CuGenDBv2

Gene ID	Sgr015809
Organism	Siraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Description	30S ribosomal protein S15, chloroplastic
Genome location	tig00005930:512583..517123
RNA-Seq Expression	Sgr015809
Synteny	Sgr015809
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000589 - Ribosomal protein S15 IPR005290 - Ribosomal protein S15, bacterial-type IPR009068 - S15/NS1, RNA-binding

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAG6606822.1 Thymidylate kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_023523996.1 uncharacterized protein LOC111788072 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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A0A1S3BXJ5 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

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A0A5A7TSB7 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

1.1e-178

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A0A6J1DD15 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

2.1e-185

80.83

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A0A6J1G9E3 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

6.6e-200

84.53

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A0A6J1K776 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

3.5e-201

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        LEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSEL  TP SSASSSWQRGISFQELYKRNAMRKG+D +AP    + GR GML FDSIRESLRQVSSS+AMQNERK  DSMS
Subjt:  LEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSELSSTPSSSASSSWQRGISFQELYKRNAMRKGEDANAPADSTKRGRGGMLPFDSIRESLRQVSSSRAMQNERKGVDSMS

Query:  LSAFKNSLKLKPSDSMPAPS--------LPGSVFGKEMRDRKEGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKET
        LSAFKNSLKLKP D  PA +        LP SVFGKEM DRK+GENEGMKTEFVKMYSHGELG+KLRALRP+  KG+NWFSLTELNERLMKLR +EEKET
Subjt:  LSAFKNSLKLKPSDSMPAPS--------LPGSVFGKEMRDRKEGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKET

Query:  ESRIVGISFQDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQL
        ES+I GISFQDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDI+GQLGRTPN+MLQPP+EHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVR+EFKMSESDCGSARVQVAQL
Subjt:  ESRIVGISFQDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQL

Query:  TTKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYKN
        TTKINHL +VLH KDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYC+VLNKL  R+N  YKN
Subjt:  TTKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYKN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A4Y9B7 30S ribosomal protein S15

2.9e-11

Show/hide

Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIR
        AK+  EF   E+D GS  VQVA LT +INHL      H  D HS++GLL MV  R+KL  YL+RTD E Y  ++ KL +R
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIR

A8F724 30S ribosomal protein S15

2.0e-12

48.78

Show/hide

Query:  ELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIR
        E  K+ ++F+++E D GSA VQVA LT +I HL   L  H KD HS++GL+ MV  R+KLL+YLR+++ ESY  ++ KL++R
Subjt:  ELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIR

B0K1D1 30S ribosomal protein S15

7.7e-12

45.88

Show/hide

Query:  KIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRE
        K + A++ ++FK+ ++D GS  VQ+A LT +IN+L + L  H KD HS++GLL MV  R+ LL YL +TD E Y  ++ KLD+R+
Subjt:  KIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRE

B0K9P5 30S ribosomal protein S15

7.7e-12

45.88

Show/hide

Query:  KIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRE
        K + A++ ++FK+ ++D GS  VQ+A LT +IN+L + L  H KD HS++GLL MV  R+ LL YL +TD E Y  ++ KLD+R+
Subjt:  KIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRE

Q8RHN4 30S ribosomal protein S15

2.2e-11

51.85

Show/hide

Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRE
        A++  EF  SE+D GS  VQ+A LT KINHL   L  H KD HS+ GLL MV  RK+LL YL + D E Y  ++ KL IR+
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVL--HDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRE

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G15810.1 S15/NS1, RNA-binding protein

8.3e-78

44.88

Show/hide

Query:  MALQLSLRPKNPKNLTNASLFHLFSSNSSAPSDPN-----DETADTSSSAPTGSAQSPTSSYFSDVKARLKQQQQSSSPPSSRKPSYPSTSFPNRSSSPA
        MAL L+ R  + +  +N SL   F SNSS+ S P       E    S S+P+ S  SP     + +K +L+ QQ+    P  R  +       NR S+  
Subjt:  MALQLSLRPKNPKNLTNASLFHLFSSNSSAPSDPN-----DETADTSSSAPTGSAQSPTSSYFSDVKARLKQQQQSSSPPSSRKPSYPSTSFPNRSSSPA

Query:  SKAASLEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSELSSTPSSSASSSWQRGISFQELYKRNAMRKGEDANAPADSTKRGRGGMLPFDSIRESLRQVSSSRAMQNERKG
        S     + + KNL++F+ RS+VPPP +       S        IS   LYK++A     D   P +S  +G       ++++    Q+++S  M  +R G
Subjt:  SKAASLEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSELSSTPSSSASSSWQRGISFQELYKRNAMRKGEDANAPADSTKRGRGGMLPFDSIRESLRQVSSSRAMQNERKG

Query:  VDSMSLSAFKNSLKLKPSDSMPAPSLPGSVFGKEMRDRK--EGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKETE
        V    L +FK+++           +LP  +F  +M + K  EGE E   TEF+  Y+  ELG KLR LRP+  K + WFSL ELN+RL+KLR VEEKE +
Subjt:  VDSMSLSAFKNSLKLKPSDSMPAPSLPGSVFGKEMRDRK--EGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKETE

Query:  SRIVGISFQDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLT
         R    +F  LR  +   K   +E ++ ++ Q + I+G LG  P Y L PPKE LV+ YFHPDNMSSAEK+KIEL+KVR+EFKMSESDCGSARVQVAQLT
Subjt:  SRIVGISFQDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLT

Query:  TKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYK
        TKI HL S LH KDKHS+KGLL MVQ RKKLLKYLRRTDW+SYCLVL+KL +R+N  YK
Subjt:  TKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYK

AT1G80620.1 S15/NS1, RNA-binding protein

1.7e-83

44.9

Show/hide

Query:  MALQLSLRPKNPKNLTNASLFHLFSSNSSAPSDPNDETADTSSSAPTGSAQSPTSSYFSDVKARLKQQQQSSSPPSSRKPSYPSTSFPNRSSSPASKAAS
        MAL L+ RPK   + +N SL HLFS++SS+ S    +  +++      S+    SSYFS +++ LKQ Q                 F    + P +  + 
Subjt:  MALQLSLRPKNPKNLTNASLFHLFSSNSSAPSDPNDETADTSSSAPTGSAQSPTSSYFSDVKARLKQQQQSSSPPSSRKPSYPSTSFPNRSSSPASKAAS

Query:  LEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSELSSTPSSSASSSWQRGISFQELYKRNAMRKGEDANAPADSTKRGRGGMLPFDSIRESLRQVSSSRAMQNERKGVDSMS
         ++IR+NL+EFRSR++ PPP ++                  Q+L+K+N + K       +  T+R  G  +P  +I+ +LRQ+   +A    +      +
Subjt:  LEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSELSSTPSSSASSSWQRGISFQELYKRNAMRKGEDANAPADSTKRGRGGMLPFDSIRESLRQVSSSRAMQNERKGVDSMS

Query:  LSAFKNSLKLKPSDSM-------PAPSLPGSVFGKEMRDRKEGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKE-T
        LS  +N +K   +D++        A  LP SV GKE+ +    E E MK+EF+K Y   ELG KLR  RP+  K + WFSL ELN+RL+KLRA+EE++  
Subjt:  LSAFKNSLKLKPSDSM-------PAPSLPGSVFGKEMRDRKEGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKE-T

Query:  ESRIVGISF-QDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQ
        ++ IV  SF  +LR    K   +     K    Q  +I G L  TP YML+PPK+ LVE YFHPDNMSSAEK+KIELAKVR+EFKMSESDCGSARVQVAQ
Subjt:  ESRIVGISF-QDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQ

Query:  LTTKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYK
        LTTKI HL SVLH KDKHS+KGL+AMVQ RKKLLKY+RRTDW+SYCL L+KL +R+N  YK
Subjt:  LTTKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCGGCCTCTCTTGCAGTTGCTTTTCAAATGCATTCTGATGTCGGTTTCAATTCACAACTTAAGGCGCTGTTCCTCAATATTGTAGGTTCCTCTTTACAAGTTGGTTG
TATTTGGCAGGCCTTTGCATCTTCTCATTTCTCAAACCCTAGTCACCTTCTTCTTCTTCTTCTACCACTGTCTAAAGCTCGCTCCGAACCTTCTTCAGTTGGTCTTCCAA
TGGCGCTTCAACTCAGCCTCAGACCCAAAAACCCTAAAAATCTTACCAATGCTTCTCTCTTCCACCTCTTCTCCTCCAACTCGTCAGCCCCATCTGATCCAAATGACGAG
ACTGCCGATACTTCTTCCTCCGCCCCCACGGGCTCAGCTCAATCTCCCACGTCATCTTACTTCAGTGATGTCAAAGCGCGTCTCAAACAGCAGCAACAATCCTCTTCCCC
ACCGAGTTCTAGAAAGCCTTCGTACCCATCTACTTCTTTTCCAAATCGATCGAGTTCTCCGGCTTCGAAAGCCGCTTCACTGGAAGAAATTAGAAAAAATCTTTCTGAAT
TTCGCAGTCGATCATCTGTGCCTCCTCCCTCCGAACTCAGTTCTACACCCTCGTCTTCTGCTTCTTCGTCTTGGCAGCGTGGTATCTCGTTTCAAGAGCTTTACAAGAGA
AATGCGATGAGGAAGGGCGAGGATGCTAATGCGCCTGCCGATTCGACGAAACGTGGCCGTGGTGGAATGCTGCCATTCGACTCTATTCGGGAGAGCTTGCGGCAGGTGAG
CTCATCAAGGGCAATGCAAAATGAACGTAAGGGCGTGGATTCAATGTCCTTATCGGCATTTAAGAACAGCTTGAAATTGAAACCGTCGGATTCCATGCCAGCGCCGTCGT
TGCCGGGGTCAGTTTTCGGGAAGGAGATGAGGGACAGAAAAGAGGGGGAGAACGAGGGAATGAAGACGGAGTTTGTGAAGATGTATAGCCATGGGGAATTGGGAAGCAAG
TTGAGAGCTTTGAGGCCAGATAATGCAAAAGGCCAGAATTGGTTTTCATTGACGGAGTTGAATGAGAGGTTGATGAAGCTAAGGGCAGTGGAGGAGAAGGAGACTGAGTC
AAGAATTGTGGGGATTTCATTCCAGGATTTGAGAGAGAGCTTGGTTAAGATGAAGATGTCTGATGATGAGAAGGCAAAGAAAACGACGATCCAGCGACTTGATATCATTG
GTCAGCTAGGCCGAACACCAAACTATATGCTACAACCTCCGAAGGAACATCTTGTTGAAAAGTATTTCCATCCAGATAACATGTCGTCTGCTGAAAAGCTGAAAATCGAG
TTGGCAAAAGTTAGAGATGAATTTAAAATGTCGGAGTCAGACTGTGGATCTGCTCGAGTTCAAGTTGCACAACTTACCACTAAAATCAATCATCTGATTTCCGTCTTGCA
CGATAAGGATAAGCATTCTAAGAAAGGTCTTCTTGCAATGGTGCAACTGAGGAAAAAGTTACTGAAGTATCTTCGACGAACTGACTGGGAATCCTACTGTCTGGTTCTCA
ACAAACTTGATATTCGAGAGAACCGGGCTTACAAAAACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSASLAVAFQMHSDVGFNSQLKALFLNIVGSSLQVGCIWQAFASSHFSNPSHLLLLLLPLSKARSEPSSVGLPMALQLSLRPKNPKNLTNASLFHLFSSNSSAPSDPNDE
TADTSSSAPTGSAQSPTSSYFSDVKARLKQQQQSSSPPSSRKPSYPSTSFPNRSSSPASKAASLEEIRKNLSEFRSRSSVPPPSELSSTPSSSASSSWQRGISFQELYKR
NAMRKGEDANAPADSTKRGRGGMLPFDSIRESLRQVSSSRAMQNERKGVDSMSLSAFKNSLKLKPSDSMPAPSLPGSVFGKEMRDRKEGENEGMKTEFVKMYSHGELGSK
LRALRPDNAKGQNWFSLTELNERLMKLRAVEEKETESRIVGISFQDLRESLVKMKMSDDEKAKKTTIQRLDIIGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIE
LAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLISVLHDKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLDIRENRAYKN

Sgr015809 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome