; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0024182 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0024182
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:1911446..1912298
RNA-Seq ExpressionSed0024182
SyntenySed0024182
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058005.1 hypothetical protein E6C27_scaffold274G003090 [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-3468.52Show/hide
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KAG6589576.1 hypothetical protein SDJN03_14999, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-4076.85Show/hide
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KGN63749.1 hypothetical protein Csa_013996 [Cucumis sativus]2.0e-3969.75Show/hide
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PON92695.1 hypothetical protein TorRG33x02_115550 [Trema orientale]7.0e-2456.73Show/hide
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TYK28377.1 hypothetical protein E5676_scaffold629G00030 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-3469.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRV9 Uncharacterized protein9.8e-4069.75Show/hide
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A0A2P5AKC8 Uncharacterized protein7.5e-2456.73Show/hide
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A0A2P5F4J0 Uncharacterized protein3.4e-2456.73Show/hide
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A0A5A7UWL1 Uncharacterized protein2.1e-3468.52Show/hide
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A0A5D3DX07 Uncharacterized protein9.5e-3569.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTCACAGAGAATCCATCAAAGGCATCAAAACAAAGAATGAAACTGTGCATAAGAAGAGCTGTGCCTACCAAGTTTGGGATTTCATTCACAATTCCAGACAGAAT
GGCCACAGAAATCAATGACAAGAAGAGAATTAGTGGATTGCACCCTCTTAGAATTATCAGAATCCCATTTGGTGGGCCATTGGAGTTTCATCAAATTGTAAAAGAGGCTC
AAAAAGTTTCTCCTCCACTGAAGATTCAGCAGCAAGGTAAGCCACCAAATCCCAAAGCAGAATATCATAGGAGCTGCCTGAATCACTGGCATCCCCAAGTGTTTCATTTC
AGCAAATGTATAGTTTGCAGAGATGGAGTTGGTAACGCCAACGAAAGCAATAGTTCAACCGACATAAATATGTACCCGTTATTTCTTGATCATAGTTCAAATCTCTCCAC
TCCAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGCATTCTGCAGTTAAAAACTTCAACACACCAATGATCACAGCCAAACCAAACCAAATCAACAAACAAATATCATCACAAAAAACACTTTTCATTTCTCAATAAGCCAC
AAAAATGGAGCTCACAGAGAATCCATCAAAGGCATCAAAACAAAGAATGAAACTGTGCATAAGAAGAGCTGTGCCTACCAAGTTTGGGATTTCATTCACAATTCCAGACA
GAATGGCCACAGAAATCAATGACAAGAAGAGAATTAGTGGATTGCACCCTCTTAGAATTATCAGAATCCCATTTGGTGGGCCATTGGAGTTTCATCAAATTGTAAAAGAG
GCTCAAAAAGTTTCTCCTCCACTGAAGATTCAGCAGCAAGGTAAGCCACCAAATCCCAAAGCAGAATATCATAGGAGCTGCCTGAATCACTGGCATCCCCAAGTGTTTCA
TTTCAGCAAATGTATAGTTTGCAGAGATGGAGTTGGTAACGCCAACGAAAGCAATAGTTCAACCGACATAAATATGTACCCGTTATTTCTTGATCATAGTTCAAATCTCT
CCACTCCAAAATGATTTCTCGAGAGTACGAATCTCTCCACTCCAACATGATTTCTTGACATGAGTTCGAATCTCTCCCCTCCAAATTGAAGTTGAACTCAGAAAAGAGAT
GCAGTTGGTAACAAACTTGTTGGATGGTGTAACTGCCAAAAGTATTTATATTTAGTCATAATTCATGTTTGATTAGCTTTTAGAATCTTTTTGTGGGGTTTTTTTCTCCC
TTTCTTGGAGGCAAACCACTCAGTTTCTACAAATGTTTTCTTAGTAAACAATGGAAGGTACATGTCAATTATCATTAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELTENPSKASKQRMKLCIRRAVPTKFGISFTIPDRMATEINDKKRISGLHPLRIIRIPFGGPLEFHQIVKEAQKVSPPLKIQQQGKPPNPKAEYHRSCLNHWHPQVFHF
SKCIVCRDGVGNANESNSSTDINMYPLFLDHSSNLSTPK