; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0023490 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0023490
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationLG06:4546939..4549622
RNA-Seq ExpressionSed0023490
SyntenySed0023490
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141196.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X1 [Cucumis sativus]6.1e-9793.33Show/hide
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XP_008443563.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 25-like [Cucumis melo]2.1e-8995.48Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]9.5e-9096.05Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]4.1e-9391.71Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]4.9e-9492.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein3.0e-9793.33Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.0e-8995.48Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.0e-8995.48Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like2.0e-9391.71Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like1.5e-8893.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 62.7e-3962.81Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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           L +Y  +     + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.1e-3951.46Show/hide
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        +S+ +NSPCAACKFLRRKC P+CVFAPYFPP++PQKFANVHK+FGASNV+KLLNE+ P QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCVG IS+LQ Q+ +LQ +
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Query:  LDATNANLIRYACSEIPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSYGHYYSGPYFSPWSNNHGPCGDGHDKG
        L    + L +Y    I   +   S      + +     T+    Y H+   P    +     P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 255.3e-5183.78Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 62.7e-3962.81Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
Subjt:  SNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQKELDAT

Query:  NANLIRYACSEIPTPSPSSSS
           L +Y  +     + S+S+
Subjt:  NANLIRYACSEIPTPSPSSSS

Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES4.6e-4759.67Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NA+L  Y  S             +  P P  S Q    +      G S   +    G   S   F PW+N H   G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 253.8e-5283.78Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
Subjt:  DATNANLIRYA

AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein3.3e-4859.67Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Query:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG
        ELDA NA+L  Y  S             +  P P  S Q    +      G S   +    G   S   F PW+N H   G
Subjt:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG

AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein3.3e-4859.67Show/hide
Query:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQK
        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
Subjt:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQK

Query:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG
        ELDA NA+L  Y  S             +  P P  S Q    +      G S   +    G   S   F PW+N H   G
Subjt:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG

AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein3.3e-4859.67Show/hide
Query:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQK
        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
Subjt:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQK

Query:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG
        ELDA NA+L  Y  S             +  P P  S Q    +      G S   +    G   S   F PW+N H   G
Subjt:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG

AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein3.3e-4859.67Show/hide
Query:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQK
        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
Subjt:  SSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQK

Query:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG
        ELDA NA+L  Y  S             +  P P  S Q    +      G S   +    G   S   F PW+N H   G
Subjt:  ELDATNANLIRYACSE------------IPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSY---GHYYSGPYFSPWSNNHGPCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAATCAACTGCTTACACAAAGGAAGGAAAGGGAAAAAAGTTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTTCGGCG
TAAATGCCTTCCCGATTGCGTTTTTGCACCGTATTTCCCTCCCGAGGAGCCACAAAAGTTCGCCAACGTTCACAAGATATTCGGTGCCAGCAATGTCAGCAAACTGCTCA
ATGAAGTCCAGCCGCATCAGCGGGAGGATGCTGTGAACTCGCTCGCCTATGAGGCCGAGGCGAGGATGAAAGACCCCGTTTATGGCTGTGTTGGCGCAATCTCCATCCTC
CAAAGGCAAGTCATCAAGCTACAGAAAGAACTCGACGCCACGAACGCCAACCTCATTCGCTATGCCTGCAGTGAAATTCCCACACCGTCCCCATCCTCGTCGTCACAATA
TGCTCGAAGATCATCGTCGACGAGCCACGAGGGAACCTCATCTACCTCTAGTTATGGGCACTATTATTCTGGCCCCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACCATGGCCCTT
GTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTCTCTTTACCCTTTTGAAATGAGCACTGTTTAAGCAGGTTTTCTCTCTTCTCTTTATATCACCAATTAGGGTTTTTCTTTCTCTCTCTCACATGTTACATTATTTAGG
AATATCCCATAAATAAAGTTTGTTCCTTTTTTTTCTCTCTCCCCCATTTCTCTCTCTACATGGCTTCAACTTCATTTTCCTTCAAATTTTCATACAAGAGATGTTGAATC
AACTGCTTACACAAAGGAAGGAAAGGGAAAAAAGTTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTTCGGCGTAAATGCCTT
CCCGATTGCGTTTTTGCACCGTATTTCCCTCCCGAGGAGCCACAAAAGTTCGCCAACGTTCACAAGATATTCGGTGCCAGCAATGTCAGCAAACTGCTCAATGAAGTCCA
GCCGCATCAGCGGGAGGATGCTGTGAACTCGCTCGCCTATGAGGCCGAGGCGAGGATGAAAGACCCCGTTTATGGCTGTGTTGGCGCAATCTCCATCCTCCAAAGGCAAG
TCATCAAGCTACAGAAAGAACTCGACGCCACGAACGCCAACCTCATTCGCTATGCCTGCAGTGAAATTCCCACACCGTCCCCATCCTCGTCGTCACAATATGCTCGAAGA
TCATCGTCGACGAGCCACGAGGGAACCTCATCTACCTCTAGTTATGGGCACTATTATTCTGGCCCCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACCATGGCCCTTGTGGAGATGG
CCATGACAAAGGAGAATACAAGTAAAAATTTTCCATTTGATCATATCATTATAATTTGGTCATCACATGGGGTTTTCAATATGTTGATATGGGTGTGAAATTTATGTATT
TTGATCAATAAATATAAGTGATAATTACAAACCACACCTTTTCCATTCATCTAGTTTGTAAAAATTATATCTTTATGTTACAAAAATGGTTTCAAACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLNQLLTQRKEREKSYWKMSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISIL
QRQVIKLQKELDATNANLIRYACSEIPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGTSSTSSYGHYYSGPYFSPWSNNHGPCGDGHDKGEYK