; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr021653 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr021653
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionProtein TIC 20
Genome locationtig00153782:313348..321184
RNA-Seq ExpressionSgr021653
SyntenySgr021653
Gene Ontology termsGO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005691 - Chloroplast protein import component Tic20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575237.1 Protein TIC 20-I, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-13383.88Show/hide
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XP_022151562.1 protein TIC 20-I, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]9.3e-14292.22Show/hide
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XP_023006630.1 protein TIC 20-I, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]1.0e-13284.44Show/hide
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XP_038875339.1 protein TIC 20-I, chloroplastic [Benincasa hispida]2.3e-14091.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TDM5 Protein TIC 201.8e-13082.96Show/hide
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A0A6J1DBI9 Protein TIC 201.1e-14091.88Show/hide
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A0A6J1DDV0 Protein TIC 204.5e-14292.22Show/hide
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A0A6J1H4H9 Protein TIC 206.1e-13183.33Show/hide
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A0A6J1KYA1 Protein TIC 205.0e-13384.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P73387 Tic20 family protein5.5e-0428.29Show/hide
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        R  + L Y++PL + +M+        P L+       P L    + P   F+  F V ++ VVR     HF RF+ +  +L+ I L + G +  ++   V
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Query:  YWGKLGMHFWTAVAFAYLFTV---FECIRCALAGMYADIPFVCDAAYIQIPY
        +    G+   T   FA+L  +   F  I  ++ G YA+IP + DAAY Q+ +
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Q8GZ79 Protein TIC 20-I, chloroplastic6.1e-10470.07Show/hide
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        ++ G +TP+     +SR F   S R+A  +T    +  +   +++SW             SRG+    L A SS LL G+ G L  T+P LP ++K  +T
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        P+ASKDVP+SFRFPPMT KP+WWWRTLACLPYLMPLHETWMYAETAYHLHPFLEDFEF TYPFLGAIGRLPSWF MAYFFVAYLG+VRRKEWPHFFRFHV
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Query:  VMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKLGMHFWTAVAFAYLFTVFECIRCALAGMYADIPFVCDAAYIQIPYD
        VMGMLLEIALQVIGTVS+WMPL VYWGK GMHFWTAVAFAYLFTV E IRCALAGMYADIPFVCDAAYIQIPYD
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Q9ZQZ9 Protein TIC 20-IV, chloroplastic3.1e-3944.74Show/hide
Query:  GLLHTIPRLPRQKKIGMTPQASKDVPTSFRFPPMTTKPKWWWRTLACLPYLMPLHETWMYAETAYHLHPFLEDFEF---FTYPFLGAIGRLPSWFFMAYF
        GL    P L R ++     + +KD     + P +  +P+WWWRTLAC+PYL+ L      ++  +++ PFLE  +      Y   GAI R P+WFFM Y 
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Query:  FVAYLGVVRRKEWPHFFRFHVVMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKLGMHFWTAVAFAYLFTVFECIRCALAGMYADIPFVCDAAYI
        ++ Y+ VV+ KE PH+ RFH++MGMLLE ALQVI   S + PL  + G+ GM++W A+ F Y+  + ECIRCALAG+YA IPF+ DAA I
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Q9ZST8 Protein TIC 20, chloroplastic3.9e-8263.52Show/hide
Query:  AAASIRSSWEPRLEHQTCFSRGLLPLKLRAGSSPLLTGDLGGLLHTIPRLPRQKKIGMTPQASKDVPTSFRFPPMTTKPKWWWRTLACLPYLMPLHETWM
        A +SIRS W   LE++    RG+    + A SS LL+G    L  TIP LP   K   TP+A+KD  + FRFPPMT KP+WWWRTL+C+PYL+P H+ WM
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Query:  YAETAYHLHPFLEDFEFFTYPFLGAIGRLPSWFFMAYFFVAYLGVVRRKEWPHFFRFHVVMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKLGMHFWTAVAFAY
        YA TAYHLHPF+  F+  TYPFL AIG LP W  +AYF +AYL +VRRKEWPHFFRFHV +GML+EIALQV G VSRWMP + YWGKLGMHFWT   F +
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Query:  LFTVFECIRCALAGMYADIPFVCDAAYIQIPYD
        LFT  ECIRCAL GMYAD+PFVCDAAYIQIP++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04940.1 translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 204.4e-10570.07Show/hide
Query:  ILNGCTTPTGCFFSNSRFFPIPS-RSATSRTPD-CSMQAAASIRSSW---EPRLEHQTCFSRGLLPLKLRAGSSPLLTGDLGGLLHTIPRLPRQKKIGMT
        ++ G +TP+     +SR F   S R+A  +T    +  +   +++SW             SRG+    L A SS LL G+ G L  T+P LP ++K  +T
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        VMGMLLEIALQVIGTVS+WMPL VYWGK GMHFWTAVAFAYLFTV E IRCALAGMYADIPFVCDAAYIQIPYD
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AT1G04945.3 HIT-type Zinc finger family protein3.2e-9267.72Show/hide
Query:  ILNGCTTPTGCFFSNSRFFPIPS-RSATSRTPD-CSMQAAASIRSSW---EPRLEHQTCFSRGLLPLKLRAGSSPLLTGDLGGLLHTIPRLPRQKKIGMT
        ++ G +TP+     +SR F   S R+A  +T    +  +   +++SW             SRG+    L A SS LL G+ G L  T+P LP ++K  +T
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Query:  PQASKDVPTSFRFPPMTTKPKWWWRTLACLPYLMPLHETWMYAETAYHLHPFLEDFEFFTYPFLGAIGRLPSWFFMAYFFVAYLGVVRRKEWPHFFRFHV
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Query:  VMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKLGMHFWTAVAFAYLFTVFECIRCALA
        VMGMLLEIALQVIGTVS+WMPL VYWGK GMHFWTAVAFAYLFTV E IRCALA
Subjt:  VMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKLGMHFWTAVAFAYLFTVFECIRCALA

AT4G03320.1 translocon at the inner envelope membrane of chloroplasts 20-IV2.2e-4044.74Show/hide
Query:  GLLHTIPRLPRQKKIGMTPQASKDVPTSFRFPPMTTKPKWWWRTLACLPYLMPLHETWMYAETAYHLHPFLEDFEF---FTYPFLGAIGRLPSWFFMAYF
        GL    P L R ++     + +KD     + P +  +P+WWWRTLAC+PYL+ L      ++  +++ PFLE  +      Y   GAI R P+WFFM Y 
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Query:  FVAYLGVVRRKEWPHFFRFHVVMGMLLEIALQVIGTVSRWMPLAVYWGKLGMHFWTAVAFAYLFTVFECIRCALAGMYADIPFVCDAAYI
        ++ Y+ VV+ KE PH+ RFH++MGMLLE ALQVI   S + PL  + G+ GM++W A+ F Y+  + ECIRCALAG+YA IPF+ DAA I
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCACGTAGCCATATCTTCCCACATCGAGTACAAATTTCTCCGGCGGCTCCAATTTCTCTCTTGCGAAACCCCTAACACCGAAATCGTCCGCTCTTTGGGAGGCTTAGGAT
CAGTAACCTTCAAACCTCAGAAAGAAGAACTTTGCATTCCTGACAAAGTGGCTGTGGAGATTCACCGAGCAAAAGGCCTTGTGGAGAACTGTAACCTAGATATGATCCTT
AATGGATGCACCACACCCACTGGGTGCTTCTTCTCAAATTCCAGGTTTTTTCCCATTCCTAGCCGCTCTGCTACCTCACGTACTCCTGATTGCAGTATGCAAGCTGCTGC
TAGCATTAGGAGTTCGTGGGAACCTCGTTTAGAGCATCAGACATGTTTCTCTAGAGGTCTCTTACCCTTAAAACTACGTGCTGGATCTTCCCCTCTCTTAACTGGGGATC
TAGGTGGCTTGCTACATACAATCCCAAGGTTACCAAGGCAAAAGAAAATTGGCATGACTCCACAAGCATCCAAAGATGTCCCTACGAGTTTTCGGTTCCCTCCGATGACA
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GGACTTTGAATTCTTTACATATCCCTTTCTCGGAGCGATTGGGAGACTGCCAAGTTGGTTCTTTATGGCATACTTTTTTGTTGCCTATCTAGGAGTTGTAAGACGGAAGG
AATGGCCACACTTCTTTAGATTTCACGTCGTTATGGGCATGTTGTTGGAGATTGCCCTGCAAGTGATTGGTACAGTGAGCCGTTGGATGCCCCTTGCAGTCTACTGGGGT
AAATTGGGGATGCACTTTTGGACAGCCGTAGCATTCGCTTACCTATTCACGGTTTTCGAATGCATACGCTGCGCTCTTGCGGGCATGTACGCCGACATCCCCTTCGTCTG
TGATGCAGCATACATCCAAATTCCATATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTCAAACGCCGCGGACCCTTTGCCATTTTCATGGCTTGACGACTCGTCTTCTTCCCCTCGCCGAGGCTGCACACCTCCTTCTTGCGCTGCCGCCTCCATATCCAGAGT
GCACGTAGCCATATCTTCCCACATCGAGTACAAATTTCTCCGGCGGCTCCAATTTCTCTCTTGCGAAACCCCTAACACCGAAATCGTCCGCTCTTTGGGAGGCTTAGGAT
CAGTAACCTTCAAACCTCAGAAAGAAGAACTTTGCATTCCTGACAAAGTGGCTGTGGAGATTCACCGAGCAAAAGGCCTTGTGGAGAACTGTAACCTAGATATGATCCTT
AATGGATGCACCACACCCACTGGGTGCTTCTTCTCAAATTCCAGGTTTTTTCCCATTCCTAGCCGCTCTGCTACCTCACGTACTCCTGATTGCAGTATGCAAGCTGCTGC
TAGCATTAGGAGTTCGTGGGAACCTCGTTTAGAGCATCAGACATGTTTCTCTAGAGGTCTCTTACCCTTAAAACTACGTGCTGGATCTTCCCCTCTCTTAACTGGGGATC
TAGGTGGCTTGCTACATACAATCCCAAGGTTACCAAGGCAAAAGAAAATTGGCATGACTCCACAAGCATCCAAAGATGTCCCTACGAGTTTTCGGTTCCCTCCGATGACA
ACGAAACCAAAATGGTGGTGGAGGACATTAGCATGCCTACCCTATCTAATGCCCCTTCACGAAACTTGGATGTACGCTGAAACAGCGTACCATCTACACCCGTTCCTGGA
GGACTTTGAATTCTTTACATATCCCTTTCTCGGAGCGATTGGGAGACTGCCAAGTTGGTTCTTTATGGCATACTTTTTTGTTGCCTATCTAGGAGTTGTAAGACGGAAGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NGCTTPTGCFFSNSRFFPIPSRSATSRTPDCSMQAAASIRSSWEPRLEHQTCFSRGLLPLKLRAGSSPLLTGDLGGLLHTIPRLPRQKKIGMTPQASKDVPTSFRFPPMT
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KLGMHFWTAVAFAYLFTVFECIRCALAGMYADIPFVCDAAYIQIPYD