; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr023053 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr023053
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionSerine/arginine-rich splicing factor SC35-like
Genome locationtig00000729:2330609..2333765
RNA-Seq ExpressionSgr023053
SyntenySgr023053
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016607 - nuclear speck (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-11292.13Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRS SRS+ERYDRDR HRSERER+RSRSRS SPDR+KDRRRGRDD+ERRS SHSDRSMSPTR+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
        PDTRRS SPRRT PSRGRSD+  SPK DN   SPDDKPVDSRSPSPA+SDADVS
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS

KAG6598682.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.8e-11292.09Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRS SRS+ER+DRDR HRSERER+RSRSRS SPDR KDRRRGRDD ERRS SHSDRSMSP R+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
        PDTRRS SPRRT PSRGRSDD HSP+RDN   SPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV

XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo]4.4e-11192.06Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRS SRS+ERYDRDR HRSERER+RSRSRS SPDR+KDRRRGRDD+ERRS SHSDRSMSPTR+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
        PDTRRS SPRRT PSRGRSD+  SPK DN   SPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD

XP_022961979.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita moschata]4.4e-11191.7Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRS SRS+ER+DRDR HRSERER+RSRSRS SPDR KDR RGRDD ERRS SHSDRSMSP R+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
        PDTRRS SPRRT PSRGRSDD HSP+RDN   SPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV

XP_022997247.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita maxima]2.0e-11191.7Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRS SRS+ER+DRDR HRSERER+RSRSRS SPDR KDRRRGRDD ERRS SHSDRSMSP R+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
        PDTRRS SPRRT PSRGRSD+ HSP+RDN   SPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein2.8e-11191.67Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPR RHRDD+RDRDYRRRS SRS+ERYDRDR HRSERER+RSRSRS SPDR+KDRRRGRDD+ERRS SHSDRSMSPTR+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
        PDTRRS SPR+T PSR RSDD HSPK DN   SPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD

A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like2.1e-11192.06Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRS SRS+ERYDRDR HRSERER+RSRSRS SPDR+KDRRRGRDD+ERRS SHSDRSMSPTR+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
        PDTRRS SPRRT PSRGRSD+  SPK DN   SPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD

A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like2.5e-11292.13Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRS SRS+ERYDRDR HRSERER+RSRSRS SPDR+KDRRRGRDD+ERRS SHSDRSMSPTR+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
        PDTRRS SPRRT PSRGRSD+  SPK DN   SPDDKPVDSRSPSPA+SDADVS
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS

A0A6J1HFJ8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X22.1e-11191.7Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRS SRS+ER+DRDR HRSERER+RSRSRS SPDR KDR RGRDD ERRS SHSDRSMSP R+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
        PDTRRS SPRRT PSRGRSDD HSP+RDN   SPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV

A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X29.5e-11291.7Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS
        IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRS SRS+ER+DRDR HRSERER+RSRSRS SPDR KDRRRGRDD ERRS SHSDRSMSP R+S
Subjt:  IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNS

Query:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
        PDTRRS SPRRT PSRGRSD+ HSP+RDN   SPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt:  PDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 21.3e-2545.16Show/hide
Query:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
        +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+    +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG  P++   
Subjt:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI

Query:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSP
        R+G        +    RSRSPR R R   R R    RS SRS+ RY R +     R R RSRSRS S  R+  R + +     RS S S RS S +R+ P
Subjt:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSP

Query:  DTRRSTSPRRTPSRGRS
             TS R + SR RS
Subjt:  DTRRSTSPRRTPSRGRS

Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 25.5e-2442.6Show/hide
Query:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
        +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+    +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG  P++   
Subjt:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI

Query:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHS---DRSMSPTR
        R+G             RSRSPR R R   R R    RS SRS+ RY R +     R R RSRSRS S  R+  R + +     RS S S    RS SP  
Subjt:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHS---DRSMSPTR

Query:  NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDG
         S    +S S  ++P +   ++G
Subjt:  NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDG

Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 24.2e-2442.6Show/hide
Query:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
        +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+    +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG  P++   
Subjt:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI

Query:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHS---DRSMSPTR
        R+G             RSRSPR R R   R R    RS SRS+ RY R +     R R RSRSRS S  R+  R + +     RS S S    RS SP  
Subjt:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHS---DRSMSPTR

Query:  NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDG
         S    +S S  ++P +   ++G
Subjt:  NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDG

Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 25.5e-2442.6Show/hide
Query:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
        +GR  PPD+    SL V N+T+RT+ D L  +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+    +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG  P++   
Subjt:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI

Query:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHS---DRSMSPTR
        R+G             RSRSPR R R   R R    RS SRS+ RY R +     R R RSRSRS S  R+  R + +     RS S S    RS SP  
Subjt:  RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHS---DRSMSPTR

Query:  NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDG
         S    +S S  ++P +   ++G
Subjt:  NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDG

Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC358.7e-6261.23Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERE-RHRSRSRSDSPDRNKDRR
        I KGRV+E    S ++R RS                    RSRSPR R RDDYR++DYR+RS SRS +R  R+RH   +R+ R R+RSRS SPD  K R 
Subjt:  IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERE-RHRSRSRSDSPDRNKDRR

Query:  RGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSR---SPDDKPVDSRSPSPAKS
        RGR D E RS S S  S SP R SP   RS+SP++T P+R  S D  S +R    R   SP    +   SPS   S
Subjt:  RGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSR---SPDDKPVDSRSPSPAKS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 332.2e-1238.22Show/hide
Query:  SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
        SLLV N+      +DL   F+++G V D+++PRD  TGD RGF FV++    +A  A   +DG +L GRE+ V FA+     E  +K   M +  +  GR
Subjt:  SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR

Query:  ------------SRSRSPRPRH-RDDYRDRDY----RRRSHSRS----KERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSD-RSM
                    SRSRSP PR  R   R  DY     RR H RS    +ERYD  R +        SR RS +P R K   R      RRSIS S  RS 
Subjt:  ------------SRSRSPRPRH-RDDYRDRDY----RRRSHSRS----KERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSD-RSM

Query:  SPTRNSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
        SP   SP   RS SPRR+ SR       SP+R   S +P+     S+SP   + D D S
Subjt:  SPTRNSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDGHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS

AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A1.4e-0934.98Show/hide
Query:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFA-----KYGPNA
        FG S   D+    SLLV N+      +DL   F+++G V D+++PRD  TGD RGF F+++    +A +A  ++DG +L GRE+ V FA     K     
Subjt:  FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFA-----KYGPNA

Query:  EKIRKGRVMESSSKTRGRSR-SRSPRPR--HRDDYRDRDY--------RRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSI
         + R GR      + R   R SRSP PR   R   R R Y        + RS S    RY+++R +      + SR RS SP R K   R      RRS+
Subjt:  EKIRKGRVMESSSKTRGRSR-SRSPRPR--HRDDYRDRDY--------RRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSI

Query:  S-HSDRSMSPTR---NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDGHSPKR
        S   +RS +P +    SP  R+S SP   P RG  +   SP +
Subjt:  S-HSDRSMSPTR---NSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDDGHSPKR

AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 289.4e-1134.59Show/hide
Query:  LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRG--
        LL+ N+      +DL   F+++G + D+++PR+  TG+ RGF FV+Y+YA++A +A+ +++ +++ GREI + FA+   N +  ++ R    +S   G  
Subjt:  LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRG--

Query:  -RSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRN
         R+  RSPR R+R   R R   RR    SK R D D +  S R R RS SRS  P RN+   + R+    R     +R ++P R+
Subjt:  -RSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRN

AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC356.2e-6361.23Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERE-RHRSRSRSDSPDRNKDRR
        I KGRV+E    S ++R RS                    RSRSPR R RDDYR++DYR+RS SRS +R  R+RH   +R+ R R+RSRS SPD  K R 
Subjt:  IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERE-RHRSRSRSDSPDRNKDRR

Query:  RGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSR---SPDDKPVDSRSPSPAKS
        RGR D E RS S S  S SP R SP   RS+SP++T P+R  S D  S +R    R   SP    +   SPS   S
Subjt:  RGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSR---SPDDKPVDSRSPSPAKS

AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC356.2e-6361.23Show/hide
Query:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
        MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt:  MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK

Query:  IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERE-RHRSRSRSDSPDRNKDRR
        I KGRV+E    S ++R RS                    RSRSPR R RDDYR++DYR+RS SRS +R  R+RH   +R+ R R+RSRS SPD  K R 
Subjt:  IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERE-RHRSRSRSDSPDRNKDRR

Query:  RGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSR---SPDDKPVDSRSPSPAKS
        RGR D E RS S S  S SP R SP   RS+SP++T P+R  S D  S +R    R   SP    +   SPS   S
Subjt:  RGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRT-PSRGRSDDGHSPKRDNDSR---SPDDKPVDSRSPSPAKS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGCACTTCGGGAGATCGGGTCCTCCCGATATCAGAGACACCTACTCCCTCCTCGTCCTCAACATCACTTTCCGAACCACCGCCGACGATCTTTACCCTCTGTTCGA
CAAGTATGGAAAGGTCGTGGACGTCTTCATCCCCAGAGACCGAAGGACTGGGGATTCCCGAGGATTTGCGTTTGTTCGATACAAGTATGCGGACGAAGCACAGAAGGCAA
TCGACAAGCTTGACGGACGAATGTTGGATGGCAGAGAAATTATGGTTCAATTCGCCAAGTACGGACCCAACGCCGAGAAAATTCGCAAGGGGAGGGTGATGGAATCATCA
TCAAAGACAAGGGGCAGGTCAAGGAGCCGCAGTCCTCGTCCAAGGCACCGTGATGACTATAGGGATAGGGATTATAGGAGGAGAAGTCACAGTAGAAGCAAGGAGAGATA
TGATCGTGATAGACACCACAGAAGTGAGAGAGAACGCCATCGCAGTAGGAGTCGTAGTGATAGTCCTGATCGCAATAAAGATCGTAGGAGGGGAAGAGATGATGAGGAAC
GACGTAGTATAAGCCACTCTGATAGAAGCATGTCACCCACCCGGAATTCCCCCGATACTCGGAGAAGCACATCTCCACGTAGGACTCCATCTAGGGGTAGAAGCGATGAT
GGGCATTCACCGAAGCGAGATAATGACTCACGCTCACCAGATGATAAACCAGTTGATTCTCGAAGTCCATCTCCTGCTAAATCTGATGCTGATGTGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGCACTTCGGGAGATCGGGTCCTCCCGATATCAGAGACACCTACTCCCTCCTCGTCCTCAACATCACTTTCCGAACCACCGCCGACGATCTTTACCCTCTGTTCGA
CAAGTATGGAAAGGTCGTGGACGTCTTCATCCCCAGAGACCGAAGGACTGGGGATTCCCGAGGATTTGCGTTTGTTCGATACAAGTATGCGGACGAAGCACAGAAGGCAA
TCGACAAGCTTGACGGACGAATGTTGGATGGCAGAGAAATTATGGTTCAATTCGCCAAGTACGGACCCAACGCCGAGAAAATTCGCAAGGGGAGGGTGATGGAATCATCA
TCAAAGACAAGGGGCAGGTCAAGGAGCCGCAGTCCTCGTCCAAGGCACCGTGATGACTATAGGGATAGGGATTATAGGAGGAGAAGTCACAGTAGAAGCAAGGAGAGATA
TGATCGTGATAGACACCACAGAAGTGAGAGAGAACGCCATCGCAGTAGGAGTCGTAGTGATAGTCCTGATCGCAATAAAGATCGTAGGAGGGGAAGAGATGATGAGGAAC
GACGTAGTATAAGCCACTCTGATAGAAGCATGTCACCCACCCGGAATTCCCCCGATACTCGGAGAAGCACATCTCCACGTAGGACTCCATCTAGGGGTAGAAGCGATGAT
GGGCATTCACCGAAGCGAGATAATGACTCACGCTCACCAGATGATAAACCAGTTGATTCTCGAAGTCCATCTCCTGCTAAATCTGATGCTGATGTGAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESS
SKTRGRSRSRSPRPRHRDDYRDRDYRRRSHSRSKERYDRDRHHRSERERHRSRSRSDSPDRNKDRRRGRDDEERRSISHSDRSMSPTRNSPDTRRSTSPRRTPSRGRSDD
GHSPKRDNDSRSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS