; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0024647 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0024647
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description(S)-2-hydroxy-acid oxidase
Genome locationLG06:161522..166599
RNA-Seq ExpressionSed0024647
SyntenySed0024647
Gene Ontology termsGO:0009854 - oxidative photosynthetic carbon pathway (biological process)
GO:0005777 - peroxisome (cellular component)
GO:0003973 - (S)-2-hydroxy-acid oxidase activity (molecular function)
GO:0010181 - FMN binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000262 - FMN-dependent dehydrogenase
IPR008259 - FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active site
IPR012133 - Alpha-hydroxy acid dehydrogenase, FMN-dependent
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR037396 - FMN hydroxy acid dehydrogenase domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581778.1 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.4e-17888.11Show/hide
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XP_022955687.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.6e-17687.57Show/hide
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XP_022980627.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X2 [Cucurbita maxima]3.8e-17887.84Show/hide
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XP_023527007.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-17687.3Show/hide
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XP_038880942.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X1 [Benincasa hispida]3.2e-17785.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D4Y8 (S)-2-hydroxy-acid oxidase2.7e-17487.09Show/hide
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A0A6J1GUB4 (S)-2-hydroxy-acid oxidase7.7e-17787.57Show/hide
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A0A6J1GUK3 (S)-2-hydroxy-acid oxidase2.2e-17686.4Show/hide
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A0A6J1GVS5 (S)-2-hydroxy-acid oxidase5.0e-17688.74Show/hide
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A0A6J1IRU2 (S)-2-hydroxy-acid oxidase1.8e-17887.84Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8AKX6 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO11.7e-11760.28Show/hide
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        E  NV E++ +A++ LPKM YD+YA GAEDE TLK+N +AF RI  RPRIL+DVS+I+MS T+LG  +S PI++AP+A   +A   GE ATA AA+AA T
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Query:  IMVLSYSSSCSIEEVASSCNAIRFFQLYIFKRRDITTLIVQRAERSGYKAIVLTVDTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLMSMEFNSDQGSKLET
        IM LS  ++ S+EEVAS+   IRFFQLY++K R++   +V+RAER+G+KAI LTVDTPRLGRREADIKN+ + PP   +KN EGL   E +    S L +
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Query:  YANETLDASLCWEDIRWLRSITSLPILIKGILTQEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATISVLEEVVHAVKGKVPVLLDGGVRRGTDVFKALALG
        Y    +D +L W+D++WL+SITSLPIL+KG++T EDA  AV +G  GIIVSNHGARQLD+ PATIS LEEVV A  G++PV LDGGVRRGTDVFKALALG
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Query:  AQSVLIGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYDKL
        A  V IGRP++F LAA+GE GVR VL M++ E E+TMALSGC S+ DITR+H+ T  D+L
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B8B8K5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO41.8e-13064.27Show/hide
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        PVNV E++ELA++ALPKM YD+  GGAEDEHTL++NI A+ RI +RPR+LVDVS+I+MSTT+LG+ + +PI+VAPT  H LA  +GE ATA AAA+   I
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        MVLS+SSSC IE+VASSCNAIRF+QLY++K R+++  +V+RAE  G+KA++LTVDTP LGRREADI+NKM+ P   NLEGLM++ + ++  GS+LE +A 
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         TLD SL W+DI WL+SITS+PI +KGI+T EDA +AVEAGV G+IVSNHGARQLD+APATI+ LEEVV AV G VPVL+DGG+RRGTDVFKALALGA++
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        V+   P+ FGLAA+GE G R V+EML  ELE+ MAL GC S+ +ITRSHV T+ D++ S+L
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Q24JJ8 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO35.2e-14670.75Show/hide
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        VNV+EF+ELA++ALPKM+YDFY GGAED+HTL +N+QAF RI  RPR+LVDVS+I+MST ILG+ +SAPI++APT  H LA  +GE ATA AAAA  TIM
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        ++SY SSC+ EE+ASSCNA+RF Q+Y++KRRDIT  +V+RAE++G+KAIVLTVD PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E    +GS ++ +A+  
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         DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT+EDA KAVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PATI+VLEEVV  V+G++PVLLDGGVRRGTDVFKALALGAQ+VL
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        IGRPI++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+HV T+ ++LHSML
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Q8H3I4 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO43.3e-13264.82Show/hide
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        PVNV E++ELA++ALPKM YD+  GGAEDEHTL++NI A+ RI +RPR+LVDVS+I+MSTT+LG+ + +PI+VAPT  H LA  +GE ATA AAA+   I
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         TLD SL W+DI WL+SITS+PI +KGI+T EDA +AVEAGV G+IVSNHGARQLD+APATI+ LEEVV AV G VPVL+DGG+RRGTDVFKALALGA++
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Query:  VLIGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYDKLHSML
        V++GRP+ FGLAA+GE G R V+EML  ELE+ MAL GC S+ +ITRSHV T+ D++ S+L
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Q9LJH5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO47.2e-14871.03Show/hide
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        VNV+EF+ELA++ALPKM+YDFY GGAED+HTL +N+QAF RI  RPR+LVDVS I+MST++LG+ +SAPI++APTA H LA  +GE+ATA AAAA  TIM
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        ++S+ S+C+IEEVASSCNA+RF Q+Y++KRRD+T  IV+RAE++G+KAIVLTVD PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL+S E   ++GS +E +A+  
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         DASL W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT+EDA KAVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PATI+VLEEVVHAVKG++PVLLDGGVRRGTDVFKALALGAQ+VL
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        IGRPI++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I D+TR+HV T+ +++ SML
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14130.1 Aldolase-type TIM barrel family protein5.1e-14971.03Show/hide
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        VNV+EF+ELA++ALPKM+YDFY GGAED+HTL +N+QAF RI  RPR+LVDVS I+MST++LG+ +SAPI++APTA H LA  +GE+ATA AAAA  TIM
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        ++S+ S+C+IEEVASSCNA+RF Q+Y++KRRD+T  IV+RAE++G+KAIVLTVD PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL+S E   ++GS +E +A+  
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         DASL W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT+EDA KAVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PATI+VLEEVVHAVKG++PVLLDGGVRRGTDVFKALALGAQ+VL
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        IGRPI++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I D+TR+HV T+ +++ SML
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AT3G14150.1 Aldolase-type TIM barrel family protein3.7e-14770.75Show/hide
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        VNV+EF+ELA++ALPKM+YDFY GGAED+HTL +N+QAF RI  RPR+LVDVS+I+MST ILG+ +SAPI++APT  H LA  +GE ATA AAAA  TIM
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        ++SY SSC+ EE+ASSCNA+RF Q+Y++KRRDIT  +V+RAE++G+KAIVLTVD PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E    +GS ++ +A+  
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         DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT+EDA KAVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PATI+VLEEVV  V+G++PVLLDGGVRRGTDVFKALALGAQ+VL
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        IGRPI++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+HV T+ ++LHSML
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AT3G14150.2 Aldolase-type TIM barrel family protein3.7e-14770.75Show/hide
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        VNV+EF+ELA++ALPKM+YDFY GGAED+HTL +N+QAF RI  RPR+LVDVS+I+MST ILG+ +SAPI++APT  H LA  +GE ATA AAAA  TIM
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Query:  VLSYSSSCSIEEVASSCNAIRFFQLYIFKRRDITTLIVQRAERSGYKAIVLTVDTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLMSMEFNSDQGSKLETYANET
        ++SY SSC+ EE+ASSCNA+RF Q+Y++KRRDIT  +V+RAE++G+KAIVLTVD PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E    +GS ++ +A+  
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         DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT+EDA KAVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PATI+VLEEVV  V+G++PVLLDGGVRRGTDVFKALALGAQ+VL
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Query:  IGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYDKLHSML
        IGRPI++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+HV T+ ++LHSML
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AT3G14420.1 Aldolase-type TIM barrel family protein4.0e-11759.22Show/hide
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        E  NV E+  +A++ LPKM YD+YA GAED+ TL++N  AF RI  RPRIL+DVS+I+M+TT+LG  +S PI+VAPTA   +A   GE ATA AA+AA T
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Query:  IMVLSYSSSCSIEEVASSCNAIRFFQLYIFKRRDITTLIVQRAERSGYKAIVLTVDTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLMSMEFNSDQGSKLET
        IM LS  ++ S+EEVAS+   IRFFQLY++K R++   +V+RAER+G+KAI LTVDTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   + +    S L +
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Query:  YANETLDASLCWEDIRWLRSITSLPILIKGILTQEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATISVLEEVVHAVKGKVPVLLDGGVRRGTDVFKALALG
        Y    +D +L W+D++WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PATIS LEEVV A +G++PV LDGGVRRGTDVFKALALG
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Query:  AQSVLIGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYD
        A  + IGRP++F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+H++T++D
Subjt:  AQSVLIGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYD

AT3G14420.2 Aldolase-type TIM barrel family protein4.0e-11759.22Show/hide
Query:  EPVNVNEFKELARRALPKMHYDFYAGGAEDEHTLKDNIQAFHRITIRPRILVDVSQINMSTTILGHLVSAPILVAPTAAHMLAFHQGELATATAAAAAKT
        E  NV E+  +A++ LPKM YD+YA GAED+ TL++N  AF RI  RPRIL+DVS+I+M+TT+LG  +S PI+VAPTA   +A   GE ATA AA+AA T
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Query:  IMVLSYSSSCSIEEVASSCNAIRFFQLYIFKRRDITTLIVQRAERSGYKAIVLTVDTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLMSMEFNSDQGSKLET
        IM LS  ++ S+EEVAS+   IRFFQLY++K R++   +V+RAER+G+KAI LTVDTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   + +    S L +
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        Y    +D +L W+D++WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PATIS LEEVV A +G++PV LDGGVRRGTDVFKALALG
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Query:  AQSVLIGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYD
        A  + IGRP++F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+H++T++D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTTCTAGGGACATCTGTTTTCTAACCAATTTTAGTTTCATTCACTTAAGAATGTTGTGGTTGCTATTTGATGAACAGGGTAAAATGTCTTCTGAACCAGTGAATGT
GAATGAGTTCAAAGAGTTAGCTAGAAGGGCTCTTCCAAAAATGCACTACGATTTCTATGCAGGGGGAGCTGAGGATGAGCACACACTTAAAGACAACATACAAGCATTTC
ATAGAATCACGATTCGACCTCGAATTCTCGTGGATGTGAGCCAAATTAATATGTCAACAACCATATTAGGCCATCTTGTCTCTGCACCTATCCTTGTTGCTCCCACTGCT
GCACACATGTTGGCATTTCATCAAGGAGAACTGGCCACAGCTACGGCGGCAGCTGCTGCAAAAACTATAATGGTGTTGTCCTACTCTTCAAGCTGTTCAATCGAGGAAGT
TGCCTCTAGCTGCAATGCTATTCGTTTCTTTCAATTATACATTTTCAAAAGGCGTGATATCACAACTCTGATAGTACAAAGAGCTGAGAGATCCGGATACAAGGCAATTG
TCTTGACTGTTGATACTCCTCGGCTTGGTAGAAGAGAGGCGGACATAAAGAATAAGATGATTGCACCTCCAGTGAAGAATCTTGAAGGCCTCATGTCTATGGAATTTAAC
TCTGATCAAGGCTCAAAATTAGAAACTTATGCCAATGAGACTTTGGATGCATCTTTGTGCTGGGAAGATATAAGGTGGTTAAGATCAATCACTAGTCTGCCAATTCTGAT
AAAGGGGATTCTCACTCAAGAAGATGCAACTAAAGCTGTGGAAGCAGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGAGCCCGCCAACTAGACTTTGCTCCTGCCACTA
TTTCTGTCCTCGAAGAGGTTGTTCATGCTGTGAAAGGTAAAGTTCCCGTACTCTTAGACGGAGGTGTGCGGCGAGGAACGGATGTGTTCAAGGCATTGGCCCTCGGTGCA
CAGTCAGTTCTTATAGGGAGACCAATTTTATTTGGTCTGGCAGCAAAGGGAGAAGGAGGAGTAAGAACAGTACTGGAAATGCTGAAGAATGAGTTGGAGATCACCATGGC
ACTTTCAGGTTGCCCATCTATCAAGGATATCACCAGAAGCCATGTGAGCACACAATATGATAAGCTGCACTCAATGCTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAAACTGATTTAAGCTTTGTTAAATTATGTTCCTTAGCTGATTCTATCTCTAAGCTTTACTTTCTCGACCATGTTCCTCGAAGTTTGCTTTTCTTCATAGGGTTCTTT
TAGTTTTACCCATCAACAATCTCACCCTTTATACTAATTTTATGATATTTTGTAGATTTGTGCTTATGTGTTTCATTTATCAATTTATTCATGCTACCAACACCTCTTAT
TATAGTCTCCGGCAAACGGCCGAGTTGGTTATAATAACCCAACCAATATTTGTCCCACATTTTATTATAAAGGGTGAATACCTAAACCTGCATGTCCGTTTATCTACACC
TTACACATATTACTTTTTGTTACATACCCTCAAACATCATTTATCATAATCTCTGTTATAATAACTTGCCCCTCCAACACCGTTTATAATAACCCACCATTTATCATAAC
CTTTCGTCTATAATAACCAAACCGGTGCTCCAAACGCACCCTAAAGAGCAGCCTTAGTTGGTTTGAGCTGAGTTGAGCTTAATTATAAAATCGCTTCTAATGCAAGAACT
TTATGTTTTCTAGGGACATCTGTTTTCTAACCAATTTTAGTTTCATTCACTTAAGAATGTTGTGGTTGCTATTTGATGAACAGGGTAAAATGTCTTCTGAACCAGTGAAT
GTGAATGAGTTCAAAGAGTTAGCTAGAAGGGCTCTTCCAAAAATGCACTACGATTTCTATGCAGGGGGAGCTGAGGATGAGCACACACTTAAAGACAACATACAAGCATT
TCATAGAATCACGATTCGACCTCGAATTCTCGTGGATGTGAGCCAAATTAATATGTCAACAACCATATTAGGCCATCTTGTCTCTGCACCTATCCTTGTTGCTCCCACTG
CTGCACACATGTTGGCATTTCATCAAGGAGAACTGGCCACAGCTACGGCGGCAGCTGCTGCAAAAACTATAATGGTGTTGTCCTACTCTTCAAGCTGTTCAATCGAGGAA
GTTGCCTCTAGCTGCAATGCTATTCGTTTCTTTCAATTATACATTTTCAAAAGGCGTGATATCACAACTCTGATAGTACAAAGAGCTGAGAGATCCGGATACAAGGCAAT
TGTCTTGACTGTTGATACTCCTCGGCTTGGTAGAAGAGAGGCGGACATAAAGAATAAGATGATTGCACCTCCAGTGAAGAATCTTGAAGGCCTCATGTCTATGGAATTTA
ACTCTGATCAAGGCTCAAAATTAGAAACTTATGCCAATGAGACTTTGGATGCATCTTTGTGCTGGGAAGATATAAGGTGGTTAAGATCAATCACTAGTCTGCCAATTCTG
ATAAAGGGGATTCTCACTCAAGAAGATGCAACTAAAGCTGTGGAAGCAGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGAGCCCGCCAACTAGACTTTGCTCCTGCCAC
TATTTCTGTCCTCGAAGAGGTTGTTCATGCTGTGAAAGGTAAAGTTCCCGTACTCTTAGACGGAGGTGTGCGGCGAGGAACGGATGTGTTCAAGGCATTGGCCCTCGGTG
CACAGTCAGTTCTTATAGGGAGACCAATTTTATTTGGTCTGGCAGCAAAGGGAGAAGGAGGAGTAAGAACAGTACTGGAAATGCTGAAGAATGAGTTGGAGATCACCATG
GCACTTTCAGGTTGCCCATCTATCAAGGATATCACCAGAAGCCATGTGAGCACACAATATGATAAGCTGCACTCAATGCTTTAATGTCTATGTATACTGTAATCTGCTAT
AGAAGCAAAACTCAGTTAGATTTACAAATAAGAGGAAACTTGGATCTGCCAAAAATGAACCATGAACAAAAAATAATTGGGTTGTTACCCTGTTCTACAACTCTTCCAAA
TCAAGATTTCTCTCATGTTGTTAATAGATTGGTTTGAGCTTTCATTTGATAAAGAGTGAAATAACTCGTCTATCTTATCAATGTTAGGAGTTTCCTTTACCTTTTCAATG
TTGGATAAATATCATTTCTATGCGATGATGCTACTTTGGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSRDICFLTNFSFIHLRMLWLLFDEQGKMSSEPVNVNEFKELARRALPKMHYDFYAGGAEDEHTLKDNIQAFHRITIRPRILVDVSQINMSTTILGHLVSAPILVAPTA
AHMLAFHQGELATATAAAAAKTIMVLSYSSSCSIEEVASSCNAIRFFQLYIFKRRDITTLIVQRAERSGYKAIVLTVDTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLMSMEFN
SDQGSKLETYANETLDASLCWEDIRWLRSITSLPILIKGILTQEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATISVLEEVVHAVKGKVPVLLDGGVRRGTDVFKALALGA
QSVLIGRPILFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSHVSTQYDKLHSML