CuGenDBv2

Gene ID	Sed0024868
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	V-type proton ATPase subunit D
Genome location	LG05:43234062..43237075
RNA-Seq Expression	Sed0024868
Synteny	Sed0024868
Gene Ontology terms	GO:1902600 - proton transmembrane transport (biological process) GO:0005774 - vacuolar membrane (cellular component) GO:0033176 - proton-transporting V-type ATPase complex (cellular component) GO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function) GO:0046961 - proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KGN48252.2 hypothetical protein Csa_003783 [Cucumis sativus]

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XP_004140139.1 V-type proton ATPase subunit D [Cucumis sativus]

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A0A0A0KGM2 Uncharacterized protein

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A0A1S3BMU1 V-type proton ATPase subunit D

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A0A5D3DC51 V-type proton ATPase subunit D

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A0A6J1D312 V-type proton ATPase subunit D

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A0A6J1JNF5 V-type proton ATPase subunit D-like

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P57746 V-type proton ATPase subunit D

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Q5RCS8 V-type proton ATPase subunit D

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Q9V7D2 V-type proton ATPase subunit D 1

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Q9XGM1 V-type proton ATPase subunit D

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Q9Y5K8 V-type proton ATPase subunit D

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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT3G58730.1 vacuolar ATP synthase subunit D (VATD) / V-ATPase D subunit / vacuolar proton pump D subunit (VATPD)

2.2e-116

82.38

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        FFRLKKIQGYKRRE+E+Q ANAK FAEE + E IS+Q+G SIN+A N L   AEKD DIIF
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Sequences

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AATACGTTGCTGGTGACAACATCAAGCATATCGTCCTTGAGAATGTCCAAACTGCAGCTATCAAGATTCGATCCCGACAAGAGAATATTGCTGGCGTAAAACTCCCAAAA
TTTGAACACTATTCCGATGGTGAGACAAAAAATGACCTTACAGGGCTAGCCAGGGGTGGACAGCAGATCCAGCGTTGTCGGGGTGCCTACGTAAAGGCAATTGAGGTTCT
TGTCGAGCTTGCATCACTTCAGACATCATTTTTGACTCTTGATGAGGCAATTAAAACCACAAACCGCAGGGTTAATGCTCTAGAGAATGTTGTGAAGCCAAGGCTGGAGA
ATACTATTAGTTACATTAAGGGAGAATTGGATGAACTGGAAAGGGAAGATTTCTTTAGATTGAAAAAGATACAGGGTTATAAAAGAAGGGAAATTGAGAAACAACGAGCC
AATGCCAAGCTATTTGCTGAGGAACAACTTGCTGAGAAGATATCATTGCAAAAGGGCTTCTCCATAAATTCAGCTCACAATTTACTGTCTGCAGCTGCTGAGAAGGACCA
GGATATTATTTTTTGA

mRNA sequence

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AAGAAAAAACCCTTCCCACGCAGAGCATCTGCACCATTTTCTTTCTTCGCCAAATATCCCTCACGCCCGCAGGCGAATCAGATCTGAAGTGGGGATTTTGTTTAGATTTC
GATCAGCAATTTCGTTGGATTTGTTCGATCCGATTTTAGGAGCACTTTGTTGGAGATACTCACCTTGTGGTGCAATTATCTCACATTGAAAAGATATTGAAAAAGATCAA
AGATGTCAGGCCAAAGCCAGCGTTTGAATGTGGTTCCAACAGTTACAATGCTCGGAGCAATGAAAGCCCGCCTTGTTGGTGCAACCAGAGGTCATGCTCTCCTAAAGAAG
AAGAGTGATGCTCTGACAGTCCAGTTTCGTCAGATACTAAAGAAGATCGTCTCATCTAAGGAATCAATGGGGGAAGTCATGAAGACATCTTCATTTTCTCTCACCGAAGC
GAAATACGTTGCTGGTGACAACATCAAGCATATCGTCCTTGAGAATGTCCAAACTGCAGCTATCAAGATTCGATCCCGACAAGAGAATATTGCTGGCGTAAAACTCCCAA
AATTTGAACACTATTCCGATGGTGAGACAAAAAATGACCTTACAGGGCTAGCCAGGGGTGGACAGCAGATCCAGCGTTGTCGGGGTGCCTACGTAAAGGCAATTGAGGTT
CTTGTCGAGCTTGCATCACTTCAGACATCATTTTTGACTCTTGATGAGGCAATTAAAACCACAAACCGCAGGGTTAATGCTCTAGAGAATGTTGTGAAGCCAAGGCTGGA
GAATACTATTAGTTACATTAAGGGAGAATTGGATGAACTGGAAAGGGAAGATTTCTTTAGATTGAAAAAGATACAGGGTTATAAAAGAAGGGAAATTGAGAAACAACGAG
CCAATGCCAAGCTATTTGCTGAGGAACAACTTGCTGAGAAGATATCATTGCAAAAGGGCTTCTCCATAAATTCAGCTCACAATTTACTGTCTGCAGCTGCTGAGAAGGAC
CAGGATATTATTTTTTGATTTCAAGGTTTGATTTTTTTTTACCCTTTTTCTAAATGAGCTGCTTTCTTTCCTTATTATGGTTTAAAAAAAATATTTGGTGACTTAGGTGG
CTCGTGGAGTAATCTAAATAAATCACCATATGCTCTAGCCATGATGTATTTATTTGATTCCTATCACCTTCAAGGCTTTCCAGTCTTGCAATAAATACTCAAGTGGCTCA
TGGAGTTATAATCTCAATAAAACACCTTATGAGCCATAATGTATTTATTTGATTTCTTTCCCTTCAAGGCTTTCAGGTCTTATAAATATTTCTTCACTTGACAGGTTTTT
GTTTCTTTGATACAAAATATTTTGTTTTATCATTCTGAATTTTTGTATGGTTGTTGGGTTTGATCACTG

Protein sequence

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FEHYSDGETKNDLTGLARGGQQIQRCRGAYVKAIEVLVELASLQTSFLTLDEAIKTTNRRVNALENVVKPRLENTISYIKGELDELEREDFFRLKKIQGYKRREIEKQRA
NAKLFAEEQLAEKISLQKGFSINSAHNLLSAAAEKDQDIIF

Sed0024868 (gene) of Chayote v1 genome