| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0049431.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo var. makuwa] | 3.2e-115 | 92.65 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSIS SRSP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSY
R+DYSRSP+ K+NGRSP EVD ARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSY
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSY
|
|
| XP_004134179.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis sativus] | 5.4e-115 | 92.68 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSIS SRSP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RRDYSRSP+ K+NGRSP EVD ARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| XP_008438778.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo] | 1.4e-115 | 92.68 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSIS SRSP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
R+DYSRSP+ K+NGRSP EVD ARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| XP_022137875.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Momordica charantia] | 5.2e-118 | 95.12 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRY ESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRN G RDEYLSPARSRSISRSRSPH+
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RRDYSRSPS KENGRSP EVDI RSRSRS RADSRSPSGSRS+SYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida] | 2.8e-116 | 93.5 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M RYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKR+DDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+ G R+EYLSPARSRSISRSRSP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RRDYSRSP+ KENGRSP EVD ARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 6.8e-116 | 92.68 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSIS SRSP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
R+DYSRSP+ K+NGRSP EVD ARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.5e-115 | 92.65 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSIS SRSP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSY
R+DYSRSP+ K+NGRSP EVD ARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSY
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.5e-118 | 95.12 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRY ESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRN G RDEYLSPARSRSISRSRSPH+
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RRDYSRSPS KENGRSP EVDI RSRSRS RADSRSPSGSRS+SYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.8e-114 | 92.28 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MA+YRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSISRS SP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RRDYSRSP+ KENGRSP VD ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.4e-115 | 93.09 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRS+SPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR+TSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+ G RDEYLSPARSRSISRS SP +
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHN
Query: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RRDYSRSP+ KENGRSP VDIARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYS
Subjt: RRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.0e-20 | 41.46 | Show/hide |
Query: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRLTSR
+ L V NL P+ LR FE++G V DVY+P++ YT E RGF FV+F DA +A ++ V+ GRE+R+ A +R+ P R S
Subjt: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRLTSR
Query: SSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHNRRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSR
GR +RSPRRR RS SRS S +R SR+ +R + S RSRS S S+S RR S+S S+ + RS +RSRSRSP S+ S SR
Subjt: SSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHNRRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSR
Query: SRSYS
SRS S
Subjt: SRSYS
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.2e-62 | 63.2 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRS+SPR R RSPPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDE--YLSPARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR+ R++ Y RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDE--YLSPARSRSISRSR
Query: SPHNRRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
P N R+Y N RSP E R +P SR S SRSRS S
Subjt: SPHNRRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 2.7e-32 | 44.96 | Show/hide |
Query: FSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
+SP RR RGR PR Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F A DA EA++
Subjt: FSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
Query: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTS------------RSSGRSYRRR-SPARSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRS
+N GREI +V A E+RK P+EMR+ + RS GRS R S +RSPRR RYRS S SP+P R G DE S
Subjt: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTS------------RSSGRSYRRR-SPARSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRS
Query: ISRSRSPHNRRDYSRSPSLKENG-----RSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRS
RS SP + +P NG PG A R R RA SRSPSGSRSRS
Subjt: ISRSRSPHNRRDYSRSPSLKENG-----RSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRS
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 1.6e-37 | 48.81 | Show/hide |
Query: RSRSFSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RS++P SPPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSFSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHNR---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R R+ Y SP R SRS SP +R
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHNR---
Query: --RDYSRSP---SLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYSSQ
R YSRSP + SPG V +S SRSPR RS S ++RSY+ +
Subjt: --RDYSRSP---SLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYSSQ
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.2e-35 | 48.83 | Show/hide |
Query: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RS++P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPH-----N
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SR+ +Y SP R RS SP
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPH-----N
Query: RRDYSRSP-SLKENGRSPGEV---------DIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RR YSRSP S GRS V RS SRSPR SRSPS R+RS S
Subjt: RRDYSRSP-SLKENGRSPGEV---------DIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 8.2e-37 | 48.83 | Show/hide |
Query: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RS++P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPH-----N
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SR+ +Y SP R RS SP
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPH-----N
Query: RRDYSRSP-SLKENGRSPGEV---------DIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
RR YSRSP S GRS V RS SRSPR SRSPS R+RS S
Subjt: RRDYSRSP-SLKENGRSPGEV---------DIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 5.9e-35 | 49.35 | Show/hide |
Query: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RS++P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPH-----N
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SR+ +Y SP R RS SP
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPH-----N
Query: RRDYSRSP-SLKENGRSPGEVDIARSRSRSP
RR YSRSP S GRS V +SRS SP
Subjt: RRDYSRSP-SLKENGRSPGEVDIARSRSRSP
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.9e-33 | 46.07 | Show/hide |
Query: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
R RS++P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRGFG
Subjt: RSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
Query: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISR
FV+F DAA+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R G +R R R RY S SRSP P R SR+ +Y SP R R
Subjt: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISR
Query: SRSPH-----NRRDYSRSP-SLKENGRSPGEV---------DIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
S SP RR YSRSP S GRS V RS SRSPR SRSPS R+RS S
Subjt: SRSPH-----NRRDYSRSP-SLKENGRSPGEV---------DIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.1e-38 | 48.81 | Show/hide |
Query: RSRSFSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RS++P SPPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSFSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHNR---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R R+ Y SP R SRS SP +R
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDEYLSPARSRSISRSRSPHNR---
Query: --RDYSRSP---SLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYSSQ
R YSRSP + SPG V +S SRSPR RS S ++RSY+ +
Subjt: --RDYSRSP---SLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYSSQ
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 3.0e-63 | 63.2 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRS+SPR R RSPPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSFSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDE--YLSPARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR+ R++ Y RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRLTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNHGTRDE--YLSPARSRSISRSR
Query: SPHNRRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
P N R+Y N RSP E R +P SR S SRSRS S
Subjt: SPHNRRDYSRSPSLKENGRSPGEVDIARSRSRSPRADSRSPSGSRSRSYS
|
|
