CuGenDBv2

Gene ID	Sgr029909
Organism	Siraitia grosvenorii cv. Qingpiguo (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Description	Tubulin alpha chain
Genome location	tig00153554:1045566..1048229
RNA-Seq Expression	Sgr029909
Synteny	Sgr029909
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0044314.1 tubulin alpha chain [Cucumis melo var. makuwa]

4.1e-66

88.82

Show/hide

Query:  TLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGF
        TL   GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED N++DFGLGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGF
Subjt:  TLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGF

Query:  WPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAP
        WPLI+ITVSFFF LYFFFG SF+HDGKT ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP
Subjt:  WPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAP

KAE8649025.1 hypothetical protein Csa_015052 [Cucumis sativus]

2.6e-65

87.1

Show/hide

Query:  TLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGF
        TL   GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED NS+DF LGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGF
Subjt:  TLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGF

Query:  WPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        WPLI+ITVSFFF LYFF G SF+HDG+T ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP VN
Subjt:  WPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

XP_004150271.1 uncharacterized protein LOC101221726 [Cucumis sativus]

1.0e-64

88.08

Show/hide

Query:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI
        +GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED NS+DF LGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI
Subjt:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI

Query:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        +ITVSFFF LYFF G SF+HDG+T ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP VN
Subjt:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

XP_008454422.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494832 [Cucumis melo]

1.8e-66

89.4

Show/hide

Query:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI
        +GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED N++DFGLGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI
Subjt:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI

Query:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        +ITVSFFF LYFFFG SF+HDGKT ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP VN
Subjt:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

XP_022149320.1 uncharacterized protein LOC111017763 [Momordica charantia]

6.7e-69

93.38

Show/hide

Query:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI
        +GEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLED+NSNDFGLGGEMTGE R  SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI
Subjt:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI

Query:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        VITVSFFFALYFFFGPSFVH+G+T ISPPPYVDPYALLEDERISQ APRVN
Subjt:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KY14 Uncharacterized protein

4.9e-65

88.08

Show/hide

Query:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI
        +GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED NS+DF LGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI
Subjt:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI

Query:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        +ITVSFFF LYFF G SF+HDG+T ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP VN
Subjt:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

A0A1S3BY38 uncharacterized protein LOC103494832

8.9e-67

89.4

Show/hide

Query:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI
        +GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED N++DFGLGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI
Subjt:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI

Query:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        +ITVSFFF LYFFFG SF+HDGKT ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP VN
Subjt:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

A0A5A7TME0 Tubulin alpha chain

2.0e-66

88.82

Show/hide

Query:  TLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGF
        TL   GEEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED N++DFGLGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGF
Subjt:  TLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGF

Query:  WPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAP
        WPLI+ITVSFFF LYFFFG SF+HDGKT ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP
Subjt:  WPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAP

A0A5D3E071 Tubulin alpha chain

8.3e-65

90.41

Show/hide

Query:  EEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLIVI
        EEPPESLFMKELKKRG+TPTSLLED N++DFGLGGEMTGE+R  S RSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI+I
Subjt:  EEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLIVI

Query:  TVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAP
        TVSFFF LYFFFG SF+HDGKT ISPPPYVDPYALLEDERISQIAP
Subjt:  TVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAP

A0A6J1D5D9 uncharacterized protein LOC111017763

3.3e-69

93.38

Show/hide

Query:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI
        +GEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLED+NSNDFGLGGEMTGE R  SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPR KLLLTIGGTFFLGFWPLI
Subjt:  SGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDR--SSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLI

Query:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        VITVSFFFALYFFFGPSFVH+G+T ISPPPYVDPYALLEDERISQ APRVN
Subjt:  VITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G50020.1 unknown protein

4.5e-47

Show/hide

Query:  GEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDAN-SNDFGLGGEMTGEDRSSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLIVI
        GEEPPESLFMKELK+RG+TPTSLL+D     D    G+ TG + S  +A +   +KSL NQRERS+ LNSEGLEGLIPR ++LLTIGGTFFLGFWPLIV+
Subjt:  GEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDAN-SNDFGLGGEMTGEDRSSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEGLIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLIVI

Query:  TVSFFFALYFFFGPSFVHDG-KTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN
        T+  F ALY +FG  F+HDG +T +SPPPY+DPYALLEDERIS + PR+N
Subjt:  TVSFFFALYFFFGPSFVHDG-KTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTTTCAATTTTGAAGAACTTGGTGTTTTCCAAGGCTGGAGTAAGTTGCTTTGGCTACACCCAAGATCTCTTTAGTTGTGTCTGGTGCTTTACATTACCTTTTTCAGG
AGAAGAACCTCCAGAATCATTATTCATGAAGGAACTGAAGAAGAGAGGTTTAACTCCCACTTCCTTGCTTGAGGATGCTAACAGCAATGACTTTGGACTTGGTGGTGAGA
TGACGGGAGAAGACAGATCTAGTAGAAGTGCTGTTTCAACTGAAGTTAACAAGAGCCTATCCAATCAAAGGGAGCGTTCCATGCAATTGAACAGTGAAGGCCTTGAGGGG
TTGATCCCTCGTGGTAAACTTTTGCTAACAATTGGAGGAACATTCTTCTTAGGATTTTGGCCGTTGATTGTCATCACTGTTTCATTCTTTTTTGCTTTATACTTTTTTTT
TGGACCATCTTTTGTTCATGATGGCAAAACGTCAATATCTCCTCCGCCGTATGTTGATCCATATGCTCTTTTAGAAGACGAGAGAATTTCGCAAATAGCTCCTCGTGTAA
ATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLSILKNLVFSKAGVSCFGYTQDLFSCVWCFTLPFSGEEPPESLFMKELKKRGLTPTSLLEDANSNDFGLGGEMTGEDRSSRSAVSTEVNKSLSNQRERSMQLNSEGLEG
LIPRGKLLLTIGGTFFLGFWPLIVITVSFFFALYFFFGPSFVHDGKTSISPPPYVDPYALLEDERISQIAPRVN

Sgr029909 (gene) of Monk fruit (Qingpiguo) v1 genome