; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0026949 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0026949
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationLG01:14422192..14430800
RNA-Seq ExpressionSed0026949
SyntenySed0026949
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.4e-14093.45Show/hide
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XP_011660315.1 TLC domain-containing protein 4-B [Cucumis sativus]4.1e-13993.07Show/hide
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XP_023543000.1 transmembrane protein 56 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-13993.45Show/hide
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XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]7.5e-14194.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein2.0e-13993.07Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like6.2e-14193.8Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like6.2e-14193.8Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 564.5e-13992.73Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like9.9e-13993.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B1.5e-1123.55Show/hide
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        V G  +  +L +  ++ ++S+++ + Y  L   +  +WN+R +ST+HA+ + +  LY +++ D  ++    G        L    + I+ GY   DL L+
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           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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Query:  VIKMHVIGYILVFGVPTV-LGLMNLMWFGKILKGLMKTISSR
          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+ +
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A3.1e-1224Show/hide
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        D    Y  V G  L  +L++  ++  +   Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ GY
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Query:  FLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKR-SWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYH
         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  R SW  L+NG+ +   + + RI +    +  
Subjt:  FLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKR-SWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYH

Query:  VYLHY--DQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSR
        V+  +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K + ++
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Q6P4N1 TLC domain-containing protein 41.2e-1123.79Show/hide
Query:  FTPYTSVLGGMLTCKLVYD-LTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISVGYFL
        F  Y  V G  L  +L++  ++      Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + +  +     G   +    ++     I+ GY +
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Query:  ADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKR-SWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVY
         DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  R SW  L+NG+ +   + + RI +    +  V+
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Query:  LHY--DQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSR
          +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K + ++
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B1.3e-1327.17Show/hide
Query:  FTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYL--GLTKI---QRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISV
        F+P T  +   +T   V+     V +S+  + L  G  K+   Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ 
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Query:  GYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAG-MKRSWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGY
        GY ++DL LI++ +  +G   +V HH L+ L   Y V  GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +   
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Query:  TFYHVYLHY-DQVIKMHVIGYILVFGVPTV-LGLMNLMWFGKILKGLMKTISSR
         +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW  KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 43.3e-1427.44Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
Subjt:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYS

Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNL
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKILKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
Subjt:  MWFGKILKGLMKTIS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-11372.53Show/hide
Query:  TMSLKNVMAIKSYQSQADALVKNYLLADYFTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS
        T SL+ + AIKSY  QA  LVKNYLLAD F PYTSVL G+  CK+VYDL   +SNS+ K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFS
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Query:  DQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAY
        D+ H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY
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Query:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSR
        ++NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKI++G+ KT++ R
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-11372.53Show/hide
Query:  TMSLKNVMAIKSYQSQADALVKNYLLADYFTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS
        T SL+ + AIKSY  QA  LVKNYLLAD F PYTSVL G+  CK+VYDL   +SNS+ K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFS
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Query:  DQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAY
        D+ H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY
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Query:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSR
        ++NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKI++G+ KT++ R
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein3.6e-6450.63Show/hide
Query:  SVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGLVTFQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  V+GIS+GYFLADL +I
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Query:  VWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WLVAR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  VWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTIS
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+S
Subjt:  KMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTIS

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.1e-10570.9Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADYFTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQ     
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Query:  VT-FQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSRQ
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKI+KGL KT+  RQ
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSRQ

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.1e-10570.9Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADYFTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQ     
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADYFTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSRQ
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKI+KGL KT+  RQ
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSRQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAATGTCTTTGAAGAATGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTGGTAAAGAACTACTTGTTAGCAGACTATTTTACGCCATACACCTCTGT
CCTCGGAGGCATGCTTACTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTCTTACTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCTACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCATCATGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACGCTGTCTACTTTCGTATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCTGATCTTGGATTGATCGTTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGCGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTTTCTGGACTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACGTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACCACACCTGAGA
TTAATATGAGATGGTACCTTGACACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGGGCATATCTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGTTACACATTCTATCATGTTTACCTACACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATATTTTAGTATTTGGAGTACCAACAGTGCTAGGCTTGATGAACTT
GATGTGGTTTGGGAAGATCCTCAAGGGGTTAATGAAAACTATATCAAGTAGGCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAATAAAGAAAATAATAATAATAATCATCGGCTAAGGCGCGAAGTTATCAAATTTCTTGGATAGAATCACAATTCATCCAATCCACAAGAACACGACGATCCCATCTCT
GGACACTCAAATCCATTGCTGATTAGCAAAAACCCACTTCCAATTCGCATTACCCATTTCATAATTTCCTCTTAATCGTTCCTAATTTCTCTTAATCCCCATTACATTGT
CGCAGTTGGCTTCTCATTGATTGAACTTCACGGGATAACAAGATGGAGTGTGGCTAAAGTACAGCAATCGCTGAATGTTATATAGTCAAACACAACCATGACAATGTCTT
TGAAGAATGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTGGTAAAGAACTACTTGTTAGCAGACTATTTTACGCCATACACCTCTGTCCTCGGAGGCATG
CTTACTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTCTTACTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGAATAACCGCGGCAT
GTCTACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCATCATGCTGGCCTTGTTACCTTTCAAAGTTCAA
CGCTGTCTACTTTCGTATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCTGATCTTGGATTGATCGTTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGCGGGATGGAGTATGTTGTCCACCAC
TCTCTTTCTGGACTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACGTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACCACACCTGAGATTAATATGAGATG
GTACCTTGACACTGCTGGTATGAAGAGGTCCTGGGCATATCTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGCTGTTTGGTTACACATTCT
ATCATGTTTACCTACACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATATTTTAGTATTTGGAGTACCAACAGTGCTAGGCTTGATGAACTTGATGTGGTTTGGG
AAGATCCTCAAGGGGTTAATGAAAACTATATCAAGTAGGCAATGAGGAGCATATTTTTCTGGTTAATGTCTCTTACTCTTCACTCTATTGCTCTTTTCTTTACATCTACA
CATGGGTTGGGGAGAAAAATGAATTTGTAAATGGTTCAAAATAATTTAAAATTTGTTGGCATTTAGTGTCCTTTTCTTCTTATCAGATTTATGTACCAACCAATTCATTT
CTTTCTGTAAAGTTCTCTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTCCAAGAATGAATGCATACATTGTATGGAAGAAATGTGAGATACTACAGCAATTTTTTGTCTTCGGTTATAGTT
ATGATTTCGGTTCTCGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTMSLKNVMAIKSYQSQADALVKNYLLADYFTPYTSVLGGMLTCKLVYDLTQLVSNSYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQHHAGLVT
FQSSTLSTFVLGISVGYFLADLGLIVWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSWAYLINGIVIFFAWLVARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYILVFGVPTVLGLMNLMWFGKILKGLMKTISSRQ