| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6579070.1 hypothetical protein SDJN03_23518, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.4e-83 | 96.27 | Show/hide |
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| KAG7032688.1 hypothetical protein SDJN02_06738, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.9e-84 | 98.76 | Show/hide |
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| XP_021894560.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 [Carica papaya] | 2.1e-82 | 99.36 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0KPS4 Uncharacterized protein | 1.3e-82 | 99.36 | Show/hide |
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| A0A6J0ZV58 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 3.8e-82 | 98.08 | Show/hide |
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| A0A6J1E6V3 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like | 4.5e-83 | 100 | Show/hide |
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| A0A6J1FGH6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 isoform X1 | 3.5e-83 | 95.68 | Show/hide |
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| A0A6J1JSG6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like | 4.5e-83 | 100 | Show/hide |
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P38421 DNA-directed RNA polymerase II subunit 7 | 2.9e-79 | 92.31 | Show/hide |
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AGPVQIFVS HLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT I
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|
| P46279 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.1e-83 | 96.79 | Show/hide |
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI
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|
|
| P62487 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 5.0e-47 | 55.41 | Show/hide |
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MF+HI LE + LHPR+FG NL + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+NIG G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+++AVVT VNK+G F E
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +I
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|
| Q5E9B8 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 5.0e-47 | 55.41 | Show/hide |
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +I
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| Q7ZW41 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 5.0e-47 | 56.05 | Show/hide |
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D V IQ+D E+RLKI+GTRVD +I
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06790.1 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 4.1e-04 | 28.74 | Show/hide |
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MF+ LE ++++ P L + + + L G V+I I+++ G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
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|
|
| AT1G06790.2 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 4.1e-04 | 28.74 | Show/hide |
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MF+ LE ++++ P L + + + L G V+I I+++ G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
Subjt: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLVTKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEA
|
|
| AT3G22900.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 2.9e-13 | 36.45 | Show/hide |
Query: GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
G+++ T +ENIG+G I++ TG + FPV + + F+ FKGEI+ VV V+K G F ++GP +I +H+ EF G+ P + S +IQ + V
Subjt: GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
Query: RLKIIGT
R ++ T
Subjt: RLKIIGT
|
|
| AT4G14660.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 2.9e-13 | 29.87 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHF---GRNLRENLVTKLMKDVEGTCSGRH-GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMG
MF + L N+ + + G L+ ++ +L++ + + G+ VA+T ++ IG+G IR+ TG V FPV + + F+ FKGEI+ VV V K G
Subjt: MFFHIVLERNMQLHPRHF---GRNLRENLVTKLMKDVEGTCSGRH-GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMG
Query: FFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTR
F GP++ ++ D ++ G+ P + S +IQ ++ VR+ +IG +
Subjt: FFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTR
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| AT5G59180.1 DNA-directed RNA polymerase II | 2.1e-80 | 92.31 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLVTKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAE
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Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI
AGPVQIFVS HLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT I
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