; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0024565 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0024565
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationLG10:35401483..35420930
RNA-Seq ExpressionSed0024565
SyntenySed0024565
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022547.1 hypothetical protein SDJN02_16281 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.9e-6389.86Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KG+GTDRWT AV+NL+EMASNLES  KLLLKKAVYVDD+TF+RASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQK AELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.2e-6390.54Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+ AV+N++EMASNLESL K+L+KKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
XP_022967634.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]2.3e-6491.22Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+DAV+N++EMASNLESL K+L+KKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
XP_022967635.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X2 [Cucurbita maxima]5.8e-6391.72Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+DAV+N++EMASNLESL K+L+KKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]5.8e-6390.54Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+ AV+NL+EMASNLESL KLLLKKAVYVDD+TF+RASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein6.2e-6389.19Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+ AV+NL+EM SNL+SL KLLLKKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVTKELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG++
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X15.6e-6490.54Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+ AV+N++EMASNLESL K+L+KKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
A0A6J1HV17 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X22.8e-6391.72Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+DAV+N++EMASNLESL K+L+KKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X11.1e-6491.22Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRW+DAV+N++EMASNLESL K+L+KKAVYVDD+TF+RASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
A0A6J1JEJ3 uncharacterized protein LOC1114861888.2e-6389.86Show/hide
Query:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        ME+KGKGTDRWT AV+NL+EMASNLE   KLLLKKAVYVDD+TF+RASLCS+QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELR KQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein2.8e-5577.85Show/hide
Query:  MEEKGKGTD-RWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV
        MEE+  G+D RW  ++ N++EMASNL+SL KLLLKKAV+V++DTFSRASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEEKGKGTD-RWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV

Query:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ
        Q+VTKELENTTKVF+LHM+ELRG QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  QEVTKELENTTKVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAGAAGGGCAAAGGAACGGACCGATGGACCGATGCTGTATCCAATCTCTCAGAGATGGCTTCTAACCTAGAATCTCTCCACAAGCTTTTGCTCAAGAAAGCCGT
CTATGTCGACGACGACACGTTTTCCAGAGCTTCTTTGTGCTCCGAACAAGCCAGGACCATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTG
CTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAAAAACGCCAGGCTGAGGCAGCACAGAAAGCTGCTGAACTTCATGTGCAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTGTTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGTGGGAAGCAGGAAGAAATCAACAAACGTGACAAAGATATTAAGCTCTTGGAAGCTATAATTCAGACTCTTGGTGGGAA
ACAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTTAAAAAAATTGTATTTAAAAAAAAAACACTTTCAAGCAAGCCCAGAAATACTGAAAAATCGAAAGCAAAAGTGGGACAGGGATCATGAAGTTCATCGACAATTGAA
TCGCAAATCTGCAGAAAGTTTAAGCGTCGAAGAAGAAGATTGGAATCCAATCATGGAGGAGAAGGGCAAAGGAACGGACCGATGGACCGATGCTGTATCCAATCTCTCAG
AGATGGCTTCTAACCTAGAATCTCTCCACAAGCTTTTGCTCAAGAAAGCCGTCTATGTCGACGACGACACGTTTTCCAGAGCTTCTTTGTGCTCCGAACAAGCCAGGACC
ATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGCTCAGAAAAACGCCAGGCTGAGGCAGCACAGAA
AGCTGCTGAACTTCATGTGCAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTGTTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGTGGGAAGCAGGAAGAAATCAACAAAC
GTGACAAAGATATTAAGCTCTTGGAAGCTATAATTCAGACTCTTGGTGGGAAACAATGACTTTCTGCAAATCAGGTGCTAGTGGATAATGTCAAGTCAGTAGGCATCTCT
GGTTTCAAATATTGGACCCATGAAGGTGACCTTTGCAAGATTCAACCAACCATTGCAGTAAAGTAAGACCTTTGGCCTTAAGTTTTCACCTAACCACTCTAAATCTTTCT
GGATAAGAAACATTTTCATTGCTATTGGATTTGGATGAACTACCCTAACGATCGAAGAAGTATGATCGAGTTTTGTTGTTCTGAGAACTTGTTTGGTTTTTTGGAGTTCC
TCAAAATAAAACGAGTTGTGTCGAAACGAGTGTTAAACCTGAATACTGTGGTGTAGAATAAACACTTTGAAAGTTTGTTTTATATCCTCTGTAAATCAACTTGCAGGTAT
AATGCTTAATTTTCCAAAGATTTTAAGCTTAGAAACCAAGCTCAATGTGCTTACATAGTACAATGTTCTTGATGGAATAGAAACCAAGATTTTAGTTTTTATTTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEEKGKGTDRWTDAVSNLSEMASNLESLHKLLLKKAVYVDDDTFSRASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQEVTKELENTT
KVFQLHMDELRGKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKQ