; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0026159 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0026159
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Description30S ribosomal protein S15, chloroplastic
Genome locationLG06:44717276..44730817
RNA-Seq ExpressionSed0026159
SyntenySed0026159
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000589 - Ribosomal protein S15
IPR005290 - Ribosomal protein S15, bacterial-type
IPR009068 - S15/NS1, RNA-binding


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606822.1 Thymidylate kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.6e-17076.68Show/hide
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KAG7036528.1 rpsO [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-18177.75Show/hide
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XP_022948487.1 uncharacterized protein LOC111452150 [Cucurbita moschata]1.5e-18177.75Show/hide
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XP_022998182.1 uncharacterized protein LOC111492906 [Cucurbita maxima]2.5e-18177.75Show/hide
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XP_023523996.1 uncharacterized protein LOC111788072 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-18177.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BXJ5 30S ribosomal protein S15, chloroplastic3.1e-16171.27Show/hide
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A0A5A7TSB7 30S ribosomal protein S15, chloroplastic3.1e-16171.27Show/hide
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A0A6J1DD15 30S ribosomal protein S15, chloroplastic1.8e-16473.65Show/hide
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A0A6J1G9E3 30S ribosomal protein S15, chloroplastic7.1e-18277.75Show/hide
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A0A6J1K776 30S ribosomal protein S15, chloroplastic1.2e-18177.75Show/hide
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        MALQLSLRPK+PK+ TNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDEP DSSS     SAQSP+SS+FSDVKARLKQQQQ   SP   R+PSY F S PNRSS P SKAA
Subjt:  MALQLSLRPKNPKSFTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDEPADSSSYTSPASAQSPISSHFSDVKARLKQQQQQHQSPFYDRRPSYSFNSTPNRSSPPVSKAA

Query:  SFDEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILR--NSSRVMQNERKSGDSMS
        S +EIRKNLSEFRSRSSVPPPSE G TPSS++SS  WQRG+S QELY+RNA RK  D +A  +  GRS M S  SIRE LR  +SS+ MQNERKSGDSMS
Subjt:  SFDEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILR--NSSRVMQNERKSGDSMS

Query:  LSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVFGGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLREMEEK
        LSAFKNSLKL+P DP+ +T+VFGG E LPASVFGKE+ + K+   GE++ MKTEFVKMYSH +LG++L+ALRP+K K KNWFSLTELNERLMKLR MEEK
Subjt:  LSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVFGGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLREMEEK

Query:  ETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKIS-DEKEKKTTTQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVA
        ET S+IGG+ + DLR SLVK+K+S DEK KKTT QRLDILG LGRTP +MLQPP+E LVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVR+EFKMSESDCGSARVQVA
Subjt:  ETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKIS-DEKEKKTTTQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVA

Query:  QLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLRDNPDYKN
        QLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDW+SYC+VLNKLG RDNPDYKN
Subjt:  QLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLRDNPDYKN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6TEI4 30S ribosomal protein S158.0e-1352.5Show/hide
Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTA--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR
        AK+  EF   E+D GS  VQVA LT +INHL      HKKD HS++GLL MV  R+KLL YL+R D   Y  ++ +LGLR
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTA--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR

A8F724 30S ribosomal protein S151.0e-1250Show/hide
Query:  ELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR
        E  K+ ++F+++E D GSA VQVA LT +I HLT  L  H KD HS++GL+ MV  R+KLL+YLR+++ +SY  ++ KL LR
Subjt:  ELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR

B5XSX7 30S ribosomal protein S156.1e-1352.5Show/hide
Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTA--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR
        AK+  EF   E+D GS  VQVA LT +INHL      HKKD HS++GLL MV  R+KLL YL+R D   Y  ++ +LGLR
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTA--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR

B7IFB5 30S ribosomal protein S153.0e-1253.33Show/hide
Query:  EFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR
        EF++ E D GS  VQ+A LT +I HLT  L  H KD HS++GL+ +V  R+K+LKYLR  D +SY  V+ KLGLR
Subjt:  EFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR

Q8RHN4 30S ribosomal protein S151.0e-1253.75Show/hide
Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR
        A++  EF  SE+D GS  VQ+A LT KINHLT  L  HKKD HS+ GLL MV  RK+LL YL + D + Y  ++ KLG+R
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15810.1 S15/NS1, RNA-binding protein9.8e-8345.28Show/hide
Query:  MALQLSLRPKNPKSFTNPSLIHLFSSNSSAPSDPN------DEPADSSSYTSPASAQSPISSHFSDVKARLKQQQQQHQSPFYDRRPSYSFNSTPNRSSP
        MAL L+ R +   S  N SLI  F SNSS+ S P       ++P+ S S  SP S  SPI    + +K +L+ QQ+Q + PF DR  + S     NR S 
Subjt:  MALQLSLRPKNPKSFTNPSLIHLFSSNSSAPSDPN------DEPADSSSYTSPASAQSPISSHFSDVKARLKQQQQQHQSPFYDRRPSYSFNSTPNRSSP

Query:  PVSKAASFDEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILRNSSRVMQNERKSG
          S+      + KNL++F+ RS+VPPP + G     S         +S+  LY+++AA      N+   R  ++   +  ++ E L+N    +      G
Subjt:  PVSKAASFDEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILRNSSRVMQNERKSG

Query:  DSMS-LSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVFGGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLR
             L +FK+++                 E LP  +F  ++ E+K + +GE++   TEF+  Y+ E+LG +L+ LRP+  K++ WFSL ELN+RL+KLR
Subjt:  DSMS-LSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVFGGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLR

Query:  EMEEKETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKISDEKEKKTTTQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSAR
        ++EEKE   R     +  LR  +   K  +E  + ++ Q + I+G+LG  PEY L PPKE LV+ YFHPDNMSSAEK+KIEL+KVR+EFKMSESDCGSAR
Subjt:  EMEEKETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKISDEKEKKTTTQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSAR

Query:  VQVAQLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLRDNPDYK
        VQVAQLTTKI HL++ LHKKDKHS+KGLL MVQ RKKLLKYLRRTDWDSYCLVL+KL LRDNPDYK
Subjt:  VQVAQLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLRDNPDYK

AT1G80620.1 S15/NS1, RNA-binding protein1.1e-8946.65Show/hide
Query:  MALQLSLRPKNPKSFTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDEPADSSSYTSPASAQSPISSHFSDVKARLKQQQQQHQSPFYDRRPSYSFNSTPNRSSPPVSKAA
        MAL L+ RPK  +  +NPSLIHLFS++SS+ S    +  +S+   S +S+   ISS+FS +++ LKQ Q Q       +R    F++ P  S       +
Subjt:  MALQLSLRPKNPKSFTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDEPADSSSYTSPASAQSPISSHFSDVKARLKQQQQQHQSPFYDRRPSYSFNSTPNRSSPPVSKAA

Query:  SFDEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILRNSSRVMQNERKSGDS--MS
           +IR+NL+EFRSR++ PPP +                   +Q+L+++N   K G      TR    +   L +I+  LR     M+ ++ + +S   +
Subjt:  SFDEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILRNSSRVMQNERKSGDS--MS

Query:  LSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVFGGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLREMEEK
        LS  +N +K   +D   +  + G  E LP SV GKE++E    +D   + MK+EF+K Y   +LG +L+  RP+  KE+ WFSL ELN+RL+KLR MEE+
Subjt:  LSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVFGGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLREMEEK

Query:  --ETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKISDEKEKKTTTQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQV
          +  S +     ++LR    K     + +K    Q  +I G L  TP+YML+PPK+QLVE YFHPDNMSSAEK+KIELAKVR+EFKMSESDCGSARVQV
Subjt:  --ETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKISDEKEKKTTTQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQV

Query:  AQLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLRDNPDYK
        AQLTTKI HL++VLHKKDKHS+KGL+AMVQ RKKLLKY+RRTDWDSYCL L+KLGLRDNPDYK
Subjt:  AQLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWDSYCLVLNKLGLRDNPDYK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCTTCAACTCAGCCTCAGACCCAAAAACCCTAAAAGTTTCACAAATCCTTCTCTCATACACTTATTCTCCTCCAATTCCTCCGCCCCGTCCGATCCCAACGACGA
GCCCGCCGATTCTTCTTCCTACACCTCCCCCGCCTCGGCTCAATCGCCCATATCCTCTCACTTCAGCGATGTCAAAGCGCGCCTCAAACAGCAGCAGCAGCAGCATCAGT
CTCCATTTTATGATCGAAGGCCTTCATACTCATTCAATTCAACTCCTAATCGATCGAGTCCTCCGGTTTCGAAAGCCGCTTCGTTCGATGAAATCAGGAAGAACCTCTCC
GAATTTCGCAGCCGATCCTCCGTTCCTCCTCCCTCGGAACCCGGCTCGACACCTTCCTCTTCCGCTTCTTCTTCGCCCTGGCAGCGCGGTGTCTCAGTTCAAGAGCTGTA
CCAGAGAAATGCGGCCAGGAAGGACGGCGATGCGAATGCAGATTCAACGAGAGAAGGCCGGAGCATCATGCATTCGCTTGGTTCGATTCGGGAGATTTTACGGAATTCGT
CGAGGGTAATGCAGAATGAACGGAAGAGTGGGGATTCAATGTCCTTGTCGGCGTTTAAGAACAGCTTGAAATTGCAGCCGTCGGATCCGTCGACGACGACGGCGGTGTTC
GGTGGGAGGGAGACGTTACCCGCATCGGTGTTTGGGAAGGAGATTAAGGAAACAAAGGAAACAAAAGATGGGGAGAGTAAGAGGATGAAGACTGAGTTTGTGAAGATGTA
TAGCCATGAGGACTTGGGGAGCCAGTTGAAAGCTCTGAGGCCAGATAAAACAAAAGAGAAGAATTGGTTTTCATTGACAGAGTTGAATGAGAGGTTGATGAAGCTAAGGG
AAATGGAGGAGAAGGAAACTGGATCCAGAATTGGAGGGGTTTTGTACGATGATTTGAGAAGGAGCTTGGTTAAGATAAAGATAAGTGATGAAAAGGAAAAGAAAACCACA
ACCCAGCGGCTCGATATCTTGGGGAATCTTGGTCGAACACCAGAGTATATGCTTCAACCTCCAAAGGAACAACTTGTTGAAAAGTACTTCCACCCGGATAACATGTCCTC
TGCTGAAAAGCTGAAAATTGAGTTAGCAAAAGTTAGAGATGAATTCAAAATGTCGGAGTCAGACTGTGGATCTGCTCGAGTTCAAGTTGCACAGCTTACCACTAAAATCA
ATCATCTAACTGCCGTGCTACACAAGAAGGACAAGCATTCCAAGAAAGGTCTTCTTGCAATGGTGCAACTGAGGAAAAAGCTACTGAAGTATCTTCGACGAACCGACTGG
GATTCCTACTGTCTGGTTCTAAACAAACTTGGTCTTCGAGACAACCCGGATTACAAGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTGCAGAGGCGCTCATTTCTGAAACCCTAGTCCCATCGTCTTCTTCGTTTTTCTGTCAAAAACCTCCAACTCAAAAACCTTCTTCAATTCCTCCTCCAATGGCGCTTCA
ACTCAGCCTCAGACCCAAAAACCCTAAAAGTTTCACAAATCCTTCTCTCATACACTTATTCTCCTCCAATTCCTCCGCCCCGTCCGATCCCAACGACGAGCCCGCCGATT
CTTCTTCCTACACCTCCCCCGCCTCGGCTCAATCGCCCATATCCTCTCACTTCAGCGATGTCAAAGCGCGCCTCAAACAGCAGCAGCAGCAGCATCAGTCTCCATTTTAT
GATCGAAGGCCTTCATACTCATTCAATTCAACTCCTAATCGATCGAGTCCTCCGGTTTCGAAAGCCGCTTCGTTCGATGAAATCAGGAAGAACCTCTCCGAATTTCGCAG
CCGATCCTCCGTTCCTCCTCCCTCGGAACCCGGCTCGACACCTTCCTCTTCCGCTTCTTCTTCGCCCTGGCAGCGCGGTGTCTCAGTTCAAGAGCTGTACCAGAGAAATG
CGGCCAGGAAGGACGGCGATGCGAATGCAGATTCAACGAGAGAAGGCCGGAGCATCATGCATTCGCTTGGTTCGATTCGGGAGATTTTACGGAATTCGTCGAGGGTAATG
CAGAATGAACGGAAGAGTGGGGATTCAATGTCCTTGTCGGCGTTTAAGAACAGCTTGAAATTGCAGCCGTCGGATCCGTCGACGACGACGGCGGTGTTCGGTGGGAGGGA
GACGTTACCCGCATCGGTGTTTGGGAAGGAGATTAAGGAAACAAAGGAAACAAAAGATGGGGAGAGTAAGAGGATGAAGACTGAGTTTGTGAAGATGTATAGCCATGAGG
ACTTGGGGAGCCAGTTGAAAGCTCTGAGGCCAGATAAAACAAAAGAGAAGAATTGGTTTTCATTGACAGAGTTGAATGAGAGGTTGATGAAGCTAAGGGAAATGGAGGAG
AAGGAAACTGGATCCAGAATTGGAGGGGTTTTGTACGATGATTTGAGAAGGAGCTTGGTTAAGATAAAGATAAGTGATGAAAAGGAAAAGAAAACCACAACCCAGCGGCT
CGATATCTTGGGGAATCTTGGTCGAACACCAGAGTATATGCTTCAACCTCCAAAGGAACAACTTGTTGAAAAGTACTTCCACCCGGATAACATGTCCTCTGCTGAAAAGC
TGAAAATTGAGTTAGCAAAAGTTAGAGATGAATTCAAAATGTCGGAGTCAGACTGTGGATCTGCTCGAGTTCAAGTTGCACAGCTTACCACTAAAATCAATCATCTAACT
GCCGTGCTACACAAGAAGGACAAGCATTCCAAGAAAGGTCTTCTTGCAATGGTGCAACTGAGGAAAAAGCTACTGAAGTATCTTCGACGAACCGACTGGGATTCCTACTG
TCTGGTTCTAAACAAACTTGGTCTTCGAGACAACCCGGATTACAAGAACTGAAGCACAGATTTGACCCGAGCTATTCTTCGTTCATCAAGTCGAGGTTGTGTAGCGTGTG
AGTCACCAAGTGCCGCCGGGACACGTTTTTCGAGGGCTCAGAATTTTATTTGGCTAGTTTGAGCTTCCAATGGATTCAAAGAGAGCTGTTAGTGGTTGGCCAAGGTACTA
CGAGATTGTATCGAGATGGGTGATCGGACGAGCTGAAGATGACCATGGGACCCGCTGCATTATTCTGTTTAGAGTCGTCTAAATTCCTTCTTTCTGCATGAACTATTTAA
GGGTGTGATAAATGGAACCTGTTTTATCGAGTTTTTATGTTTTGACTTTAGGGTACCCTAAGACTGTTTTAATGAATTTATCTCTTATAACCTTGTTCTTCCGAGTTGTT
TTAAAGGAGTTTTGTTTTAAATTTACATGCCCGAGATTGCGAATACTATTTTCATGCATTGTGAGTTAAGGACTTAGGTTTAGACCCTAGATTGGGTCGGGTCCTTACAT
TTTAACTCTGATTTGGAAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALQLSLRPKNPKSFTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDEPADSSSYTSPASAQSPISSHFSDVKARLKQQQQQHQSPFYDRRPSYSFNSTPNRSSPPVSKAASFDEIRKNLS
EFRSRSSVPPPSEPGSTPSSSASSSPWQRGVSVQELYQRNAARKDGDANADSTREGRSIMHSLGSIREILRNSSRVMQNERKSGDSMSLSAFKNSLKLQPSDPSTTTAVF
GGRETLPASVFGKEIKETKETKDGESKRMKTEFVKMYSHEDLGSQLKALRPDKTKEKNWFSLTELNERLMKLREMEEKETGSRIGGVLYDDLRRSLVKIKISDEKEKKTT
TQRLDILGNLGRTPEYMLQPPKEQLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTAVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDW
DSYCLVLNKLGLRDNPDYKN