| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6581189.1 THO complex subunit 4C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.9e-103 | 89.55 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGS+NGG+ VVIGS+RRGPL +NARPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRTGSS VNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| XP_022143379.1 THO complex subunit 4D-like [Momordica charantia] | 2.2e-103 | 91.82 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARR RGAGGSFNGGR VVIGSIRRGPLS+N RPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRT SSTVVN FPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 2.2e-103 | 90 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL +NARPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRTGSS VNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 1.3e-103 | 90 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL +NARPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRTGSS VNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.3e-103 | 90 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL +NARPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRTGSS VNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 3.9e-101 | 87.73 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGSFNGGRGVVIGS+RRGPL +NAR SAY+I K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLT ESGR + VVNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 1.1e-95 | 81.9 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLS-------------------------IMK
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGSFNGGRGVVIGS+RRGPL +NAR SAY+I KASFKLS MK
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLS-------------------------IMK
Query: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVL
NVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+L
Subjt: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVL
Query: GDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTSESG
GDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT SG
Subjt: GDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTSESG
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 1.1e-103 | 91.82 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARR RGAGGSFNGGR VVIGSIRRGPLS+N RPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRT SSTVVN FPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 1.1e-103 | 90 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL +NARPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRTGSS VNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 6.4e-104 | 90 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARR RGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL +NARPSA++ISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGT
Query: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
KLYVSNLD+GVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTV
Subjt: KLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTV
Query: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
VLTSESGRTGSS VNPFPG
Subjt: VLTSESGRTGSSTVVNPFPG
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q58EA2 THO complex subunit 4-A | 1.3e-29 | 42.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGR--ARRAR------GAGGSFNGGRG----VVIGSIRRGPLSLNA---RPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFE
M +DMSL+D+IK N ++ RGR R AR GAGG GGRG V G +R P+ RP+ Y+ K +WQHDLF+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGR--ARRAR------GAGGSFNGGRG----VVIGSIRRGPLSLNA---RPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFE
Query: DSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE
A +G+E G KL VSNLD GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I+++ E
Subjt: DSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 1.3e-58 | 56.74 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIG
M+ L+M+L++++K+ + RG +R R RG GG GGRG G RRGPL++NARPS++ I+K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+G
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIG
Query: TKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGR
T+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR
Subjt: TKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGR
Query: SRRTVVLTSESGRTG
+RTVV+ G G
Subjt: SRRTVVLTSESGRTG
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 4.9e-37 | 47.42 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLF--EDSLRAS-------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G GG G G RR + AR + Y+ + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLF--EDSLRAS-------
Query: ---GISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMP
G S IE GTKLY+SNLD+GV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P
Subjt: ---GISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAEMP
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 1.0e-37 | 47.83 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGI
M+T LDMSL+DMI KN ++RG A ARG G G + R P + R + Y +KA W HD+F ED +GI
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGI
Query: EIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE
E GTKLY+SNLD+GV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N +
Subjt: EIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 3.1e-55 | 52.89 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRARRA-RGAGGS---FNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARP-SAYAISKASFKLSIMKNVQW--QHDLFEDSL
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R++ RG GG GGRG G +RRGPL++N RP S+++I+K + + +++ W Q+DL+E++L
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRARRA-RGAGGS---FNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARP-SAYAISKASFKLSIMKNVQW--QHDLFEDSL
Query: RASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE-MPVSARI
RA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+
Subjt: RASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE-MPVSARI
Query: NVTGVNGRSRRTVVLTS--ESGRTG
NVTG+NGR +R+V + GR G
Subjt: NVTGVNGRSRRTVVLTS--ESGRTG
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-56 | 52.89 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRARRA-RGAGGS---FNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARP-SAYAISKASFKLSIMKNVQW--QHDLFEDSL
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R++ RG GG GGRG G +RRGPL++N RP S+++I+K + + +++ W Q+DL+E++L
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRARRA-RGAGGS---FNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARP-SAYAISKASFKLSIMKNVQW--QHDLFEDSL
Query: RASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE-MPVSARI
RA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+
Subjt: RASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE-MPVSARI
Query: NVTGVNGRSRRTVVLTS--ESGRTG
NVTG+NGR +R+V + GR G
Subjt: NVTGVNGRSRRTVVLTS--ESGRTG
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-56 | 52.89 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRARRA-RGAGGS---FNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARP-SAYAISKASFKLSIMKNVQW--QHDLFEDSL
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R++ RG GG GGRG G +RRGPL++N RP S+++I+K + + +++ W Q+DL+E++L
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRARRA-RGAGGS---FNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARP-SAYAISKASFKLSIMKNVQW--QHDLFEDSL
Query: RASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE-MPVSARI
RA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+
Subjt: RASGISGIEIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE-MPVSARI
Query: NVTGVNGRSRRTVVLTS--ESGRTG
NVTG+NGR +R+V + GR G
Subjt: NVTGVNGRSRRTVVLTS--ESGRTG
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 9.5e-60 | 56.74 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIG
M+ L+M+L++++K+ + RG +R R RG GG GGRG G RRGPL++NARPS++ I+K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+G
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIG
Query: TKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGR
T+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR
Subjt: TKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGR
Query: SRRTVVLTSESGRTG
+RTVV+ G G
Subjt: SRRTVVLTSESGRTG
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 1.9e-60 | 57.21 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIG
M+ L+M+L++++K+ + RG +R R RG GG GGRG G RRGPL++NARPS++ I+K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+G
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIG
Query: TKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGR
T+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR
Subjt: TKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGR
Query: SRRTVVLTSESGRTG
+RTVV+ GR G
Subjt: SRRTVVLTSESGRTG
|
|
| AT5G59950.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 7.1e-39 | 47.83 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGI
M+T LDMSL+DMI KN ++RG A ARG G G + R P + R + Y +KA W HD+F ED +GI
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRARGAGGSFNGGRGVVIGSIRRGPLSLNARPSAYAISKASFKLSIMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGI
Query: EIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE
E GTKLY+SNLD+GV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N +
Subjt: EIGTKLYVSNLDHGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEVLGDNAE
|
|
