; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0025818 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0025818
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationLG08:38989545..38991272
RNA-Seq ExpressionSed0025818
SyntenySed0025818
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]2.3e-7393.71Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKSIATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN AIDHGFIIGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_022140126.1 uncharacterized protein LOC111010860 [Momordica charantia]8.7e-7392.45Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPD RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+TRLITMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_023001482.1 uncharacterized protein LOC111495604 [Cucurbita maxima]1.8e-7092.86Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_023519488.1 membrane protein PM19L-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-6992.21Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK IATLLLLLNFCM+A+ILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAAS+ISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
         AW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]1.3e-7394.34Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKS+ATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMN AIDHGFIIGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        S+AAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYI+AIHGAVSTR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein2.5e-7091.19Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKS ATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN AIDHGFIIGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFA KEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108604.2e-7392.45Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPD RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+TRLITMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1EI31 uncharacterized protein LOC1114342866.3e-6991.56Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAV  R
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956048.7e-7192.86Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A5Y734 AWPM19-like protein1.1e-7393.71Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKSIATLLLLLNFCMY IILGIGGWAMN AIDHGFIIGP LRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L1.2e-2143.45Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTLTI
        LL+LN  MY I++G   W +N  I +G    P +             GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A SL A +++A+ AW +T 
Subjt:  LLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTLTI

Query:  LAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        LA G ACKEI +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +HG +
Subjt:  LAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein1.9e-2545.34Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA T  ++IA  LL LN  MY I+LG   W +N  I +G    P               GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVSTR
         ++++ AW +T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+M IH G++S++
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVSTR

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein5.4e-5773.38Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA  Q+K +A+ LL+LNFCMY I+LGIGGWAMN AIDHGF +GP+L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  SL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
        ++AA  AWTLT+LAMGFA KEI L  RN +L TMEAF IILS TQL+YI A+HG
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein3.1e-2844.23Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA    KS A +LL+LN  +Y +I  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        +++++ +W+LT+LAMG ACKEI + +    L T+E   II+SATQL+   AIH  V
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein8.7e-5569.48Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        M + QMK +A+ LL+LNFCMYAI+LGIG W+MN AI+HGF+IG D  LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  SL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
         SAA  AW+LT+LAMGF CKEI L  RN RL TMEAF IILSATQL+YI AI+G
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGATACACAGATGAAATCCATTGCCACTCTGCTTCTGTTGCTGAACTTCTGCATGTATGCAATCATTTTGGGCATTGGTGGATGGGCCATGAACACTGCTATTGA
TCATGGCTTCATCATTGGTCCTGATTTGCGACTACCGGCACATTTTTCGCCAATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTCTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGGACTGAACCATATTCGCTCATGGAGCGCTGAAAGCTTGGGTGCTGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACCATCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTAGATTTCAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCTTTTTTCATTATTCTCTCTGCTACACAACTTGT
TTACATTATGGCCATCCATGGTGCTGTGTCCACAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTTTTTCAATCCTCAACTCTCAACTTTTGGATCTTTTTCTCAATCAACCTTTTCTCTCTGAATTCACTGTAGAAATGGCTGATACACAGATGAAATCCATTGCCACTC
TGCTTCTGTTGCTGAACTTCTGCATGTATGCAATCATTTTGGGCATTGGTGGATGGGCCATGAACACTGCTATTGATCATGGCTTCATCATTGGTCCTGATTTGCGACTA
CCGGCACATTTTTCGCCAATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGGCTGCTGTCTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGG
ACTGAACCATATTCGCTCATGGAGCGCTGAAAGCTTGGGTGCTGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTCACCATCCTTGCCATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGA
TTGCACTAGATTTCAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCTTTTTTCATTATTCTCTCTGCTACACAACTTGTTTACATTATGGCCATCCATGGTGCTGTGTCCACA
AGATGAGAGCTGAATTTGTTTGATTCACTGTCCATTTTTAATTGTATTTGATGTTTTTTTCCTTTGTTTTATCTGACCATCTGCAAACCTTGCAACTTGTAAGGAGCTTA
ATTTAGGAGATTATTTTTTTGTGATGTGTGTGATGTGATTTCATTTGTACAAGTATTTACAATAAACTTGGTTTGATTGCACTGGATTTCATTTATCTATTTTTGTATAT
GTATGAGTGCTAAAATCAATTTAAGCGCACCTCAACTATTCTCACATAACTAAATATCTGTTCCTATAACATTTGGTAGTCAAGAAAACTCGAACGAAATTAATTCATAC
ATAGGTAAGAGAGATTAGAATGTGGAGGGTTGGGACATTTGGTAGTCAAGATGAGAGCTTGACAATAGGCAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAIILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPDLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTL
TILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR