; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0026848 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0026848
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionBnaCnng13060D protein
Genome locationContig00347:68296..70155
RNA-Seq ExpressionSed0026848
SyntenySed0026848
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
OIW21822.1 hypothetical protein TanjilG_12081 [Lupinus angustifolius]3.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
QCD96519.1 hypothetical protein DEO72_LG6g1223 [Vigna unguiculata]3.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
QCE00046.1 hypothetical protein DEO72_LG7g1332 [Vigna unguiculata]3.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
QCE14668.1 hypothetical protein DEO72_LG11g1671 [Vigna unguiculata]3.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
QHO19958.1 uncharacterized protein DS421_11g333640 [Arachis hypogaea]3.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A394DF89 Uncharacterized protein1.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
A0A4D6M576 Uncharacterized protein1.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
A0A4D6MFA1 Uncharacterized protein1.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
A0A4D6N158 Uncharacterized protein1.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
A0A4D6NMU8 Uncharacterized protein1.8e-3989.25Show/hide
Query:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
        S  G +E      PSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
Subjt:  SGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCCACATCTCAGGGTCAGGCGCTGATGAGCACATTGAACTATCCATTCCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCGGACCAGCTACTGATCATCGCCTTGGTAAGCTATT
GCCTCACCAACTAGCTAATCAGACGCGAGCCCCTCCTCGGGCGGATTCCTCCTTTTGCTCCTCAGCGTACGGGGTATTAGCAGCCGTTTCCAGCTGTTGTTCCCCTCCCA
AGGGCAGGTTCTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACTGGAAACACCACTTCCCGTCCGACTTGCATGTGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCCACATCTCAGGGTCAGGCGCTGATGAGCACATTGAACTATCCATTCCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCGGACCAGCTACTGATCATCGCCTTGGTAAGCTATT
GCCTCACCAACTAGCTAATCAGACGCGAGCCCCTCCTCGGGCGGATTCCTCCTTTTGCTCCTCAGCGTACGGGGTATTAGCAGCCGTTTCCAGCTGTTGTTCCCCTCCCA
AGGGCAGGTTCTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACTGGAAACACCACTTCCCGTCCGACTTGCATGTGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIHISGSGADEHIELSIPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPSATGNTTSRPTCMC