| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6588492.1 Serine/arginine-rich splicing factor SR30, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.0e-110 | 96.65 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFED+RDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDH YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| XP_022928780.1 serine/arginine-rich splicing factor SR30-like [Cucurbita moschata] | 4.0e-110 | 96.65 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFED+RDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDH YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| XP_022969758.1 serine/arginine-rich splicing factor SR30-like [Cucurbita maxima] | 3.1e-110 | 97.13 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDH YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| XP_023530260.1 serine/arginine-rich splicing factor SR30-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.2e-108 | 96.19 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGR-GHSSSIDHYSSYSRS
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGR GHSSSIDH YSRS
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGR-GHSSSIDHYSSYSRS
Query: GSSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPS
GSSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPS
Subjt: GSSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPS
Query: RDSRRSYYSR
RDSR+S YSR
Subjt: RDSRRSYYSR
|
|
| XP_038879705.1 serine/arginine-rich splicing factor SR30-like [Benincasa hispida] | 2.2e-108 | 95.69 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSS+D YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLP SASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1C1X9 serine/arginine-rich splicing factor SR30 isoform X1 | 2.0e-107 | 94.74 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRL+E+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRG SSSID YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSR+YVRVKEYDSRRSYSRSPS
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| A0A6J1C3Z4 serine/arginine-rich splicing factor SR30 isoform X2 | 2.0e-107 | 94.74 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRL+E+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRG SSSID YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSR+YVRVKEYDSRRSYSRSPS
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| A0A6J1C630 serine/arginine-rich splicing factor SR30 isoform X3 | 2.0e-107 | 94.74 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRL+E+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRG SSSID YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSR+YVRVKEYDSRRSYSRSPS
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| A0A6J1ESI8 serine/arginine-rich splicing factor SR30-like | 1.9e-110 | 96.65 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFED+RDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDH YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| A0A6J1HYQ5 serine/arginine-rich splicing factor SR30-like | 1.5e-110 | 97.13 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSRNSRTI+VGNLPGDIRLRE+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDH YSRSG
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
DSRRS YSR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A2RVS6 Serine/arginine-rich splicing factor SR34A | 1.3e-76 | 67.59 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MS R SR+I+VGNLPGDIR E+ED+FYKYG IVDI+LK+PPRPP Y FVEFE RDAEDAI GRDGY DGCRLRVE AHGGRG SSS D Y G
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRG-----------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYD
S G GVSR +++RV+V GLP SASWQDLKDHMR+AGDVCF+EV RD G G+VDYTNYDDMKYAIRKLDD+EFRN ++R ++RVK+Y+
Subjt: SSRG-----------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYD
Query: SRRSYSRSPSRDSRRS
S RS SRSPSR RS
Subjt: SRRSYSRSPSRDSRRS
|
|
| F4JHI7 Serine/arginine-rich splicing factor SR34B | 1.1e-75 | 71.3 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYS---
MSSR+SRTI+VGNLPGDIR RE+EDLF KYGP+V IDLKIPPRPPGYAFVEFED RDA+DAIYGRDGY FDG LRVE AHGGR SS D SYS
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYS---
Query: ---RSGSSRG----GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDS
R G G G SRR++YRV+V+GLP SASWQDLKDHMR+ G+VCFS+VFRD G GIVDYT+Y+DMKYA LDD+EFRNAFS YVRV+EYDS
Subjt: ---RSGSSRG----GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDS
Query: RRSYSRSPSRDSRRSY
RR SRSPSR RSY
Subjt: RRSYSRSPSRDSRRSY
|
|
| O22315 Serine/arginine-rich-splicing factor SR34 | 1.6e-77 | 69.3 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR+SRT++VGNLPGDIR RE+EDLF KYGP+V IDLK+PPRPPGYAFVEF+D RDAEDAI+GRDGY FDG RLRVE AHGGR SS D S++ G
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
G G SRR+++RVLVTGLP SASWQDLKDHMR+ GDVCFS+V+RD G G+VDYT Y+DMKYA++KLDD+EFRNAFS YVRV+EYDSR
Subjt: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
Query: RSYSRSPSRDSRRSY
+ SRSPSR RSY
Subjt: RSYSRSPSRDSRRSY
|
|
| Q6NYA0 Serine/arginine-rich splicing factor 1B | 4.0e-52 | 54.37 | Show/hide |
Query: SSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSGS
+ N I+VGNLP DIR +++ED+FYKYG I DIDLK P +AFVEFED RDAEDA+YGRDGY +DG RLRVEF GRG
Subjt: SSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSGS
Query: SRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFR-NAFSRAYVRVKEYDSRR-SYSRSPS
G SRR++YRV+V+GLPPS SWQDLKDHMR AGDVC+++VFRD G+V++ +DM YA+RKLD+++FR + AY+RVK R SY RS S
Subjt: SRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFR-NAFSRAYVRVKEYDSRR-SYSRSPS
Query: RDSRRS
R RS
Subjt: RDSRRS
|
|
| Q9XFR5 Serine/arginine-rich splicing factor SR30 | 1.9e-86 | 78.47 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR +RTI+VGNLPGDIR E+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFED RDA+DAIYGRDGY FDGCRLRVE AHGGR S S+D YSS S
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
S+ SRR+DYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMR+AGDVCFSEVF DR GM+G+VDY+NYDDMKYAIRKLD +EFRNAFS AY+RV+EY+S RS SRSP
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
D +SY SR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G02840.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-78 | 69.3 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR+SRT++VGNLPGDIR RE+EDLF KYGP+V IDLK+PPRPPGYAFVEF+D RDAEDAI+GRDGY FDG RLRVE AHGGR SS D S++ G
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
G G SRR+++RVLVTGLP SASWQDLKDHMR+ GDVCFS+V+RD G G+VDYT Y+DMKYA++KLDD+EFRNAFS YVRV+EYDSR
Subjt: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
Query: RSYSRSPSRDSRRSY
+ SRSPSR RSY
Subjt: RSYSRSPSRDSRRSY
|
|
| AT1G02840.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-78 | 69.3 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR+SRT++VGNLPGDIR RE+EDLF KYGP+V IDLK+PPRPPGYAFVEF+D RDAEDAI+GRDGY FDG RLRVE AHGGR SS D S++ G
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
G G SRR+++RVLVTGLP SASWQDLKDHMR+ GDVCFS+V+RD G G+VDYT Y+DMKYA++KLDD+EFRNAFS YVRV+EYDSR
Subjt: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
Query: RSYSRSPSRDSRRSY
+ SRSPSR RSY
Subjt: RSYSRSPSRDSRRSY
|
|
| AT1G02840.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-78 | 69.3 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR+SRT++VGNLPGDIR RE+EDLF KYGP+V IDLK+PPRPPGYAFVEF+D RDAEDAI+GRDGY FDG RLRVE AHGGR SS D S++ G
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
G G SRR+++RVLVTGLP SASWQDLKDHMR+ GDVCFS+V+RD G G+VDYT Y+DMKYA++KLDD+EFRNAFS YVRV+EYDSR
Subjt: SSRG---------GVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSR
Query: RSYSRSPSRDSRRSY
+ SRSPSR RSY
Subjt: RSYSRSPSRDSRRSY
|
|
| AT1G09140.1 SERINE-ARGININE PROTEIN 30 | 1.3e-87 | 78.47 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR +RTI+VGNLPGDIR E+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFED RDA+DAIYGRDGY FDGCRLRVE AHGGR S S+D YSS S
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
S+ SRR+DYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMR+AGDVCFSEVF DR GM+G+VDY+NYDDMKYAIRKLD +EFRNAFS AY+RV+EY+S RS SRSP
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
D +SY SR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
| AT1G09140.2 SERINE-ARGININE PROTEIN 30 | 1.3e-87 | 78.47 | Show/hide |
Query: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
MSSR +RTI+VGNLPGDIR E+EDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFED RDA+DAIYGRDGY FDGCRLRVE AHGGR S S+D YSS S
Subjt: MSSRNSRTIFVGNLPGDIRLRELEDLFYKYGPIVDIDLKIPPRPPGYAFVEFEDVRDAEDAIYGRDGYKFDGCRLRVEFAHGGRGHSSSIDHYSSYSRSG
Query: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
S+ SRR+DYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMR+AGDVCFSEVF DR GM+G+VDY+NYDDMKYAIRKLD +EFRNAFS AY+RV+EY+S RS SRSP
Subjt: SSRGGVSRRTDYRVLVTGLPPSASWQDLKDHMRRAGDVCFSEVFRDRGGMAGIVDYTNYDDMKYAIRKLDDSEFRNAFSRAYVRVKEYDSRRSYSRSPSR
Query: DSRRSYYSR
D +SY SR
Subjt: DSRRSYYSR
|
|
