1FT55 uncharacterized protein LOC1114466291.8e-10582.26Show/hide
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        MS+AL RV+R+++KGSGFSPEDLGYGSVF+RLD+  VD GV       +ESNT   +SSSSSSIGRNSD+S R SSDGE+ G  DEVQSSYKGPLD+M+S
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A0A6J1J4F7 uncharacterized protein LOC1114812366.7e-10581.89Show/hide
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        MS+AL  V+R+++KGSGFSPEDLG+GSVF RLD+  VD GV       +ESNT   +SSSSSSIGRNSD+S R SSDGE+ G  DEVQSSYKGPLD+M+S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24550.1 unknown protein3.1e-0937.1Show/hide
Query:  SSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLD-LMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRNLMAHN
        SS SSSSIG         SS+ E+   +D+  S  +G LD    SLE+ LP+++G+S  Y GKSKSF +L++A+  S  K++ K EN ++K+RR ++A+ 
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Query:  L-------------MWEKNKSFPL
        L              W+   S PL
Subjt:  L-------------MWEKNKSFPL

AT3G43850.1 unknown protein7.1e-2245.91Show/hide
Query:  TSSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRNLMAHN
        +SS+SS SIG NSD         +D G ++E++SSY GPLD+MESLEE LP+++ ISKFY GKSKSF SL + SS+  +K++ KPEN YS++RRNL++H 
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Query:  LMWEKNKSFPLKNNGGGISKRPISSSKSSLAFAVAMSSSESNCSEDSNSSSYSSSPPPR
        +            + GGISK+P  S        +AMS  E     DS+SS   S P  R
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AT5G21940.1 unknown protein1.0e-3648.02Show/hide
Query:  SNTSSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLV-----DASSVSSMKEIAKPENAYSKKR
        S+ SSS+SSSIGRNSD   +SS DG D   ++EV+S YKGPL++MESLE+VLPVRKGISK+Y+GKSKSFT+L        +S SSMK++AKPEN YS++R
Subjt:  SNTSSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLV-----DASSVSSMKEIAKPENAYSKKR

Query:  RNLMAHNLMWEKNKSFPLKNNGGGISKRPI-SSSKSSLAFAVAMSS-------SESNCSEDSNSSSYSSSPPPR------------PPRHPQSRASNCNL
        RNL+ H + WE NK+ P     GGISK+ + SSS+S+L  A+A+++       S S       SS  +S  PPR            PP +P+S+ S  NL
Subjt:  RNLMAHNLMWEKNKSFPLKNNGGGISKRPI-SSSKSSLAFAVAMSS-------SESNCSEDSNSSSYSSSPPPR------------PPRHPQSRASNCNL

Query:  ASLVPPQRNFSTWRSYSLADLQECATA
         S       F  WRS+S+AD   C  A
Subjt:  ASLVPPQRNFSTWRSYSLADLQECATA

AT5G24890.1 unknown protein1.3e-0739.32Show/hide
Query:  SSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKG--PLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRNLMAHN
        SS SSSIG   D       + E    +D+V S   G   L  M SLE+ LP ++G+S  Y GKSKSF +L     + S+KE+AK EN  +K+RR  + + 
Subjt:  SSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKG--PLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRNLMAHN

Query:  L------MWEKNKSFPL
        L       W+  KS PL
Subjt:  L------MWEKNKSFPL

AT5G56550.1 oxidative stress 31.4e-0638.38Show/hide
Query:  DESNTSSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRN
        DE + SSS S S    SD +       ED   DD   SS  GPL+ +  L   LP+++G+SKFY GKS+SFTSL +  S+  + +       Y  KR++
Subjt:  DESNTSSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKSKSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGTTGCTCTGGCTAGGGTTCGGCGACTTGACGAAAAGGGCTCTGGATTCTCGCCGGAGGATTTGGGTTACGGATCGGTGTTTCAGAGGTTGGATTCTGCGGCGGT
GGATCGCGGCGTTGTTGATGAATCCAATACTTCCAGTTCTTCGTCTTCTTCGATTGGGAGGAACAGTGATCGGTCTGTGAGATCGTCGTCGGACGGCGAGGATGGCGGCG
TGGATGATGAGGTTCAGAGCTCGTATAAAGGGCCGCTTGATTTGATGGAGTCTTTGGAGGAGGTTTTGCCTGTCAGAAAAGGTATTTCAAAGTTCTATGCTGGTAAATCA
AAGTCTTTCACCAGTCTGGTCGATGCCTCCTCTGTTTCTTCCATGAAGGAGATTGCAAAACCAGAGAATGCATATTCCAAGAAACGTAGGAATCTTATGGCCCATAATCT
TATGTGGGAGAAGAACAAGAGTTTTCCTCTCAAGAATAACGGTGGTGGAATATCCAAGAGACCCATCAGCTCAAGCAAAAGCTCCCTGGCTTTTGCTGTTGCTATGAGCA
GCTCTGAAAGTAACTGTAGCGAGGATTCCAATTCTAGCTCGTATTCAAGCTCGCCACCGCCTCGCCCACCTCGGCACCCACAATCCAGAGCTTCTAACTGCAATCTGGCT
TCCCTGGTGCCTCCTCAACGAAATTTCTCCACGTGGCGTTCATACTCCTTGGCCGATTTACAAGAGTGTGCCACCGCTGCTAATAAGGCCAATCTAACAAATGAAAATCT
CAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTCTCCCAATCTCATCATGATTTATTTCCTTACCAATTAATATATTCCATGGATTTATGATCTATGCAATCTCAACCGTCCATTTCCATAATCCAAAATCCCCAATT
TCTTCATTTATAAAGCCCACATTTCCACTTTTCCACTTCATCTTCATCTTCTTCGTCTCGTCTGCGTTTTTTCTTTCATTTTCTCTCTTAATTTCTTCAAATTCGAAGCC
GACATGTCGGTTGCTCTGGCTAGGGTTCGGCGACTTGACGAAAAGGGCTCTGGATTCTCGCCGGAGGATTTGGGTTACGGATCGGTGTTTCAGAGGTTGGATTCTGCGGC
GGTGGATCGCGGCGTTGTTGATGAATCCAATACTTCCAGTTCTTCGTCTTCTTCGATTGGGAGGAACAGTGATCGGTCTGTGAGATCGTCGTCGGACGGCGAGGATGGCG
GCGTGGATGATGAGGTTCAGAGCTCGTATAAAGGGCCGCTTGATTTGATGGAGTCTTTGGAGGAGGTTTTGCCTGTCAGAAAAGGTATTTCAAAGTTCTATGCTGGTAAA
TCAAAGTCTTTCACCAGTCTGGTCGATGCCTCCTCTGTTTCTTCCATGAAGGAGATTGCAAAACCAGAGAATGCATATTCCAAGAAACGTAGGAATCTTATGGCCCATAA
TCTTATGTGGGAGAAGAACAAGAGTTTTCCTCTCAAGAATAACGGTGGTGGAATATCCAAGAGACCCATCAGCTCAAGCAAAAGCTCCCTGGCTTTTGCTGTTGCTATGA
GCAGCTCTGAAAGTAACTGTAGCGAGGATTCCAATTCTAGCTCGTATTCAAGCTCGCCACCGCCTCGCCCACCTCGGCACCCACAATCCAGAGCTTCTAACTGCAATCTG
GCTTCCCTGGTGCCTCCTCAACGAAATTTCTCCACGTGGCGTTCATACTCCTTGGCCGATTTACAAGAGTGTGCCACCGCTGCTAATAAGGCCAATCTAACAAATGAAAA
TCTCAACTGACCAGGAAGATGCCCTCCTCTTGCTTTTAGGTACGCAAAAGACTTTAACTTCTATAGGTAATCTGAAATAGAATGTTCTTACAGTATGATTTTAGCTCTTA
TGGTCGTTTCTGTACTGTATATTAGAAACCAAAACTTTCATGTCTCGTTTAGTTCAAATGGGGATATGACACGAGTCCGCATTTGTCAAACTCGTCTGTACTGGCCTAAG
ACAACCAACCCAGCTACTCATCCACACAAAAACAGCCACCTTGAAGGTTAATTTGACCCATGAATCACAAATTTCAAATTCTTTTTGGTTCACCATGATCAGTAACCTGG
TTGGTTGAAGAACTGCTAAGGTCAGATCTTTCTGTTCTTAAAGATCTATCCTTCAGGGTGTCCTTCCACAGTCTATGCAATTGACTTTATAACTCGAGTTCATATGTTAA
ATCTACCCTTACAATCTCAACACTGTATCCCCAAACACTCCTCAACACGCTTCAAGACCCACACATGTAACCGTCGTCTCTATAATCATTCACTTATCGTTCTCATTTTC
CTTGTTCCAAACGCCACAACCATCAGATGCAGTTCATCCTGATATTGTGTATTTATGGTTGAAGTTAACTACGGCTTTCTTTTAGACCTTGAGAATGTAAACATGCACCA
TCTTGCAATTGGCTCTTGATTAAGCAGTTTGTAAGCTTTCACAAATGACTTTGATTTGTTCCTTTTGCTGATTGTCATTGAAAATAGATGGATTTTTCTTTTTGTTGGAT
AGATTGTTGTCTTATTCCCTTTGATTTCATATGAGTTTTTTAGTGTTATAGCTGTTAGAATATATCGGTTGACGTGTTTGTACAGTTTTAGATTGGATTAGATGAATTGA
CTATCTATTCAAATCCCTTTATTCCAATTATTTATGACCATTTATTTTTAATTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVALARVRRLDEKGSGFSPEDLGYGSVFQRLDSAAVDRGVVDESNTSSSSSSSIGRNSDRSVRSSSDGEDGGVDDEVQSSYKGPLDLMESLEEVLPVRKGISKFYAGKS
KSFTSLVDASSVSSMKEIAKPENAYSKKRRNLMAHNLMWEKNKSFPLKNNGGGISKRPISSSKSSLAFAVAMSSSESNCSEDSNSSSYSSSPPPRPPRHPQSRASNCNLA
SLVPPQRNFSTWRSYSLADLQECATAANKANLTNENLN