CuGenDBv2

Gene ID	Sed0027331
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	60S ribosomal protein L12
Genome location	LG03:13985120..13985974
RNA-Seq Expression	Sed0027331
Synteny	Sed0027331
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

NP_001238575.2 60S ribosomal protein L12 [Glycine max]

7.4e-83

95.18

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQ+VDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGS+KEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGD+E+PLD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

XP_007132258.1 hypothetical protein PHAVU_011G079400g [Phaseolus vulgaris]

4.3e-83

96.39

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGS+KEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGD+E+PLD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

3.3e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGD+EIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

9.6e-83

96.39

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGD+E+P D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

7.4e-83

96.99

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGD+EIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0R0HHB6 Uncharacterized protein

3.6e-83

95.18

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQ+VDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGS+KEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGD+E+PLD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

A0A445I3P2 60S ribosomal protein L12

3.6e-83

95.18

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQ+VDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGS+KEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGD+E+PLD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

A0A6J1F4X7 60S ribosomal protein L12-1-like

1.6e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGD+EIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

1.6e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIAR+MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGD+EIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

V7AF97 Uncharacterized protein

2.1e-83

96.39

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGS+KEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGD+E+PLD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

2.7e-80

90.96

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIK+LKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD
        H+G+ISLDDVIEIA+IM+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGD+EIPLD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

8.0e-64

73.17

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDP++V  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKLT+QNRQA VSVVPSA+ALVIK+LKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI +G+IEIP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

P50883 60S ribosomal protein L12-1

1.8e-79

89.63

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG++EIP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

1.4e-79

90.24

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        HNGNIS DDVIEIA+IMRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GDI+IP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

2.3e-79

90.24

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G+IEIP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.3e-80

89.63

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG++EIP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.6e-80

90.24

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        HNGNIS DDV EIARIMRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G+IEIP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

9.6e-81

90.24

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIK+LKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP
        HNGNIS DDVIEIA+IMRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GDI+IP
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCCCAAGTTCGATCCCAGCCAAGTCGTCGACGTATTCGTCAGAGTCACCGGCGGCGAGGTCGGCGCCGCCAGTTCCCTCGCTCCCAAAATCGGTCCGCTAGGTCT
TTCCCCGAAGAAAATCGGAGAAGACATTGCCAAAGAAACCGCCAAGGAATGGAAGGGCCTGAGAGTCACCGTCAAGCTCACCGTCCAGAATCGTCAAGCCAAAGTCTCCG
TCGTCCCCTCCGCCGCGGCTTTGGTCATCAAGTCGCTGAAGGAGCCTGAGCGCGATCGGAAGAAGACGAAGAACATCAAGCATAATGGTAATATCTCGCTCGATGATGTG
ATTGAGATTGCGAGGATTATGCGACCTAGGTCTATGGCCAAAGATCTTAGTGGATCTGTCAAGGAGATTCTTGGGACTTGCGTTTCTGTTGGATGTACGGTTGATGGTAA
GGATCCCAAGGATTTGCAGCAGGAAATTTCTGATGGGGATATTGAAATTCCCCTGGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCACCAATCTCTAAAACCCTAAACCAAGCCTCTGTCCTCGCCTCCTCCAAATCTCTGCAACTCAACAAAAATTCCAAACCCTAAATCCGAAATTCAACAATGCCTCCCAA
GTTCGATCCCAGCCAAGTCGTCGACGTATTCGTCAGAGTCACCGGCGGCGAGGTCGGCGCCGCCAGTTCCCTCGCTCCCAAAATCGGTCCGCTAGGTCTTTCCCCGAAGA
AAATCGGAGAAGACATTGCCAAAGAAACCGCCAAGGAATGGAAGGGCCTGAGAGTCACCGTCAAGCTCACCGTCCAGAATCGTCAAGCCAAAGTCTCCGTCGTCCCCTCC
GCCGCGGCTTTGGTCATCAAGTCGCTGAAGGAGCCTGAGCGCGATCGGAAGAAGACGAAGAACATCAAGCATAATGGTAATATCTCGCTCGATGATGTGATTGAGATTGC
GAGGATTATGCGACCTAGGTCTATGGCCAAAGATCTTAGTGGATCTGTCAAGGAGATTCTTGGGACTTGCGTTTCTGTTGGATGTACGGTTGATGGTAAGGATCCCAAGG
ATTTGCAGCAGGAAATTTCTGATGGGGATATTGAAATTCCCCTGGATTGAGGTTTTTGTTTTGCTTTCAAGTTTTGGAATTTTAAATGTTTTTCTTTATATTATTGTTTT
TAAATGACTTTATATCTCGATATGAGGATTTATTTAATGTGGGAGATATTGCTTCATTTTGGGGATGAATGCATTCATTTTGTGGTTCCCTTTTGATCTGAAGTTTAGAC
TTTTCGGTATTTTTCAAATTGTTGAGAATGGCCCTATTAAGATTCAGTAATTAATCTGAGCGCAGGGCATAGTTTTCTGTCTTGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKSLKEPERDRKKTKNIKHNGNISLDDV
IEIARIMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDIEIPLD

Sed0027331 (gene) of Chayote v1 genome