; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr017947 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr017947
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionKH domain-containing protein
Genome locationtig00153057:859512..867896
RNA-Seq ExpressionSgr017947
SyntenySgr017947
Gene Ontology termsGO:0048024 - regulation of mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR032377 - STAR protein, homodimerisation region
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR045071 - KH domain-containing BBP-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004139764.1 KH domain-containing protein At5g56140 [Cucumis sativus]3.0e-14594.77Show/hide
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XP_038897899.1 KH domain-containing protein At5g56140 isoform X1 [Benincasa hispida]1.3e-14896.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M6 KH domain-containing protein1.4e-14594.77Show/hide
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A0A1S3BI94 KH domain-containing protein At5g56140 isoform X21.2e-14494.43Show/hide
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A0A6J1CCS9 KH domain-containing protein At5g56140-like isoform X14.8e-14996.52Show/hide
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A0A6J1F952 KH domain-containing protein At5g56140-like8.0e-14493.43Show/hide
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A0A6J1IMS3 KH domain-containing protein At5g56140-like4.2e-14593.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WLR1 KH domain-containing protein At4g264806.8e-10873.43Show/hide
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Q75GR5 KH domain-containing protein SPIN13.4e-6753.67Show/hide
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        SP   S       +YL+ELL E QKL PFM VLP   +LL+QEI+RV++++         +      SP++S    SN  G   + W    Q  +     
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          ++ +W  +  S S  +VK+ +R+DVPVD+YPN+NFVGR+LGPRGNSLKRVEAST CRV IRG+GSIKDP +E+ +RGKPGYEHL++PLHIL+EAE P 
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         IIDARL  A+E++E+LLKP++ES DFYK+QQLRELAMLN TLRE+ SP   SVSPF N
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Q8GYR4 KH domain-containing protein At3g086208.1e-6952.33Show/hide
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        Y  FSPS +A      P +R+PSS         +Y+S+LL E QKL PFM VLP   RLLNQEI R+T ++          L H   SP+AS  + SN  
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        G  + GW       + G      A  W  + +S S   VKR +R+D+PVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +EE ++GK
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        PGYEHLNE LHIL+EA+LP++I+D +L QA+EI+E+L+KP++ES D+ K+QQLRELA+LN  LRE     S SVSPF++
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Q9FKT4 KH domain-containing protein At5g561402.7e-11275.7Show/hide
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        GG +M +S S    PSAP SP+   GLRS SS     +EQEKYLSELL ER KL+PF+PVLP+++RLLNQEILRVTTLL  A+VL QSGL+H SPLASGG
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        MMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELP+EI+DARLMQAREIL+DLL P+EE+HD YKKQQLRELA+LNGTLREEGSPMS SVSP+++
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Q9ZVI3 KH domain-containing protein At2g386101.8e-6853.61Show/hide
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        SP   S   ++  +YL+ELL E QKL+PFM VLP   RLLNQE+ RV+ ++          L H   SP+AS  + SN     + GW    Q  +SG   
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        P    +W  +  S S   VKR +R+++PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +E+ +RG+PGYEHLNE LHIL+EA+LP 
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Query:  EIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNT
         I++ RL QA+EI+E+LLKP++ES DF K+QQLRELA+LN   LREE  G     SVSPF+++
Subjt:  EIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38610.1 RNA-binding KH domain-containing protein1.3e-6953.61Show/hide
Query:  SPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSEMSGLLQ
        SP   S   ++  +YL+ELL E QKL+PFM VLP   RLLNQE+ RV+ ++          L H   SP+AS  + SN     + GW    Q  +SG   
Subjt:  SPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSEMSGLLQ

Query:  PSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPV
        P    +W  +  S S   VKR +R+++PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +E+ +RG+PGYEHLNE LHIL+EA+LP 
Subjt:  PSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPV

Query:  EIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNT
         I++ RL QA+EI+E+LLKP++ES DF K+QQLRELA+LN   LREE  G     SVSPF+++
Subjt:  EIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNT

AT2G38610.2 RNA-binding KH domain-containing protein1.3e-6953.61Show/hide
Query:  SPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSEMSGLLQ
        SP   S   ++  +YL+ELL E QKL+PFM VLP   RLLNQE+ RV+ ++          L H   SP+AS  + SN     + GW    Q  +SG   
Subjt:  SPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSEMSGLLQ

Query:  PSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPV
        P    +W  +  S S   VKR +R+++PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +E+ +RG+PGYEHLNE LHIL+EA+LP 
Subjt:  PSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPV

Query:  EIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNT
         I++ RL QA+EI+E+LLKP++ES DF K+QQLRELA+LN   LREE  G     SVSPF+++
Subjt:  EIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNT

AT3G08620.1 RNA-binding KH domain-containing protein5.8e-7052.33Show/hide
Query:  YMAFSPSPSAPHSPHLPGLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-G
        Y  FSPS +A      P +R+PSS         +Y+S+LL E QKL PFM VLP   RLLNQEI R+T ++          L H   SP+AS  + SN  
Subjt:  YMAFSPSPSAPHSPHLPGLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-G

Query:  GADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGK
        G  + GW       + G      A  W  + +S S   VKR +R+D+PVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +EE ++GK
Subjt:  GADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGK

Query:  PGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHN
        PGYEHLNE LHIL+EA+LP++I+D +L QA+EI+E+L+KP++ES D+ K+QQLRELA+LN  LRE     S SVSPF++
Subjt:  PGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHN

AT4G26480.1 RNA-binding KH domain-containing protein4.8e-10973.43Show/hide
Query:  SAGGMYMAFSP----SPSAPHSPHLP-GLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLAS
        S GG ++ + P     PSAP SP+   GLRS  S    L+EQEKYLSELL ER KL+PF+PVLP+  RL+NQEILRVTTLL  A  L QS  +H SPLAS
Subjt:  SAGGMYMAFSP----SPSAPHSPHLP-GLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLAS

Query:  GGIFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAR
        GGIF N  ADMNGW S+F SE S  +  S A NWL+S  SSSGLIVKRTIRVD+PVD YPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDP +
Subjt:  GGIFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAR

Query:  EEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHN
        E+MMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELP+EI+DARLMQAREIL+DLL P+EE+HDFYKKQQLRELA+LNG+LREEGSPMS S+SP+++
Subjt:  EEMMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHN

AT5G56140.1 RNA-binding KH domain-containing protein1.9e-11375.7Show/hide
Query:  GGMYMAFSPS----PSAPHSPHLP-GLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLASGG
        GG +M +S S    PSAP SP+   GLRS SS     +EQEKYLSELL ER KL+PF+PVLP+++RLLNQEILRVTTLL  A+VL QSGL+H SPLASGG
Subjt:  GGMYMAFSPS----PSAPHSPHLP-GLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLASGG

Query:  IFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREE
        IF N  ADMNGW S+F SE S  +  S   NWL+S  SSSGLI KRTIRVD+PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDP +EE
Subjt:  IFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREE

Query:  MMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHN
        MMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELP+EI+DARLMQAREIL+DLL P+EE+HD YKKQQLRELA+LNGTLREEGSPMS SVSP+++
Subjt:  MMRGKPGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGTCGTCTGCTGGCGGGATGTACATGGCCTTCTCTCCCTCACCCTCGGCTCCTCACTCGCCTCACCTCCCTGGTCTCCGCTCCCCGTCCTCTGCATCTGCTGCTCT
ACTCGAGCAAGAAAAGTATCTCTCTGAGTTATTGACAGAGCGTCAGAAACTTAGTCCGTTTATGCCTGTGCTCCCTAATAGTTATCGCTTGCTGAACCAAGAAATATTGC
GTGTAACTACACTATTGGGGAAGGCATCAGTATTAGGTCAAAGTGGGCTTGAACATGCCAGCCCCCTGGCATCTGGAGGAATATTTTCAAATGGAGGTGCTGACATGAAT
GGATGGCCATCACGGTTCCAATCAGAAATGTCAGGTTTATTACAACCCTCATCAGCACAAAATTGGCTAAGTTCCCAAAGTAGTTCATCAGGTCTTATTGTGAAGAGAAC
CATCAGAGTAGACGTTCCTGTTGACAACTACCCTAATTATAACTTTGTCGGCCGCCTCCTAGGACCTAGGGGAAACTCTCTCAAGCGAGTGGAGGCAAGCACCGATTGTC
GAGTTTTGATCAGAGGGCGTGGTAGCATTAAGGATCCAGCTAGGGAAGAAATGATGAGAGGAAAACCAGGTTATGAGCATTTGAACGAGCCTCTCCACATCCTAGTTGAG
GCAGAATTGCCAGTTGAAATTATTGATGCTCGCCTAATGCAAGCACGTGAGATTCTTGAAGACTTGCTCAAGCCAATAGAAGAATCTCATGACTTCTACAAGAAACAACA
GCTACGAGAGCTAGCTATGCTTAATGGCACGCTTCGTGAGGAGGGTTCGCCTATGTCCAGTTCCGTGTCTCCCTTCCACAATACAGTCCCATTCCAAGGTGTTGCCTGCA
GCCAATACCTTCAACTGCAATCGGGGCACTCGCACTCTTATGTGCAGTTAAGGATTACTAGCGATTGGGGGGGGCTTGCTTATATATATATATTATATATATATATACTT
GTTGCTTTAGCAGTTAATGGATGGTGGGTTCTTTGGGACTTTGGGAAAGAAAATGGGTTTAGGTTTGTAAGGGAATGTGAGGAACAGGGAACATTGATTTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACGTCGTCTGCTGGCGGGATGTACATGGCCTTCTCTCCCTCACCCTCGGCTCCTCACTCGCCTCACCTCCCTGGTCTCCGCTCCCCGTCCTCTGCATCTGCTGCTCT
ACTCGAGCAAGAAAAGTATCTCTCTGAGTTATTGACAGAGCGTCAGAAACTTAGTCCGTTTATGCCTGTGCTCCCTAATAGTTATCGCTTGCTGAACCAAGAAATATTGC
GTGTAACTACACTATTGGGGAAGGCATCAGTATTAGGTCAAAGTGGGCTTGAACATGCCAGCCCCCTGGCATCTGGAGGAATATTTTCAAATGGAGGTGCTGACATGAAT
GGATGGCCATCACGGTTCCAATCAGAAATGTCAGGTTTATTACAACCCTCATCAGCACAAAATTGGCTAAGTTCCCAAAGTAGTTCATCAGGTCTTATTGTGAAGAGAAC
CATCAGAGTAGACGTTCCTGTTGACAACTACCCTAATTATAACTTTGTCGGCCGCCTCCTAGGACCTAGGGGAAACTCTCTCAAGCGAGTGGAGGCAAGCACCGATTGTC
GAGTTTTGATCAGAGGGCGTGGTAGCATTAAGGATCCAGCTAGGGAAGAAATGATGAGAGGAAAACCAGGTTATGAGCATTTGAACGAGCCTCTCCACATCCTAGTTGAG
GCAGAATTGCCAGTTGAAATTATTGATGCTCGCCTAATGCAAGCACGTGAGATTCTTGAAGACTTGCTCAAGCCAATAGAAGAATCTCATGACTTCTACAAGAAACAACA
GCTACGAGAGCTAGCTATGCTTAATGGCACGCTTCGTGAGGAGGGTTCGCCTATGTCCAGTTCCGTGTCTCCCTTCCACAATACAGTCCCATTCCAAGGTGTTGCCTGCA
GCCAATACCTTCAACTGCAATCGGGGCACTCGCACTCTTATGTGCAGTTAAGGATTACTAGCGATTGGGGGGGGCTTGCTTATATATATATATTATATATATATATACTT
GTTGCTTTAGCAGTTAATGGATGGTGGGTTCTTTGGGACTTTGGGAAAGAAAATGGGTTTAGGTTTGTAAGGGAATGTGAGGAACAGGGAACATTGATTTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSSAGGMYMAFSPSPSAPHSPHLPGLRSPSSASAALLEQEKYLSELLTERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLASGGIFSNGGADMN
GWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQSSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREEMMRGKPGYEHLNEPLHILVE
AELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIEESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNTVPFQGVACSQYLQLQSGHSHSYVQLRITSDWGGLAYIYILYIYIL
VALAVNGWWVLWDFGKENGFRFVRECEEQGTLIY