; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0024639 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0024639
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionCLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 43
Genome locationLG07:36341987..36349402
RNA-Seq ExpressionSed0024639
SyntenySed0024639
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR040274 - CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 27/43


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573960.1 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 27, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-2764.86Show/hide
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KAG6601288.1 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 43, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-2564.22Show/hide
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KAG7015490.1 hypothetical protein SDJN02_23126, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-1758Show/hide
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        M TRRIA SSSFA+LILI+WV QIWVF C SQ  A+RI PPPPP      T D T      D +N RYELL KYFKDRA +DPHRH      +GF D ++
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KAG7032076.1 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 43, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.9e-2564.22Show/hide
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KGN52083.1 hypothetical protein Csa_008231 [Cucumis sativus]1.3e-2158.26Show/hide
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        M  RRI TSSS      FA+LILI+WV QIWV CH Q  A+RI     PPPPP  AD +L+G  KD  N + +LL KYF  RA       RH RH +GFE
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061E6F8 Clavata3/esr-related 43, putative1.2e-0738.46Show/hide
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        S+R++  SS   +++LI++ LQIWV C  +  A RILP    R    +    G   + G+ +L  KYF  R+          +  +GFE+SKR++PSCPD
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A0A067JZV1 Uncharacterized protein1.3e-0636.7Show/hide
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        S RRI  SSS  +++L+++VLQIWVF  C+ +  A RI P        + +  +T     +S        K+F  R           R  +GFE++KR++
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A0A0A0KR66 Uncharacterized protein6.5e-2258.26Show/hide
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        M  RRI TSSS      FA+LILI+WV QIWV CH Q  A+RI     PPPPP  AD +L+G  KD  N + +LL KYF  RA       RH RH +GFE
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A0A6A1W705 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 432.2e-0641.67Show/hide
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        S  +++LI+ VLQIWV C     A  I   P    A  T  G+ G      + ELL KYF  R           R   GFE+SKR++PSCPDPLHN
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A0A6J1DAV9 uncharacterized protein LOC1110186337.7e-1551.43Show/hide
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        M TRRIA    ++SSFA+LILI+WV QIWV CH Q  A+RILPPP        LTG  K  ++G+ EL+ KY + RA       RH    +GFEDSKR++
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        PSC D
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G25425.1 CLAVATA3/ESR-RELATED 436.0e-0428.42Show/hide
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        +F++ +L++ + QIW+F   +     +      +  +T +T   K+ +     L  +YFK R+               FEDS R+IPS PD LHN
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AT3G25905.1 CLAVATA3/ESR-RELATED 279.3e-0533.65Show/hide
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        R + +++  M+IL+ ++L +  FC +S+V A RI P  P          +GK       +L+ KYF       +D         G+G  +SKR +PSCPD
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        PLHN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTACCAGAAGAATTGCCACTTCCTCTTCTTTTGCGATGCTGATTTTGATCATGTGGGTGTTGCAGATTTGGGTTTTTTGTCACTCCCAAGTTACAGCTACGAGGAT
TCTCCCTCCGCCGCCGCCGCGCACGGCGGATACGACACTCACCGGCGCCGGTAAAGACAGCTCCAACGGCAGATATGAACTTCTCCTTAAATACTTCAAGGACAGAGCCT
TGATCGACCCCCATCGCCACCGCCACCGCCGCCATGGTCAAGGATTTGAAGATAGCAAACGGAAAATACCCAGTTGTCCAGATCCTCTTCATAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAGAATTTCTTCCATACTCTTGAGACCAAAATGGTATTTTAACTTATTTTTTATTATTCCTATAATTACTTTTTACTCTTTATTTTTTAGATACTATTTTTTTCTTTGTA
GCCTACTTATTAAATTACAAGATTTGAGGCTTTGCAATTCCAGAGTACAATTTCCTCCATCCTCTTCGTTTTCTTCACATAATTCGCCGTTTCCGTTTCTTGGTCGAATC
AATGTACAGTTGTAATTGAAATTTTGGTAGGTCATTGCAACGTTTATGTCAAAGGATTCAAAACCGTTTTGGGTGTGTTTTACTAGGGAGGTCCCCCCACTGTGCCTGAT
ATGCGACCCAAATGCCTTGGCTAGAGAGGTCGATGGCCTGGACAGGATCATGTGATCGGAAGAGTGGATATGTCCCCTCTTTTTGTCCTTTATTCCTGTGCACATGTACA
AAGGTTGTGTAATTGCAGGTACAGAAACATTAAATAATGCGTAGAGTGATTCTGGAACTTCTCCAGTGAAACACTGCACAAAGGTTTTATCTTTGTTTTGCAATTGCCAT
TGCAACTATTGCTTCTGAAATATCTATCATCATTTGTACTTCACAAAGGTTACAGTGGCAAGCTATCTTCTAAGGCATTATCTTTAATGATATGACGCAGTTGGCTGTAT
TATGATGAGGCCGTGTTTAAATTGATGGTGTTCCTGAGCAGAAGAGCTTTTGAAGATGATGGCAGCTTTGGGTAATCAAGCTAAGTTTAGAAGGTGGACCATTTGAGCTG
CTATTCCTTCATCACGTGGCCCACTTCTCTCTCTTCTCTCTGAGTCCCATTATAGCCGTCTTTTCTTTGCTCTTATATCTCACAGCTAAGCCTCATATTCATTTGAGAGA
GAGAAAAAAAAACAGTAAACACATTTAATTTATACATGTGGACAAGCAAGATAGAGGAAGGGTTTGAGAGCTATTGAAGCTAAGTTTCATCAAATTTCATTTTTGGGTTT
GTTTTTTCTTCAGCGATGAGTACCAGAAGAATTGCCACTTCCTCTTCTTTTGCGATGCTGATTTTGATCATGTGGGTGTTGCAGATTTGGGTTTTTTGTCACTCCCAAGT
TACAGCTACGAGGATTCTCCCTCCGCCGCCGCCGCGCACGGCGGATACGACACTCACCGGCGCCGGTAAAGACAGCTCCAACGGCAGATATGAACTTCTCCTTAAATACT
TCAAGGACAGAGCCTTGATCGACCCCCATCGCCACCGCCACCGCCGCCATGGTCAAGGATTTGAAGATAGCAAACGGAAAATACCCAGTTGTCCAGATCCTCTTCATAAT
TAGTAGGATTAATTCATTTTTTCACCCTTTTTTTTTCTCTCCATCCAAAATACCCCCGTTTTTCTCTTGATTTTTTTTGGTTATAATTTATAAGACGCATTTTCCGTGAT
TCAACAGAGAAAACCGGGGTTATTTTGGTGCTTCTCTTTGTAATATATGAATTAAATCATAAATTTTCTTCTTTTTCTTTTTTTAATAATTCATTTCAGTGCAGAAAACA
ATGCGTAGTAGTAGTGGCTAGCGATTTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTATGTTTCTTTGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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