; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr012992 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr012992
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionDNA ligase
Genome locationtig00153640:15677..55335
RNA-Seq ExpressionSgr012992
SyntenySgr012992
Gene Ontology termsGO:0006260 - DNA replication (biological process)
GO:0006266 - DNA ligation (biological process)
GO:0006281 - DNA repair (biological process)
GO:0006310 - DNA recombination (biological process)
GO:0071897 - DNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003910 - DNA ligase (ATP) activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR012310 - DNA ligase, ATP-dependent, central
IPR016059 - DNA ligase, ATP-dependent, conserved site
IPR036599 - DNA ligase, ATP-dependent, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008444062.1 PREDICTED: DNA ligase 1 isoform X2 [Cucumis melo]4.1e-11488.11Show/hide
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XP_022158502.1 DNA ligase 6-like isoform X2 [Momordica charantia]5.0e-12092.21Show/hide
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XP_038878216.1 DNA ligase 6-like isoform X1 [Benincasa hispida]8.8e-11789.34Show/hide
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XP_038878217.1 DNA ligase 6-like isoform X2 [Benincasa hispida]8.8e-11789.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B921 DNA ligase4.9e-11387.76Show/hide
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A0A1S3BA94 DNA ligase2.0e-11488.11Show/hide
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A0A5A7VEZ9 DNA ligase4.9e-11387.76Show/hide
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A0A6J1DXE4 DNA ligase2.4e-12092.21Show/hide
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A0A6J1E130 DNA ligase2.4e-12092.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HPZ9 DNA ligase 67.6e-7960.41Show/hide
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        KAFTCEYKYDGQRAQIHKL DG++ +FSRN D+TTS+FPDL+++I +   PAA TF+LDAEVVA DR N  +LMSFQELS+R RGSK +LI  ++IKV++
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P18858 DNA ligase 16.9e-4039.91Show/hide
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        ++VL AL+QAV ++     +   MV+  K K        L+     +   +  +P+ D I+P L+  G+E       + PGIP+KPMLA  T GI + LK
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         FE  AFTCEYKYDGQRAQIH L  G +++FSRN +D T K+PD+I+ I ++  P+ ++FILD E VA DR    ++  FQ L++R R      +    I
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        +V +C++ FD++  NGE L+  PL  RR+ L++
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P37913 DNA ligase 11.7e-3838.63Show/hide
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        ++VL ALAQAV ++     +   +V+  K K        L+     +   +  +P+ D I+P L+  G+E       + PG+P+KPMLA  T G+ + LK
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         FE   FTCEYKYDGQRAQIH L  G +++FSRN +D T K+PD+I+ I ++  P+ ++FILD E VA DR    ++  FQ L++R R      +    I
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        +V +C++ FD++  NGE L+  PL  RR+ L++
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Q42572 DNA ligase 13.7e-4140.17Show/hide
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        +TVL AL QA        +YNE   +   N K  L+  +  V   + VLP +D+IVP+L+  G+     + +   G+PI PMLAK T G+ + L  F++ 
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         FTCEYKYDG+RAQIH + DG+  ++SRN++  T K+PD+   ++ + KP+  +FILD EVVA DR    +++ FQ LS+R R +    + V+ IKV +C
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        +F FD++  NG+QL+   L+ RR+ L +   +E  GYF+
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Q869E1 DNA ligase 12.5e-4241.38Show/hide
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        R+VL ALA++V ++  +        +I  +   E  +E+ Q+  + V  AY+ LPN+DL VP L+   GI+   S+ S+  GIP+KPMLA+ T GI Q L
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          F +  FTCE+KYDG+RAQIH+L DG+  +++RN +D T K+PD++  + +   P   +FILD E VA D     +++SFQ LS+R R S    + +  
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        IKV +CVF FD++  NG+ L+  PL  RR++L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08130.1 DNA ligase 12.6e-4240.17Show/hide
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        +TVL AL QA        +YNE   +   N K  L+  +  V   + VLP +D+IVP+L+  G+     + +   G+PI PMLAK T G+ + L  F++ 
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AT1G49250.1 ATP-dependent DNA ligase3.7e-3636.48Show/hide
Query:  RTVLHALAQAVFISSSLNIYNEGMVE---NLKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFENK
        +TVL AL QA        +YNE   +   N+K  L   +  V   +++LP +D+IV +L+  G+     + ++  G+P++PMLAK T  +   L+ F++ 
Subjt:  RTVLHALAQAVFISSSLNIYNEGMVE---NLKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFENK

Query:  AFTCEYKYDGQRAQIHKLADGSMRVFSRNSDDTTSKFPDLINIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDIC
         FT EYKYDG+RAQI+ + DG++ +FSR+++  T K+PD+  +++ + KP   +FILD EVV  +R    +++  Q  S+R   +    + V  IKV +C
Subjt:  AFTCEYKYDGQRAQIHKLADGSMRVFSRNSDDTTSKFPDLINIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDIC

Query:  VFVFDIMLANGEQLLGLPLRHRRKYLKDLLGDERLGYFELRRKL
        VF FDI+  NG+ L+   L  RR+ L D   +E LGYF+    L
Subjt:  VFVFDIMLANGEQLLGLPLRHRRKYLKDLLGDERLGYFELRRKL

AT1G66730.1 DNA LIGASE 65.4e-8060.41Show/hide
Query:  AMLRTVLHALAQAVFISSSLNIYNEGMVEN-LKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFEN
        AMLRTVL AL +A+ ++S  N +N+ + E+  +EKL+  SAAV+ AYN+LP+ D++VPSLM K IEFS+S+LSMVPGIPIKPMLAKI  G+ +   + + 
Subjt:  AMLRTVLHALAQAVFISSSLNIYNEGMVEN-LKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFEN

Query:  KAFTCEYKYDGQRAQIHKLADGSMRVFSRNSDDTTSKFPDLINIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDI
        KAFTCEYKYDGQRAQIHKL DG++ +FSRN D+TTS+FPDL+++I +   PAA TF+LDAEVVA DR N  +LMSFQELS+R RGSK +LI  ++IKV++
Subjt:  KAFTCEYKYDGQRAQIHKLADGSMRVFSRNSDDTTSKFPDLINIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDI

Query:  CVFVFDIMLANGEQLLGLPLRHRRKYLKDLLGDERLGYFELRRKL
        CVFVFDIM  NGEQLL LPLR RR+ LK++  + R GY E  +++
Subjt:  CVFVFDIMLANGEQLLGLPLRHRRKYLKDLLGDERLGYFELRRKL

AT5G57160.1 DNA ligase IV3.6e-0726.67Show/hide
Query:  GMVENLKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFENKAFTCEYKYDGQRAQIHKLADGSMRV
        GM E  K   Q F       +NV  +  L+   L  +        + +  G  ++P LA     +  A K    K    E K+DG R QIHK     +  
Subjt:  GMVENLKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFENKAFTCEYKYDGQRAQIHKLADGSMRV

Query:  FSRNSDDTTS---KFPDLI--NIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDICVFVFDIMLANGEQLLGLPLR
        FSRN  D +       DLI  NI+ + C       ILD E++  D   N     F E  S    +K +   +D+ K  +C   FD++      ++   L+
Subjt:  FSRNSDDTTS---KFPDLI--NIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDICVFVFDIMLANGEQLLGLPLR

Query:  HRRKYLKDLL
         R + LK ++
Subjt:  HRRKYLKDLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAGCCATGTTGAGAACTGTTCTTCATGCTCTTGCCCAAGCTGTTTTCATAAGTTCCTCCCTCAACATTTACAATGAAGGAATGGTAGAAAATTTGAAGGAGAAGCTTCAG
TCCTTTTCAGCTGCTGTGCTTGGGGCATACAATGTGCTTCCTAATTTTGATCTGATTGTTCCTTCTCTTATGGGCAAAGGGATCGAATTCTCTTCATCATCTTTATCAAT
GGTTCCAGGAATACCTATTAAGCCAATGCTTGCAAAAATTACCAATGGTATTCCTCAAGCATTGAAAATCTTTGAGAATAAAGCTTTTACATGTGAATACAAATATGATG
GTCAGCGTGCCCAAATTCACAAATTGGCTGATGGTTCTATGCGAGTTTTTTCTCGGAACAGTGATGATACAACATCAAAATTTCCAGATTTGATCAATATAATTAATGAA
GTATGTAAACCTGCTGCCTCAACTTTCATACTGGATGCTGAGGTTGTTGCAGTTGATAGGAGAAATAACTGCAGACTAATGTCTTTCCAAGAATTATCATCACGTGGGAG
AGGGAGCAAAGGCTCCCTGATTGCAGTTGATACCATAAAGGTTGATATTTGCGTTTTTGTCTTTGACATCATGCTTGCCAATGGGGAGCAACTGCTGGGGTTACCTCTCC
GGCATAGACGAAAATACTTGAAGGATTTGTTGGGTGATGAGAGGCTAGGATATTTTGAATTGCGAAGGAAATTACT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGCCATGTTGAGAACTGTTCTTCATGCTCTTGCCCAAGCTGTTTTCATAAGTTCCTCCCTCAACATTTACAATGAAGGAATGGTAGAAAATTTGAAGGAGAAGCTTCAG
TCCTTTTCAGCTGCTGTGCTTGGGGCATACAATGTGCTTCCTAATTTTGATCTGATTGTTCCTTCTCTTATGGGCAAAGGGATCGAATTCTCTTCATCATCTTTATCAAT
GGTTCCAGGAATACCTATTAAGCCAATGCTTGCAAAAATTACCAATGGTATTCCTCAAGCATTGAAAATCTTTGAGAATAAAGCTTTTACATGTGAATACAAATATGATG
GTCAGCGTGCCCAAATTCACAAATTGGCTGATGGTTCTATGCGAGTTTTTTCTCGGAACAGTGATGATACAACATCAAAATTTCCAGATTTGATCAATATAATTAATGAA
GTATGTAAACCTGCTGCCTCAACTTTCATACTGGATGCTGAGGTTGTTGCAGTTGATAGGAGAAATAACTGCAGACTAATGTCTTTCCAAGAATTATCATCACGTGGGAG
AGGGAGCAAAGGCTCCCTGATTGCAGTTGATACCATAAAGGTTGATATTTGCGTTTTTGTCTTTGACATCATGCTTGCCAATGGGGAGCAACTGCTGGGGTTACCTCTCC
GGCATAGACGAAAATACTTGAAGGATTTGTTGGGTGATGAGAGGCTAGGATATTTTGAATTGCGAAGGAAATTACT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
AMLRTVLHALAQAVFISSSLNIYNEGMVENLKEKLQSFSAAVLGAYNVLPNFDLIVPSLMGKGIEFSSSSLSMVPGIPIKPMLAKITNGIPQALKIFENKAFTCEYKYDG
QRAQIHKLADGSMRVFSRNSDDTTSKFPDLINIINEVCKPAASTFILDAEVVAVDRRNNCRLMSFQELSSRGRGSKGSLIAVDTIKVDICVFVFDIMLANGEQLLGLPLR
HRRKYLKDLLGDERLGYFELRRKLL