; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr000272 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr000272
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionJ domain-containing protein
Genome locationtig00000140:4082..5444
RNA-Seq ExpressionSgr000272
SyntenySgr000272
Gene Ontology termsGO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607621.1 hypothetical protein SDJN03_00963, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-3681.02Show/hide
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KAG7011072.1 hypothetical protein SDJN02_27870, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-3681.02Show/hide
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XP_022926268.1 DNA ligase 1 [Cucurbita moschata]1.2e-3681.02Show/hide
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XP_023521008.1 DNA ligase 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-3681.02Show/hide
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XP_038898675.1 DNA ligase 1 [Benincasa hispida]3.5e-3678.99Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7U1 Uncharacterized protein3.0e-3373.91Show/hide
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A0A1S3CFW3 uncharacterized protein LOC1035004271.8e-3070.42Show/hide
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A0A6J1DVD5 uncharacterized protein LOC1110234591.8e-3072.59Show/hide
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            E E E+VRI PEVVVR+LLKEFPDVG+DL+Q
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A0A6J1EHJ8 DNA ligase 15.9e-3781.02Show/hide
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A0A6J1IUN5 uncharacterized protein LOC1114807505.0e-3680.29Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65280.1 DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein4.1e-0645.45Show/hide
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        T  S TSSS+  SSD+SDSSS       + RR    GS  REK +KRE     +ERKRK +I  ++RKR+  K +++ K KR+Y S+++   S+SG  + 
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        S+ E +     PE VV+E+L EFP+VGNDLKQ
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTAATAACATCTCTATATCTTGCAAACCGGGATGACAGCTACTTGGAAGTGATTGCATTGGATTTGAACTCTAAACTTGAGGTTGATTTCTTCGACGAGCGATGGGG
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CGAAAGTGATGATGGGTCCTCCCATTCAGGGCATCGTACCGATAGCGAGTTTGAGCGAGAGGAGGTGAGGATTGTGCCTGAAGTGGTCGTCAGGGAGCTGCTGAAGGAAT
TTCCTGACGTTGGGAATGACTTAAAACAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTAATAACATCTCTATATCTTGCAAACCGGGATGACAGCTACTTGGAAGTGATTGCATTGGATTTGAACTCTAAACTTGAGGTTGATTTCTTCGACGAGCGATGGGG
TTTGAGGAACTTGTTCGGGTGTCAACATGGGAGTTTCAACTTCAATTGTCATACCAACGGTGGAATGCCGACTCGGAGAAAGAAGAAGCGCACTGATGACTCAGAAACTT
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AGGATTGGAGATAGGGAGAGGAAGAGAAAAGATAGGATTAGGGAGAGAGATAGAAAGAGAAAAAAGAAGAAATTGAGAAGGGAGGGCAAGAGAAAGAGGGATTATGGATC
CGAAAGTGATGATGGGTCCTCCCATTCAGGGCATCGTACCGATAGCGAGTTTGAGCGAGAGGAGGTGAGGATTGTGCCTGAAGTGGTCGTCAGGGAGCTGCTGAAGGAAT
TTCCTGACGTTGGGAATGACTTAAAACAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RIGDRERKRKDRIRERDRKRKKKKLRREGKRKRDYGSESDDGSSHSGHRTDSEFEREEVRIVPEVVVRELLKEFPDVGNDLKQ