; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0025977 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0025977
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionAlpha/beta-Hydrolases superfamily protein
Genome locationLG05:36507261..36510520
RNA-Seq ExpressionSed0025977
SyntenySed0025977
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607977.1 hypothetical protein SDJN03_01319, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-7585.57Show/hide
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KAG7037491.1 hypothetical protein SDJN02_01118 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-7586.46Show/hide
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XP_022981115.1 uncharacterized protein LOC111480359 [Cucurbita maxima]1.2e-7889.42Show/hide
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XP_023523373.1 uncharacterized protein LOC111787590 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-7888.95Show/hide
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XP_038897096.1 suppressor protein SRP40 [Benincasa hispida]1.3e-7585.07Show/hide
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        L DGYESDGSYQKITIRDQLAQLFR RDDDFSIPLGKNLKKVSAKFLTISQKRNIKRQ YLNEVSQRNDSVFFATVGAFVILPPIVILGIAILTGYVQLF
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        P
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L2V6 Uncharacterized protein9.0e-7585.86Show/hide
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A0A1S3CNU3 uncharacterized protein LOC103503051 isoform X11.1e-7285.34Show/hide
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A0A5D3CDY1 Uncharacterized protein1.1e-7285.34Show/hide
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A0A6J1FJ79 uncharacterized protein LOC1114459623.6e-7187.57Show/hide
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A0A6J1IYJ7 uncharacterized protein LOC1114803596.0e-7989.42Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42975.1 unknown protein3.9e-4663.02Show/hide
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        MA NF +    P  + SSSS S   H+   LL+L S   +R  S      V++       D      S S SSSS RTQLDLLEQL+  S SDGY SDG 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCGCTGTTCATCTTCTTCGAGAAATTTCGCTGTTTCGGAGGGCGCTGAGGGTAGACTTCAAGATCAGGAACTTCTCATTTCGTCTTCTTCTGGATCATCTTCTTCTGCAC
GCACACAGCTTGATCTCTTGGAGCAACTCTCTTCTGGTAGCCTAAGTGATGGTTATGAAAGTGATGGCAGTTACCAGAAAATTACGATCCGTGATCAGCTTGCGCAATTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FRGRDDDFSIPLGKNLKKVSAKFLTISQKRNIKRQEYLNEVSQRNDSVFFATVGAFVILPPIVILGIAILTGYVQLFP