; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sed0027358 (gene) of Chayote v1 genome

Gene IDSed0027358
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionribonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationLG03:4350692..4352588
RNA-Seq ExpressionSed0027358
SyntenySed0027358
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
GO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578369.1 hypothetical protein SDJN03_22817, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.7e-17791.79Show/hide
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XP_022939079.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like [Cucurbita moschata]1.4e-17691.49Show/hide
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XP_022993124.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like [Cucurbita maxima]1.1e-17691.19Show/hide
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XP_023550668.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-17892.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5N6QXP3 Uncharacterized protein6.5e-17287.84Show/hide
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A0A6J1BWR9 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain7.2e-17992.1Show/hide
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A0A6J1FG17 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like6.8e-17791.49Show/hide
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A0A6J1JZC2 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like5.2e-17791.19Show/hide
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A0A6P4AGQ7 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain3.8e-17287.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B6.3e-15678.98Show/hide
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        MP++ ++P+L P PDRFCMFPI+YP IWEMYKKA ASFWT EEVDLSQD R WE  LT DE+HFI HVLAFFAASDGIVLENL+ RFM DVQ++EARAFY
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        KRVGEYQKAS+MSS++GN      H F +DEDF
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.2e-16785.71Show/hide
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        MP I ++PLLA +PDRFCMFPI+YP IWEMYKKA+ASFWT EEVDLS D RHWE LT  E+HFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMK+VQVAEARAFYG
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P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A3.7e-14073.85Show/hide
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        +++PLL     RF MFPI Y SIWEMYKKA ASFWT EEVDLS D++ WE LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ DVQV EARAFYGFQIA
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        +ENIHSEMYSLLLET+IKDS +K+RLF+AI+TIPC++KKA W L WI    SFA RL+AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
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Query:  HCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE
        HCDFACLLYSLL+ +L  E V  IV +AV+IE EFVC ALPC L+GMN +LMS YI+FVADRLL+ LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGE
Subjt:  HCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE

Query:  YQKASVMSSLNGNGGIHEFNMDEDF
        YQKASVMS+L      +EF  +EDF
Subjt:  YQKASVMSSLNGNGGIHEFNMDEDF

P79733 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M23.0e-12967.66Show/hide
Query:  SRQEMPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEAR
        S+ +  A+ ++PLL  NP RF +FPI+Y  IW+MYKKA ASFWT EEVDLS+DL+HW+ L  +E++FI+HVLAFFAASDGIV ENL  RF ++VQV EAR
Subjt:  SRQEMPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEAR

Query:  AFYGFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWI-DGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSN
         FYGFQIA+ENIHSEMYSLL++TYIKDS ++  LF+AI+T+PCV KKADWAL WI D +  + ER++AFA VEGIFFSGSF SIFWLKKRGLMPGLTFSN
Subjt:  AFYGFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWI-DGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSN

Query:  ELISRDEGLHCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKT
        ELISRDEGLHCDFACL++  L  K SEETV+ I+  AV+IE+EF+ DALP  L+GMN DLM  YIEFVADRLLL LG  K+Y V+NPFD+ME ISL+GKT
Subjt:  ELISRDEGLHCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKT

Query:  NFFEKRVGEYQKASVMSSLNGNGGIHEFNMDEDF
        NFFEKRVGEYQ+  VMS    N     F +D DF
Subjt:  NFFEKRVGEYQKASVMSSLNGNGGIHEFNMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C3.4e-15781.02Show/hide
Query:  MPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWE-GLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEARAFY
        MP++ ++PLL P PDRFCMFPI YP IWEMYKKA ASFWT EEVDLSQD R WE  L   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM DVQV+EARAFY
Subjt:  MPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWE-GLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEARAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ +++ LF AI+TIPCV KKA WA+KWIDGS++FAER+IAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+TKLSEE V+ IV  AV+IEREFVCDALPCALVGMN DLMS YIEFVADRLL ALG+ K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFNMDEDF
        KRVG+YQKASVMSS+NGNG    H F++DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFNMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A2.6e-14173.85Show/hide
Query:  TKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEARAFYGFQIA
        +++PLL     RF MFPI Y SIWEMYKKA ASFWT EEVDLS D++ WE LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ DVQV EARAFYGFQIA
Subjt:  TKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEARAFYGFQIA

Query:  IENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
        +ENIHSEMYSLLLET+IKDS +K+RLF+AI+TIPC++KKA W L WI    SFA RL+AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
Subjt:  IENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL

Query:  HCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGE
        HCDFACLLYSLL+ +L  E V  IV +AV+IE EFVC ALPC L+GMN +LMS YI+FVADRLL+ LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGE
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Query:  YQKASVMSSLNGNGGIHEFNMDEDF
        YQKASVMS+L      +EF  +EDF
Subjt:  YQKASVMSSLNGNGGIHEFNMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein2.4e-15881.02Show/hide
Query:  MPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWE-GLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEARAFY
        MP++ ++PLL P PDRFCMFPI YP IWEMYKKA ASFWT EEVDLSQD R WE  L   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM DVQV+EARAFY
Subjt:  MPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWE-GLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAEARAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ +++ LF AI+TIPCV KKA WA+KWIDGS++FAER+IAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+TKLSEE V+ IV  AV+IEREFVCDALPCALVGMN DLMS YIEFVADRLL ALG+ K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFNMDEDF
        KRVG+YQKASVMSS+NGNG    H F++DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSSLNGNGGI--HEFNMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCGGCAGTTATCTCAAGCGACGTTTTGTCTTCTCGTCAAGAGATGCCGGCAATTACTAAAGATCCGTTGCTCGCTCCCAACCCCGACAGATTCTGTATGTTCCC
AATTGAATATCCTTCGATATGGGAGATGTATAAGAAGGCAGTGGCTTCATTCTGGACCGTTGAGGAAGTTGATCTCTCTCAGGACCTTCGCCATTGGGAAGGTCTCACTG
CTGACGAGAAGCATTTCATCACGCACGTTCTTGCCTTCTTTGCTGCATCCGATGGGATTGTTTTGGAAAATCTTGCTGGACGGTTTATGAAGGATGTTCAGGTTGCGGAG
GCGAGAGCGTTCTATGGTTTTCAAATTGCGATTGAGAATATTCATTCTGAGATGTACAGTTTGTTGCTTGAAACCTACATTAAGGATTCAGTTAAGAAGAACAGGTTGTT
CCATGCCATTGATACTATCCCTTGTGTTACAAAGAAGGCTGACTGGGCACTTAAATGGATCGATGGCTCAGAGTCCTTTGCAGAAAGGCTGATTGCGTTTGCCTGTGTGG
AAGGCATCTTCTTCTCAGGGAGTTTTTGCTCGATATTCTGGTTGAAGAAGCGTGGACTGATGCCGGGATTGACATTCTCGAATGAACTGATTTCACGAGATGAAGGTCTG
CATTGTGATTTTGCTTGCTTGTTGTACTCACTGTTAAGGACAAAGTTAAGTGAGGAGACAGTGCAGGGGATAGTCCGACAGGCGGTGGATATTGAGAGGGAATTTGTTTG
TGATGCATTGCCCTGCGCATTGGTAGGGATGAATGGTGATCTGATGAGTGTATATATCGAGTTTGTTGCCGATCGACTACTGTTAGCCTTGGGGCATAGCAAGATTTACA
ATGTGCAGAATCCATTCGATTGGATGGAACTAATATCACTACAAGGGAAAACCAACTTCTTTGAGAAGAGGGTGGGAGAGTATCAGAAAGCTTCTGTGATGTCAAGCTTA
AATGGCAATGGAGGGATTCATGAGTTCAACATGGATGAGGATTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCAGAACCCTCATTTCCCGCGAAACAAAGGATCAATTCATCTCTTTCGTTTGGGATTTTCGGAAATTCTAAACCCTAATATTCCTCTGCTATGGCTCCGGCAGTTATCTC
AAGCGACGTTTTGTCTTCTCGTCAAGAGATGCCGGCAATTACTAAAGATCCGTTGCTCGCTCCCAACCCCGACAGATTCTGTATGTTCCCAATTGAATATCCTTCGATAT
GGGAGATGTATAAGAAGGCAGTGGCTTCATTCTGGACCGTTGAGGAAGTTGATCTCTCTCAGGACCTTCGCCATTGGGAAGGTCTCACTGCTGACGAGAAGCATTTCATC
ACGCACGTTCTTGCCTTCTTTGCTGCATCCGATGGGATTGTTTTGGAAAATCTTGCTGGACGGTTTATGAAGGATGTTCAGGTTGCGGAGGCGAGAGCGTTCTATGGTTT
TCAAATTGCGATTGAGAATATTCATTCTGAGATGTACAGTTTGTTGCTTGAAACCTACATTAAGGATTCAGTTAAGAAGAACAGGTTGTTCCATGCCATTGATACTATCC
CTTGTGTTACAAAGAAGGCTGACTGGGCACTTAAATGGATCGATGGCTCAGAGTCCTTTGCAGAAAGGCTGATTGCGTTTGCCTGTGTGGAAGGCATCTTCTTCTCAGGG
AGTTTTTGCTCGATATTCTGGTTGAAGAAGCGTGGACTGATGCCGGGATTGACATTCTCGAATGAACTGATTTCACGAGATGAAGGTCTGCATTGTGATTTTGCTTGCTT
GTTGTACTCACTGTTAAGGACAAAGTTAAGTGAGGAGACAGTGCAGGGGATAGTCCGACAGGCGGTGGATATTGAGAGGGAATTTGTTTGTGATGCATTGCCCTGCGCAT
TGGTAGGGATGAATGGTGATCTGATGAGTGTATATATCGAGTTTGTTGCCGATCGACTACTGTTAGCCTTGGGGCATAGCAAGATTTACAATGTGCAGAATCCATTCGAT
TGGATGGAACTAATATCACTACAAGGGAAAACCAACTTCTTTGAGAAGAGGGTGGGAGAGTATCAGAAAGCTTCTGTGATGTCAAGCTTAAATGGCAATGGAGGGATTCA
TGAGTTCAACATGGATGAGGATTTCTAAGAAATGACTTTTTTAAAGTTAATTGTGTATTTTAGGTTTTTTGTTTTGGGCTCTTTAATTTCATGTTTGTTAATGATCGACT
GAAATGGAATCTGTTTTTATGTAGGGGTTTCTCTTGTTTCATAATTAGCTCAGTTATTTTTAGAATCTATTTTTATTGATATAAAATAAGTTATGAGCATGCTATTAACT
TCATTCTCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPAVISSDVLSSRQEMPAITKDPLLAPNPDRFCMFPIEYPSIWEMYKKAVASFWTVEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKDVQVAE
ARAFYGFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVKKNRLFHAIDTIPCVTKKADWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGL
HCDFACLLYSLLRTKLSEETVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSVYIEFVADRLLLALGHSKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQKASVMSSL
NGNGGIHEFNMDEDF