; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr026406 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr026406
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Descriptionphotosystem I reaction center subunit N, chloroplastic
Genome locationtig00153031:5017036..5019710
RNA-Seq ExpressionSgr026406
SyntenySgr026406
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0030093 - chloroplast photosystem I (cellular component)
InterPro domainsIPR008796 - Photosystem I reaction centre subunit N, chloroplastic
IPR044907 - Photosystem I reaction centre subunit N superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604288.1 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-8292.44Show/hide
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KAG7034449.1 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-8292.44Show/hide
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XP_008441057.1 PREDICTED: photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic [Cucumis melo]9.7e-8494.74Show/hide
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XP_022132424.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]1.1e-8495.91Show/hide
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XP_038883748.1 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]4.3e-8495.32Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B240 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic4.7e-8494.74Show/hide
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A0A5D3DQX9 Photosystem I reaction center subunit N4.7e-8494.74Show/hide
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A0A6J1BT08 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X15.5e-8595.91Show/hide
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A0A6J1GG47 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic-like2.6e-8292.4Show/hide
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A0A6J1KNN3 photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic isoform X13.4e-8292.98Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65107 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic (Fragment)3.6e-4183.7Show/hide
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P31093 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic2.1e-4467.36Show/hide
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        +AVP +ASP  A            RV  A  + RR+ALL L A    AA AAS  SA A V +EYLEKSK NKELNDKKR ATSGANFARAYTV+FG+CK
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        FP NFTGCQDLAKQKKVPFI+DDL++ECEGK+K+KCGSNVFWKW
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P49107 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic8.0e-5767.05Show/hide
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Q9SBN5 Photosystem I reaction center subunit N, chloroplastic1.8e-2453.03Show/hide
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        A+RAQ A+V  A+           +   R  LL LG  L AAA A    +ANAGV+E+ L KS ANK LN+KKRLATS AN AR+ TV  GTC+FPENF 
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        GC++LA  K V +I++DL +ECEGKD   CGS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64040.1 photosystem I reaction center subunit PSI-N, chloroplast, putative / PSI-N, putative (PSAN)5.7e-5867.05Show/hide
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AT5G64040.2 photosystem I reaction center subunit PSI-N, chloroplast, putative / PSI-N, putative (PSAN)1.6e-3962.5Show/hide
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        MA MNSSVL C+YAI+G+GS ELN K+  V  +   G      +P I+AQ+    +   + GRR+A+++L ATLF+ AA   ++SANAGVI+EYLE+SK 
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        NKELNDKKRLATSGANFARA+TV+FG+CKFPENFTGCQDLAKQK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGAGATAACTTTTGTTTATGAGGGAACATTTATAGCAACAGTCCTGTTCTATTATATTCCGTTTTTGAAGTTGATGCTCCCAAATCTTGCAGTTGCAGCAATGGCGACCA
TGAATTCCAGTGTTTTGGCCTGCAACTACGCCATTTCGGGAGCTGGATCGCCTGAGCTGAACTCGAAACTCAGCGCCGTGCCTTGCGCTGCATCGCCGGGGGTTGCTGGC
TACAAGTTGCCTGCTATTAGGGCTCAACAGGCGAGAGTTCCTGAAGCGAAGAATGAAGGAAGGAGGACTGCGCTTCTTTACCTTGGAGCCACCCTCTTTGCTGCGGCTGC
GGCTGCCTCCAACTCTTCTGCTAATGCAGGAGTCATTGAAGAGTACCTTGAGAAGAGTAAAGCTAACAAGGAATTGAATGACAAGAAAAGATTGGCAACAAGTGGAGCAA
ACTTTGCAAGGGCATACACTGTTGAGTTTGGAACATGCAAGTTCCCAGAGAACTTCACAGGGTGCCAAGATCTTGCCAAGCAAAAGAAAGTTCCATTTATCTCTGATGAT
TTGGACTTGGAGTGTGAGGGGAAGGACAAGTACAAGTGTGGTTCCAATGTCTTCTGGAAATGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LDLECEGKDKYKCGSNVFWKW