CuGenDBv2

Gene ID	Sed0023475
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	30S ribosomal protein S3, chloroplastic
Genome location	Contig00297:111580..112236
RNA-Seq Expression	Sed0023475
Synteny	Sed0023475
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001351 - Ribosomal protein S3, C-terminal IPR004044 - K Homology domain, type 2 IPR005704 - Ribosomal protein S3, bacterial-type IPR009019 - K homology domain superfamily, prokaryotic type IPR015946 - K homology domain-like, alpha/beta IPR018280 - Ribosomal protein S3, conserved site IPR036419 - Ribosomal protein S3, C-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

YP_009560874.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes kirilowii]

3.2e-118

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009752113.1 ribosomal protein S3 [Dendrosicyos socotranus]

7.1e-118

98.17

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHS+WFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009752281.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes baviensis]

4.2e-118

98.62

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNY+QK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009752534.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes tubiflora]

7.1e-118

98.62

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        K+LNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009945453.1 ribosomal protein S3 [Sechium edule]

1.3e-119

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A410HFC8 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.5e-118

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6H0EPH7 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

6.3e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6H0ETZ7 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.5e-118

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6H0EV08 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.5e-118

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A6M3RWJ0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.5e-118

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIE GSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0ZZ73 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

8.2e-109

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGLQED+KIRDCI+NYVQK  R+ SGVEGIARIEIQKR+DLIQVII+MGFPKLLIED  RK+EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN +NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKI+YC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF+DE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A4QK56 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.1e-108

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGL+ED+KIRDCI+NYVQK +RI SG+EGIARIEIQKRIDLIQ+II+MGFPKLLIED  R++EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN VNRKLNIAITRI NPYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKIDYC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

P56798 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

3.1e-108

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGL+ED+KIRDCI+NYVQK +RI SG+EGIARIEIQKRIDLIQ+II+MGFPKLLIED  R++EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN VNRKLNIAITRI NPYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKIDYC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q2L946 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

8.2e-109

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGLQED+KIRDCI+NYVQK  R+ SGVEGIARIEIQKR+DLIQVII+MGFPKLLIED  RK+EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN +NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKI+YC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF+DE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q4VZN0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.1e-118

95.87

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHS+WFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCI+NYVQK MRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKL+I+DGSRKIEELQ+NVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KE NS NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYG+LGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00800.1 structural constituent of ribosome

2.2e-109

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHS+WFA PKKYSEGL+ED+KIRDCI+NYVQK +RI SG+EGIARIEIQKRIDLIQ+II+MGFPKLLIED  R++EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN VNRKLNIAITRI NPYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKIDYC Y V
Subjt:  KELNSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

ATMG00090.1 structural constituent of ribosome;protein binding

2.4e-07

32.14

Show/hide

Query:  NSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKN-RVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRI-DGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVR
        N  N K  I   +I + Y   + +A+ I+ QLKN R SF     K ++   + G +GI++  +GR+ D  E A+ +  +  +        KIDY    V 
Subjt:  NSVNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKN-RVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRI-DGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVR

Query:  TIYGVLGIKIWI
        T YG+ G+K+WI
Subjt:  TIYGVLGIKIWI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGACAAAAAATAAATCCACTCGGTTTTAGACTTGGTGCAACCCAAGGGCATCATTCTATTTGGTTTGCACACCCCAAAAAATATTCTGAAGGTTTACAAGAAGATCA
AAAAATACGAGATTGTATCCGGAATTATGTACAAAAAAAGATGAGAATATTCTCTGGTGTTGAAGGAATTGCACGTATCGAGATTCAAAAAAGAATTGATCTTATTCAAG
TGATAATCTTTATGGGATTCCCAAAGTTATTAATAGAAGATGGGTCTCGAAAAATAGAAGAATTACAGATGAATGTACAAAAAGAATTAAATTCTGTGAACCGAAAACTC
AACATTGCTATTACAAGAATAGGAAATCCTTATGGACACCCAAATATTCTTGCAGAATTTATAGCCGGACAATTAAAGAATAGAGTTTCCTTTCGCAAAGCAATGAAAAA
AGCTATTGAATTAACTGAACAGGCGGGTACAAAGGGAATTCAAGTACAAATTGCCGGACGTATAGATGGCAAAGAAATTGCACGTGTAGAATGGATCAGAGAAGGAAGGG
TTCCTCTACAAACCATTCGAGCTAAAATTGATTATTGTTGCTATCCAGTTAGAACTATCTATGGGGTATTAGGCATAAAAATTTGGATATTTGTAGACGAACAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGQKINPLGFRLGATQGHHSIWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKKMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEDGSRKIEELQMNVQKELNSVNRKL
NIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVRTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Sed0023475 (gene) of Chayote v1 genome