; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0024896 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0024896
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionglucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like isoform X8
Genome locationLG14:23723074..23726056
RNA-Seq ExpressionSed0024896
SyntenySed0024896
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7034687.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-11679.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KI12 X8 domain-containing protein7.8e-11376.77Show/hide
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A0A5D3CNT9 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like6.2e-11074.75Show/hide
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A0A6J1IUV4 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 2-like isoform X14.3e-11980.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 13.5e-1746.6Show/hide
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P52409 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase2.1e-1439.31Show/hide
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Q84V39 Major pollen allergen Ole e 102.9e-1643.44Show/hide
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Q8VYE5 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 121.2e-1743.38Show/hide
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        Q++ A +  C F GA+     DPS G+C +  + +T
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 41.8e-1039.78Show/hide
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         C   +S S TP+T TP     TPT   PTT T TT TP    PT  TPT   P   TP      G       PT +SSS  P T+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.1e-2538.36Show/hide
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Query:  ---TPSTTTPINPPMTPTPMPPTTPTITTPTPPDTMPTDTTPTDTTPTDTTPTD-AGGYGTDPT-----DTSSSTIPITSFFSFVFLGSLIV
           TPST T   PP+T TP+ PT   I     P  +     PT  T  + +    AGGYG D +      TSS +  +   F    + +LI+
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.9e-2740.97Show/hide
Query:  IPIVNPTIPGGTTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPT--ITPITPTTPI--TTPI--TTPT---------------TPTTTGG------------------
        IP+VNPT PGG+T T T I  P+ P  +   PT PT    P+  TTP     P+  TTP                TP   GG                  
Subjt:  IPIVNPTIPGGTTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPT--ITPITPTTPI--TTPI--TTPT---------------TPTTTGG------------------

Query:  ----------GSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHASYAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASR
                  G WCIA  NASPT+LQVA+DYACGYGGADC  IQ G +C+EPN++RDHAS+AFN YYQK+P   SC FGGAAQ++STDPS GSC F++S 
Subjt:  ----------GSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHASYAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASR

Query:  STPSTTTPINPPMTPTPMPPTTPTITTPTPPDTMPTDTTPTDTTPTDTTPTDAGGYGTDPTDTSSSTIPITSFFSFVFLGSLIVTNYI
         T ST    +PP   +P   ++P  +T  PP T PT        P      +  G     T  S S + I  F +   L  L+  NY+
Subjt:  STPSTTTPINPPMTPTPMPPTTPTITTPTPPDTMPTDTTPTDTTPTDTTPTDAGGYGTDPTDTSSSTIPITSFFSFVFLGSLIVTNYI

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.3e-2446.43Show/hide
Query:  TTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPTITPITPTTPITTPITTPTTPTTTGGGSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHAS
        TTP  T   NPT   P+  +P   +      TTP+T P ++P      G  SWC+A  N +  ALQ A+DYACG GGADCS IQ GG+C+ PNSLR HAS
Subjt:  TTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPTITPITPTTPITTPITTPTTPTTTGGGSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHAS

Query:  YAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASRSTPSTTTPINP---------PMTPTPMP
        +AFN YYQKNP P+SC F G A   S DPS GSC F ++ ++ S     +          P  PTP P
Subjt:  YAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASRSTPSTTTPINP---------PMTPTPMP

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein6.7e-2452.31Show/hide
Query:  TTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPTITPITPTTPITTPITTPTTPTTTGGGSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHAS
        TTP  T   NPT   P+  +P   +      TTP+T P ++P      G  SWC+A  N +  ALQ A+DYACG GGADCS IQ GG+C+ PNSLR HAS
Subjt:  TTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPTITPITPTTPITTPITTPTTPTTTGGGSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHAS

Query:  YAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPS
        +AFN YYQKNP P+SC F G A   S DPS
Subjt:  YAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPS

AT4G29360.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein8.5e-1943.38Show/hide
Query:  TGPTITPITPT--------TPITTPITTPTTPTTTGGG------SWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHASYAFNDYY
        TG   TP++PT        +P ++PI    +  T GGG       WCIAS  AS T LQ A+D+ACG G  DCSA+Q    CFEP+++  HASYAFN YY
Subjt:  TGPTITPITPT--------TPITTPITTPTTPTTTGGG------SWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHASYAFNDYY

Query:  QKNPAPT-SCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASRST
        Q++ A +  C F GA+     DPS G+C +  + +T
Subjt:  QKNPAPT-SCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASRST


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTACCTGCATTCACCTCCATTTTGCAATGCTGTCATTGTTAATCTTCCTCAATCAAGGTTCAAGTATAGCACAGACTTCGTATTTTGATGCGAATCGAGAAAACTC
TGGACTGCAAAATCAAGAAGATCAAATACCATACTTTTCAACTTCAGTATCTAGCACTCAACTGGATACAATCCCCATTGTGAATCCAACCATCCCAGGCGGCACAACTC
CGACCCAGACCCCGATTGTGAACCCAACAATGCCGCCACCCTCGCAACAAATCCCAACAGGACCGACCATAACCCCGATAACTCCAACAACCCCAATAACAACCCCAATA
ACAACCCCAACAACTCCAACAACCACAGGGGGTGGAAGTTGGTGCATAGCAAGCCCAAATGCTTCCCCAACAGCCTTGCAGGTAGCTATTGACTATGCTTGTGGCTATGG
AGGAGCAGATTGCTCAGCAATTCAAACAGGCGGTAGTTGCTTCGAGCCGAACAGCCTGAGAGACCATGCTTCTTATGCCTTCAACGACTACTACCAGAAGAATCCAGCAC
CTACAAGCTGCGTGTTTGGAGGAGCGGCGCAGATCTCCAGTACAGATCCCAGCAGTGGAAGTTGTCGCTTCGCAGCATCAAGATCAACGCCAAGCACAACAACACCAATC
AATCCACCAATGACTCCAACTCCGATGCCGCCGACAACCCCAACCATAACAACACCAACACCACCCGACACAATGCCTACCGATACAACGCCTACTGATACAACGCCGAC
CGATACCACACCGACCGACGCTGGCGGTTACGGCACAGATCCAACAGACACATCAAGCTCCACGATTCCCATCACAAGCTTCTTCTCTTTCGTGTTCTTGGGGTCCCTTA
TAGTGACAAATTACATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGCCTGTCTCAAAACCTGAACTCTGAAGACAATAAAAGATTTTATAATTAAGTTCGGCCGTCGCCTCGGTACCGGGATACCTTATTCTAATTTCTAACACCTAAATGAG
ATTTGAGTTCCTAGGAGAGAGATATATCTGCCTTTCCTTCTCCATATACCTTTTTCCATTTTTTAAACCTTCCCTTGCTTGCAGTTCCCAACTATTCAAATATACAATTT
CTCCTAATTCAAGTTTCCTCATATTCTCCTCCCCTTCTTTATGACTCTTGATGATCCAAGAAAACTTAGATTCTGTCTTCCACCTCTATGTATATATTGCTTACCGCCAA
AAAGGGTAATTCTTCTTTGCAGAAACACATTTGATGAGCTCTAATTTTCATTAATCATTGTTCAAGAACTTGGAAGATCCAGAACCAAACATTAGAAGTAATTTTCAGAG
ATGGGTACCTGCATTCACCTCCATTTTGCAATGCTGTCATTGTTAATCTTCCTCAATCAAGGTTCAAGTATAGCACAGACTTCGTATTTTGATGCGAATCGAGAAAACTC
TGGACTGCAAAATCAAGAAGATCAAATACCATACTTTTCAACTTCAGTATCTAGCACTCAACTGGATACAATCCCCATTGTGAATCCAACCATCCCAGGCGGCACAACTC
CGACCCAGACCCCGATTGTGAACCCAACAATGCCGCCACCCTCGCAACAAATCCCAACAGGACCGACCATAACCCCGATAACTCCAACAACCCCAATAACAACCCCAATA
ACAACCCCAACAACTCCAACAACCACAGGGGGTGGAAGTTGGTGCATAGCAAGCCCAAATGCTTCCCCAACAGCCTTGCAGGTAGCTATTGACTATGCTTGTGGCTATGG
AGGAGCAGATTGCTCAGCAATTCAAACAGGCGGTAGTTGCTTCGAGCCGAACAGCCTGAGAGACCATGCTTCTTATGCCTTCAACGACTACTACCAGAAGAATCCAGCAC
CTACAAGCTGCGTGTTTGGAGGAGCGGCGCAGATCTCCAGTACAGATCCCAGCAGTGGAAGTTGTCGCTTCGCAGCATCAAGATCAACGCCAAGCACAACAACACCAATC
AATCCACCAATGACTCCAACTCCGATGCCGCCGACAACCCCAACCATAACAACACCAACACCACCCGACACAATGCCTACCGATACAACGCCTACTGATACAACGCCGAC
CGATACCACACCGACCGACGCTGGCGGTTACGGCACAGATCCAACAGACACATCAAGCTCCACGATTCCCATCACAAGCTTCTTCTCTTTCGTGTTCTTGGGGTCCCTTA
TAGTGACAAATTACATATAAGAGGAAGCAGAAAAGTGACTCGAATCTGGTTTATTACAATCTGCAGATCGAGGAAGCATTTAGAAATTATTTTTTCATACCATGTAACGT
TTATATAAAGGAGGTGGGGAACTGGGGGGAGGAATTAGTGTTTTATTACTAAGGTAGTGGTGATAGAATAAATTTATAGCTTACATCTACGTTTAGGACTGTATTCCCTC
GGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTCIHLHFAMLSLLIFLNQGSSIAQTSYFDANRENSGLQNQEDQIPYFSTSVSSTQLDTIPIVNPTIPGGTTPTQTPIVNPTMPPPSQQIPTGPTITPITPTTPITTPI
TTPTTPTTTGGGSWCIASPNASPTALQVAIDYACGYGGADCSAIQTGGSCFEPNSLRDHASYAFNDYYQKNPAPTSCVFGGAAQISSTDPSSGSCRFAASRSTPSTTTPI
NPPMTPTPMPPTTPTITTPTPPDTMPTDTTPTDTTPTDTTPTDAGGYGTDPTDTSSSTIPITSFFSFVFLGSLIVTNYI