; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0026014 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0026014
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionsyntaxin-71
Genome locationLG04:27791204..27794996
RNA-Seq ExpressionSed0026014
SyntenySed0026014
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0048278 - vesicle docking (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR006012 - Syntaxin/epimorphin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607729.1 Syntaxin-71, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-13295.47Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPD+IQAIPDGT TSTKKNGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_022145692.1 syntaxin-71 [Momordica charantia]6.2e-13295.09Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTT+TKK GGWTSS SRT+IKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_022941200.1 syntaxin-71-like [Cucurbita moschata]8.0e-13295.47Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALP+RIQAIPDGT TSTKKNGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_022981579.1 syntaxin-71-like [Cucurbita maxima]8.0e-13295.85Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DAS EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT TSTKKNGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

XP_023521570.1 syntaxin-71-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-13295.85Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT TSTKKNGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B689 syntaxin-711.9e-13195.09Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T+TK NGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+EQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A1S3CFA3 syntaxin-71-like1.6e-13094.34Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLE++PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T+TK NGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+ TVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A6J1CXF0 syntaxin-713.0e-13295.09Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTT+TKK GGWTSS SRT+IKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A6J1FSW5 syntaxin-71-like3.9e-13295.47Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALP+RIQAIPDGT TSTKKNGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

A0A6J1J294 syntaxin-71-like3.9e-13295.85Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFA+LYATVEADIEAALQKA+DAS EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT TSTKKNGGWTSS SRTEIKFDSDG+FD+EYFQH+E+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
        +DRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK
Subjt:  VDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54IX6 Probable syntaxin-8B8.7e-0423.61Show/hide
Query:  DAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEEIPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTTTS
        D   +L  ++ ADI+      + + +++N   +V  N  A++R     +  EI +LQ  L     + +  ++L  R + V   +++ +++ +  D    +
Subjt:  DAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEEIPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTTTS

Query:  TKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
        T +      + +   I + S+ QF     + +E + QF        Q++ MR  +QD+ LD++S+ +   KNMAH M+ E+D+   ++D+++   D  + 
Subjt:  TKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAAS

Query:  DLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL
         L+N N R++ T+ Q   S    + I++L I++
Subjt:  DLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL

Q94KK5 Syntaxin-735.7e-8865.92Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF++LY+ VE  +E  LQK +D S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE IPKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFD---SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+   +S    GGW +STS + I+FD   SD +  +EYFQ + +S QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFD---SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLK TV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Q94KK6 Syntaxin-722.6e-8563.16Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF++L+ ++++DIEA L+KA+ AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL E++ KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKK-NGGW-TSSTSRTEIKFD-SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K+ N  W  +S     IKFD S+   D+ +FQ SE+SSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKK-NGGW-TSSTSRTEIKFD-SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRLK  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

Q9SF29 Syntaxin-712.9e-10877.44Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFA+LY   E  IE AL+KA+  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL EE+PKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWT--SSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K    WT  S+TSR +IKFDSDG+FD++YFQ S +SSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWT--SSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09740.1 syntaxin of plants 712.1e-10977.44Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFA+LY   E  IE AL+KA+  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL EE+PKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWT--SSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K    WT  S+TSR +IKFDSDG+FD++YFQ S +SSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWT--SSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLYNVLK
Subjt:  EEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G45280.1 syntaxin of plants 721.9e-8663.16Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF++L+ ++++DIEA L+KA+ AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL E++ KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKK-NGGW-TSSTSRTEIKFD-SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K+ N  W  +S     IKFD S+   D+ +FQ SE+SSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKK-NGGW-TSSTSRTEIKFD-SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRLK  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+YN L
Subjt:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVL

AT3G61450.1 syntaxin of plants 734.0e-8965.92Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF++LY+ VE  +E  LQK +D S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE IPKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFD---SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+   +S    GGW +STS + I+FD   SD +  +EYFQ + +S QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFD---SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLK TV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK

AT3G61450.2 syntaxin of plants 731.3e-9267.04Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF++LY+ VE  +E  LQK +D S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE IPKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFD---SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+   +S    GGW +STS + I+FD   SD +  +EYFQ + +S QF+QEYEM+++KQDQGLD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFD---SDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLK TV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++YN +K
Subjt:  NEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACTAGAGTAGATGCGATCTGCCAGAAGTATGACAAATATGATGTAGAGAAGCAGAGGGATCTCAATGTCTCTGGTGACGATGCATTTGC
TCAACTCTATGCTACCGTTGAAGCCGACATTGAAGCCGCTCTGCAGAAAGCAGACGATGCTTCCAAAGAGAAGAATAGAGCGTCGGTGGTGGCACTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACTAAGGCTCGATTACTGGAGGAGATCCCCAAGTTGCAGAGATTGGCTGTAAAGCGGGTAAAAGGGCTATCAACTGAAGATCTTACTACTCGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCTGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGAACTACTACTTCCACGAAGAAGAATGGGGGTTGGACATCCTCAACTTCACGCACTGAAATAAAATTTGACTC
AGATGGGCAATTCGATAATGAGTACTTCCAACATTCTGAGCAGTCGAGTCAATTCAGGCAAGAGTATGAAATGCGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTAGACATGATAT
CAGAAGGGTTGGACACTCTGAAGAACATGGCTCATGATATGAATGAGGAAGTAGACAGGCAAGTTCCCTTGATGGATGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAACGTCAGATTAAAGCACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTTTGTATTGATATCATTTTGTTGTGCATAATCTTGGGTATTGCTGC
TTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACTAGAGTAGATGCGATCTGCCAGAAGTATGACAAATATGATGTAGAGAAGCAGAGGGATCTCAATGTCTCTGGTGACGATGCATTTGC
TCAACTCTATGCTACCGTTGAAGCCGACATTGAAGCCGCTCTGCAGAAAGCAGACGATGCTTCCAAAGAGAAGAATAGAGCGTCGGTGGTGGCACTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACTAAGGCTCGATTACTGGAGGAGATCCCCAAGTTGCAGAGATTGGCTGTAAAGCGGGTAAAAGGGCTATCAACTGAAGATCTTACTACTCGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCTGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGAACTACTACTTCCACGAAGAAGAATGGGGGTTGGACATCCTCAACTTCACGCACTGAAATAAAATTTGACTC
AGATGGGCAATTCGATAATGAGTACTTCCAACATTCTGAGCAGTCGAGTCAATTCAGGCAAGAGTATGAAATGCGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTAGACATGATAT
CAGAAGGGTTGGACACTCTGAAGAACATGGCTCATGATATGAATGAGGAAGTAGACAGGCAAGTTCCCTTGATGGATGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAACGTCAGATTAAAGCACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTTTGTATTGATATCATTTTGTTGTGCATAATCTTGGGTATTGCTGC
TTATCTATACAATGTGTTGAAGAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFAQLYATVEADIEAALQKADDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV
LALPDRIQAIPDGTTTSTKKNGGWTSSTSRTEIKFDSDGQFDNEYFQHSEQSSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEVDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
DLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYNVLKK