; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr021976 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr021976
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationtig00153870:302346..306150
RNA-Seq ExpressionSgr021976
SyntenySgr021976
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036519.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-10179.58Show/hide
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KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-10197.81Show/hide
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XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]8.6e-10097.79Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]7.8e-10198.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.2e-9997.79Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like7.6e-10279.58Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.2e-10198.9Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.2e-10097.79Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.2e-10097.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.3e-6362.98Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.4e-6362.98Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.4e-6362.98Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.3e-8785.16Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like9.0e-8481.97Show/hide
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        MI LFKVKEKQRE +++ NG+    VKKQ+AGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein6.4e-8581.97Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 113.7e-2438.52Show/hide
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         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 113.7e-2438.52Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 19.5e-8985.16Show/hide
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        MI LFKVKEKQRE A+NA  G   VKKQ+AGELRL KDISELNLP +CSISFPNGKDDLMNFEV+I PD+GYY  GTF+F+FQVSPVYPHE PKVKCKTK
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 19.5e-8985.16Show/hide
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        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVGQTFF R
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCACCCGGCAACTGGAGATAGCTTCCGTTTCTCTGGGGCCTTTACAGAAACGGCGCAGTGCCACAGTGAAGTAAGTTTGAGGTGGATGACGCCGGTCCTCAGTCGAAA
ATCGAAAGCGAAGGGAGCCGAATTTGGCCCTGCAGAGCGAAGAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGGGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAA
AGCCCCCTGTCAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGAT
CTGATGAACTTCGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACGTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGT
GAAGTGCAAGACAAAAGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAATGTCTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAACCCGTTCTTAATATCAACACTATAATAT
ACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAATCACGATGCTGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCCAAGATGTTCGAATCGAATGTGAGAAGA
GCCATGGCTGGGGGCTATGTGGGGCAGACTTTCTTCACACGTAATGTGTTCAGAGGACTATCTCATCATCAACACGACGAGAAGTCTTTTGTGATGCTGGTGGAACTTTG
TTGTGTGTTTGCAGTATTGGTTTCAAATTCTCAAAGTGTATTGCTGGAAGTTGGACTGGAATCTGAAACTCTTATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCACCCGGCAACTGGAGATAGCTTCCGTTTCTCTGGGGCCTTTACAGAAACGGCGCAGTGCCACAGTGAAGTAAGTTTGAGGTGGATGACGCCGGTCCTCAGTCGAAA
ATCGAAAGCGAAGGGAGCCGAATTTGGCCCTGCAGAGCGAAGAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGGGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGAA
AGCCCCCTGTCAAGAAGCAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGAT
CTGATGAACTTCGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACGTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGT
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TTGTGTGTTTGCAGTATTGGTTTCAAATTCTCAAAGTGTATTGCTGGAAGTTGGACTGGAATCTGAAACTCTTATCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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