; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0025515 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0025515
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG08:37534393..37535951
RNA-Seq ExpressionSed0025515
SyntenySed0025515
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573109.1 hypothetical protein SDJN03_26996, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.4e-5669.15Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSI-MEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT
        MFG IRS SSL+ LER  SKI KDDCLSIYETTLMKLKLGSQRD  P I +EDALEDGE DSNSSSSC E MNT +        K S +L N TKEDLM 
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSI-MEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT

Query:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIV--EEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV
        +DSDYS TS   TPD+SE+  STEYST+R+M NSILYLFSKFKNS G P I+  EEA+A ED CCVVMSPSSS++Q TDNSELHS+ + I+ S ALSEKV
Subjt:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIV--EEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV

Query:  L
        L
Subjt:  L

XP_022954829.1 uncharacterized protein LOC111456975 [Cucurbita moschata]3.2e-5669.15Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSI-MEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT
        MFG IRS SSL+ LER  SKI KDDCLSIYETTLMKLKLGSQRD  P I +EDALEDGE DSNSSSSC E MNT +        K S +L NSTKEDLM 
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSI-MEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT

Query:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIV--EEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV
        +DSDYS TS   TPD+SE+  STEYST+R+M NSILYLFSKFKNS G P I+  EEA+A ED CCVVMSPSSS++Q TDNSELHS+ + I+ S +LSEKV
Subjt:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIV--EEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV

Query:  L
        L
Subjt:  L

XP_022994168.1 uncharacterized protein LOC111489988 [Cucurbita maxima]5.7e-5869.7Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL
        MFG IRS SSLD LER  SKI KDDCLSIYETTLMKLKLGSQR+  P I EDALEDGE DSNSSSSC E MNT +        K S +L NSTKEDLM +
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL

Query:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL
        DSDY   ST T+PD+SE+  STEYST+R+M NSILYLFSKFK S G P I+EEA+A ED CCVVMSPSSS++Q TDNSELHS+ + I+ S ALSEKVL
Subjt:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL

XP_023542779.1 uncharacterized protein LOC111802587 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-5669.54Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL
        MFG IRS SSLD LERP SKI KDDCLSIYETTLMKLKLGSQRD  P I    LEDGE DSNSSSSC E MNT +        K S +L NSTK+DLM +
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL

Query:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV
        DSDYS TS   TPD+SE+  STEYST+R+M NSILYLFSKFKNS G P I+EEA+A ED CCVVMSPSSS++Q TDNSELHS+ + I+ S ALSEKV
Subjt:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV

XP_038876936.1 uncharacterized protein LOC120069295 [Benincasa hispida]1.9e-6171.72Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL
        MFG IRS SSLD LERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLK GSQ +S+P I EDALEDGE DSNSSSSC E MNTE+  S     K S ELA STKED MT+
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL

Query:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL
        DSDYS TS  +TP+ SE   STEYST+R+MKNSILYLFSKFKNSPGI TI+EE M  ED CCVV+SPSSS++QST N ELHS+ +SI  S  L E+VL
Subjt:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LR39 Uncharacterized protein1.4e-4663.21Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL
        MFG IRS SS D LERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQ DS+P I EDALEDGE DS+S S   E MNTE+  S    PK S EL  STKED+MT+
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL

Query:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNAL
        DSDY       T +  E+  STE ST+R+M NSILYLFSKFKNS  I TI+EE    ED C VVMSP  S++ ST + ELHS+ +SI SS  +
Subjt:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNAL

A0A6J1C6T9 uncharacterized protein LOC1110089311.9e-5467.21Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL
        MFG IRS SSLD LERPPSKILKDDCLSIYE TL+KLKLGSQR+S+P   EDALEDGE D+NSSS   E M TE   +PA+ PKGS ELA+S KEDLMT+
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL

Query:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSK
        DSDYS  ST +TP+ASE+  STEYS +R++++SILYLFSKFKN P I TI+EE  A ++  C  M PSSS++QST+N ELH K
Subjt:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSK

A0A6J1E7B6 uncharacterized protein LOC1114312904.3e-5165.83Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDS-NPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT
        MFG +RS SS+D LERPPSK+LKDD LSIYETTL KLKLGSQ DS  P+  +DALEDGE +S S SS  E M TE+  SPA  PKGS ELAN TKEDL+T
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDS-NPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT

Query:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYST-RRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEA--MAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSE
        +DSDYS TST +T +AS +  STE+ST +R+MKNSI YLFSK+KNSPGI TIVEEA     ED CC+V SPSS+++QS+DN +LHSK +SI SS   SE
Subjt:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYST-RRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEA--MAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSE

A0A6J1GU65 uncharacterized protein LOC1114569751.5e-5669.15Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSI-MEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT
        MFG IRS SSL+ LER  SKI KDDCLSIYETTLMKLKLGSQRD  P I +EDALEDGE DSNSSSSC E MNT +        K S +L NSTKEDLM 
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSI-MEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT

Query:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIV--EEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV
        +DSDYS TS   TPD+SE+  STEYST+R+M NSILYLFSKFKNS G P I+  EEA+A ED CCVVMSPSSS++Q TDNSELHS+ + I+ S +LSEKV
Subjt:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIV--EEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKV

Query:  L
        L
Subjt:  L

A0A6J1K4E6 uncharacterized protein LOC1114899882.8e-5869.7Show/hide
Query:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL
        MFG IRS SSLD LER  SKI KDDCLSIYETTLMKLKLGSQR+  P I EDALEDGE DSNSSSSC E MNT +        K S +L NSTKEDLM +
Subjt:  MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTL

Query:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL
        DSDY   ST T+PD+SE+  STEYST+R+M NSILYLFSKFK S G P I+EEA+A ED CCVVMSPSSS++Q TDNSELHS+ + I+ S ALSEKVL
Subjt:  DSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G48490.1 unknown protein4.2e-0635.86Show/hide
Query:  MFGTIR-SCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT
        MFG +R   S  D LER P+KI+KDD LS+YE+TL+KLK GS R                D+ SS    ET   E+  S ++S   S +       D M 
Subjt:  MFGTIR-SCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMT

Query:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKN-SILYLFSKFKN
        +D                   S E S + K KN S+L +FSK+KN
Subjt:  LDSDYSITSTITTPDASEELTSTEYSTRRKMKN-SILYLFSKFKN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCGGAACAATCAGATCGTGTTCTTCATTGGATCCTTTGGAGCGGCCGCCTTCCAAGATTCTTAAAGATGATTGTCTCTCCATCTACGAAACCACCCTAATGAAGCT
TAAACTTGGTTCTCAGCGTGACTCAAACCCATCCATCATGGAGGATGCCTTAGAAGACGGAGAAGCTGATTCTAACTCGAGTTCGTCGTGCATCGAGACAATGAACACAG
AGTCAAGCTACAGTCCAGCAAATTCTCCGAAGGGTTCTCCTGAGCTAGCCAACTCAACCAAAGAAGATTTGATGACTCTCGATTCAGATTATTCGATTACAAGTACTATT
ACTACACCTGATGCTTCCGAGGAATTGACATCAACAGAATATTCAACACGGCGTAAAATGAAGAACTCCATCCTTTACCTATTCTCTAAATTCAAGAATTCTCCAGGAAT
TCCAACAATCGTGGAGGAGGCAATGGCAATGGAAGATGCCTGTTGCGTGGTTATGTCACCAAGTTCTAGTTCCGCTCAGTCGACCGATAACAGTGAGCTACATTCAAAGT
CACAGTCCATCAACTCTTCGAATGCATTGTCGGAAAAGGTTTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCGGAACAATCAGATCGTGTTCTTCATTGGATCCTTTGGAGCGGCCGCCTTCCAAGATTCTTAAAGATGATTGTCTCTCCATCTACGAAACCACCCTAATGAAGCT
TAAACTTGGTTCTCAGCGTGACTCAAACCCATCCATCATGGAGGATGCCTTAGAAGACGGAGAAGCTGATTCTAACTCGAGTTCGTCGTGCATCGAGACAATGAACACAG
AGTCAAGCTACAGTCCAGCAAATTCTCCGAAGGGTTCTCCTGAGCTAGCCAACTCAACCAAAGAAGATTTGATGACTCTCGATTCAGATTATTCGATTACAAGTACTATT
ACTACACCTGATGCTTCCGAGGAATTGACATCAACAGAATATTCAACACGGCGTAAAATGAAGAACTCCATCCTTTACCTATTCTCTAAATTCAAGAATTCTCCAGGAAT
TCCAACAATCGTGGAGGAGGCAATGGCAATGGAAGATGCCTGTTGCGTGGTTATGTCACCAAGTTCTAGTTCCGCTCAGTCGACCGATAACAGTGAGCTACATTCAAAGT
CACAGTCCATCAACTCTTCGAATGCATTGTCGGAAAAGGTTTTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFGTIRSCSSLDPLERPPSKILKDDCLSIYETTLMKLKLGSQRDSNPSIMEDALEDGEADSNSSSSCIETMNTESSYSPANSPKGSPELANSTKEDLMTLDSDYSITSTI
TTPDASEELTSTEYSTRRKMKNSILYLFSKFKNSPGIPTIVEEAMAMEDACCVVMSPSSSSAQSTDNSELHSKSQSINSSNALSEKVL