; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0024598 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0024598
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationLG07:6440251..6442612
RNA-Seq ExpressionSed0024598
SyntenySed0024598
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006459 - Casparian strip membrane protein
IPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031116.1 CASP-like protein 2A1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-7879.8Show/hide
Query:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA
        KYS  GGA         DESL+ +GMR ADT+LRL  MG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVH NGICAGYSFLSAVVAAM RPS+MSKA
Subjt:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA

Query:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSFG+FC+KA ASV+ITFVVVA+YA ISI+SSYKLF RY+APM DPSK LEISAF G
Subjt:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

XP_022142751.1 CASP-like protein 2A1 [Momordica charantia]1.2e-7984.13Show/hide
Query:  YSNG-GGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQ
        YSNG G   DE L G GMRAADT LRL+PMG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPS+MSKAWT F LDQ
Subjt:  YSNG-GGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQ

Query:  LLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFH
        LLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSF +FC+KA  SVIITFVVVA YA ISI+SSYKLFSRY APMADPSK LEI+AFH
Subjt:  LLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFH

XP_022941677.1 CASP-like protein 2A1 [Cucurbita moschata]1.7e-7879.8Show/hide
Query:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA
        KYS  GGA         DESL+ +GMR ADT+LRL  MG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVH NGICAGYSFLSAVVAAM RPS+MSKA
Subjt:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA

Query:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSFG+FC+KA ASV+ITFVVVA YA ISI+SSYKLF RY+APM DPSK LEISAF G
Subjt:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

XP_022982561.1 CASP-like protein 2A1 [Cucurbita maxima]2.2e-7879.29Show/hide
Query:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA
        KYS  GGA         DESL+ +GMR ADT+LRL  MG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVH NGICAGYSFLSAVVAAM RPS+MSKA
Subjt:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA

Query:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSFG+FC+KA ASV+ITFVVVA YA ISI+SSYKLF RY+APM DPSK LE+SAF G
Subjt:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

XP_023525986.1 CASP-like protein 2A1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.5e-7878.5Show/hide
Query:  KYSNGGGAP----------DESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMS
        KYS  GGA           DE+L+ +GMR ADT+LRL  MG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVH NGICAGYSFLSAVVAAM RPS+MS
Subjt:  KYSNGGGAP----------DESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMS

Query:  KAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        KAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSFG+FC+KA ASV+ITFVVVA YA ISI+SSYKLF RY+APM DPSK LEISAF G
Subjt:  KAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BSC6 CASP-like protein1.2e-7475Show/hide
Query:  KYSN----GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLF
        KY+N    G  + D+SLA TGMRAADT+LRL+PMG C+AALIVML+NS+ NDYGSV+YSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSA VAAM  PS++SKAWTLF
Subjt:  KYSN----GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLF

Query:  FLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPS--KNLEISAFHG
        FLDQLLTY+TLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACG+FG+FC+KA ASV+ITF+VVA YA ISI+SSYKLFSRYNAP+  P+  + L++  FHG
Subjt:  FLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPS--KNLEISAFHG

A0A5A7VB95 CASP-like protein1.2e-7475Show/hide
Query:  KYSN----GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLF
        KY+N    G  + D+SLA TGMRAADT+LRL+PMG C+AALIVML+NS+ NDYGSV+YSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSA VAAM  PS++SKAWTLF
Subjt:  KYSN----GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLF

Query:  FLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPS--KNLEISAFHG
        FLDQLLTY+TLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACG+FG+FC+KA ASV+ITF+VVA YA ISI+SSYKLFSRYNAP+  P+  + L++  FHG
Subjt:  FLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPS--KNLEISAFHG

A0A6J1CN49 CASP-like protein5.7e-8084.13Show/hide
Query:  YSNG-GGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQ
        YSNG G   DE L G GMRAADT LRL+PMG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPS+MSKAWT F LDQ
Subjt:  YSNG-GGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQ

Query:  LLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFH
        LLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSF +FC+KA  SVIITFVVVA YA ISI+SSYKLFSRY APMADPSK LEI+AFH
Subjt:  LLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFH

A0A6J1FN57 CASP-like protein8.2e-7979.8Show/hide
Query:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA
        KYS  GGA         DESL+ +GMR ADT+LRL  MG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVH NGICAGYSFLSAVVAAM RPS+MSKA
Subjt:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA

Query:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSFG+FC+KA ASV+ITFVVVA YA ISI+SSYKLF RY+APM DPSK LEISAF G
Subjt:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

A0A6J1IZN6 CASP-like protein1.1e-7879.29Show/hide
Query:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA
        KYS  GGA         DESL+ +GMR ADT+LRL  MG CVAALIVML+NSQT+DYGSV+YSDLGAFKFLVH NGICAGYSFLSAVVAAM RPS+MSKA
Subjt:  KYSNGGGA--------PDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKA

Query:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTE  WS ACGSFG+FC+KA ASV+ITFVVVA YA ISI+SSYKLF RY+APM DPSK LE+SAF G
Subjt:  WTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A7QBZ2 CASP-like protein 2A16.1e-6363.24Show/hide
Query:  GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTY
        G G  DES   + MR  +T+LRL+P+  C  +L+VML+NSQTND+GS+SYSDLGAF++LVHANGICAGYS LSA+  AMPRP +MS+AWT F LDQ+LTY
Subjt:  GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTY

Query:  ITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFH
        + LAAG VSTEV+YLAY GD    WS+AC SFG FC K  AS+ ITFV V  YA++S+ISSYKLFS+Y+AP+    K +EI+AFH
Subjt:  ITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFH

B9I0G0 CASP-like protein 2A14.0e-6267.05Show/hide
Query:  RAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLY
        R A+T+LRL+PM  CV+AL+VML+N+QTNDYGS+SYSDLGAF++LVH NGICAGYS LSAV+ AMPR S+M +AW  F LDQ+LTY+ LAAGTVSTEVLY
Subjt:  RAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLY

Query:  LAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP-MADPSKNLEISAFHG
        LA  GDT   WSEAC SFG FC+KA  S++ITFVVV  YA +S++SSYKLFS+Y++P +  P K +EI+ FHG
Subjt:  LAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP-MADPSKNLEISAFHG

B9T3K6 CASP-like protein 2A14.2e-6463.59Show/hide
Query:  GAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYIT
        G+ D+ L    MR A+TVLRL+PM FC++AL++ML+NSQTND+G++SYSDLGAF++LVHANGICAGYS LSA++ AMPRPS+MS+AWT FFLDQ+LTY+ 
Subjt:  GAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYIT

Query:  LAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP-MADPSKNLEISAFH
        LAA  VS E LYLA  GD    WS AC SFG FC+KA  S +ITF+VV  YA++S++SSYKLFSRY AP ++ P K +E++AFH
Subjt:  LAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP-MADPSKNLEISAFH

C6TCJ2 CASP-like protein 2A22.0e-6162.5Show/hide
Query:  DESLAG---TGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYIT
        D  L G   + +R A+T LRL P+G CV+AL++ML++SQ N+YGSV YSDLGAF++LVHANGICAGYS  SAV+AAMP PS++ +AWT F LDQ+LTYI 
Subjt:  DESLAG---TGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYIT

Query:  LAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        LAAG VSTEVLYLA NGD  T WS ACGSFG+FC+K  ASV ITFV V  Y ++S++SSYKLF++Y+AP + P++ +E++AF G
Subjt:  LAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

Q8W4Z5 CASP-like protein F162.2e-6059.68Show/hide
Query:  GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTY
        G    +     T MR A+T+LRL+PM   VAAL+VML+NSQ+ND+GSVSYSDLGAF++LVHANGICAGYS LSA++AA+P PS+M +AWT F LDQ+LTY
Subjt:  GGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTY

Query:  ITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG
        + L A  VSTEVLYLA  GD+   WS ACG+F  FC+KA  +V+ITFV V  YA++S++SSY+LF++++AP+  PSK +E + FHG
Subjt:  ITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17200.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)3.4e-6160.8Show/hide
Query:  NNNHKKYSNG--GGAPDESLAGT--GMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSS-MS
        +N+H K S+G  GG   E    T  G+R A+T+LRL P+G CVAAL+VML++S+TN++GS+SYS+L AF++LVHANGICAGYS LSA +AAMPR SS M 
Subjt:  NNNHKKYSNG--GGAPDESLAGT--GMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSS-MS

Query:  KAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP-MADPSKNLEISAF
        + WT F LDQLLTY+ LAAG VS EVLYLAYNGD+   WS+AC S+G FC++A ASVIITF VV  Y ++S+ISSYKLF+R++ P + D +KNLE++ F
Subjt:  KAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP-MADPSKNLEISAF

AT1G17200.2 Uncharacterised protein family (UPF0497)8.5e-3663.03Show/hide
Query:  GYSFLSAVVAAMPRPSS-MSKAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFS
        GYS LSA +AAMPR SS M + WT F LDQLLTY+ LAAG VS EVLYLAYNGD+   WS+AC S+G FC++A ASVIITF VV  Y ++S+ISSYKLF+
Subjt:  GYSFLSAVVAAMPRPSS-MSKAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFS

Query:  RYNAP-MADPSKNLEISAF
        R++ P + D +KNLE++ F
Subjt:  RYNAP-MADPSKNLEISAF

AT3G14380.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)7.9e-4251.9Show/hide
Query:  RAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAV-VAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVL
        ++A+ VLR+  M   +  L++M++NS +N++GSVSYS++GAF +LV ANG+CA YS LSA+ + A+P P S  +  TLF LDQ++TY+ LAAG VS E +
Subjt:  RAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAV-VAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVL

Query:  YLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP
        YLAY G+    WS AC S+G FC+ A  SV+ TFVV  LY ++S+ISSY+LF+R+ AP
Subjt:  YLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAP

AT5G06200.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)3.1e-1433.12Show/hide
Query:  GMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGS------VSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSA--VVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYITLA
        G+   D +LRL  +   +AA   M  + +T  + +       SY DL  F+F V A  I AGY  LS    V  + RP +++    L  LD     +  A
Subjt:  GMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGS------VSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSA--VVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTYITLA

Query:  AGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKL
        A + +  ++YLA+NG+T T W   C  FG FC K   +V+  F  V   AI+ +IS   L
Subjt:  AGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKL

AT5G54980.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)5.5e-1928.72Show/hide
Query:  NNNHKKYSNGGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTN-DYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWT
        NN  ++  +      +  A   ++  D+ LRL  +   VA + + + N ++N DYG++ Y+ +   K++V  + I A Y+ LS V + +     +SKAW 
Subjt:  NNNHKKYSNGGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTN-DYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWT

Query:  LFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKN
         F  DQ+L Y+   +   +TE++YL   GD    WSE C S+  +C+K   ++ +   V+  +  +S+IS+Y+ FS ++ P    + N
Subjt:  LFFLDQLLTYITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACAACAACCACAAAAAATACAGCAACGGCGGCGGAGCACCCGACGAGAGCCTCGCCGGAACAGGGATGCGGGCGGCGGACACGGTGCTCCGCCTCCTTCCGATGGG
GTTCTGCGTGGCGGCGCTCATCGTCATGCTAGAGAATTCTCAGACCAACGACTATGGCTCTGTTTCGTACTCTGATCTTGGAGCTTTCAAGTTTTTGGTGCACGCTAATG
GGATTTGTGCTGGGTACTCGTTTTTGTCGGCGGTGGTGGCCGCCATGCCTCGACCTTCATCCATGTCCAAAGCTTGGACTCTGTTTTTTCTTGATCAGCTGCTGACCTAC
ATAACCCTAGCGGCCGGGACGGTGTCGACCGAGGTGCTGTACTTAGCCTACAACGGAGACACCGAAACAGCTTGGAGTGAAGCGTGCGGCTCATTCGGCCAGTTCTGCAA
CAAAGCCAGAGCCTCAGTGATCATCACATTTGTTGTGGTTGCTTTGTATGCTATAATTTCCATTATATCTTCTTACAAACTGTTCAGCAGATACAATGCTCCCATGGCAG
ATCCTTCCAAGAACCTTGAGATTTCAGCCTTCCATGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAACCACAAAAGCAAGATGATGATGAAGCCTTATATTTGTACACACAAACCCCAACCAAACTCCCACCTCAATTATTTCTCACGAAATCTCAAGATCCCATCTCTCCAAT
ATGAACAACAACCACAAAAAATACAGCAACGGCGGCGGAGCACCCGACGAGAGCCTCGCCGGAACAGGGATGCGGGCGGCGGACACGGTGCTCCGCCTCCTTCCGATGGG
GTTCTGCGTGGCGGCGCTCATCGTCATGCTAGAGAATTCTCAGACCAACGACTATGGCTCTGTTTCGTACTCTGATCTTGGAGCTTTCAAGTTTTTGGTGCACGCTAATG
GGATTTGTGCTGGGTACTCGTTTTTGTCGGCGGTGGTGGCCGCCATGCCTCGACCTTCATCCATGTCCAAAGCTTGGACTCTGTTTTTTCTTGATCAGCTGCTGACCTAC
ATAACCCTAGCGGCCGGGACGGTGTCGACCGAGGTGCTGTACTTAGCCTACAACGGAGACACCGAAACAGCTTGGAGTGAAGCGTGCGGCTCATTCGGCCAGTTCTGCAA
CAAAGCCAGAGCCTCAGTGATCATCACATTTGTTGTGGTTGCTTTGTATGCTATAATTTCCATTATATCTTCTTACAAACTGTTCAGCAGATACAATGCTCCCATGGCAG
ATCCTTCCAAGAACCTTGAGATTTCAGCCTTCCATGGCTGAGATTTATAATTGCTGAATTTCCTCTTTGCCCTTTTGCTTTGTTTTTTATAACACTCGTAGCTTTTAATG
AAGAGAGCTTTGTGATGTGTAATTGTATAAACTGTTTATGCAAAAGCTGTAACTTTTAAGGTGGTGTGTGAAATGCAATGGTAATAACTGCTTTGGTTTCAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNNNHKKYSNGGGAPDESLAGTGMRAADTVLRLLPMGFCVAALIVMLENSQTNDYGSVSYSDLGAFKFLVHANGICAGYSFLSAVVAAMPRPSSMSKAWTLFFLDQLLTY
ITLAAGTVSTEVLYLAYNGDTETAWSEACGSFGQFCNKARASVIITFVVVALYAIISIISSYKLFSRYNAPMADPSKNLEISAFHG