; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr014364 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr014364
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Descriptionextensin-3-like
Genome locationtig00000289:806869..807403
RNA-Seq ExpressionSgr014364
SyntenySgr014364
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF9861390.1 hypothetical protein H0E87_012598 [Populus deltoides]1.9e-0542.45Show/hide
Query:  MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIF------------PPPPSKKPYELTSPPPPPPLQARP
        MGS M   +  LL+A +SL+LPS+  A Y + SPP  PPP   +SPPPPP    P  P +P+ +            PPPP   PY+  SPPPPPP+  +P
Subjt:  MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIF------------PPPPSKKPYELTSPPPPPPLQARP

Query:  IVPYYP
          P +P
Subjt:  IVPYYP

TKY45985.1 Extensin-3 protein [Spatholobus suberectus]1.6e-0441.67Show/hide
Query:  MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSP-------PPKAVQSPP-------PPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQA
        MGS M    F L + ++SLTLPS  A HYI+ SPP  P       PP  V SPP       PPP    P  PYY     PPP KKPY   SPPP      
Subjt:  MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSP-------PPKAVQSPP-------PPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQA

Query:  RPIVPYYPLDILHLHLENAP
            P Y   + HLH    P
Subjt:  RPIVPYYPLDILHLHLENAP

XP_008466986.1 PREDICTED: extensin-3-like, partial [Cucumis melo]2.0e-0755.17Show/hide
Query:  FLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELT-SPPPPPPLQ--ARPIVPYYP
        F+++ L+SL LPS FAAHYI         P ++ SPPP P   RPIVPY+PFIFPPP  K     T  PPP PP Q   RPIVPYYP
Subjt:  FLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELT-SPPPPPPLQ--ARPIVPYYP

XP_022141653.1 extensin-3-like [Momordica charantia]1.8e-1668.82Show/hide
Query:  AMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAA-HYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPP-PPPPLQARPIVPYYP
        AM P V F L+ALVS  LPSKFAA  YIHPSPPS          P P  T RPIVPYYPFIFPPPP KKPY+ TSPP PPP LQ RPIVPYYP
Subjt:  AMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAA-HYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPP-PPPPLQARPIVPYYP

XP_022141655.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Momordica charantia]5.4e-0850Show/hide
Query:  LLIALVSLTLPSKFAAHYIHPS--PPSSPPPKAVQSPPPP----------PLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQ-ARPIVPYYP
        +LIA V L + +K +A ++HPS  PP++PPP     P PP          P  A PIVPY+PF++ P PS KPYE TSPPPP P+  A PIVPY+P
Subjt:  LLIALVSLTLPSKFAAHYIHPS--PPSSPPPKAVQSPPPP----------PLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQ-ARPIVPYYP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCN5 RRM domain-containing protein1.4e-0650.5Show/hide
Query:  PSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPP--PPLTARPIVPYYPFIFP--PPPSKKPYELTSPPPPPPLQ---------ARPIVPYY
        P V  LL+ALVSL LPSKF+A Y H  PP   P K  QS PP   P  + PIVPY+PF++   P PS+KPYE   P PPPPL+         + P+VPY+
Subjt:  PSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPP--PPLTARPIVPYYPFIFP--PPPSKKPYELTSPPPPPPLQ---------ARPIVPYY

Query:  P
        P
Subjt:  P

A0A1S3CSG8 extensin-3-like9.9e-0855.17Show/hide
Query:  FLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELT-SPPPPPPLQ--ARPIVPYYP
        F+++ L+SL LPS FAAHYI         P ++ SPPP P   RPIVPY+PFIFPPP  K     T  PPP PP Q   RPIVPYYP
Subjt:  FLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELT-SPPPPPPLQ--ARPIVPYYP

A0A1U8K790 extensin isoform X22.3e-0444.66Show/hide
Query:  MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPS------SPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIF---PPPPS--KKPYELTSPPPPPPLQARPI
        MGS +      LL+ ++SL+LPS+  A+Y + SPP       SPPP   +SPPPPP    P  P  P+ +   PPPPS  K PY+  SPPPPPP  + P 
Subjt:  MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPS------SPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIF---PPPPS--KKPYELTSPPPPPPLQARPI

Query:  VPY
         PY
Subjt:  VPY

A0A6J1CIP8 leucine-rich repeat extensin-like protein 32.6e-0850Show/hide
Query:  LLIALVSLTLPSKFAAHYIHPS--PPSSPPPKAVQSPPPP----------PLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQ-ARPIVPYYP
        +LIA V L + +K +A ++HPS  PP++PPP     P PP          P  A PIVPY+PF++ P PS KPYE TSPPPP P+  A PIVPY+P
Subjt:  LLIALVSLTLPSKFAAHYIHPS--PPSSPPPKAVQSPPPP----------PLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQ-ARPIVPYYP

A0A6J1CL44 extensin-3-like9.0e-1768.82Show/hide
Query:  AMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAA-HYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPP-PPPPLQARPIVPYYP
        AM P V F L+ALVS  LPSKFAA  YIHPSPPS          P P  T RPIVPYYPFIFPPPP KKPY+ TSPP PPP LQ RPIVPYYP
Subjt:  AMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAA-HYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPP-PPPPLQARPIVPYYP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATCTGCAATGCTACCTTCTGTTTTCTTCCTTCTCATAGCATTGGTTTCTTTAACTCTGCCATCAAAATTTGCCGCACACTATATTCACCCATCTCCTCCGTCGTC
ACCGCCGCCCAAAGCAGTACAGTCCCCGCCACCGCCACCTTTGACCGCCAGGCCGATAGTTCCTTATTACCCTTTTATATTCCCACCACCTCCATCCAAGAAGCCTTATG
AACTCACATCACCACCGCCGCCGCCGCCGTTGCAGGCAAGACCAATAGTTCCTTATTATCCCTTGGATATTCTCCACCTCCATCTGGAAAACGCCCCTATCCTCCTCCGA
TCTACCAGTTGTTTCCCCCGCAGGGCTCAGCACCGCCAGCAAAGAAGCAATACACAGCCAAGTCACCGCCAGCGGCCCCGCCACCACCGCCTAAGAGGCCATGGCCAAGG
GGTTCACCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGATCTGCAATGCTACCTTCTGTTTTCTTCCTTCTCATAGCATTGGTTTCTTTAACTCTGCCATCAAAATTTGCCGCACACTATATTCACCCATCTCCTCCGTCGTC
ACCGCCGCCCAAAGCAGTACAGTCCCCGCCACCGCCACCTTTGACCGCCAGGCCGATAGTTCCTTATTACCCTTTTATATTCCCACCACCTCCATCCAAGAAGCCTTATG
AACTCACATCACCACCGCCGCCGCCGCCGTTGCAGGCAAGACCAATAGTTCCTTATTATCCCTTGGATATTCTCCACCTCCATCTGGAAAACGCCCCTATCCTCCTCCGA
TCTACCAGTTGTTTCCCCCGCAGGGCTCAGCACCGCCAGCAAAGAAGCAATACACAGCCAAGTCACCGCCAGCGGCCCCGCCACCACCGCCTAAGAGGCCATGGCCAAGG
GGTTCACCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSAMLPSVFFLLIALVSLTLPSKFAAHYIHPSPPSSPPPKAVQSPPPPPLTARPIVPYYPFIFPPPPSKKPYELTSPPPPPPLQARPIVPYYPLDILHLHLENAPILLR
STSCFPRRAQHRQQRSNTQPSHRQRPRHHRLRGHGQGVHP