CuGenDBv2

Gene ID	Sed0023754
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	LG03:3405904..3415425
RNA-Seq Expression	Sed0023754
Synteny	Sed0023754
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6602242.1 Nuclear pore complex protein NUP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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        S GK LYS    RS  + S +S+ND+KPSSSF QIPLRSSEMASKILEQLEK+TPPK+KSS+LKL    NNSP KLSPSMLHGPALRSLEDV+ SK+LEN
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        R+EK+DGSLVA+SK SDT+AITVDKP AS E+K STVSE+NK N Q K++VP TA KSPIFSFAT+S P+I  NAK PESTL PEK +  EAPK A A I
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        FGFGDK P QK S SSAPTF FGNK +PS NEQNDVPVA SESNV+P              KA F IP  AATENGNKN GS  KFASPL NEK SAKVG
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        T DSNKRPE+S+ A GN P FGAPV PA+SGVASSTQSTPV  FSSSST FGLA NT  SSGSSLFGSSAPASN+FSSG  FG         +S SS AG
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        AEDT+QAV   TPTFGQQP TPP SSGF+FGS APPP+AASPFQFG QQN P PQN SPFQ SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDK+ R+ VKVK K
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KAG7032922.1 Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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        + SH VPT VM ANVLDEDVASPAEIAKAYMG RPPKATPLSM S S KFGD+FAS + SKSS  +LVPRSPG FDVIENGFVTPRS GRSALY+M RMP
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        YS VSAT SIK SVAT DAYRATG SSSQ AWE+    GSKQG LKRRSSVLDDEMG VGPIRR R KS LLYP GLSLPSSSTSIPVSG GSE  Q  Q
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        STKVHPFSSS GK LYS    RS  + S +S+ND+KPSSSF QIPLRSSEMASKILEQLEK+TPPK+KSS+LKL    NNSP KLSPSMLHGPALRSLED
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        V+ SK+LENVEDI+SND R++TSQKN+KVEESSSLK+K+ P +K ISAGDG+GS VPTKD V SS   VSFVG S QTK AF++SAHEDFVD+D EGCSN
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        GPVTD SF+R+EK+DGSLVA+SK SDT+AITVDKP AS E+K STVSE+NK N Q K++VP TA KSPIFSFAT+S P+I  NAK PESTL PEK +  E
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        APK A A IFGFGDK P QK S SSAPTF FGNK +PS NEQN VPVA SESNV+P              KA F IP  AATENGNKN GS  KFASPL 
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        N+ TNQN SI+ SL AAPSN EPATTT+LS   S +PSFSAAPIFKFGSPS PS+SAP LSA       ET  KQETTFGNL GIPPSDTSAAKVSSTG 
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        SVFQFGAAAT DSNKRPE+S+ A GN P FGAPV PA+SGVASSTQSTPV  FSSSST FGLA NTG SSGSSLFGSSAPASN+FSSG  FG + +SSS 
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               AGTSSS FNWQ+SS P FSTGF STPTGGF FGLSSSSAASNS+P +FGSS       SMFSFTS   AASSQPAFGNSNHGFTF STPPANN
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        DQ+NM+DSMAEDT+QAV   TPTFGQQP TPP SSGF+FGS APPP+AASPFQFG QQN P PQN SPFQ SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDK+ R+ 
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        VKVK K
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XP_022956154.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita moschata]

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        AEDTVQAV   TPTFGQQP TPP SSGF+FGS APPP+AASPFQFG QQN PTPQN SPF  SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDK+ R+ VKVK K
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XP_023527371.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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        VM ANVLDEDVASPAEIAKAYMG RPPKATPLSM S S KFGD+FAS + SKSS  +LVPRSPG FDVIENGFVTPRS GRSALY+M RMPYS VSAT S
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        IK SVAT DAYRATG SSSQ AWE+    GSKQG LKRRSSVLDDEMG VGPIRR R KS LLYP GLSLPSSSTSIPVSG GSE  Q  QSTKVHPFSS
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        VEDI+SND R++TSQKN+KVEESSSLK+K+ P DK+ISAGDG+GS VPTKD V SS   V+FVG S QTK AF++SAHEDFVD+D EGCSNGPVTD SF+
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Query:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI
        R+EK+DGSL A+SK +DT+AITVDKP AS E+K ST SE+NK N Q K++VP  AEKSPIFSFAT+S P+I ANAK PESTL PEK +  EAPK A A I
Subjt:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI

Query:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG
        FGFGDK P QK S SSAPTF FGNK +PS NEQN VPVA SESNV+P              KA F IP  AATENGNKN GS  KFASPL NEK  AKVG
Subjt:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG

Query:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNSS
        S+SVF AES SSS  SFGVPKE ++DK GD  SSAGL+VGTS NLFSSSV TST +P+LFSFSSPS+NSNLNNGSLVSTPSIFSSPAT  SN+ TNQN S
Subjt:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNSS

Query:  IQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGAAA
        I+ SL  APSNSEPATTT   +  S +PSFSAAPIFKFGSPS PS+SAP LSA       ET  KQETTFGNL GIPPSDTSAAKVSSTG SVFQFGAAA
Subjt:  IQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGAAA

Query:  TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS--------AG
        T DSNKRPE+S+ APGN P FGAPV PA+SGVASSTQSTPV  FSSSST FGLA NTG SSGS LFGSSAPASN+FS G  FG +++SSS        AG
Subjt:  TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS--------AG

Query:  TSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS-------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMDDSM
        TSSS FNWQ+SS P FSTGFSSTPTGGF FGLSSSSAASNS+P +FGSS       SMFSFTS   A SSQPAFGNSNHGFTF STPPANNDQ+NM+DSM
Subjt:  TSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS-------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMDDSM

Query:  AEDTVQAVAPSTPTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVKVKRK
        AEDTVQAV   TPTFGQQP TPP SSGF+FGS APPP+AASPFQFG QQN PTPQN SPF  SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDK+ R+ VKVK K
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XP_038884354.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida]

0.0e+00

74.92

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Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIA
        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRP+RRS+TTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLI SSAH LFS+VF KRLPPPP  LP+S EANDEM N NQ E+A
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Query:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPA--QDGVGSHAVP
        ADPP TQEGT++DFVPSI  + THGV+DLE+ILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRV+DVPSGVE  K EQVPST VISYG  E   KFPA  QDGV  H V 
Subjt:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPA--QDGVGSHAVP

Query:  TNVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSAT
        T+V+SANVLDEDVASPAEIAKAYMG RPPKATPLSM S SQKFGD F+ G+PSKS T SL+PRSPG FDV ENGFVTPRS GRSALYSM RMPYSRV AT
Subjt:  TNVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSAT

Query:  PSIK-SVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFS
        PSIK SVAT DAYRAT SSSQSAW Q    GS+QG LKRR+SVLDDEMGSVGPIRR R KS  L+PKGLSLPSSSTSIPVSG GSET Q  QSTKVHPFS
Subjt:  PSIK-SVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFS

Query:  SSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLE
        S+ GK LYSS+TKR+  +MS +S+NDM PSSSF QIPLRSSEMASKILEQL+K+TPPKEKSSELKL   RNNSP KLSPSMLHGPALRSLEDV+ +K+LE
Subjt:  SSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLE

Query:  NVEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD-EGCSNGPVTDSSF
        NVE IRSND  D+TS+KNDK EESS LKFKV P DKSIS G+GVGSSVP K+ V  S   VSFVGPS QTK AF++SAHEDFVD+D EG SNGPV D S 
Subjt:  NVEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD-EGCSNGPVTDSSF

Query:  ERQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATAS
        ERQEKV+ SLVAVSK ++T+AITVDKP AS E K  TVS MNK N QGK++VP T EKSPIFSF T+SSP+I AN   PES + PEKI   E PKAAT  
Subjt:  ERQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATAS

Query:  IFGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKV
        IFGFG+KFP QK + S APTF F NK++ S NEQN +PV  SE NV P QQAS PTTFKFGDKA F IP  AATENGNKN GS + FASPL NEK  AK 
Subjt:  IFGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKV

Query:  -GSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPT--LFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTN
         GSASVF AES SSS PSFGVPKE +++K GD  SSAG  VGTSG+LFSSSV TS  TPT  LFSFSSPS+NSNLNNGSLVST   F +PAT  SN+ TN
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Query:  QNSSIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQF
        QNSSI+ S  AA SNSEP TTT+L T SS MPSFSAAPI KFGS S PSTSAP LSAPS VG +E+  KQETTFGNL GIPPSD SA KVSSTGSSVFQF
Subjt:  QNSSIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQF

Query:  GAAAT-MDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSS--------
        GAA+T  DSNKRP +S+F P N P FGA   P SSG+ASSTQSTPV  F+SSST FGL GNTG +SGSSLFGSSAPASN+F+SG  FG +SS        
Subjt:  GAAAT-MDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSS--------

Query:  SSSAGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS-------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSN
        SSSAGTSSS FNWQ SS P FSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAP +FGSS       SMFSFTSAATA +SQPAFGNSNHGFTF STPPANNDQ+N
Subjt:  SSSAGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS-------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSN

Query:  MDDSMAEDTVQAVAPSTPTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQ-NASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVK
        M+DSMAEDTVQ V    P+FGQQP TPP SSGF+FGSTA PPL ASPFQFGG QQN PTPQ N SPFQ SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDKS R+ VK
Subjt:  MDDSMAEDTVQAVAPSTPTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQ-NASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVK

Query:  VKRK
        VK K
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

72.76

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        MATERE + YEGGRGGKFQKRPLRRS+TTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLI SSAH LFS+VF KRLPPPP  LP+S EANDEM  +NQ E+A
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Query:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQDGVGSHAVPTN
        ADPP TQEGT+ DFVPSI  +  HGV+DLE+ILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRV+DVPSGVE RKFE V ST VISY + E S KFPAQ+GV  H VPT+
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Query:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSATPS
        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MG RPPKATPLSM + SQKFGD FA G+PSKSST SLVPRSPG FDV EN FVTPRS GRSALYSM RMPYSRV ATPS
Subjt:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSATPS

Query:  IK-SVATIDAYRAT-GSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFSS
        IK SVAT D+YRAT  SSSQSAWEQ     S QG LKRRSSVLDDE+GSVGPIRR R KS LL+PKGLSLPSSSTSIPVSG GSET Q  QSTKVHPFSS
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Query:  SVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLEN
          GKA YSS+TKR+  +MS +S+ND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+K+TPPKEKSSELKL   RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDV+ +K+LEN
Subjt:  SVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLEN

Query:  VEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDV-DEGCSNGPVTDSSFE
        VEDIRSND RD+TS+K DK E+SS LK KVP  DKSIS G GVGSSVP+KD V SS + VSFVGPSS TK AF++S  EDFVD+ DE  SNGPV+  SFE
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Query:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI
        R+EKVD SLVAV K SDT+AITVDKP AS + K S VSEM K N Q K++VP T EKS IFSF T+S  +  AN   PEST  PEKI   E PKAA A I
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Query:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG
        FGFG+K P QK    S+PTF FGNKV+ S NEQN VP   SE NV+P  QAS PTTFKFGDKA F IP   ATENGN  AGS  KFAS L NEK  AK G
Subjt:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG

Query:  SASVFIAE----SFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNR-SSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFT
        SASVF +E    SF+ S  SFGVPKE +++K GD + SSAGL+VGTSGNL  SSV +STPTP+LFSFSSP++NSNL NGSL STPS F SP+    ++ T
Subjt:  SASVFIAE----SFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNR-SSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFT

Query:  NQNSSIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETT-FGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVF
        NQNSSI+ SL AA SNSEP TTT+LST SS MPSFSAAPIFKFGS S PS+     SAPS VG VET  KQETT FGN+ GI PSDTSAAKV STGSSVF
Subjt:  NQNSSIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETT-FGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVF

Query:  QFGAAA-TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS---
        QFGAA+ T DSNK+PE S+FAP + P+FGAPVLPASSGVASSTQSTPV  FSSSST FGL GNTG +SG+SL GSSAPASN+F+SG  FGF SSSS+   
Subjt:  QFGAAA-TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS---

Query:  ----AGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS--------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQ
            AGTSSS FNWQ+SSAP FS+GF STPTGGFSFGL+SSSAAS+S+P +FGSS        SMFSFTSAATAA SQPAFG SNHGFTF STPPANND 
Subjt:  ----AGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS--------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQ

Query:  SNMDDSMAEDTVQAVAPST--PTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRR
        +NM+DSMAEDTVQ VA  T  P+FGQQP TPP SSGF+FGSTAP PL A+PFQFGG QQN PTPQN +PFQ SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDKS R+
Subjt:  SNMDDSMAEDTVQAVAPST--PTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRR

Query:  IVKVKRK
         VKVK K
Subjt:  IVKVKRK

A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

73.06

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Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIA
        MATERE + YEGGRGGKFQKRPLRRS+TTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLI SSAH LFS+VF KRLPPPP  LP+S EANDEM  +NQ E+A
Subjt:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIA

Query:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQDGVGSHAVPTN
        ADPP TQEGT+ DFVPSI  +  HGV+DLE+ILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRV+DVPSGVE RKFE V ST VISY + E S KFPAQ+GV  H VPT+
Subjt:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQDGVGSHAVPTN

Query:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSATPS
        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MG RPPKATPLSM + SQKFGD FA G+PSKSST SLVPRSPG FDV EN FVTPRS GRSALYSM RMPYSRV ATPS
Subjt:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSATPS

Query:  IK-SVATIDAYRAT-GSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFSS
        IK SVAT D+YRAT  SSSQSAWEQ     S QG LKRRSSVLDDE+GSVGPIRR R KS LL+PKGLSLPSSSTSIPVSG GSET Q  QSTKVHPFSS
Subjt:  IK-SVATIDAYRAT-GSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFSS

Query:  SVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLEN
          GKA YSS+TKR+  +MS +S+ND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+K+TPPKEKSSELKL   RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDV+ +K+LEN
Subjt:  SVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLEN

Query:  VEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDV-DEGCSNGPVTDSSFE
        VEDIRSND RD+TS+K DK E+SS LK KVP  DKSIS G GVGSSVP+KD V SS + VSFVGPSS TK AF++S  EDFVD+ DE  SNGPV+  SFE
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Query:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI
        R+EKVD SLVAV K SDT+AITVDKP AS + K S VSEM K N Q K++VP T EKS IFSF T+S  +  AN   PEST  PEKI   E PKAA A I
Subjt:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI

Query:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG
        FGFG+K P QK    S+PTF FGNKV+ S NEQN VP   SE NV+P  QAS PTTFKFGDKA F IP   ATENGN  AGS  KFAS L NEK  AK G
Subjt:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG

Query:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNR-SSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNS
        SASVF +ES SSS  SFGVPKE +++K GD + SSAGL+VGTSGNL  SSV +STPTP+LFSFSSP++NSNL NGSL STPS F SP+    ++ TNQNS
Subjt:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNR-SSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNS

Query:  SIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETT-FGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA
        SI+ SL AA SNSEP TTT+LST SS MPSFSAAPIFKFGS S PS+     SAPS VG VET  KQETT FGN+ GI PSDTSAAKV STGSSVFQFGA
Subjt:  SIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETT-FGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA

Query:  AA-TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS-------
        A+ T DSNK+PE S+FAP + P+FGAPVLPASSGVASSTQSTPV  FSSSST FGL GNTG +SG+SL GSSAPASN+F+SG  FGF SSSS+       
Subjt:  AA-TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS-------

Query:  AGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS--------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMD
        AGTSSS FNWQ+SSAP FS+GF STPTGGFSFGL+SSSAAS+S+P +FGSS        SMFSFTSAATAA SQPAFG SNHGFTF STPPANND +NM+
Subjt:  AGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS--------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMD

Query:  DSMAEDTVQAVAPST--PTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVKV
        DSMAEDTVQ VA  T  P+FGQQP TPP SSGF+FGSTAP PL A+PFQFGG QQN PTPQN +PFQ SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDKS R+ VKV
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        K K
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A0A6J1GY88 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

75.87

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        VM ANVLDEDVASPAEIAKAYMG RPPK+TPLSM S S KFGD+FAS + SKSS  +LVPRSPG FDVIENGFVTPRS GRSALY+M RMPYS VSAT S
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        IK SVAT DAYRATG SSSQ AWE+    GSKQG LKRRSSVLDDEMG VGPIRR R KS LLYP GLSLPSSSTSIPVSG GSE  Q  QSTKVHPFSS
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        S GK LYS    RS  + S +S+ND+KPSSSF QIPLRSSEMASKILEQLEK+TPPK+KSS+LKL    NNSP KLSPSMLHGPALRSLEDV+ SK+LEN
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        VEDI+SND R++TSQKN+KVEESSSLK+K+ P +K ISAGDG+GS VPTKD V SS   VSFVG S QTK AF++SAHEDFVD+D EGCSNGPVTD SF+
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        R+EK+D SLVA+SK SDT+AITVDKP AS E+K STVSE+NK N Q K++VP TAEKSPIFSFAT+S P+I  NAK PESTL PEK +  EAPK A A I
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        FGFGDK P QK S SSAPTF FGNK +PS NEQN VPVA SESNV+P              KA F IP  AATENGNKN GS  KFASPL NEK SAKVG
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        S+SVF AES SSS  SFGVPKE ++DK GD   SAGL+VGTS NLFSSSV TST  P+LFSFSSPS+NSNLNNGSLVSTPSIFSSPAT  SN+ TNQN S
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        I+ SL  APSNSEPATTT+LS   S +PSFSAAPIFKFGSPS PS+SAP LSA       ET  KQETTFGNL GIPPSDTSAAKVSSTG SVFQFGAAA
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Query:  TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS--------AG
        T DSNKRPE+S+ APGN P FGAPV PA+SGVASSTQSTPV  FSSSST FGLA NTG SSGSSLFGSSAPASN+FSSG  FG + +SSS        AG
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        TSSS FNWQ+SS P FSTGFSSTPTGGF FGLSSSSAASNS+P +FGSS       SMFSFTS   AASSQPAF NSNHGFTF STPPANNDQ+NM+DSM
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Query:  AEDTVQAVAPSTPTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVKVKRK
        AEDTVQAV   TPTFGQQP TPP SSGF+FGS APPP+AASPFQFG QQN PTPQN SPF  SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDK+ R+ VKVK K
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A0A6J1JSL2 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

74.77

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        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRS+TTPYDRPPTALRNSAG GWLSKLVDPAQKLI SSAH LFS+VF KR+PPPP  LPVS EANDEMGNEN  E+A
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Query:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQDGVGSHAVPTN
        AD   TQEG + DF PSIK D THGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRV DVPSGVEERKFE   ST VISY + E S KF AQDG+ SH VPT 
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        VM ANVLDEDVASPAEIAKA+MG RPPKATPLSM S S KF DNFAS + SKSS  +LVPRSPG FDVIENGFVTPRS GRSALY+M RMPYS VSAT S
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Query:  IK-SVATIDAYRATG-SSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFSS
        IK SVAT DAYRATG SSSQ A E+    GSKQG LKRRSSVLDDEMG VGPIRR R KS LLYP GLSLPSSSTSIPVSG GSE  Q  QSTKVHPFSS
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        S GK LYS    RS  + S +S+ND+KPSSSF QIPLRSSEMASKILEQLEK+TPPK+KS +LKL    NNSP KLSPSMLHGPALRSLEDV+ SK+LEN
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Query:  VEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD-EGCSNGPVTDSSFE
        VEDI+SND R++TSQKN KVEESSSLK+K+ P +K+ISAGDG+GS VPTKD V SS   VSFVG S QTK AF++SAHEDFVD+D EGCSNGPVTD SF+
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Query:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI
        R+EK+DGSLVA+SK +DT+AITVDKP AS E+K ST SE+NK N Q K++VP TAEKSPI SFAT+S P+I ANAK PES L PEK +  EAPKAA A I
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        FGFGDK P QK S SSAPTF FGNK +PS NEQN VPVA SESNV+P              KA F IP  AATENGNKN G+  KFASPL NEK S KVG
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Query:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNSS
        S+SVF AES S S  SFG P+E ++DK GD RSSAGL+VGTS NLFSSSV TST  P+LFSFSSPS+NSNLNNGSLVSTPSIFSSPAT  SN+ TNQN S
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Query:  IQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGAAA
        I+ SL  APSNSEPATTT+LS   S +PSFSAAPIFKFGSPS PS+SAP LSA       ET  KQETTFGNL GIPPSDTSAAKVSS G SVFQFGAAA
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Query:  TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS--------AG
        T DSNK+PE+ + APGN P FGAPV PA+SGVASSTQSTPV  FSSSST FGLA NTG SSGSSLFGSSAPASN+FSSG  FG + +SSS        AG
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Query:  TSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS-------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMDDSM
        TSSS FNWQ+SS P FSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNS+P +FGSS       SMFSFTS    ASSQPAFGNSNHGFTF STP ANNDQ+NM+DSM
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Query:  AEDTVQAVAPSTPTFG---QQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVKVKRK
        AEDTVQAV   TPTFG   QQP TPP SSGF+FGS APPP+AASPFQFG QQN PTPQN SPF  SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDK+ R+ VKVK K
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A0A6J1K059 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

72.68

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        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRPLRR++TTPYDRPP ALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLI SSAH LFS+VF KRLPPPP  LP+  EANDEM  +NQ E+A
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Query:  ADPPETQEGTDIDFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQDGVGSHAVPTN
        AD P TQEGT+ DFVPSI  +  HGV+DLE+ILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRV+DVPSGVE RKFE+VPST VISY + E S KFPAQ+ V  H VP +
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Query:  VMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFASGDPSKSST-SLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSMPRMPYSRVSATPS
        V++ANV DEDVASPAEIAKA+MG RPPKATPLSM + SQKFGD FA G+PSKSST SLVPRSPG FDV EN FVTPRS GRSALYSM RMPYSRV ATPS
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Query:  IK-SVATIDAYRAT-GSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQ--QSTKVHPFSS
        IK SVAT D+YRA+  SSSQSAWEQ     S QG LKRRSSVLDDE+GSVGPIRR R KS LL+PKGLSLPSSSTSIPVSG GSET Q  QSTKVHPFSS
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Query:  SVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKL---RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVNPSKFLEN
        + GKA YSS+TKR+  +MS +S+ND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+K+TPPKEKSSELKL   RNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDV+ +K+LEN
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Query:  VEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDV-DEGCSNGPVTDSSFE
        VEDIRSND RD+TS+KNDK E+SS LK +VP  DKSIS G GVGSSVP+KD V SS + VSFVGPSS TK AF++S  EDFVD+ DE  SNGPV   SFE
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Query:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI
        R+EKVD SLVAV K SD +AI VDKP AS + K STVSEM K N Q K+++P T EKS IFSF T+S  +  A    PEST  PEKI   E PKAA A I
Subjt:  RQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSFATSSSPNIRANAKSPESTLTPEKIVPFEAPKAATASI

Query:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG
        FGFG+KFP QK    S+PTF FGNKV+ S NEQN VP   SE NV+P  QAS PTTFKFGDKA F IP    TENGN  AGS  KFAS L NEK  AK G
Subjt:  FGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVG

Query:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNR-SSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNS
        SASVF +ES SSS  SFGVPKE +++K GD + SSAGL+VGTSGNL  SSV +STPTP+LFSFSSP++NSNL NGSL STPS F SP+    ++ TNQNS
Subjt:  SASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNR-SSAGLTVGTSGNLFSSSVPTSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNS

Query:  SIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETT-FGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA
        SI+ SL AA SNSEP TTT+LST SS MPSFSAAPIFKFGS S PST     SAP+  G VET  KQETT FGN+ GI PSDTSAAKV STGSSVFQFGA
Subjt:  SIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETT-FGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA

Query:  AA-TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS-------
        A+ T DSNK PE S+FAP + P+FGAPVLPASSGVASSTQSTPV  FSSSST FGL GNTG +SG+SL GSSAPASN+F+SG  FGF SSSS+       
Subjt:  AA-TMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSS-------

Query:  AGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS--------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMD
        AGTSSS FNWQ+SS P FS+GF STPTGGFSFGL+SSSAAS+SAP +FGSS        SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTF STPPANND +NM+
Subjt:  AGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPAVFGSS--------SMFSFTSAATAASSQPAFGNSNHGFTFNSTPPANNDQSNMD

Query:  DSMAEDTVQAVAPST--PTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVKV
        DSMAEDTVQ VA  T  P+FGQQP TPP SSGF+FGSTAP PL A+PFQFGG QQN  TPQN +PFQ SGS D +AS+ GGSFSLG GGGDKS R+ VKV
Subjt:  DSMAEDTVQAVAPST--PTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGG-QQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLGTGGGDKSKRRIVKV

Query:  KRK
        K K
Subjt:  KRK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q555D2 Nuclear pore complex protein DDB_G0274915

1.1e-06

25.55

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Query:  QKNDKVEESSSL---KFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVDEGCSNGPVTDSSFERQEKVDGSLVA-
        +K  K ++ S+     F  PP   S+      G S+       SS+    F G S  T S        D    DE        DS+ +R++K + S  + 
Subjt:  QKNDKVEESSSL---KFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKDAVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVDEGCSNGPVTDSSFERQEKVDGSLVA-

Query:  -----VSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFS-------------FATSSSPNIRANAKSPESTL----TPEKIVP
             +   +  K    DKPS +    ++T S    T   G  + P T     +FS             F  S+  +      +P ++L    TP     
Subjt:  -----VSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFS-------------FATSSSPNIRANAKSPESTL----TPEKIVP

Query:  FEAPKAATASIFGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVS---PSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKF
          +  ++T S     +      +S SS  + +FG+  S   PS         + S+S        S    F     + FSIP   ++            F
Subjt:  FEAPKAATASIFGFGDKFPLQKASDSSAPTFVFGNKVS---PSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQASVPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKF

Query:  ASPLANEKGSAKVGSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSSSVPT----------STPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSL
         S    E   +KV + +   A + + S   FG    P T     + S++ LT   S  LF +S  T          +TP+  LF  SS SS+S++++ S 
Subjt:  ASPLANEKGSAKVGSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSSSVPT----------STPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSL

Query:  VSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNSSIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGI
         ST    ++P+T +  S T        +  AA   + P+T    ST SS+  + +  P   FGS + PST+    S P+    + T      + G  G  
Subjt:  VSTPSIFSSPATAVSNSFTNQNSSIQHSLAAAPSNSEPATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFGSPSAPSTSAPTLSAPSAVGFVETIAKQETTFGNLGGI

Query:  PPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGAAATMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGL-AGNTGSSSGSSLFGSSAPASNM
             S++ +++T  S   FG+ ++  +N  P    F          P      G +SST ST ++  SSSST   L + +T ++  + LFGS+AP++ +
Subjt:  PPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGAAATMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASSTQSTPVWSFSSSSTPFGL-AGNTGSSSGSSLFGSSAPASNM

Query:  FSSGMAFGFSSSSSSAGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPA--VFGS-----SSMFSFTSAATAASSQPAFGN---SNHG
        F S  A   + S+   G++++     + S  LF +  SSTP+    FG SSS+ +S + P+  +FGS     SS FS  +++T A+S P   N   ++  
Subjt:  FSSGMAFGFSSSSSSAGTSSSLFNWQSSSAPLFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPA--VFGS-----SSMFSFTSAATAASSQPAFGN---SNHG

Query:  FTFNSTPPAN-------NDQSNMDDSMAEDTVQAVAPSTPTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQ----PSGSFDLH
         T +STP +N       ++ ++        T    A +TP+FG  PF  PS       ST+  P  ASP  FG   +T +P   +P      P G+  + 
Subjt:  FTFNSTPPAN-------NDQSNMDDSMAEDTVQAVAPSTPTFGQQPFTPPSSSGFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQ----PSGSFDLH

Query:  ASSGGGSFSLGTGGGDKS
         SS    F    GG   S
Subjt:  ASSGGGSFSLGTGGGDKS

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

1.7e-105

34.03

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIAADPPE
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LI  SA  LF ++  KRL     PL  SPE   ++      +      E
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIAADPPE

Query:  TQEG--TDI-------------DFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQD
        T+ G   D+             D   S+ P K  G TDLE+IL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ +D  +  EE++ E      V     HE     P  +
Subjt:  TQEG--TDI-------------DFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQD

Query:  GVGSHAVPTNVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFA----SGDPSKSSTSLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSM
        G  +  V T   S   LDE +ASPA++AKAYMG RP + TP  +G   Q   ++      +  P KS T  +   P     +ENGFVTPRS GRSA+YSM
Subjt:  GVGSHAVPTNVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFA----SGDPSKSSTSLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSM

Query:  PRMPYSRVSATPSIKSVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQG---TLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSET
         R PYSR  ++  I S+           +S S WE+ + SGS+QG    LKRRSSVLD+++GSVGP+RR RQKS  L  + L+LP S + + V   G E 
Subjt:  PRMPYSRVSATPSIKSVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQG---TLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSET

Query:  PQQSTKVHPFSSSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKLRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLED
           ++K                           S  D+ P SSF+ +P +SSEMASKIL+QL+K+   +EK         SP KLSPSML GPAL+SL++
Subjt:  PQQSTKVHPFSSSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKLRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLED

Query:  VNPSKFLENVEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKD------AVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD
        V   KFL N+ + ++N   D + QK +   ES S +  +   +K+  A DG   +  +KD       V   + N     P    K +FR+SAHEDF+++D
Subjt:  VNPSKFLENVEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKD------AVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD

Query:  E--GCSNGPVTDSSFERQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSF-----------ATSSSPNIRA
        +  G ++ P   +  +   +V+ S +++           +KP    E   ST    N    QG +N     E++   +F           +  +S  I+ 
Subjt:  E--GCSNGPVTDSSFERQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSF-----------ATSSSPNIRA

Query:  NAKSPESTLTP---EKIVPFEAPKAATASIF-----------------GFGDKFPLQKASDSS-APTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQAS
          KS  S+  P   EK +P E PK   A++F                 G      L+K S ++   +  +       K   N    A S ++ +P    S
Subjt:  NAKSPESTLTP---EKIVPFEAPKAATASIF-----------------GFGDKFPLQKASDSS-APTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQAS

Query:  VPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVGSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSS-SVP
        +   F  G  A    P        N +  S   F   ++N      VG     +    ++ N S    K P ++      +SA     TS   F   + P
Subjt:  VPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVGSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSS-SVP

Query:  TSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSI-FSSPATAVSNSFTNQNSSIQHSLAAAPSNSEP-----------ATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFG
         S P  +  S    S  + + N +  +T +  F   A+A      +Q++ I     +A + S P            +T N ST+++S P  S + IF   
Subjt:  TSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSI-FSSPATAVSNSFTNQNSSIQHSLAAAPSNSEP-----------ATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFG

Query:  SPSAPSTSAPTLSAPSAVGFV--ETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA--AATMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASS
        S S P T    +SA SA               F + G       SA    STGSSVF F A  +A+  S++    + F  GN     A      SG  +S
Subjt:  SPSAPSTSAPTLSAPSAVGFV--ETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA--AATMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASS

Query:  TQSTPVWSFSSSSTP-FGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSSAGTSSSL------FNWQS-----SSAPLFSTGF--SSTPTGGFS
        TQS P    SS S P FGL+GN+  +S SS FG S     +F+S      SS++SSA +SS++       +WQ+     +S P+FS+ F  SSTPT  FS
Subjt:  TQSTPVWSFSSSSTP-FGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSSAGTSSSL------FNWQS-----SSAPLFSTGF--SSTPTGGFS

Query:  FGLSSSSAASNSAPAVFGSSS--------MFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTF----NSTPPANNDQSNMDDSMAEDTVQAVAPS--
        FG SS++  S++   +FG+S+        +F F S       QP            FGNS  GF F    N     NN Q +M+DSMAEDT QA   S  
Subjt:  FGLSSSSAASNSAPAVFGSSS--------MFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTF----NSTPPANNDQSNMDDSMAEDTVQAVAPS--

Query:  TPTFGQQPFTPPSSS-GFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLG-TGGGDKSKRRIVKVKR
         P FGQ   + P  +  F  G+   PP  A+PFQFGGQ    T QNASPFQ S S +     GGGSFSLG TGGGDKS RRI K K+
Subjt:  TPTFGQQPFTPPSSS-GFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLG-TGGGDKSKRRIVKVKR

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

1.2e-106

34.03

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIAADPPE
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LI  SA  LF ++  KRL     PL  SPE   ++      +      E
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIAADPPE

Query:  TQEG--TDI-------------DFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQD
        T+ G   D+             D   S+ P K  G TDLE+IL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ +D  +  EE++ E      V     HE     P  +
Subjt:  TQEG--TDI-------------DFVPSIKPDKTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHEASLKFPAQD

Query:  GVGSHAVPTNVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFA----SGDPSKSSTSLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSM
        G  +  V T   S   LDE +ASPA++AKAYMG RP + TP  +G   Q   ++      +  P KS T  +   P     +ENGFVTPRS GRSA+YSM
Subjt:  GVGSHAVPTNVMSANVLDEDVASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQKFGDNFA----SGDPSKSSTSLVPRSPGKFDVIENGFVTPRSHGRSALYSM

Query:  PRMPYSRVSATPSIKSVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQG---TLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSET
         R PYSR  ++  I S+           +S S WE+ + SGS+QG    LKRRSSVLD+++GSVGP+RR RQKS  L  + L+LP S + + V   G E 
Subjt:  PRMPYSRVSATPSIKSVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQG---TLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPKGLSLPSSSTSIPVSGFGSET

Query:  PQQSTKVHPFSSSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKLRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLED
           ++K                           S  D+ P SSF+ +P +SSEMASKIL+QL+K+   +EK         SP KLSPSML GPAL+SL++
Subjt:  PQQSTKVHPFSSSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEKMTPPKEKSSELKLRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLED

Query:  VNPSKFLENVEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKD------AVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD
        V   KFL N+ + ++N   D + QK +   ES S +  +   +K+  A DG   +  +KD       V   + N     P    K +FR+SAHEDF+++D
Subjt:  VNPSKFLENVEDIRSNDVRDITSQKNDKVEESSSLKFKVPPYDKSISAGDGVGSSVPTKD------AVPSSIMNVSFVGPSSQTKSAFRLSAHEDFVDVD

Query:  E--GCSNGPVTDSSFERQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSF-----------ATSSSPNIRA
        +  G ++ P   +  +   +V+ S +++           +KP    E   ST    N    QG +N     E++   +F           +  +S  I+ 
Subjt:  E--GCSNGPVTDSSFERQEKVDGSLVAVSKLSDTKAITVDKPSASDEIKSSTVSEMNKTNVQGKANVPETAEKSPIFSF-----------ATSSSPNIRA

Query:  NAKSPESTLTP---EKIVPFEAPKAATASIF-----------------GFGDKFPLQKASDSS-APTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQAS
          KS  S+  P   EK +P E PK   A++F                 G      L+K S ++   +  +       K   N    A S ++ +P    S
Subjt:  NAKSPESTLTP---EKIVPFEAPKAATASIF-----------------GFGDKFPLQKASDSS-APTFVFGNKVSPSKNEQNDVPVAISESNVSPCQQAS

Query:  VPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVGSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSS-SVP
        +   F  G  A    P        N +  S   F   ++N      VG     +    ++ N S    K P ++      +SA     TS   F   + P
Subjt:  VPTTFKFGDKAAFSIPEIAATENGNKNAGSLIKFASPLANEKGSAKVGSASVFIAESFSSSNPSFGVPKEPVTDKGGDNRSSAGLTVGTSGNLFSS-SVP

Query:  TSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSI-FSSPATAVSNSFTNQNSSIQHSLAAAPSNSEP-----------ATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFG
         S P  +  S    S  + + N +  +T +  F   A+A      +Q++ I     +A + S P            +T N ST+++S P  S + IF   
Subjt:  TSTPTPTLFSFSSPSSNSNLNNGSLVSTPSI-FSSPATAVSNSFTNQNSSIQHSLAAAPSNSEP-----------ATTTNLSTSSSSMPSFSAAPIFKFG

Query:  SPSAPSTSAPTLSAPSAVGFV--ETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA--AATMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASS
        S S P T    +SA SA               F + G       SA    STGSSVF F A  +A+  S++    + F  GN     A      SG  +S
Subjt:  SPSAPSTSAPTLSAPSAVGFV--ETIAKQETTFGNLGGIPPSDTSAAKVSSTGSSVFQFGA--AATMDSNKRPEHSSFAPGNEPAFGAPVLPASSGVASS

Query:  TQSTPVWSFSSSSTP-FGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSSAGTSSSL------FNWQS-----SSAPLFSTGF--SSTPTGGFS
        TQS P    SS S P FGL+GN+  +S SS FG S     +F+S      SS++SSA +SS++       +WQ+     +S P+FS+ F  SSTPT  FS
Subjt:  TQSTPVWSFSSSSTP-FGLAGNTGSSSGSSLFGSSAPASNMFSSGMAFGFSSSSSSAGTSSSL------FNWQS-----SSAPLFSTGF--SSTPTGGFS

Query:  FGLSSSSAASNSAPAVFGSSS--------MFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTF----NSTPPANNDQSNMDDSMAEDTVQAVAPS--
        FG SS++  S++   +FG+S+        +F F S       QP            FGNS  GF F    N     NN Q +M+DSMAEDT QA   S  
Subjt:  FGLSSSSAASNSAPAVFGSSS--------MFSFTSAATAASSQPA-----------FGNSNHGFTF----NSTPPANNDQSNMDDSMAEDTVQAVAPS--

Query:  TPTFGQQPFTPPSSS-GFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLG-TGGGDKSKRRIVKVKR
         P FGQ   + P  +  F  G+   PP  A+PFQFGGQ    T QNASPFQ S S +     GGGSFSLG TGGGDKS RRI K K+
Subjt:  TPTFGQQPFTPPSSS-GFLFGSTAPPPLAASPFQFGGQQNTPTPQNASPFQPSGSFDLHASSGGGSFSLG-TGGGDKSKRRIVKVKR

AT5G20200.1 nucleoporin-related

1.3e-20

27.6

Show/hide

Query:  GGRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIAADPPETQEG-T
        GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S++VDPA ++I+  A  +    FS     P    P       E  N++QGE+  +P +     T
Subjt:  GGRGGKFQKRPLRRSNTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLIASSAHMLFSTVFSKRLPPPPAPLPVSPEANDEMGNENQGEIAADPPETQEG-T

Query:  DIDFVP---SIKPDKTHG--------------------------VTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHE
         I   P   SI+     G                          +++LE++++ KTF++ EIDRL E++ SR  D+P    + +  ++P   +       
Subjt:  DIDFVP---SIKPDKTHG--------------------------VTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVSDVPSGVEERKFEQVPSTAVISYGVHE

Query:  ASLKFPAQDGVGSH-------AVPTNVMSANVLDEDV------ASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQK--FGDNFASGDPSKSSTSLVPRS--PGK
         SL   A++ +G         A PT +  + +LD D        SPAE+AKAYMG +   ++     + ++K     +   G  S +S S  P +  PG 
Subjt:  ASLKFPAQDGVGSH-------AVPTNVMSANVLDEDV------ASPAEIAKAYMGRRPPKATPLSMGSLSQK--FGDNFASGDPSKSSTSLVPRS--PGK

Query:  FDVIENGFVTPRSHGRS-ALYSMPRMPYSRVSATPSIKSVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPK
            ++GF TP+S   S  L + PR PYSR   + S   +  +    +   S+  +  Q +    + G L +       + G  GP RRTRQ +T   P 
Subjt:  FDVIENGFVTPRSHGRS-ALYSMPRMPYSRVSATPSIKSVATIDAYRATGSSSQSAWEQEIFSGSKQGTLKRRSSVLDDEMGSVGPIRRTRQKSTLLYPK

Query:  GLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQQSTKVHPFSSSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEK---MTPPKEKSSELKL
         +S P S  S   S F +    +       SS  G++ Y S   RS      K K   +       +P  SS++A  IL+ LE+    + PK K++ELKL
Subjt:  GLSLPSSSTSIPVSGFGSETPQQSTKVHPFSSSVGKALYSSDTKRSSFQMSVKSKNDMKPSSSFHQIPLRSSEMASKILEQLEK---MTPPKEKSSELKL

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGACCGAGCGTGAGGAGATTCGTTACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAATTCCAGAAACGCCCTCTCAGAAGGTCGAACACGACGCCGTATGATCGCCCGCCGACTGC
TCTGCGAAACTCCGCCGGAAAAGGATGGCTCTCTAAGCTCGTCGATCCGGCGCAGAAGCTCATCGCCTCCAGCGCGCATATGCTGTTTTCTACCGTGTTTTCTAAACGCC
TGCCCCCTCCGCCCGCGCCATTGCCAGTTTCTCCAGAGGCAAATGATGAGATGGGAAATGAGAACCAGGGAGAAATTGCAGCTGATCCTCCTGAAACTCAAGAAGGGACA
GATATTGATTTTGTTCCGAGCATCAAACCTGATAAGACACATGGGGTAACTGACCTTGAGCAAATATTGAAGGAGAAGACCTTTACGAGGTTTGAGATTGATCGTTTGAC
TGAACTTCTAAAATCAAGAGTTTCTGATGTTCCAAGTGGTGTTGAAGAGAGGAAGTTTGAACAGGTCCCTTCAACGGCTGTTATCAGTTATGGAGTACATGAAGCATCGT
TAAAATTTCCAGCTCAAGATGGAGTTGGCTCTCATGCGGTTCCAACAAATGTTATGAGTGCAAATGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCG
TACATGGGCCGTAGGCCTCCTAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGGGTCCCTTAGTCAAAAGTTTGGGGATAATTTTGCTTCTGGCGATCCCTCAAAATCCTCTACATCTCT
TGTGCCAAGGTCTCCGGGAAAATTTGATGTTATTGAAAATGGTTTTGTCACCCCAAGATCTCACGGCAGATCTGCTCTTTACAGTATGCCTCGAATGCCATATTCCAGAG
TTAGTGCAACCCCTAGCATTAAGAGTGTAGCAACAATAGATGCATACAGGGCAACAGGGTCCTCATCTCAGTCAGCATGGGAGCAGGAGATATTTTCGGGCTCTAAACAA
GGGACTTTAAAACGCAGAAGCTCAGTTTTAGACGATGAAATGGGTTCTGTTGGTCCTATTCGAAGAACTCGTCAGAAATCCACTCTCCTTTACCCAAAAGGTCTGAGTTT
GCCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTTAGTGGGTTTGGTTCTGAGACTCCCCAGCAGTCTACAAAAGTGCATCCATTTTCTTCTTCTGTTGGGAAGGCACTTTATTCGA
GTGACACCAAGCGGAGTTCGTTCCAAATGTCTGTGAAGTCCAAAAATGATATGAAACCTAGTTCAAGTTTTCATCAAATTCCTCTCAGGTCAAGTGAGATGGCCTCAAAA
ATTTTAGAGCAGCTTGAGAAAATGACCCCGCCGAAGGAAAAGTCTTCTGAATTAAAGCTGAGAAATAACTCACCCATGAAGTTGTCACCATCAATGTTGCATGGTCCAGC
TCTTAGAAGTCTGGAAGATGTGAATCCGTCTAAGTTCTTGGAAAATGTTGAAGACATTCGGTCTAACGATGTCCGGGATATTACTTCTCAAAAGAACGATAAGGTTGAGG
AAAGCAGTTCGTTAAAATTTAAAGTACCACCCTATGATAAATCTATTTCTGCAGGTGATGGTGTAGGTTCTTCAGTTCCTACGAAGGATGCTGTACCTAGTTCTATTATG
AACGTTTCATTTGTTGGCCCTTCCTCTCAAACAAAGTCTGCTTTCCGGCTGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATGTGGATGAAGGATGTTCTAATGGGCCAGTGACTGA
TAGTTCATTTGAAAGGCAAGAAAAAGTGGATGGCTCATTAGTGGCAGTGAGTAAGCTGAGTGATACTAAAGCCATCACAGTCGATAAACCTTCGGCTTCAGATGAGATTA
AATCATCCACTGTATCCGAAATGAACAAAACAAATGTCCAGGGAAAAGCTAATGTTCCTGAGACTGCTGAAAAGAGCCCCATTTTTTCATTTGCAACATCATCTTCACCT
AACATTAGAGCCAATGCGAAAAGCCCTGAATCAACCTTGACGCCCGAAAAAATTGTTCCATTTGAGGCACCAAAAGCAGCTACTGCCTCTATATTTGGCTTTGGAGATAA
GTTTCCATTACAGAAGGCATCAGATTCTTCTGCTCCCACCTTTGTTTTTGGAAACAAGGTTTCCCCCTCAAAAAATGAACAAAATGATGTTCCTGTTGCAATTTCTGAAA
GCAATGTTTCACCTTGCCAACAAGCTTCTGTTCCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTGCATTTTCTATACCAGAAATTGCTGCTACCGAAAACGGAAATAAGAAC
GCAGGGTCTCTGATTAAATTTGCATCACCTTTAGCCAATGAAAAAGGAAGTGCTAAAGTGGGTAGTGCATCAGTTTTTATAGCAGAAAGTTTTAGCAGCAGCAACCCGTC
GTTTGGAGTTCCGAAAGAGCCCGTGACAGATAAAGGCGGTGATAACAGATCAAGTGCTGGTCTCACAGTTGGTACGTCTGGAAATTTGTTTTCGTCATCTGTCCCAACAT
CAACACCAACTCCCACTTTATTTTCCTTTAGCTCCCCTAGCAGTAATTCAAATCTTAATAACGGATCTCTTGTTTCTACCCCATCTATTTTTTCCTCCCCAGCCACTGCC
GTTTCCAATAGTTTTACAAATCAAAATTCATCCATCCAACACTCCCTCGCTGCTGCCCCTAGCAACAGTGAGCCTGCCACCACTACTAATCTTTCTACGTCTTCTTCTTC
TATGCCATCCTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTCGGGAGCCCTAGCGCTCCTTCAACTTCTGCTCCAACACTATCAGCACCGAGCGCAGTTGGATTCGTTGAAACCA
TCGCCAAGCAAGAAACAACCTTTGGCAATTTAGGTGGCATTCCTCCAAGCGACACATCTGCTGCTAAAGTATCTAGTACTGGAAGCAGCGTTTTTCAATTCGGAGCTGCA
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TCAGAGTACACCGGTTTGGTCATTTAGTTCATCGTCTACACCATTTGGTTTGGCTGGGAATACGGGTTCGTCTTCTGGCAGTTCTCTGTTTGGTTCTTCAGCACCGGCCT
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Sed0023754 (gene) of Chayote v1 genome