; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Sgr028378 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome

Gene IDSgr028378
OrganismSiraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionNudix hydrolase 23
Genome locationtig00153145:1315465..1320395
RNA-Seq ExpressionSgr028378
SyntenySgr028378
Gene Ontology termsGO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000086 - NUDIX hydrolase domain
IPR015797 - NUDIX hydrolase-like domain superfamily
IPR020084 - NUDIX hydrolase, conserved site
IPR029401 - Nudix hydrolase, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011652088.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]1.2e-14486.93Show/hide
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XP_022158351.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]1.6e-15288.85Show/hide
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XP_022158352.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]7.0e-14888.56Show/hide
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XP_038904906.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]2.8e-14486.41Show/hide
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XP_038904907.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]9.5e-14587.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGX9 Nudix hydrolase domain-containing protein6.0e-14586.93Show/hide
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A0A1S3B747 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X21.3e-14486.93Show/hide
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A0A5A7TPK7 Nudix hydrolase 231.3e-14486.93Show/hide
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A0A6J1DX07 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X23.4e-14888.56Show/hide
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A0A6J1E0P0 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X17.8e-15388.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A5UA57 NAD-capped RNA hydrolase NudC6.9e-0524.4Show/hide
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A5UGU3 NAD-capped RNA hydrolase NudC8.1e-0624.83Show/hide
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P93740 Nudix hydrolase 23, chloroplastic9.4e-8760Show/hide
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Q4QNB3 NAD-capped RNA hydrolase NudC6.9e-0524.4Show/hide
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Q58549 ADP-ribose pyrophosphatase1.1e-0731.09Show/hide
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        Y +P + V  +I  DNK+LL KRK  P  G + LP G++E GE+  +  +RE  EE     +V   +  ++  D    G    I+F+  +       G +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42070.1 nudix hydrolase homolog 236.7e-8860Show/hide
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        MLKAVQ+ G SSG             ++  L  ++  ST S +S SS  LS  +++S     R  SFK           P   SSS          P+  
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Query:  VVQSA--VGHSLNLLWCGGQTKHGIPDGEEKLRAICTVCGKITYQNPKMVVGCLINHDNKVLLCKRKIEPSYGLWTLPAGYLEIGESAADGAIRETLEEA
         VQSA  V       WCGG TKH IPDGEEKLRAICT CGKI YQNPKMVVGCLI H+ KVLLCKR I+PS+GLWTLPAGYLE+GESAA GA+RET EEA
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         A VEVISPFAQLDIPLIGQTY+IF+AKLK  HF+PG ESLEC LF+LD+IPFDSLAFSS+ VTL LY+ED+K G++ FHYGTINKRPG+  SDI A++L
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Query:  DYHLR
        DYHL+
Subjt:  DYHLR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGTTGTGGGTTGTTTGATTAATCACGACAACAAGGTCTTACTTTGCAAGAGGAAGATTGAGCCATCTTATGGCCTTTGGACTCTTCCGGCTGGTTACTTGGAAATTGGGG
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ATCCATGTTGGTTACCTTAAGATTGTATGTTGAGGATGTCAAGGCAGGAAGAATCGCATTCCATTATGGAACCATCAATAAAAGGCCTGGCACAGGTGCTTCAGATATTC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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