; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr017579 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr017579
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionRNA-binding family protein
Genome locationtig00153051:289773..300751
RNA-Seq ExpressionSgr017579
SyntenySgr017579
Gene Ontology termsGO:0008380 - RNA splicing (biological process)
GO:0010628 - positive regulation of gene expression (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0035145 - exon-exon junction complex (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR008111 - RNA-binding motif protein 8
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR033744 - RBM8, RNA recognition motif
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004139049.1 RNA-binding protein Y14 [Cucumis sativus]3.1e-9195.63Show/hide
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XP_022154366.1 RNA-binding protein Y14A [Momordica charantia]3.4e-9396.7Show/hide
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XP_022961208.1 RNA-binding protein Y14-like [Cucurbita moschata]1.4e-9195.63Show/hide
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XP_022988215.1 RNA-binding protein Y14A-like [Cucurbita maxima]2.0e-9094.54Show/hide
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XP_038880227.1 RNA-binding protein Y14A [Benincasa hispida]1.8e-9195.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M2V3 RRM domain-containing protein1.5e-9195.63Show/hide
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A0A1S3BNH9 RNA-binding protein 8A-B1.5e-9195.63Show/hide
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A0A6J1DNH7 RNA-binding protein Y14A1.6e-9396.7Show/hide
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A0A6J1HB67 RNA-binding protein Y14-like6.8e-9295.63Show/hide
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A0A6J1JIZ0 RNA-binding protein Y14A-like9.9e-9194.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7FAL5 RNA-binding protein Y14A5.4e-6265.45Show/hide
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        A+ +ADVEAVDF+P++DDLMDED    AD +P AP P+L+S I GG         G ++TKGRGFR++ + R++RLAG    SDFDSL S  GPGP RSI
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        EGWI+LVTGVHEEAQEDDL N F +FG++KNLHLNLDRRTGFVKGYALIE+E +EEA+ AI A+DG ELLTQII+VDWAFS+GP++R+N R
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F4I9J7 RNA-binding protein Y142.7e-6167.54Show/hide
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        MA+ + EAVDFEPEEDDLMDE+G A   AD SPRA  P+LKSAI G    S    K+TKGRGFREE  SDR  RL+  DF+SL S   PGPQRS+EGWII
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        LV+GVHEE QE+D+ NAFG+FGEIKNL+LNLDRR+G+VKGYALIE+E  EEA+ AISAM+GAELLTQ ++VDWAFS GP      RRKN+R
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Q5D018 RNA-binding protein 8A1.3e-3656.69Show/hide
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        K+ KGRGF  E    +R+   D+D++ +  D PGPQRS+EGWI+ VTGVHEEA E+D+ + F EFGEIKNLHLNLDRRTG++KGYAL+E+E Y+EA+ A+
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Query:  SAMDGAELLTQIINVDWAFSHGPIRRK
          ++G EL+ Q I+VDW F  GP + K
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Q6ATR0 RNA-binding protein Y14B2.9e-3948.19Show/hide
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        A A+ DVE VD+   E EE+D MDED           P P + S           G  R++GR       R+T +  S+   FDSL  A  P  GPQRSI
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        EGWI+LV+GV E+A+EDDL N F +FG +K+LHLNL+RRTG+ KGYAL+E+E++EEA+ AI AM+G +LLT+ + VDWAFS GPI++  +  P
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Q6PH90 RNA-binding protein 8A-B3.0e-3647.34Show/hide
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        ADV  +     ED  MDEDG    D S      KLK              K+ KGRGF  +    TR+   D+DS+ +  D PGPQRS+EGWI+ VTGVH
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Query:  EEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFENYEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWAFSHGPIR------RKNTRTP
        EEA E+D+ + FGEFGEIKN+HLNLDRRTGF+KGYAL+E+E Y+EA  A+  ++G +L+ Q ++VDW F  GP +      R+ +R+P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16610.1 arginine/serine-rich 451.8e-0725.69Show/hide
Query:  SSLAGPKRTKGRGFREESDRNTRLAG-------SDFDSLKSADGPGPQRSIEGWIILVTGVHEEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALI
        SS + P R+   G R    R    AG             K A  P  +   E  ++ V  +     E  L+  FG FGE+ ++ + +DR     +G+  +
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Query:  EFENYEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWAFSHGPIRRKNTRTP
        EF+   +AE+A   MDGA++  +++   +     P R+K +  P
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AT1G51510.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.9e-6267.54Show/hide
Query:  MASADVEAVDFEPEEDDLMDEDGAA--EADASPRAPFPKLKSAITGGASSSLAGPKRTKGRGFREE--SDRNTRLAGSDFDSLKSADGPGPQRSIEGWII
        MA+ + EAVDFEPEEDDLMDE+G A   AD SPRA  P+LKSAI G    S    K+TKGRGFREE  SDR  RL+  DF+SL S   PGPQRS+EGWII
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Query:  LVTGVHEEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFENYEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWAFSHGP-----IRRKNTR
        LV+GVHEE QE+D+ NAFG+FGEIKNL+LNLDRR+G+VKGYALIE+E  EEA+ AISAM+GAELLTQ ++VDWAFS GP      RRKN+R
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AT3G11400.1 eukaryotic translation initiation factor 3G17.2e-0929.37Show/hide
Query:  GASSSLAGPKRTKGRGFREESDRNTRLAGSDFDSLKSADGPGPQRSIEGWIILVTGVHEEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFEN
        G SS+++    T    +   S R    AG+D    +SA G   +R  +   + VT + E+ +E DL   F  FG +  +++ +D++TG  +G+  + F +
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Query:  YEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWA
         E+A+RAI+ ++G      I+ V+WA
Subjt:  YEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWA

AT3G11400.2 eukaryotic translation initiation factor 3G17.2e-0929.37Show/hide
Query:  GASSSLAGPKRTKGRGFREESDRNTRLAGSDFDSLKSADGPGPQRSIEGWIILVTGVHEEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFEN
        G SS+++    T    +   S R    AG+D    +SA G   +R  +   + VT + E+ +E DL   F  FG +  +++ +D++TG  +G+  + F +
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Query:  YEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWA
         E+A+RAI+ ++G      I+ V+WA
Subjt:  YEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWA

AT5G61030.1 glycine-rich RNA-binding protein 32.7e-0833.33Show/hide
Query:  ILVTGVHEEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFENYEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWA
        + + G+     ED L+ AF ++GE+ +  + LDR TG  +G+  + F + E A  AI A+DG +L  +++ V++A
Subjt:  ILVTGVHEEAQEDDLQNAFGEFGEIKNLHLNLDRRTGFVKGYALIEFENYEEAERAISAMDGAELLTQIINVDWA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCGGAGGAGGTGCCATATTCCGGGGACTTGTCGCCAATTCGGAGAAGAAGACTCTTCCAGCTGCTCATTCTCCCTAGAATAGGACTTTTTCTAGACGGAAAATGGAGGAG
ATGGGGAAGTGGGTTCGGATTAACACGCGGGCCTGTAGAAGCAGGGGAGTTTTCGGAGCAGGAAGAGCCTAGCAGTGAGGAGTGGGGGTTTAGAGAGAGAAGTGGAAGAG
AGAATTTTAGCTTGGAGAAAAGAACGAGCTGCGGGCAAACCAGAAACCCTCGTTTCGATCCCCAAAAACCCCACACCATCCCATTTCCTTCTCTTCTCCTTCCCCTCGAG
CATTTTGCAGGACAGACGAGGAGCTCTGAGAGAGCCATGGCAAGCGCTGATGTAGAGGCTGTGGACTTTGAGCCCGAGGAAGACGACCTCATGGACGAGGATGGAGCCGC
AGAAGCTGATGCCTCCCCGCGAGCTCCTTTTCCCAAGCTCAAATCCGCCATCACCGGCGGCGCGTCTTCCTCACTGGCCGGTCCGAAGAGGACCAAGGGTCGTGGCTTCC
GAGAAGAATCTGATCGCAACACCCGCCTTGCGGGGTCGGACTTTGATTCCCTCAAGTCTGCTGATGGCCCTGGCCCCCAAAGATCTATTGAAGGATGGATCATTCTGGTA
ACTGGTGTACATGAGGAGGCACAGGAGGATGATCTACAAAATGCATTTGGTGAGTTTGGGGAGATAAAGAATTTGCATCTAAATCTCGATCGTCGTACTGGGTTTGTTAA
GGGATATGCGTTGATCGAATTTGAGAACTATGAGGAAGCGGAGAGAGCCATATCTGCCATGGATGGAGCTGAACTTCTGACCCAAATTATCAATGTTGATTGGGCATTCA
GCCATGGACCCATCAGAAGAAAGAACACAAGAACTCCATGTGTGGTGTTTATGGATTTTATTTGGGAACGCGTTTCCTTGTTGATTGGAATAGGAGATGTTTCTACTGAG
CTTTACTCAATGTCTCAAGATTCCCCTGCTTCCCAGCCCTTCTTTTTCTCGGACGTTGATTTGGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGGAGGAGGTGCCATATTCCGGGGACTTGTCGCCAATTCGGAGAAGAAGACTCTTCCAGCTGCTCATTCTCCCTAGAATAGGACTTTTTCTAGACGGAAAATGGAGGAG
ATGGGGAAGTGGGTTCGGATTAACACGCGGGCCTGTAGAAGCAGGGGAGTTTTCGGAGCAGGAAGAGCCTAGCAGTGAGGAGTGGGGGTTTAGAGAGAGAAGTGGAAGAG
AGAATTTTAGCTTGGAGAAAAGAACGAGCTGCGGGCAAACCAGAAACCCTCGTTTCGATCCCCAAAAACCCCACACCATCCCATTTCCTTCTCTTCTCCTTCCCCTCGAG
CATTTTGCAGGACAGACGAGGAGCTCTGAGAGAGCCATGGCAAGCGCTGATGTAGAGGCTGTGGACTTTGAGCCCGAGGAAGACGACCTCATGGACGAGGATGGAGCCGC
AGAAGCTGATGCCTCCCCGCGAGCTCCTTTTCCCAAGCTCAAATCCGCCATCACCGGCGGCGCGTCTTCCTCACTGGCCGGTCCGAAGAGGACCAAGGGTCGTGGCTTCC
GAGAAGAATCTGATCGCAACACCCGCCTTGCGGGGTCGGACTTTGATTCCCTCAAGTCTGCTGATGGCCCTGGCCCCCAAAGATCTATTGAAGGATGGATCATTCTGGTA
ACTGGTGTACATGAGGAGGCACAGGAGGATGATCTACAAAATGCATTTGGTGAGTTTGGGGAGATAAAGAATTTGCATCTAAATCTCGATCGTCGTACTGGGTTTGTTAA
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GCCATGGACCCATCAGAAGAAAGAACACAAGAACTCCATGTGTGGTGTTTATGGATTTTATTTGGGAACGCGTTTCCTTGTTGATTGGAATAGGAGATGTTTCTACTGAG
CTTTACTCAATGTCTCAAGATTCCCCTGCTTCCCAGCCCTTCTTTTTCTCGGACGTTGATTTGGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SEEVPYSGDLSPIRRRRLFQLLILPRIGLFLDGKWRRWGSGFGLTRGPVEAGEFSEQEEPSSEEWGFRERSGRENFSLEKRTSCGQTRNPRFDPQKPHTIPFPSLLLPLE
HFAGQTRSSERAMASADVEAVDFEPEEDDLMDEDGAAEADASPRAPFPKLKSAITGGASSSLAGPKRTKGRGFREESDRNTRLAGSDFDSLKSADGPGPQRSIEGWIILV
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