; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0026472 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0026472
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationLG12:2814655..2820502
RNA-Seq ExpressionSed0026472
SyntenySed0026472
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141207.1 tryptophan synthase alpha chain [Cucumis sativus]1.8e-15490.06Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV QSKRFAPMAAL A PV+GL+ETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELS P+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK+IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VS RVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]5.0e-15791.03Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV Q+KRFAPMAAL A PV+GL+ETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCP+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VSGRVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_016903364.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X2 [Cucumis melo]1.1e-15390.06Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV Q+KRFAPMAAL A PV+GL+ETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCP+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D    GLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VSGRVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]1.7e-15288.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LP+NKIP + I SPRPC +SVFQSKRFAP+AALTASP  GL+ETF+KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCPVSLF+YYNPILKRG+ENFMMTI DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMK+IVEASEGF+YLVSS+GVTG RT+VSGRVQ+LLEEIKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]3.9e-15490.06Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        M IAFKSS   P+NKIP+S IFSPRPCK+SVF+SKRFAPMA L ASPV+GL+ETF+KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCP+SLFTYYN ILKRG+ENF+M I+DAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKDI EASEGF+YLVSS+GVTGTRT+VSGRVQTLLEE+KEVT KPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase8.6e-15590.06Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV QSKRFAPMAAL A PV+GL+ETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELS P+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK+IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VS RVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFT+SLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase2.4e-15791.03Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV Q+KRFAPMAAL A PV+GL+ETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCP+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VSGRVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A1S4E560 Tryptophan synthase5.6e-15490.06Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV Q+KRFAPMAAL A PV+GL+ETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCP+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D    GLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VSGRVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase2.4e-15791.03Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LP+NKIPN+LIFSPRPCK+SV Q+KRFAPMAAL A PV+GL+ETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCP+SLFTYYNPILKRGVENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSSIGVTGTRT+VSGRVQTLLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGII+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase8.0e-15388.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LP+NKIP + I SPRPC +SVFQSKRFAP+AALTASP  GL+ETF+KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LAR+TNF+AI+SMLKGVIPELSCPVSLF+YYNPILKRG+ENFMMTI DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMK+IVEASEGF+YLVSS+GVTG RT+VSGRVQ+LLEEIKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTKSLKSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0C6F8 Tryptophan synthase alpha chain5.1e-8057.47Show/hide
Query:  LTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYN
        +++ F +LR++G+ ALIP++TAGDPDL+TTA AL+ L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R T  D +L M+  + PE+  P+ LFTYYN
Subjt:  LTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYN

Query:  PILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVT
        PI  RGV  F+  I  AGVRGLVVPD+PLEE+E L ++A    IE+ LL  PT+ K+R++ I   S+GFIYLVS+ GVTG RT V  RVQ L+ ++++VT
Subjt:  PILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVT

Query:  KKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
         KP+ VGFGIS+ EH +QV DWGAD  IVGSA V  L E  SP +GL  +  F +SLKS+L
Subjt:  KKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain3.9e-8056.98Show/hide
Query:  VLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFT
        ++ ++  F  LR++ + ALIP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATR+L + T  DA+L M+  V P L  P+ LFT
Subjt:  VLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFT

Query:  YYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIK
        YYNPI  RGVE F+  +  AGV+GLVVPD+PLEE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+  I E S+GFIYLVS+ GVTG R+ V GRV  LL E++
Subjt:  YYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIK

Query:  EVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        +VT KP+ VGFGIS+PEH +QV +WGAD  IVGSA VK L E  +PE+GL  + +F +SLK+AL+
Subjt:  EVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain1.8e-11778.73Show/hide
Query:  TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPV
        T S  +GL+ETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNF++I+SMLK VIP+LSCP+
Subjt:  TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPV

Query:  SLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLL
        +LFTYYNPIL+RGVEN+M  I++AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASEGFIYLVSS+GVTGTR +V+ +VQ+LL
Subjt:  SLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLL

Query:  EEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic6.2e-8656.4Show/hide
Query:  SPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARK
        +P P  V     K+ A  A   + PV   ++T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA  
Subjt:  SPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARK

Query:  TNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYL
        T  DA+L ML+ V PELSCPV L +YY PI+ R     +  +++AGV GL+VPD+P      L  EA  +N+ELVLLTTP  P+DRMK+I +ASEGF+YL
Subjt:  TNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYL

Query:  VSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        VS  GVTG R  V+ RV++L++E+K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  VSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic6.6e-12072.76Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAAL-TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        M IAFKS  V  +    + + F       S    KRF PMA+L T+SP LGL +TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAAL-TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN D+IL ML  V+P++SCP+SLFTYYNPILKRG+  FM +I   GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSSIGVTG R++VSG+VQ+LL++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain4.7e-12172.76Show/hide
Query:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAAL-TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        M IAFKS  V  +    + + F       S    KRF PMA+L T+SP LGL +TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAAL-TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN D+IL ML  V+P++SCP+SLFTYYNPILKRG+  FM +I   GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSSIGVTG R++VSG+VQ+LL++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LE  TKSLKSAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.3e-11878.73Show/hide
Query:  TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPV
        T S  +GL+ETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNF++I+SMLK VIP+LSCP+
Subjt:  TASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPV

Query:  SLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLL
        +LFTYYNPIL+RGVEN+M  I++AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASEGFIYLVSS+GVTGTR +V+ +VQ+LL
Subjt:  SLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLL

Query:  EEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAAATCTTCGAGGGTTCTTCCCATCAACAAGATTCCCAATTCGCTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGCAAGGTTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGTT
TGCTCCAATGGCTGCCCTCACAGCCTCACCTGTTCTTGGACTGACTGAAACATTCGACAAATTGAGGGAGCAAGGCAAGGTTGCATTGATCCCCTACATTACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCGACCACGGCTGAAGCATTGAAAGTGCTTTCCACATGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTAGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCGGCAGCTACTCGATCTTTGGCTAGAAAGACGAACTTTGATGCAATACTTTCTATGTTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCATGTCCGGTTTCCCTGTTTAC
ATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGCGTTGAAAACTTCATGATGACGATCGAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTGGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAAACTGAAA
TTTTGAGAAAGGAAGCTGTAAAGCATAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAGGACATCGTTGAAGCTTCAGAAGGATTTATA
TATCTTGTGAGCTCCATTGGAGTTACGGGTACCCGCACAACAGTAAGTGGTAGAGTGCAAACTCTTCTTGAGGAAATCAAAGAGGTTACGAAAAAGCCAGTTGCAGTTGG
TTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTTAAACAGGTGGCTGACTGGGGGGCAGATGGCATTATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCCCCTG
AGGAAGGATTGAAGGAACTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATTCAGCCCATCAAAACGCCAATTTTCCGCCAACAACGCAACAGTGCCCGTTTTTGGCAACTGCAGCCGCTGTAAAGCCAGAACGAAATCGAGCTGCTATAAACCTCA
CATTCACTCTGTATTTGAATTCGAAGAAAACCCATTCGAGAATCTGCAGTTCCACCAAAACCCTCTTTGCGAAATGGACATTGCTTTCAAATCTTCGAGGGTTCTTCCCA
TCAACAAGATTCCCAATTCGCTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGCAAGGTTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGTTTGCTCCAATGGCTGCCCTCACAGCCTCACCTGTTCTT
GGACTGACTGAAACATTCGACAAATTGAGGGAGCAAGGCAAGGTTGCATTGATCCCCTACATTACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCGACCACGGCTGAAGCATTGAAAGT
GCTTTCCACATGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTAGCAGATGGTCCTGTTATACAGGCGGCAGCTACTCGATCTTTGGCTAGAAAGA
CGAACTTTGATGCAATACTTTCTATGTTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCATGTCCGGTTTCCCTGTTTACATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGCGTTGAAAAC
TTCATGATGACGATCGAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTGGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAAACTGAAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTAAAGCATAATATTGAACT
GGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAGGACATCGTTGAAGCTTCAGAAGGATTTATATATCTTGTGAGCTCCATTGGAGTTACGGGTACCCGCA
CAACAGTAAGTGGTAGAGTGCAAACTCTTCTTGAGGAAATCAAAGAGGTTACGAAAAAGCCAGTTGCAGTTGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTTAAACAGGTG
GCTGACTGGGGGGCAGATGGCATTATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCCCCTGAGGAAGGATTGAAGGAACTTGAAAACTTCACCAAATC
CTTAAAATCTGCACTCTCTTGATGCAATAAACCAATGCAAACAAGTGCTCAACTTGCACTGTCATCTTAAAATCACCCAAATATTTTATTTCTCTTTTCACACAGAATAA
AACTTTTAGGGTATTTTCAATCAATATAATGAGAATATTTTCTAGTATTTTCTTGGTAGCCAATGGATGGTTGCAAGTATAAATTTCTCAATAATTTACTGATTAGTCAA
TGCCCGTGATGTTTCCTTTATATTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFKSSRVLPINKIPNSLIFSPRPCKVSVFQSKRFAPMAALTASPVLGLTETFDKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARKTNFDAILSMLKGVIPELSCPVSLFTYYNPILKRGVENFMMTIEDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFI
YLVSSIGVTGTRTTVSGRVQTLLEEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS