; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0023715 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0023715
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionleucine-rich repeat extensin-like protein 3
Genome locationLG06:37684316..37685012
RNA-Seq ExpressionSed0023715
SyntenySed0023715
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581215.1 hypothetical protein SDJN03_21217, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-4770.67Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAPSAAI L+LS LF F+ +A +Q   P+ +  QDP++EIKCGSCPC+NPCV+Q PPPPPP    PPPP C  AL  PPPPPRF YT+L S PPPPRFIY
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLYQ D N+RWYYFSG T  QPA AALVVALGCGAL+LM FGKW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

KAG7017949.1 hypothetical protein SDJN02_19815, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.5e-4668.67Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAPSAAI L+LS LF F+ +A +Q   P+    QDP++EIKCGSCPC+NPCV+Q PPPPPPP+       C  AL  PPPPPRF YT+L S PPPPRFIY
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLYQ D N+RWYYFSG T  QPA AALVVALGCGAL+LM FGKW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

XP_011651408.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]1.8e-4362Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAP AAI L+ S L   +L+A +QT  PI +  Q+PD EIKCGSCPC+NPC+QQL PPPPPP P PPP  C   +   PPPPRF YTT   +PPPPRF Y
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLY+ D N+ WYYFSG    +P MAA+ VA+GCGAL LM F KW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

XP_022984145.1 probable pathogenesis-related protein ARB_02861 [Cucurbita maxima]5.5e-4568.67Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAPSAAI L+LS LF F+ +A +Q   P+    QDP++EIKCGSCPC+NPCV+Q PPPPP     PPPP C  AL  PPPPPRF YT+L S PPPPRFIY
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLYQ D N+RWYYFSG T    A AALVVALGCGAL+LM FGKW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

XP_023528316.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-4669.33Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAPSAAI L+LS LF F+ +A +Q   P+    QDP++EIKCGSCPC+NPCV+Q PPPPPP    PPPP C  AL  PPPPPRF YT L S PPPPRFIY
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLYQ D N+RWYYFSG T  +PA A LVVALGCGAL+LM FGKW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L7R0 Uncharacterized protein8.6e-4462Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAP AAI L+ S L   +L+A +QT  PI +  Q+PD EIKCGSCPC+NPC+QQL PPPPPP P PPP  C   +   PPPPRF YTT   +PPPPRF Y
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLY+ D N+ WYYFSG    +P MAA+ VA+GCGAL LM F KW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

A0A5A7V4T2 Formin-like protein 31.9e-4364Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        M  SAAI L+ S L   +L+A +QT  PISI  Q+PD EIKCGSCPC+NPC+QQL PPPPPP   PPP  C   +   PPPPRF YT    +PPPPRF Y
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLY+ D N+ WYYFSG TG +P MAA+VVALGCGAL LM F KW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

A0A6J1GAW3 leucine-rich repeat extensin-like protein 22.5e-3565.79Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCP-CNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFI
        MAPSAAIF  LSLL SFI     QT  PIS    DPDTEI C S   C+NP VQQL P P    P+PPPP          PPPRFTYTTL S PPP RFI
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCP-CNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFI

Query:  YTTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAAL-VVALGCGALDLMVFGKW
        YTTGVP +LYQ DE +RWYYFSGA GK PAMAAL VV L CGALDL+VFGKW
Subjt:  YTTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAAL-VVALGCGALDLMVFGKW

A0A6J1J7W0 probable pathogenesis-related protein ARB_028612.7e-4568.67Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY
        MAPSAAI L+LS LF F+ +A +Q   P+    QDP++EIKCGSCPC+NPCV+Q PPPPP     PPPP C  AL  PPPPPRF YT+L S PPPPRFIY
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIY

Query:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW
        TTGVPGNLYQ D N+RWYYFSG T    A AALVVALGCGAL+LM FGKW
Subjt:  TTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW

A0A6J1KHA8 leucine-rich repeat extensin-like protein 33.0e-2059.66Show/hide
Query:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGS-CPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFI
        MAPSAAIF  LSLL SFI     Q   PI     DP  EI CGS  PC+NP VQQL P P    P+PPPP          PPPRFTYTTL S PPPP+FI
Subjt:  MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGS-CPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFI

Query:  YTTGVPGNLYQFDENHRWY
        YTTGVP +LYQ DE +RWY
Subjt:  YTTGVPGNLYQFDENHRWY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 12.3e-0446.55Show/hide
Query:  PPPPPPSPVPPPPYCNQA-----LFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTGVPGNLY
        PPPPPPSP PPPPY   +     ++  PPPP + Y    SSPPPP ++Y++  P  +Y
Subjt:  PPPPPPSPVPPPPYCNQA-----LFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTGVPGNLY

AT1G23040.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein1.8e-0934.29Show/hide
Query:  LLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKC------GSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTGVPG
        ++F+ +++A    P  I+ GS   D  ++           C+  C+Q  PPPP PP P PPPP C      PPPPP+   +  P  PPP  F+Y TG PG
Subjt:  LLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKC------GSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTGVPG

Query:  NLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMV
        NLY  DE      F  A GK   +  L   +  G +  ++
Subjt:  NLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMV

AT1G70990.1 proline-rich family protein5.4e-0639.09Show/hide
Query:  AAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPP-PPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTG
        AA  LT  +  +F ++  A          +DP   IKC       PC+Q +PPP PPPPSP PP   C      PP PP+ +Y      PPP  +IY TG
Subjt:  AAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPP-PPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTG

Query:  VPGNLYQFDE
         PG LY  D+
Subjt:  VPGNLYQFDE

AT3G03350.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.7e-0740.91Show/hide
Query:  PPPPRFTY-TTLPSSPPPPRFIYTTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALD
        PPPPR TY +   SSPPPP+++Y TGVPG LY+ + + +W Y S           ++V +G G ++
Subjt:  PPPPRFTY-TTLPSSPPPPRFIYTTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALD

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.3e-0438.04Show/hide
Query:  IKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPP-PPRFIYTTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAM
        I C S  C+ P     PPPPPPP P PPPP        PPPPP + Y + P  PP PP ++Y    P  +Y    +  + Y       QP M
Subjt:  IKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPP-PPRFIYTTGVPGNLYQFDENHRWYYFSGATGKQPAM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCTTCTGCCGCCATTTTTCTCACTCTTTCTCTTCTCTTCTCCTTCATACTCGTCGCCCGGGCCCAAACCCCTCTGCCGATATCGATCGGTTCGCAAGATCCCGA
CACAGAAATAAAATGTGGATCTTGCCCTTGTAACAACCCATGTGTTCAACAGTTACCACCGCCTCCACCACCACCGTCACCAGTACCACCACCACCGTATTGCAATCAAG
CACTGTTTCATCCACCGCCACCTCCGAGGTTTACGTATACGACATTGCCATCTTCACCACCGCCTCCGAGGTTTATTTATACGACGGGTGTTCCCGGTAACCTGTACCAG
TTTGACGAGAATCATCGATGGTATTACTTCTCCGGTGCAACGGGGAAGCAGCCGGCCATGGCGGCCCTCGTTGTGGCTCTTGGCTGTGGAGCTTTAGATCTCATGGTGTT
TGGTAAGTGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTTTTCATTATTCTCATGCACCTAACATAAGCAAATAACAGCCCAACACTCACCTTCACATTAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAAACTCAATCTTCATTGATTTC
AGAGCTTCTTCTACCTGAACATGGCGCCTTCTGCCGCCATTTTTCTCACTCTTTCTCTTCTCTTCTCCTTCATACTCGTCGCCCGGGCCCAAACCCCTCTGCCGATATCG
ATCGGTTCGCAAGATCCCGACACAGAAATAAAATGTGGATCTTGCCCTTGTAACAACCCATGTGTTCAACAGTTACCACCGCCTCCACCACCACCGTCACCAGTACCACC
ACCACCGTATTGCAATCAAGCACTGTTTCATCCACCGCCACCTCCGAGGTTTACGTATACGACATTGCCATCTTCACCACCGCCTCCGAGGTTTATTTATACGACGGGTG
TTCCCGGTAACCTGTACCAGTTTGACGAGAATCATCGATGGTATTACTTCTCCGGTGCAACGGGGAAGCAGCCGGCCATGGCGGCCCTCGTTGTGGCTCTTGGCTGTGGA
GCTTTAGATCTCATGGTGTTTGGTAAGTGGTAAAGGTTGAATAGGATATAGAGCAAATTGATGTATTAAACTTGGTCTAAGATATTAAAAATATTTTACTCTCCCAAGTA
TAAACATATTAATATGATTTTTAGATATCAATTTATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPSAAIFLTLSLLFSFILVARAQTPLPISIGSQDPDTEIKCGSCPCNNPCVQQLPPPPPPPSPVPPPPYCNQALFHPPPPPRFTYTTLPSSPPPPRFIYTTGVPGNLYQ
FDENHRWYYFSGATGKQPAMAALVVALGCGALDLMVFGKW