; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr026578 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr026578
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionTubulin beta chain
Genome locationtig00153033:1459198..1462261
RNA-Seq ExpressionSgr026578
SyntenySgr026578
Gene Ontology termsGO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process)
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GO:0005874 - microtubule (cellular component)
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GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain
IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
IPR023123 - Tubulin, C-terminal
IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain
IPR017975 - Tubulin, conserved site
IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site
IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal
IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain
IPR002453 - Beta tubulin
IPR000217 - Tubulin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147894.1 tubulin beta chain [Cucumis sativus]1.9e-251100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29516 Tubulin beta-8 chain7.6e-25197.64Show/hide
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P37392 Tubulin beta-1 chain4.9e-25097.41Show/hide
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Q40106 Tubulin beta-2 chain4.9e-25097.41Show/hide
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Q56YW9 Tubulin beta-2 chain1.1e-24997.64Show/hide
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Q8H7U1 Tubulin beta-2 chain2.9e-25097.64Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGGAGATTCCGATCTTCAGCTTGAGAGGATTAATGTCTACTACAACGAAGCGAGTTGCGGGAGGTATGTTCCTCGCGCTGTTCTCATGGATCTTGAGCCGGGTACCATGG
ACAGTATCAGATCTGGTCTCTATGGCCAGATCTTCAGGCCGGATAACTTCGTTTTCGGTCAATCTGGCGCTGGAAACAACTGGGCTAAAGGCCACTACACTGAAGGCGCT
GAGCTAATTGATTCCGTGCTCGATGTCGTCCGAAAGGAGGCGGAGAACTGTGATTGTTTGCAAGGGTTTCAGGTGTGCCATTCTCTAGGAGGGGGAACTGGATCTGGGAT
GGGTACTCTTCTGATTTCAAAGATCAGAGAAGAATACCCAGACAGGATGATGCTTACCTTCTCTGTCTTCCCATCGCCGAAGGTCTCTGATACTGTCGTTGAGCCTTACA
ACGCAACCCTCTCAGTTCATCAGCTGGTTGAAAATGCCGACGAGTGCATGGTTCTTGACAATGAAGCTCTCTATGATATCTGCTTCCGTACCCTCAAGCTCACCACTCCA
AGCTTTGGTGATCTGAACCATTTGATCTCTGCAACAATGTCCGGTGTGACTTGCTGTTTGAGATTCCCTGGTCAACTCAACTCTGATCTCCGAAAGCTCGCCGTTAATCT
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CTCAATGTGCAGAACAAGAACTCTTCATACTTTGTGGAGTGGATTCCAAACAATGTTAAATCAACCGTTTGTGATATCCCTCCAACTGGTCTGAAGATGGCTTCGACTTT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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