CuGenDBv2

Gene ID	Sed0026001
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG03:2097474..2107739
RNA-Seq Expression	Sed0026001
Synteny	Sed0026001
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR007789 - Protein of unknown function DUF688

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]

3.2e-67

68.7

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        M++  +D++S+K   + K+E KFFTRALSKE NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKHTFS TS+PPLTPPPSY+SSS+STSKA        SI
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        FPRLTPRKSR             SSSSLASWS   SSS SSP PFV PKFFKRR R  D PSL P+ Y+ DD  GDE V  S  NSPTS LCF GGSSSR
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        AS FGGCYQLVSVKNALLS +GHGSASRG+
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]

1.4e-67

68.53

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        M++  +D++S+K   + K+E KFFTRALSKE NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKHTFS TS+PPLTPPPSY+SSS+STSKA        SI
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        FPRLTPRKSR             SSSSLASWS   SSS SSP PFV PKFFKRR R  D PSL P+ Y+ DD  GDE V  S  NSPTS LCF GGSSSR
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        AS FGGCYQLVSVKNALLS +GHGSASRG +N
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]

7.0e-67

67.81

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        MQ+ ++D++S+K  Q+ K+E +FFTRALSKE NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKHTFS TS+PPLTPPPSY+SSS+STSKA        SI
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        FPRLTPRKSR             SSSSLASWS   SSS SSP PFV PKFFKRR    D PSL P+ Y+ DD  GDE V  S   NSPTS LCF GGSSS
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        RAS FGGCYQLVSVK ALLS +GHGSASRG +N
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XP_023545973.1 uncharacterized protein LOC111804354 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.1e-58

66.02

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        MQ+ ++D++S+K L++K+E  +F +RA+S EANS  +SSFRVYYGGA G+IPFRWESRPGTPKHTFS+TS+PPLTPPPSYY SSS+STSKA S    L+ 
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           R + SS ++ SSSS SSP PFV PKFFKRR R SLDS SL P  YN +DN G+E+V SSNSPTSTL +GG S R SF GGCYQLVSVKNALL+ +GH
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Query:  GSASRG
        GS +RG
Subjt:  GSASRG

XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]

2.3e-65

67.53

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        MQ+ ++D++S+K  Q  K+E +FF RALSK+ NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKH FS TS+PPLTPPPSYYSSS+STSKA        SI
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        FPRLTPRKSR            SSSS ASWS   SSS SSP  FV PKFFKRR R  +S SL P+ Y+ DDN  DE V  S  NSPTSTLCFGG SSSRA
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Query:  SFFGGCYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGIVN
        S FGGCYQLVSVKNALLS +GHGSASRG +N
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein

6.9e-68

68.53

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        M++  +D++S+K   + K+E KFFTRALSKE NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKHTFS TS+PPLTPPPSY+SSS+STSKA        SI
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        FPRLTPRKSR             SSSSLASWS   SSS SSP PFV PKFFKRR R  D PSL P+ Y+ DD  GDE V  S  NSPTS LCF GGSSSR
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        AS FGGCYQLVSVKNALLS +GHGSASRG +N
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein

3.4e-67

67.81

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        MQ+ ++D++S+K  Q+ K+E +FFTRALSKE NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKHTFS TS+PPLTPPPSY+SSS+STSKA        SI
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        FPRLTPRKSR             SSSSLASWS   SSS SSP PFV PKFFKRR    D PSL P+ Y+ DD  GDE V  S   NSPTS LCF GGSSS
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        RAS FGGCYQLVSVK ALLS +GHGSASRG +N
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein

3.4e-67

67.81

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        MQ+ ++D++S+K  Q+ K+E +FFTRALSKE NST +SSFRVYYGGATG+IPFRWESRPGTPKHTFS TS+PPLTPPPSY+SSS+STSKA        SI
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Query:  FPRLTPRKSRI------------SSSSLASWS---SSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESS---NSPTSTLCF-GGSSS
        FPRLTPRKSR             SSSSLASWS   SSS SSP PFV PKFFKRR    D PSL P+ Y+ DD  GDE V  S   NSPTS LCF GGSSS
Subjt:  FPRLTPRKSRI------------SSSSLASWS---SSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESS---NSPTSTLCF-GGSSS

Query:  RASFFGGCYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGIVN
        RAS FGGCYQLVSVK ALLS +GHGSASRG +N
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein

1.4e-57

61.95

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Query:  MQSGDFDEMSKKCLQMKNEG-KFFTR---ALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTSLPPLTPPPSYYSSSNSTSKA-------
        MQS ++D++S+K LQ+K++  +FFTR    LSKEANS  +SSFRVYYGGA+G+IPFRWESRPGTPKH++S+TS+PPLTPPPSYY+SS+S SKA       
Subjt:  MQSGDFDEMSKKCLQMKNEG-KFFTR---ALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTSLPPLTPPPSYYSSSNSTSKA-------

Query:  FSIFPRLTPRKSRIS---------SSSLASWSSSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGG
         SIFPRL PR+SR S         SSS +SW SSSRSS        FFKRR    D+PSL P+ Y+ DD  GDE   SSNSPTSTLCFGG+SS  + F G
Subjt:  FSIFPRLTPRKSRIS---------SSSLASWSSSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGG

Query:  CYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGIVN
        CYQLVSVKNA LS +GHGSA RG VN
Subjt:  CYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGIVN

A0A6J1HHB7 uncharacterized protein LOC111462925

9.3e-57

64.08

Show/hide

Query:  MQSGDFDEMSKKCLQMKNE-GKFFTRALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTSLPPLTPPPSYYSS-SNSTSKAFSIFPRLTP
        MQ+ ++D++S+K L++K+E  +F +R +SK+ NS  +SSFRVYYGGA G+IPFRWESRPGTPKHTFS+TS+PPLTPPPSYYSS S+ST KA S    L+ 
Subjt:  MQSGDFDEMSKKCLQMKNE-GKFFTRALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTSLPPLTPPPSYYSS-SNSTSKAFSIFPRLTP

Query:  RKSRISSSSLASWSSSSRSSPLPFVTPKFFKRRLR-SLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLSTLGH
           R + SS ++ SSSS SSP PFV PKFFKRR R SLDS SL P  YN +DN G+E++ SSNSPTSTL +GG S R SF GGCYQLVSVKNALL+ +GH
Subjt:  RKSRISSSSLASWSSSSRSSPLPFVTPKFFKRRLR-SLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLSTLGH

Query:  GSASRG
        GS +RG
Subjt:  GSASRG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G06930.1 unknown protein

2.7e-08

32.61

Show/hide

Query:  YYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTS--------------LPPLTPPPSYYSSSNSTSKAFS------IFPRLTPRKSRISSSSLASWSSSSRSSPLP
        YYGG++ ++PF+WES+PGTP+    ++S                PLTPPPSY+ +S S++K  S      +F  L  +   + SS  +S SSSS S P  
Subjt:  YYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTS--------------LPPLTPPPSYYSSSNSTSKAFS------IFPRLTPRKSRISSSSLASWSSSSRSSPLP

Query:  FVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESS
         +       R RS+       +      +YG  S +SS
Subjt:  FVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESS

AT2G40475.1 unknown protein

2.9e-18

40.5

Show/hide

Query:  NEGKFFTRALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHT-FSQT-SLPPLTPPPSYYSSSNSTSKAFSIFPRLTPRK------SRISSSSLA
        + G   ++ + KE++   SSS   YYGGA  S+PF WE+RPGTPKH  FS++  LPPLTPPPSYYSSS+S+    S    +   +      SR  S    
Subjt:  NEGKFFTRALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHT-FSQT-SLPPLTPPPSYYSSSNSTSKAFSIFPRLTPRK------SRISSSSLA

Query:  SWSSSSRSSPLPFVT---PKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCF--GGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGI
        SWSS+S SS   + +   P   + R R   S S    +Y  +D   DE    S+SPTSTLC+  G SSS          + S+K AL S L HGS+ + +
Subjt:  SWSSSSRSSPLPFVT---PKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCF--GGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGI

AT3G56260.2 unknown protein

5.6e-14

42.94

Show/hide

Query:  YYGGATGSIPFRWESRPGTPK-HTFSQTSLP-PLTPPPSYYSS---------SNSTSK-----AFSIFP--RLTPRKSRISSSSLASWSSSSRSSPLPFV
        YYGGA  SIPF WESRPGTPK H  S +SLP PLTPPPSYYSS         S   SK     +FS+F   R +   S+ ++SS  SWSS+S SS     
Subjt:  YYGGATGSIPFRWESRPGTPK-HTFSQTSLP-PLTPPPSYYSS---------SNSTSK-----AFSIFP--RLTPRKSRISSSSLASWSSSSRSSPLPFV

Query:  TPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLS
         P   K+R+       L   NY  D        E  +SPTSTLC     S     G    + SV  AL S
Subjt:  TPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLS

AT5G01790.1 unknown protein

1.9e-09

35.4

Show/hide

Query:  STPSSSFRV-YYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQ-TSLPPLTPPPSYYS---------SSNSTSKAFSIFP-RL-------TPRKSRISSSSLASWS-
        S    SFR+ YY GA G++PF WES PGTPKH  S+  +LPPLTPPPS++S         S  ST K  ++ P RL         +  ++S+SS  S S 
Subjt:  STPSSSFRV-YYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQ-TSLPPLTPPPSYYS---------SSNSTSKAFSIFP-RL-------TPRKSRISSSSLASWS-

Query:  ----SSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFG
              +      F T +   RR  S DS +             D  ++ S    ST CFG
Subjt:  ----SSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCAAAGTGGAGACTTTGACGAAATGTCTAAAAAATGTCTCCAAATGAAAAACGAAGGCAAATTCTTCACAAGGGCTCTATCCAAAGAGGCTAACTCCACCCCCAGCTC
ATCTTTTAGAGTGTATTACGGCGGCGCCACCGGTTCGATTCCGTTCAGATGGGAGTCCCGGCCGGGAACTCCGAAGCATACTTTTTCGCAAACTTCTCTTCCTCCTCTTA
CTCCTCCTCCTTCCTACTATTCCTCTTCGAATTCTACTTCAAAGGCTTTCTCGATTTTTCCCCGGCTTACACCGAGGAAATCTCGAATCTCCTCCTCGTCATTAGCGTCG
TGGTCATCATCCTCTCGCTCGTCGCCCTTGCCTTTTGTTACACCGAAATTCTTCAAGCGTCGTCTCCGCTCCTTGGATTCTCCAAGCTTGCCGCCCTACAACTATAATAT
GGATGACAATTACGGGGACGAGTCGGTCGAGAGCTCGAATTCTCCGACCTCGACTTTGTGCTTTGGTGGTTCTTCAAGTAGGGCTTCGTTTTTCGGAGGTTGTTACCAGT
TAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCCACTCTTGGTCATGGTTCGGCAAGCCGAGGTATTGTTAATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MQSGDFDEMSKKCLQMKNEGKFFTRALSKEANSTPSSSFRVYYGGATGSIPFRWESRPGTPKHTFSQTSLPPLTPPPSYYSSSNSTSKAFSIFPRLTPRKSRISSSSLAS
WSSSSRSSPLPFVTPKFFKRRLRSLDSPSLPPYNYNMDDNYGDESVESSNSPTSTLCFGGSSSRASFFGGCYQLVSVKNALLSTLGHGSASRGIVN

Sed0026001 (gene) of Chayote v1 genome