; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr019449 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr019449
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationtig00153347:711412..712200
RNA-Seq ExpressionSgr019449
SyntenySgr019449
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008444193.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]1.9e-14194.34Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPEL GN RV+MRKSA K   SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_011011531.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Populus euphratica]1.1e-14194.32Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA--VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
        MAA+ MALSSPSLAGKAVKL+PSSPEL+GNGRVSMRK+   V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA--VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH

Query:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLAD
        SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE++DPIYPGG+FDPLGLAD
Subjt:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLAD

Query:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022142169.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Momordica charantia]1.1e-14194.34Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRK---SAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPELLGNGRVSMRK    +V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRK---SAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIF+EGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_034922355.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Populus alba]3.2e-14193.94Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA--VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
        MAA+ MALSSPS AGKAVKL+PSSPEL+GNGRVSMRK+   V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA--VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH

Query:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLAD
        SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE++DPIYPGG+FDPLGLAD
Subjt:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLAD

Query:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_038877609.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]2.5e-14194.74Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGN-GRVSMRKSA---VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPELLGN GRVSMRKSA   + SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGN-GRVSMRKSA---VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic9.1e-14294.34Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPEL GN RV+MRKSA K   SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic9.1e-14294.34Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPEL GN RV+MRKSA K   SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.0e-14194.32Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRK---SAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPELLGNGRVSMRK    +V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRK---SAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIF+EGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG

A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic5.4e-14294.34Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRK---SAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKL+PSSPELLGNGRVSMRK    +V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRK---SAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIF+EGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6M3WGX2 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.0e-14193.21Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA---VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKLSPS+PEL+GNGRVSMRK+A   V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA---VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        H RWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07369 Chlorophyll a-b binding protein 3C, chloroplastic3.5e-13889.89Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK-----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MA S MALSS + AGKAVKLSPSS E+ GNGRV+MRK+A K     SGSPWYGPDRVKYLGP SGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK-----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV DP+YPGG+FDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)1.0e-13792.16Show/hide
Query:  PSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA---VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
        P+LAG+AVKLSP++PE+ GN + +MRK+A   V SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
Subjt:  PSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA---VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL

Query:  GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLADDPEAFAELK
        GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLADDPEAFAELK
Subjt:  GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLADDPEAFAELK

Query:  VKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        VKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  VKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic4.1e-13992.05Show/hide
Query:  AASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
        AAS MALSSPSLAGKAVKL PS+PE+   GRVSMRK+  K   SGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
Subjt:  AASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH

Query:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLAD
        SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QV+LMGAVEGYRIAGGPLGEV+DPIYPGG+FDPLGLAD
Subjt:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLAD

Query:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLA PVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic7.0e-13989.81Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAA+ MALSSPS AG+AVKLSPS+PE+ GNGRVSMRK+  K   S SPWYGPDRVKYLGP SGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK---SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA
        H RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AGGPLGEV DP+YPGG+FDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        +DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic2.4e-13990.26Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA-----VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAAS MALSSPS AGKAVKLSPSS E+ GNG+V+MRK+A     V SGSPWYGPDRVKYLGP SGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSA-----VKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QVVLMGAVEGYR+AGGPLGEV DP+YPGG+FDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 34.1e-13486.52Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAAS MALSSP+ AGKAV LSP++ E+LG+GRV+MRK+  K    SGSPWYG DRVKYLGP SGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFS+GGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGG+FDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 24.1e-13486.52Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAAS MALSSP+ AGKAV LSP++ E+LG+GRV+MRK+  K    SGSPWYG DRVKYLGP SGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFS+GGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGG+FDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 11.1e-13486.89Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAAS MALSSP+ AGKAVKLSP++ E+LG+GRV+MRK+  K    SGSPWYG DRVKYLGP SGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFS+GGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGG+FDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B27.7e-13386.14Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MA+S MALSSP+ AGKAVK  P++ ++LG+GRV+MRK+  K    SGSPWYG DRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVK----SGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFS+GGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGG+FDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B11.8e-13486.84Show/hide
Query:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAV---KSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSP+L GKAVKLSP++ E+ G GR++MRK++     SGSPWYG DRVKYLGP SGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVI
Subjt:  MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAV---KSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLGL
        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAG+QIFS+GGLDYLGNPSLVHAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGG+FDPLGL
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVSDPIYPGGNFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCTCAATAATGGCTCTCTCCTCTCCATCACTCGCCGGAAAGGCAGTGAAACTCTCTCCCTCCTCCCCGGAGCTTCTCGGCAACGGGAGAGTCAGCATGAGGAA
ATCTGCCGTCAAGTCTGGAAGCCCATGGTACGGACCTGACCGTGTCAAGTATTTGGGCCCATTGTCCGGCGAGCCTCCGTCCTACCTCACAGGAGAGTTCCCCGGCGACT
ACGGTTGGGACACTGCTGGACTTTCGGCAGACCCCGAGACCTTTGCCAAGAACCGGGAGCTGGAAGTCATCCACTCTAGGTGGGCCATGCTGGGAGCCCTCGGCTGCGTC
TTCCCGGAGCTTCTGTCCCGGAACGGCGTGAAGTTCGGGGAAGCAGTGTGGTTCAAGGCGGGAGCTCAGATCTTCAGCGAAGGTGGGCTTGACTACTTGGGCAACCCGAG
CTTGGTCCACGCACAGAGCATTCTGGCCATTTGGGCGGCGCAGGTGGTTCTGATGGGGGCCGTGGAGGGATATCGTATTGCCGGCGGCCCGCTCGGAGAGGTAAGCGACC
CGATTTACCCGGGTGGAAACTTTGACCCGTTGGGGCTCGCAGATGACCCGGAAGCTTTCGCGGAGCTGAAGGTGAAGGAGCTGAAGAATGGTAGATTAGCCATGTTCTCC
ATGTTCGGATTCTTCGTGCAGGCGATCGTCACCGGAAAGGGTCCATTGGAGAACCTCGCCGACCACCTTGCTGACCCAGTCAACAACAATGCCTGGGCTTATGCTACCAA
CTTTGTTCCCGGAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCTCAATAATGGCTCTCTCCTCTCCATCACTCGCCGGAAAGGCAGTGAAACTCTCTCCCTCCTCCCCGGAGCTTCTCGGCAACGGGAGAGTCAGCATGAGGAA
ATCTGCCGTCAAGTCTGGAAGCCCATGGTACGGACCTGACCGTGTCAAGTATTTGGGCCCATTGTCCGGCGAGCCTCCGTCCTACCTCACAGGAGAGTTCCCCGGCGACT
ACGGTTGGGACACTGCTGGACTTTCGGCAGACCCCGAGACCTTTGCCAAGAACCGGGAGCTGGAAGTCATCCACTCTAGGTGGGCCATGCTGGGAGCCCTCGGCTGCGTC
TTCCCGGAGCTTCTGTCCCGGAACGGCGTGAAGTTCGGGGAAGCAGTGTGGTTCAAGGCGGGAGCTCAGATCTTCAGCGAAGGTGGGCTTGACTACTTGGGCAACCCGAG
CTTGGTCCACGCACAGAGCATTCTGGCCATTTGGGCGGCGCAGGTGGTTCTGATGGGGGCCGTGGAGGGATATCGTATTGCCGGCGGCCCGCTCGGAGAGGTAAGCGACC
CGATTTACCCGGGTGGAAACTTTGACCCGTTGGGGCTCGCAGATGACCCGGAAGCTTTCGCGGAGCTGAAGGTGAAGGAGCTGAAGAATGGTAGATTAGCCATGTTCTCC
ATGTTCGGATTCTTCGTGCAGGCGATCGTCACCGGAAAGGGTCCATTGGAGAACCTCGCCGACCACCTTGCTGACCCAGTCAACAACAATGCCTGGGCTTATGCTACCAA
CTTTGTTCCCGGAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASIMALSSPSLAGKAVKLSPSSPELLGNGRVSMRKSAVKSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCV
FPELLSRNGVKFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWAAQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVSDPIYPGGNFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFS
MFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK